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Oryza sativa
cluster # 3960 cluster # 3960       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_3960#0 length = 1360 sequences # 3  
consensusID : consensus_3960#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1360
fasta sequence 
                              [CTCACTCGCTGCACACTAGTCCTTCAGTTTCAGTCCCCTCGCATCGCCATAACCACCTCGCCCAAATCGAAGCACACTAGAGAGCCACAAGATCCCTCCTCCCGACACAAACAACCAACCACACTACCCTTCGCGCTGGTCTCGACCACCGGAGATGGCCGCCTAGCTAGTGTGCCGGTGGCAGCTGGAAGGCATGGGCTGCTGCTTCAGCAAGAAGCGCAGGAAGCAGCTGGCCAGTGCAGCTGTGTTCTCCCGCCGCTGCAAGCCGCCGGCCGAGGCCCGCGACCCGCCGCCCCCGCCGCCGTTGCCGGAGGAGGAGAAGGTCAAGGAGGTGCTCTCCGAGACCCCGAGCGCTAAGGTCAGGGCCGAGGCGAAGCCCGTCGCCAATGTGGCTGTCTTGGAGGAGCCGGAGGCGGAGAAGCAGGCGCCGAAGCCTAGCGCCGATGCGGATGTCACGGTGAGCGATCTTGGTAGCTGCATGTCGCTCGCCACCGACGATAGGTCCGAGGCGGCGTCCGAGTCGTCCGTCGCGACCAGCTCGGTGACCGGGCCAGAGCGGTCGCCGGGGAAGCCGGCCAGGAGGAAGCGCCCGGTGTCCGTCTCCGGCGAGCTGGCCCATGCCATTTCCCGGCGCGACCGCGCCGCCGCCGCCGCCTACGGCGTCCGCTCCCGCAGCGCCCGGGCCTCGGCGTCCCCTCCGCCGCGGCGCGAGCAACGGGACCGCTCAGTGCGGAGGTCGCCGTCGCCGGCAGCGAAGCGTACACCGGAGCAGCGCCGCGCCGCGAGCCCAGCCCCGTCCCTCCAGCGGAAGCCGCCCGTCCCGGTGAGGCCGTCGCCGCGGCGGGTGCAGGAAGCGCCTCCTTCTCCGCTCGAGCCCCCGCCTCCACCACCTCCGCAGCCAGAAGAGGACGCCATGACCGCCGACGGCGAGCCCAGCATTGCGGACGCCGCCAGCGCCGGCGGCGACGGCGAGGGGAAGGAGTCGCTGGACAACCCGCTGGTGTCCTTGGAATGCTTCATCTTCCTCTAGTGGCGCTGCACTACCGCCGTCGTGTCCTCCTTCGTCAGGTGGCATCGCGCTATTTTCCTTTGAAAATGTTGCGCTAATCTTGTTTAGTTTAGATGTTCTGTGTTAAGCTGGTGTGGTAATTAGTGGGTAAACTACTTGTGGTGGTGTAATGCTACTGTCATATTCCGGTTATTAACCTATGTCGGGTGGAATGACAGCAGCTTTGACTTTTGGCGTAGGATGGGCCCTCCGATTGGAATTGGACGGCGCTTGAACGTTGGATGTTTCTTTTTGGCTTTTGGACTAGCCCTCGCTGTATTTTGTAGAGCTCTTTTTCACTAATCGTCAATT]

