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Oryza sativa
cluster # 3957 cluster # 3957       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3957#0 length = 3713 sequences # 3  

consensusID : consensus_3957#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 3713
fasta sequence
                              [ACTCTTTCCCCTCCACCTCTCGACTCCTCCCTCGCTTCTCCCCCTCCGCAAGTCTCCCTCCCTCCCCCACAAACCCTACCTCGCCCCCTCCCTCCTTCGATCGGGGGAGCGCTCCATTGCGGCGAAGGGGAAGGGGGAGTCGGGGATGTTCTTCTCCGGTGACCCGACGGCGAGGAAGCGGGTGGACCTCGGCGGGCGGAGCAGCAAGGAGCGGGACCGGCAGGTGCTGCTCGAGCAGACGCGGGAGGAGCGGCGGCGGCGGCTGGGCCTGCGCCTGCAGAACAGCTCCGCCACGAAGATCCAGAAATGCTTCAGAGGGAAGAGAGATTTGGAATTGGCACGTTCGGAAGTTCGAGGGAACTTTTGCTCTACTTTTGGGGAGCACTGCCAGAGGGTTGATTGGAGCAGTTTCGGTGCTAATTCTGATTTCCTTCGTCAATTCCTGTTCTTCTTCAATGCAAAGAAAGACAGTGATATTGCTATACTCTGTCAAGTCTGCAATTTGCTGTTATATTATGTCAAACATGGTGGAGATGTTCTAAGACTCTTTGGTGGTACAAATTACTCCTCACTGGAACCTCTTGTGATTCACAGGGTTAAAAAACTTGCACTCATTTGTGTGCAAACTGTACATCAGAAAAGGCATGATTGGGGCAGTCAGCTTTTGATGCCGCCAGAAAGCACACCAAAGCCTTGTGGTTCATTACTCGAAACTGCCGCTTGCTTGATAAATCCTAAGCTTGCATGGAACTGCAAGGTAGTTGGGTATCTTCAGCGGAAGAAGATCTATTGCTTATTTAGGGGGATTATTATATCCATACCGCAAACTGCAAGAAATTTGGAGCATAATAACAATACATCTGCTCTGGAGCAAGTTCTTATGCTTATTGCTTCACATATTGGCGATGATCCGTGTTGTTGTCCAGTAGTGGATCCAAGATGGAGTTTCTCCTCTCAGCTTCTATCGATTCCTTTCCTCTGGCATCGTTTATCACACTTCAAGAAGGTTTTCTCAGCTAATGGACTCAGCAAATATTATATCCATCAGATAGCTTGCTTTTTGCCTAGCTGCGCTGATGTTCTTCCAAATGATATATCATCTAATCATCCAGGTTATGCATGTGTTCTTGCAAATGTTCTTGAAGCTGCAACCTGGATTTTGTCCGAGCCAAAGTTTGCTTCTGAAACAGCGGCTGACATCATTGCAGTCTGTACATCACTGCTGGACGCGTTGCCAACCATTACATCACCTACCGGAAGGGCAGATGACGACGATGACACACCCATGGATGATGTCATTAATGGTCTTGATGCTGATTTGGAAAAACAAATTACTGCAGCAATTGATTCAAGGTTGCTTCAACATTTGGTGAATGCTCTGTTCAGAGGCACAATTAGTACAGACTATTCTTATCCAACTGGACCGTCAGATATTGAGGTGGAAGCTGTAGGATCTATATGTGCTTTTCTTCATGTCACATTCAACACATTGCCTGCAGAGCGGATTATGACTGGCCTGGCCTACCGGACTGAAATAGTTCCTGCACTATGGAACTTCATAAAGCGATGTAATGAGAACCAAAGCTGGCCACAATTTTCCAAGTTTGTCTCTTCTCCGCCTGCAGATGCCGTGGGTTGGCTCCTACCTGTATCTGTATTCTGTCCCATATACAAGCACATGTTGAAGATAATTGATAACGGGGAATTCTATGAACAAGAGAAACCTTTGTCACTTAAAGATTTGAAGTCCTTGGTTTTAATTCTAAAGAAGGCTTTATGGGAACTTCTATGGGTTATTCCTTCACATGCCTCTCCTGCTAAGAAAGTGCTACCCAACCCTTCTGGATTTAAGAAGTTGTCAATTGAGAATGTCAAGATTGGGGCAAGGATTGGGTTATCTGAACTACTTGCACAGTTGCAAGACTGGAATAACAGGCTCCCATTTACTTCTTCCAATGATTTCTATTCACAACAAGCAACTAGTGAAAATTTTGTCTCTCAGGCTCTTCTTGGCAATACTCGAGCATCTGAAATTATAAAGCTGGCTCCCTTTTTAGCACCTTTTACCAGCAGAGTTAAAATATTCACTTCACAATTGGCAAATTCTAGACAATCGACAACATCCCATTCTGCTTTGACAAGACACCGGTTCAAAATAAGAAGAAATCGACTTCTGGAAGACGCTTTTGATCAGCTAAGCATGCTTTCTGAAGAAGACCTTAAAGGACCAATTCGAGTGGTGTTTGTTAATGAGCATGGTGTTGAAGAGGCTGGGATTGACGGAGGTGGAATTTTCAAGGATTTCATGGAAAATATCACTCGAGCCGCTTTTGATGTGCAGTACGGTTTATTCAAGGAGACAGCCGATCATCTTCTCTACCCAAATCCTGGATCTGGATTGGTCCATGAACAGCATCTGCAATACTTCCATTTTCTTGGCAGTCTCCTTGGGAAGGCAATCTATGAGGGCATACTTGTTGATCTGCCATTTGCAACATTCTTCTTGAGTAAACTAAAACACAAGTACAACTTCTTAAATGATCTGCCTTCATTGGATCCAGAATTGTATCGTCATCTTCTGTCTTTAAAGCATTATGATGGTGATATCTCGCAATTGGAGTTATACTTTGTTATTGTGAATAACGAATATGGTGAACAATCTGAAGAAGAACTGCTCCCAGGTGGGAGAGATATGCGTGTAACTAGTGAAAATGTTATTACTTATATCCATCTTGTCGCCAACCATCGGTTGAACTATCAGATCCGCGCCCAAAGCACACATTTTTTGAGAGGCTTTCAACAACTAATACCGAATGAATGGATTAACATGTTCAATGAACATGAATTCCAGGTTCTCATATCTGGCTCTCTAGAAAGCTTGGACATCGATGACTTGCGCTCGAACACTAACTATTCTGGAGGATATCATCCGGACCATGAGCTTATTGATATATTCTGGGAGGTCCTAAAGAGCTTCAGTTCGCATAATCAGGAAAAGTTTCTCAAGTTCGTGACCGGATGTTCTCGTGGACCACTCCTTGGATTTCAGTACCTCGAACCAAAATTCTGCATTCAGAGGGCTGGTGTTCCTGGCATGGAGGAGGAGGACGAAGACCGCTTGCCTACATCGGCCACTTGCATGAACCTCCTGAAGCTCCCTCCTTATAGAAACAAGACACAATTGGAAAGCAAATTGTTGTACGCGATAAATGCAGAAGCTGGTTTTGATCTAAGTTAAAATCGGCTTTTGGACCAAATATTGTGCAGTGTAGATAGTTTCTAGGTAACAGATTAAAGGCACCCAAGGGCCAAAACACCGACCTCTGGGCCCCCTTTTGAGCCCCCCATAAAGTAAAAGGAAGGATCGATTCCAGGAGGAGGTAAGCGAAACTGAAGACACGAGGAGGGAGGCAACAGCCAGCTGCTCAAGTGCTGATTAGGCCGGTGATAAATTATTCACCTTAAATAAGCAGATGCTGTTGTTGTAATCAGCCGTGAACTTGTACATGTATTTTTACCAACGTTGTGGTTGGTTGATGTCCTCTCGTGGAGTTGTGGGATGACATGTTAGTTGGGTTTGGAAACCGGCATCAGCGTCGCTGTAGCTGTACTTTGGTGTTGGTGTTGCTGTCATGTAAGGTAACCCTAACACCAGCTGCTTGGTGCCCAGGGGCTGGGAATCATACATAATCAGTGAAAAAAAAGGGAGAGAT]

