These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_3901#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 2170 fasta sequence [GTTGGCAAAATTGCTTGAGTCAGTATTACTTGATTTGGCCACTGTGAGACAAAAAATAAACAAAGGTAAAAAACGAATTTGGAAGATGGAAGGCAAATTGGAAAAGGCTCAGATTCAACATCTGACAGACTTCAACAACAAATATGGACCATCTATTCGACAATCAGTTGAAACTGCTGAACATAATAACTGTGCTTTGAGGTGTCTTAATAATTATTTGGAGTTGATGATTGAGGAACCACGGTTTAGTTCAATTGCCTATGTTCGTCTGGATTCACAAGTCAAGAAACTCGATAAGGAGAACACGTCTGCGATGGATTTATCATCCAGTTTGCACCAGATGCTTCAGAAGTTAAATTTAAGAGTACAAGATGAAGAAGTCTGGGTGTCACAGTTAGGCTCAAATTTGCAGGCTTCATTCAGAAAAATCATGGATACCTCCTCAGAAATAGGAAAATTAGAAGATGAAGTTTTGCAGCTGAAGGTCGATATAGCTGAGTTTGCTCCAGGTGAAGTAACCAGTTGTGCAGTATATGAAATGATCAAGACACTTCAAATTGTTGAACTGTTCATGAATAATTCCACCAGACATTTGAAACTTATCGATGGAATTAATTCTGAAATGAGAGAGTTTGGAAGTATCTTTAATGGCAAAGTGAGATGCCTTGTTCGCTTTGCTAGATATCAACAAACTAATATGGAGAAGTCTACACAGATAATCAATTTCCTTGGTGACATCCGTGCTAAAGTTGACAAAATGACTCAAATGTATGGTCTATCTGAAGTTGTGCCCATTGTCTCAAACCAGTTTATAGAGGGGAGCTTCAATGCCGATGCATATGCTTTTGAGAGTTTGAAAGAGCACAGCACTGATCTCTGTTTTAGTTGGAGAACAAGGAAGTTTCATAACAGATTAATTCTCCCTCCAGTGAGGCAACAAACTTCTGGTATGAAATAAATGACTTCTTGATGAAAACTTTATGTATGTCATAAGAATAAAATATGTCGTTATGATGCCATGAAAATAATTGAACGATCAGCAAAAATTGCACCTTTTCCTGTCGCAATCAGTTTTACCTAATAATTTACTTCCTAGACTGATATTTTACATACATGTTGATTTTACTCTGCTGGCTCACCCTTTTTATGTCCTGCTTCTGATGGCCTCAAGTACTTCCCCTCACACCTCTTTCTAGTCATTTGATCATGGTTGATTTGTCTACTAGGGCCCACCTCGACACAGTTTATTTTTGTTCGGTTAGCGCCTTGTTCGAGTTACTGGTATTCTTGGTCTTTCTTCTTGATTGGAACTTATATGCAAGCATAGTAATTCTTGTCAGGGACGTGTTCATATTACGCGACACTATCATCAGTTGAGTCCTTGTATAAAAGAGAATATGCATCATACCCTACTATCTTAAAAGATAAGATTGGACAGCCTGATGAATTTCTGGTTAATCTGTCAAGAGCTCAGTTGGAAGATATAGTAGAAGATTTTTATACCAGGCATAAAGTCAAGGGTTCGAAAAGGTTGAATGTTTGTTTAGATAAGATGAAAAATGAAGGCGTTATTTCGGAAGAATCATATATGAACCCTCAGGCTCAGTTTGTGCAGTCCACAGAAAGATACAAAATCAAACAATACGAAGAGCTCAATCTTGAGATTGCGATGAGGGAACGTGATAAGGAAGAAGTAAGCATTGTTGACAAGAAGTGTATAGGAAAGAAGAAAAAAAGGAGGTTCAGAAAAAAGATGAGAATGAAGGAGCACATATTTCTGACGAAGATAAAGAAAGTTATTGAGAGCCATATAATGGATGGAAAGGTGCTCATTGCTAGTTTCCGGGTAACAACTGGTTACTTCAGGTTGCTACCTCATCAAATCTACAAAATTCCAGAAGAAGATCCCCAATATGAATTGAATAAAAAAGGTAATCCCTGTTCTCATTGTGTCGTTGTTGTTGGTTTTGGGATTCGGGACGGTGAATGTTATCTGATCTATCTAAATTCATATGGGACTTCCTGGGGACATGACGGATTCGGTAGAATATACCTTGATAGTGTCAGGAAGCTTTTTTTAGCTCAGGTCTAAACTTTGCGTGTAAAACAGTGAAATTGTAAACTGAAATGTTATTGAATAATATTTCTTGATTTGGTTATCTATAATTCT] [+] EMBL AK064552 [GTTGGCAAAATTGCTTGAGTCAGTATTACTTGATTTGGCCACTGTGAGACAAAAAATAAACAAAGGTAAAAAACGAATTTGGAAGATGGAAGGCAAATTGGAAAAGGCTCAGATTCAACATCTGACAGACTTCAACAACAAATATGGACCATCTATTCGACAATCAGTTGAAACTGCTGAACATAATAACTGTGCTTTGAGGTGTCTTAATAATTATTTGGAGTTGATGATTGAGGAACCACGGTTTAGTTCAATTGCCTATGTTCGTCTGGATTCACAAGTCAAGAAACTCGATAAGGAGAACACGTCTGCGATGGATTTATCATCCAGTTTGCACCAGATGCTTCAGAAGTTAAATTTAAGAGTACAAGATGAAGAAGTCTGGGTGTCACAGTTAGGCTCAAATTTGCAGGCTTCATTCAGAAAAATCATGGATACCTCCTCAGAAATAGGAAAATTAGAAGATGAAGTTTTGCAGCTGAAGGTCGATATAGCTGAGTTTGCTCCAGGTGAAGTAACCAGTTGTGCAGTATATGAAATGATCAAGACACTTCAAATTGTTGAACTGTTCATGAATAATTCCACCAGACATTTGAAACTTATCGATGGAATTAATTCTGAAATGAGAGAGTTTGGAAGTATCTTTAATGGCAAAGTGAGATGCCTTGTTCGCTTTGCTAGATATCAACAAACTAATATGGAGAAGTCTACACAGATAATCAATTTCCTTGGTGACATCCGTGCTAAAGTTGACAAAATGACTCAAATGTATGGTCTATCTGAAGTTGTGCCCATTGTCTCAAACCAGTTTATAGAGGGGAGCTTCAATGCCGATGCATATGCTTTTGAGAGTTTGAAAGAGCACAGCACTGATCTCTGTTTTAGTTGGAGAACAAGGAAGTTTCATAACAGATTAATTCTCCCTCCAGTGAGGCAACAAACTTCTGGTATGAAATAAATGACTTCTTGATGAAAACTTTATGTATGTCATAAGAATAAAATATGTCGTTATGATGCCATGAAAATAATTGAACGATCAGCAAAAATTGCACCTTTTCCTGTCGCAATCAGTTTTACCTAATAATTTACTTCCTAGACTGATATTTTACATACATGTTGATTTTACTCTGCTGGCTCACCCTTTTTATGTCCTGCTTCTGATGGCCTCAAGTACTTCCCCTCACACCTCTTTCTAGTCATTTGATCATGGTTGATTTGTCTACTAGGGCCCACCTCGACACAGTTTATTTTTGTTCGGTTAGCGCCTTGTTCGAGTTACTGGTATTCTTGGTCTTTCTTCTTGATTGGAACTTATATGCAAGCATAGTAATTCTTGTCAGGGACGTGTTCATATTACGCGACACTATCATCAGTTGAGTCCTTGTATAAAAGAGAATATGCATCATACCCTACTATCTTAAAAGATAAGATTGGACAGCCTGATGAATTTCTGGTTAATCTGTCAAGAGCTCAGTTGGAAGATATAGTAGAAGATTTTTATACCAGGCATAAAGTCAAGGGTTCGAAAAGGTTGAATGTTTGTTTAGATAAGATGAAAAATGAAGGCGTTATTTCGGAAGAATCATATATGAACCCTCAGGCTCAGTTTGTGCAGTCCACAGAAAGATACAAAATCAAACAATACGAAGAGCTCAATCTTGAGATTGCGATGAGGGAACGTGATAAGGAAGAAGTAAGCATTGTTGACAAGA ] [+] EMBL AU100737 [ CAATCTTGAGATTGCGATGAGGGAACGTGATANGGAAGAAGTAAGCATTGTTGACAAGAAGTGTATAGGAAAGAAGAAAAAAAGGAGGTTCAGAAAAAAGATGAGAATGAAGGAGCACATATTTCTGACGAAGATAAAGAAAGTTATTGAGAGCCATATAATGGATGGAAAGGTGCTCATTGCTAGTTTCCGGGTAACAACTGGTTACTTCAGGTTGCTACCTCATCAAATCTACAAAATTCCAGAAGAAGATCCCCAATATGAATTGAATAAAAAAGGTAATCCCTGTTCTCATTGTGTCGTTGTTGTTGGTTTTGGGATTCGGGACGGTGAATGTTATCTGATCTATCTAAATTCATATGGGACTTCCTGGGGACATGACGGATTCGGTAGAATATACCTTGATAGTGTCAGGAAGCTTTTTTTAGCTCAGGTCTAAACTTTGCGTGTAAAACAGTGAAATTGTAAACTGAAATGTTATTGAATAATATTTCTTGATTTGGTTATCTATAA ] [-] EMBL D43058 [ TAGTGTCAGGAAGCTTTTTTTAGCTCAGGTCTAAACTTTGCGTGTAAAACAGTGNAATTGTAAACTGNAATGTTATTGNATAATATTTCTTGATTTGGTTATCTATATTTCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||