[+] EMBL AK119965             [CTCACTCGCTGCACACTAGTCCTTCAGTTTCAGTCCCCTCGCATCGCCATAACCACCTCGCCCAAATCGAAGCACACTAGAGAGCCACAAGATCCCTCCTCCCGACACAAACAACCAACCACACTACCCTTCGCGCTGGTCTCGACCACCGGAGATGGCCGCCTAGCTAGTGTGCCGGTGGCAGCTGGAAGGCATGGGCTGCTGCTTCAGCAAGAAGCGCAGGAAGCAGCTGGCCAGTGCAGCTGTGTTCTCCCGCCGCTGCAAGCCGCCGGCCGAGGCCCGCGACCCGCCGCCCCCGCCGCCGTTGCCGGAGGAGGAGAAGGTCAAGGAGGTGCTCTCCGAGACCCCGAGCGCTAAGGTCAGGGCCGAGGCGAAGCCCGTCGCCAATGTGGCTGTCTTGGAGGAGCCGGAGGCGGAGAAGCAGGCGCCGAAGCCTAGCGCCGATGCGGATGTCACGGTGAGCGATCTTGGTAGCTGCATGTCGCTCGCCACCGACGATAGGTCCGAGGCGGCGTCCGAGTCGTCCGTCGCGACCAGCTCGGTGACCGGGCCAGAGCGGTCGCCGGGGAAGCCGGCCAGGAGGAAGCGCCCGGTGTCCGTCTCCGGCGAGCTGGCCCATGCCATTTCCCGGCGCGACCGCGCCGCCGCCGCCGCCTACGGCGTCCGCTCCCGCAGCGCCCGGGCCTCGGCGTCCCCTCCGCCGCGGCGCGAGCAACGGGACCGCTCAGTGCGGAGGTCGCCGTCGCCGGCAGCGAAGCGTACACCGGAGCAGCGCCGCGCCGCGAGCCCAGCCCCGTCCCTCCAGCGGAAGCCGCCCGTCCCGGTGAGGCCGTCGCCGCGGCGGGTGCAGGAAGCGCCTCCTTCTCCGCTCGAGCCCCCGCCTCCACCACCTCCGCAGCCAGAAGAGGACGCCATGACCGCCGACGGCGAGCCCAGCATTGCGGACGCCGCCAGCGCCGGCGGCGACGGCGAGGGGAAGGAGTCGCTGGACAACCCGCTGGTGTCCTTGGAATGCTTCATCTTCCTCTAGTGGCGCTGCACTACCGCCGTCGTGTCCTCCTTCGTCAGGTGGCATCGCGCTATTTTCCTTTGAAAATGTTGCGCTAATCTTGTTTAGTTTAGATGTTCTGTGTTAAGCTGGTGTGGTAATTAGTGGGTAAACTACTTGTGGTGGTGTAATGCTACTGTCATATTCCGGTTATTAACCTATGTCGGGTGGAATGACAGCAGCTTTGACTTTTGGCGTAGGATGGGCCCTCCGATTGGAATTGGACGGCGCTTGAACGTTGGATGTTTCTTTTTGGCTTTTGGACTAGCCCTCGCTGTATTTTGTAGAGCTCTTTTTCACTAATCGTCAATT]
[+] EMBL C74429               [                                   CCCTCGCATCGCCATAACCACCTCGCCCAAATCGAAGCACACTAGAGAGCCACAAGACCCCTCCTCCCGACACAAACAACCAACCACACTACCCTTCGCGCTGGTCTCGACCACCGGAGATGGCCGCCTAGCTAGTGTGCCGGTGGCAGCTGGAAGGCATGGGCTGCTGCTTCAG AAGAAGCGCAGGAAGCAGCTGGCCAGTGCAGCTGTGTTCTCCCGCCGCTGCAA NCGCCGGCCGAGG CCGCGAACCGCCG CCCCG CGGCGTTG CGGAGGAGGAG AGGTCAA GAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AU029701             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCCG TCCCGCAGCNCCCGGGCCTCGGCNTCCCTTCCGCCGCGGCGCGAGCAACGGGACCGCTCAGTGCGGAGGTCCCCTTCGCCGGCAGCGAAGCNTACACCGGAGCAGCGCCGCGCCGCGAGCCNAGCCCCGTCCCTCCAGCGGAAGCCGCCCGTCCCGGTGAGGCCGTCGCCGCGGCGGGTGCAGGAAGCGCCTCCTTCTCCGCTCGAGCCCCCGCTTCCACCACCTCCGCAGCCAGAAGAGGACGCCATGACC