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[+] EMBL CB670387             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTCCATTTTCTTGGCAGTCTCCTTGGGAAGGCAATCTATGAGGGCATACTTGTTGATCTGCCATTTGCAACATTCTTCTTGAGTAAACTAAAACACAAGTACAACTTCTTAAATGATCTGCCTTCATTGGATCCAGAATTGTATCGTCATCTTCTGTCTTTAAAGCATTATGATGGTGATATCTCGCAATTGGAGTTATACTTTGTTATTGTGAATAACGAATATGGTGAACAATCTGAAGAAGAACTGCTCCCAGGTGGGAGAGATATGCGTGTAACTAGTGAAAATGTTATTACTTATATCCATCTTGTCGCCAACCATCGGTTGAACTATCAGATCCGCGCCCAAAGCACACATTTTTTGAGAGGCTTTCAACAACTAATACCGAATGAATGGATTAACATGTTCAATGAACATGAATTCCAGGTTCTCATATCTGGCTCTCTAGAAAGCTTGGACATCGATGACTTGCGCTCGAACACTAACTATTCTGGAGGATATCATCCGGACCATGAGCTTATTGATATATTCTGGGAGGTCCTAAAGAGCTTCAGTTCGCATAATCAGAAAAAGTTTCTCAAGTTCGTGACCGGATGTTCTCGTGGACCACTCCTTGGATTTCAGTACCTCGAACCAAAATTCTGCATTCAGAGGGCTGGTGTTCCTGGCATGGAGGAGGAGGACGAAGACCGCTTGCCTACATCGGCCACTTGCATGAACCTCCTGAAGCTCCCTCCTTATAGAAACAAGACACAATTGGAAAGCAAATTGTTGTACGCGATAAATGCAGAAGCTGGTTTTGATCTAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CB670388             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAAGTTTCTCAAGTTCGTGACCGGATGTTCTCGTGGACCACTCCTTGGATTTCAGTACCTCGAACCAAAATTCTGCATTCAGAGGGCTGGTGTTCCTGGCATGGAGGAGGAGGACGAAGACCGCTTGCCTACATCGGCCACTTGCATGAACCTCCTGAAGCTCCCTCCTTATAGAAACAAGACACAATTGGAAAGCAAATTGTTGTACGCGATAAATGCAGAAGCTGGTTTTGATTTAAGTTAAAATCGGCTTTTGGACCAAATATTGTGCAGTGTAGATAGTTTCTAGGTAACAGATTAAAGGCACCCAAGGGCCAAAACCCCGACCTTTGGGCCCCCTTTTGAGCCCCCCATAAAGTAAAAGGAAGGATCGATTCCAGGAGGAGGTAAGCGAAATTGAAGACACGAGGAGGGAGGCAACAGCCAGCTGCTCAAGTGTTGATTAGGCCGGTGATAAATTATTCACCTTAAATAAGCAGATGCTGTTGTTGTAATCAGCCGTGAACTTGTACATGTATTTTTACCAACGTTGTGGTTGGTTGATGTCCTCTCGTGGAGTTGTGGGATGACATGTTAGTTGGGTTTGGAAACCGGCATCAGCGTCGCTGTAGCTGTACTTTGGTGTTGGTGTTGCTGTCATGTAAGGTAACCCTAACACCAGCTGCTTGGTACCCAGGGGCTGGGAATCATCCATTATAAAGGAAAAAAAAGGGAGAGAT]


