cluster # 3767

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Oryza sativa
cluster # 3767 cluster # 3767 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_3767#0 length = 830 sequences # 2

consensusID : consensus_3767#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 830
fasta sequence

                              [GTGTGTAGCAGTAAATCTGCACAAGAAAAAGATTCAAGAACAGTTTAGATTTCAGAAAAAGAAGTGATCGATCGATTGATTGATTCTTGCACATGAGCATGGCGAGCAGTGGCGGCTACTACTCCTACTACAACGGCCACCAGCCGGCGCCGTACTACTACGGCTACGCGCAGCCGGCGAGGGTCGCCGGCGGCGGCGGCGTCGGCGGGTCGCAGCGGCCGTCGGCGCACGCGCTCCTCCTCGTCGCGACGCTGCTGCTCGTCGCCGTGACCACGCTGTACGCGCGGTGCGAGGAGGCGGTGGAGAGCCTGCTCGACCAGCTCCGCGTCCTCCTCATCCTCTCCCCGCTGCTGCTCATCGTCGCCGTGCAGGTATGGGCCGCGAGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGCCGTGGCGCCGGCGGAGGCCTCATGTACCTCCTCGCGCAGCT-GATGGGC-ATGGGCGACGGCGGCGGCTCGCCGTACGGCCGTTGGCACGGCGGCGGCGGCGGCGCGTCGTCGTCGCCGTGGGGCGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGTTCTTGGTGTCGTACCAGTCGTCGTTCCAGAGCTGGTGGTTCCCGCTGCTCAGCCGCCGATGAGAATTGCAAAAGCTCG-TGCATG-TAAAACCATGGTGAAAATATAGCAGAGGCTTCTTGGTTAATCAGAGCTAAGCTCGGTGACGATCGAGCTATATATAATTGAGCACAAGGGCGGAGCTAGAGCGAGATGGAGGGATGCCACTTGTTTAATTTACTCTGTTTTATATTAAGTTTAAGCTAATACGGGTATTTAAATTTGTAAAAAAA]

[+] EMBL AK071212             [GTGTGTAGCAGTAAATCTGCACAAGAAAAAGATTCAAGAACAGTTTAGATTTCAGAAAAAGAAGTGATCGATCGATTGATTGATTCTTGCACATGAGCATGGCGAGCAGTGGCGGCTACTACTCCTACTACAACGGCCACCAGCCGGCGCCGTACTACTACGGCTACGCGCAGCCGGCGAGGGTCGCCGGCGGCGGCGGCGTCGGCGGGTCGCAGCGGCCGTCGGCGCACGCGCTCCTCCTCGTCGCGACGCTGCTGCTCGTCGCCGTGACCACGCTGTACGCGCGGTGCGAGGAGGCGGTGGAGAGCCTGCTCGACCAGCTCCGCGTCCTCCTCATCCTCTCCCCGCTGCTGCTCATCGTCGCCGTGCAGGTATGGGCCGCGAGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGCCGTGGCGCCGGCGGAGGCCTCATGTACCTCCTCGCGCAGCT GATGGGC ATGGGCGACGGCGGCGGCTCGCCGTACGGCCGTTGGCACGGCGGCGGCGGCGGCGCGTCGTCGTCGCCGTGGGGCGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGTTCTTGGTGTCGTACCAGTCGTCGTTCCAGAGCTGGTGGTTCCCGCTGCTCAGCCGCCGATGAGAATTGCAAAAGCTCG TGCATG TAAAACCATGGTGAAAATATAGCAGAGGCTTCTTGGTTAATCAGAGCTAAGCTCGGTGACGATCGAGCTATATATAATTGAGCACAAGGGCGGAGCTAGAGCGAGATGGAGGGATGCCACTTGTTTAATTTACTCTGTTTTATATTAAGTTTAAGCTAATACGGGTATTTAAAT           ]
[+] EMBL BI800063             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CGT GCGCC GCGGAGGCCTCATGTACCTCCTCGCGCAGCTAGATGGGCAATGGGCGAC GCGGCGGCTCCCCGTACGGCCGTTGGCACGGCGGCGGC GCGGCGCGTCGTCGTCGCCGTGGGGCGTGGCGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGTTCTTGGTGTCGTACCAGTCGTCGTTCCAGAGCTGGTGGTTCCCGCTGCTCAGCCGCCGATGAGAATTGCAAAAGCTCGCTGCATGCTAAAACCATGGTGAAAATATAGCAGAGGCTTCTTGGTTAATCAGAGCTAAGCTCGGTGACGATCGAGCTATATATAATTGAGCACCAGGGCGGAGCTAGAGCGAGATGGAGGGATGCCACTTGTTTAATTTACTCTGTTTTATATTAAGTTTAAGCTAATACGGGTATTTAAATTTGTAAAAAAA]




>consensus_3767#0
GTGTGTAGCAGTAAATCTGCACAAGAAAAAGATTCAAGAACAGTTTAGATTTCAGAAAAA
GAAGTGATCGATCGATTGATTGATTCTTGCACATGAGCATGGCGAGCAGTGGCGGCTACT
ACTCCTACTACAACGGCCACCAGCCGGCGCCGTACTACTACGGCTACGCGCAGCCGGCGA
GGGTCGCCGGCGGCGGCGGCGTCGGCGGGTCGCAGCGGCCGTCGGCGCACGCGCTCCTCC
TCGTCGCGACGCTGCTGCTCGTCGCCGTGACCACGCTGTACGCGCGGTGCGAGGAGGCGG
TGGAGAGCCTGCTCGACCAGCTCCGCGTCCTCCTCATCCTCTCCCCGCTGCTGCTCATCG
TCGCCGTGCAGGTATGGGCCGCGAGCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGACCGCCGTGGCGCCG
GCGGAGGCCTCATGTACCTCCTCGCGCAGCTGATGGGCATGGGCGACGGCGGCGGCTCGC
CGTACGGCCGTTGGCACGGCGGCGGCGGCGGCGCGTCGTCGTCGCCGTGGGGCGTGGCGC
TGGTGCTGGTGCTGGTGCTGTTCTTGGTGTCGTACCAGTCGTCGTTCCAGAGCTGGTGGT
TCCCGCTGCTCAGCCGCCGATGAGAATTGCAAAAGCTCGTGCATGTAAAACCATGGTGAA
AATATAGCAGAGGCTTCTTGGTTAATCAGAGCTAAGCTCGGTGACGATCGAGCTATATAT
AATTGAGCACAAGGGCGGAGCTAGAGCGAGATGGAGGGATGCCACTTGTTTAATTTACTC
TGTTTTATATTAAGTTTAAGCTAATACGGGTATTTAAATTTGTAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case