CCGACGGCGAGCCCAGCATTGCGGACGCCGCCAGCGCCGGCGGCGACGGCGAGGGGAAGGAGTCGCTGGACAACCCGCTGGTGTCCTTGGAATGCTTCATCTTCCTCTAGTGGCGCTGCACTACCGCCGTCGTGTCCTCCTTCGTCAGGTGGCATCGCGCTATTTTCCTTTGAAAATGTTGCGCTAATCTTGTTTAGTTTAGATGTTCTGTGTTAAGCTGGTGTGGTAATTAGTGGGTAAACTACTTGTGGTGGTGTAATGCTACTGTCATATTCCGGTTATTAACCTAaaaaaana                                                                                                                                               ]




>consensus_3960#0
CTCACTCGCTGCACACTAGTCCTTCAGTTTCAGTCCCCTCGCATCGCCATAACCACCTCG
CCCAAATCGAAGCACACTAGAGAGCCACAAGATCCCTCCTCCCGACACAAACAACCAACC
ACACTACCCTTCGCGCTGGTCTCGACCACCGGAGATGGCCGCCTAGCTAGTGTGCCGGTG
GCAGCTGGAAGGCATGGGCTGCTGCTTCAGCAAGAAGCGCAGGAAGCAGCTGGCCAGTGC
AGCTGTGTTCTCCCGCCGCTGCAAGCCGCCGGCCGAGGCCCGCGACCCGCCGCCCCCGCC
GCCGTTGCCGGAGGAGGAGAAGGTCAAGGAGGTGCTCTCCGAGACCCCGAGCGCTAAGGT
CAGGGCCGAGGCGAAGCCCGTCGCCAATGTGGCTGTCTTGGAGGAGCCGGAGGCGGAGAA
GCAGGCGCCGAAGCCTAGCGCCGATGCGGATGTCACGGTGAGCGATCTTGGTAGCTGCAT
GTCGCTCGCCACCGACGATAGGTCCGAGGCGGCGTCCGAGTCGTCCGTCGCGACCAGCTC
GGTGACCGGGCCAGAGCGGTCGCCGGGGAAGCCGGCCAGGAGGAAGCGCCCGGTGTCCGT
CTCCGGCGAGCTGGCCCATGCCATTTCCCGGCGCGACCGCGCCGCCGCCGCCGCCTACGG
CGTCCGCTCCCGCAGCGCCCGGGCCTCGGCGTCCCCTCCGCCGCGGCGCGAGCAACGGGA
CCGCTCAGTGCGGAGGTCGCCGTCGCCGGCAGCGAAGCGTACACCGGAGCAGCGCCGCGC
CGCGAGCCCAGCCCCGTCCCTCCAGCGGAAGCCGCCCGTCCCGGTGAGGCCGTCGCCGCG
GCGGGTGCAGGAAGCGCCTCCTTCTCCGCTCGAGCCCCCGCCTCCACCACCTCCGCAGCC
AGAAGAGGACGCCATGACCGCCGACGGCGAGCCCAGCATTGCGGACGCCGCCAGCGCCGG
CGGCGACGGCGAGGGGAAGGAGTCGCTGGACAACCCGCTGGTGTCCTTGGAATGCTTCAT
CTTCCTCTAGTGGCGCTGCACTACCGCCGTCGTGTCCTCCTTCGTCAGGTGGCATCGCGC
TATTTTCCTTTGAAAATGTTGCGCTAATCTTGTTTAGTTTAGATGTTCTGTGTTAAGCTG
GTGTGGTAATTAGTGGGTAAACTACTTGTGGTGGTGTAATGCTACTGTCATATTCCGGTT
ATTAACCTATGTCGGGTGGAATGACAGCAGCTTTGACTTTTGGCGTAGGATGGGCCCTCC
GATTGGAATTGGACGGCGCTTGAACGTTGGATGTTTCTTTTTGGCTTTTGGACTAGCCCT
CGCTGTATTTTGTAGAGCTCTTTTTCACTAATCGTCAATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)