>consensus_3957#0 ACTCTTTCCCCTCCACCTCTCGACTCCTCCCTCGCTTCTCCCCCTCCGCAAGTCTCCCTC CCTCCCCCACAAACCCTACCTCGCCCCCTCCCTCCTTCGATCGGGGGAGCGCTCCATTGC GGCGAAGGGGAAGGGGGAGTCGGGGATGTTCTTCTCCGGTGACCCGACGGCGAGGAAGCG GGTGGACCTCGGCGGGCGGAGCAGCAAGGAGCGGGACCGGCAGGTGCTGCTCGAGCAGAC GCGGGAGGAGCGGCGGCGGCGGCTGGGCCTGCGCCTGCAGAACAGCTCCGCCACGAAGAT CCAGAAATGCTTCAGAGGGAAGAGAGATTTGGAATTGGCACGTTCGGAAGTTCGAGGGAA CTTTTGCTCTACTTTTGGGGAGCACTGCCAGAGGGTTGATTGGAGCAGTTTCGGTGCTAA TTCTGATTTCCTTCGTCAATTCCTGTTCTTCTTCAATGCAAAGAAAGACAGTGATATTGC TATACTCTGTCAAGTCTGCAATTTGCTGTTATATTATGTCAAACATGGTGGAGATGTTCT AAGACTCTTTGGTGGTACAAATTACTCCTCACTGGAACCTCTTGTGATTCACAGGGTTAA AAAACTTGCACTCATTTGTGTGCAAACTGTACATCAGAAAAGGCATGATTGGGGCAGTCA GCTTTTGATGCCGCCAGAAAGCACACCAAAGCCTTGTGGTTCATTACTCGAAACTGCCGC TTGCTTGATAAATCCTAAGCTTGCATGGAACTGCAAGGTAGTTGGGTATCTTCAGCGGAA GAAGATCTATTGCTTATTTAGGGGGATTATTATATCCATACCGCAAACTGCAAGAAATTT GGAGCATAATAACAATACATCTGCTCTGGAGCAAGTTCTTATGCTTATTGCTTCACATAT TGGCGATGATCCGTGTTGTTGTCCAGTAGTGGATCCAAGATGGAGTTTCTCCTCTCAGCT TCTATCGATTCCTTTCCTCTGGCATCGTTTATCACACTTCAAGAAGGTTTTCTCAGCTAA TGGACTCAGCAAATATTATATCCATCAGATAGCTTGCTTTTTGCCTAGCTGCGCTGATGT TCTTCCAAATGATATATCATCTAATCATCCAGGTTATGCATGTGTTCTTGCAAATGTTCT TGAAGCTGCAACCTGGATTTTGTCCGAGCCAAAGTTTGCTTCTGAAACAGCGGCTGACAT CATTGCAGTCTGTACATCACTGCTGGACGCGTTGCCAACCATTACATCACCTACCGGAAG GGCAGATGACGACGATGACACACCCATGGATGATGTCATTAATGGTCTTGATGCTGATTT GGAAAAACAAATTACTGCAGCAATTGATTCAAGGTTGCTTCAACATTTGGTGAATGCTCT GTTCAGAGGCACAATTAGTACAGACTATTCTTATCCAACTGGACCGTCAGATATTGAGGT GGAAGCTGTAGGATCTATATGTGCTTTTCTTCATGTCACATTCAACACATTGCCTGCAGA GCGGATTATGACTGGCCTGGCCTACCGGACTGAAATAGTTCCTGCACTATGGAACTTCAT AAAGCGATGTAATGAGAACCAAAGCTGGCCACAATTTTCCAAGTTTGTCTCTTCTCCGCC TGCAGATGCCGTGGGTTGGCTCCTACCTGTATCTGTATTCTGTCCCATATACAAGCACAT GTTGAAGATAATTGATAACGGGGAATTCTATGAACAAGAGAAACCTTTGTCACTTAAAGA TTTGAAGTCCTTGGTTTTAATTCTAAAGAAGGCTTTATGGGAACTTCTATGGGTTATTCC TTCACATGCCTCTCCTGCTAAGAAAGTGCTACCCAACCCTTCTGGATTTAAGAAGTTGTC AATTGAGAATGTCAAGATTGGGGCAAGGATTGGGTTATCTGAACTACTTGCACAGTTGCA AGACTGGAATAACAGGCTCCCATTTACTTCTTCCAATGATTTCTATTCACAACAAGCAAC TAGTGAAAATTTTGTCTCTCAGGCTCTTCTTGGCAATACTCGAGCATCTGAAATTATAAA GCTGGCTCCCTTTTTAGCACCTTTTACCAGCAGAGTTAAAATATTCACTTCACAATTGGC AAATTCTAGACAATCGACAACATCCCATTCTGCTTTGACAAGACACCGGTTCAAAATAAG AAGAAATCGACTTCTGGAAGACGCTTTTGATCAGCTAAGCATGCTTTCTGAAGAAGACCT TAAAGGACCAATTCGAGTGGTGTTTGTTAATGAGCATGGTGTTGAAGAGGCTGGGATTGA CGGAGGTGGAATTTTCAAGGATTTCATGGAAAATATCACTCGAGCCGCTTTTGATGTGCA GTACGGTTTATTCAAGGAGACAGCCGATCATCTTCTCTACCCAAATCCTGGATCTGGATT GGTCCATGAACAGCATCTGCAATACTTCCATTTTCTTGGCAGTCTCCTTGGGAAGGCAAT CTATGAGGGCATACTTGTTGATCTGCCATTTGCAACATTCTTCTTGAGTAAACTAAAACA CAAGTACAACTTCTTAAATGATCTGCCTTCATTGGATCCAGAATTGTATCGTCATCTTCT GTCTTTAAAGCATTATGATGGTGATATCTCGCAATTGGAGTTATACTTTGTTATTGTGAA TAACGAATATGGTGAACAATCTGAAGAAGAACTGCTCCCAGGTGGGAGAGATATGCGTGT AACTAGTGAAAATGTTATTACTTATATCCATCTTGTCGCCAACCATCGGTTGAACTATCA GATCCGCGCCCAAAGCACACATTTTTTGAGAGGCTTTCAACAACTAATACCGAATGAATG GATTAACATGTTCAATGAACATGAATTCCAGGTTCTCATATCTGGCTCTCTAGAAAGCTT GGACATCGATGACTTGCGCTCGAACACTAACTATTCTGGAGGATATCATCCGGACCATGA GCTTATTGATATATTCTGGGAGGTCCTAAAGAGCTTCAGTTCGCATAATCAGGAAAAGTT TCTCAAGTTCGTGACCGGATGTTCTCGTGGACCACTCCTTGGATTTCAGTACCTCGAACC AAAATTCTGCATTCAGAGGGCTGGTGTTCCTGGCATGGAGGAGGAGGACGAAGACCGCTT GCCTACATCGGCCACTTGCATGAACCTCCTGAAGCTCCCTCCTTATAGAAACAAGACACA ATTGGAAAGCAAATTGTTGTACGCGATAAATGCAGAAGCTGGTTTTGATCTAAGTTAAAA TCGGCTTTTGGACCAAATATTGTGCAGTGTAGATAGTTTCTAGGTAACAGATTAAAGGCA CCCAAGGGCCAAAACACCGACCTCTGGGCCCCCTTTTGAGCCCCCCATAAAGTAAAAGGA AGGATCGATTCCAGGAGGAGGTAAGCGAAACTGAAGACACGAGGAGGGAGGCAACAGCCA GCTGCTCAAGTGCTGATTAGGCCGGTGATAAATTATTCACCTTAAATAAGCAGATGCTGT TGTTGTAATCAGCCGTGAACTTGTACATGTATTTTTACCAACGTTGTGGTTGGTTGATGT CCTCTCGTGGAGTTGTGGGATGACATGTTAGTTGGGTTTGGAAACCGGCATCAGCGTCGC TGTAGCTGTACTTTGGTGTTGGTGTTGCTGTCATGTAAGGTAACCCTAACACCAGCTGCT TGGTGCCCAGGGGCTGGGAATCATACATAATCAGTGAAAAAAAAGGGAGAGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)