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Oryza sativa
cluster # 4055 cluster # 4055       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4055#0 length = 1753 sequences # 3  

consensusID : consensus_4055#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1753
fasta sequence
                              [TCTTCTGCGCCATGCTCCGCCTCCCGGCCTCCTCCCCCGCAGCCGCCAAGGCCGCCGCCGCCGAGGCCGTGATCGCCGAGCTGGGGCTCGCGCCGTGCGCCGACACCATCGTCGGCAACGCGTTCGTCCGCGGCGTGTCGGGGGGCGAGCGGAAGCGCGTCAGCATCGGGCACGAGCTGCTTGTGAACCCGAGCCTCCTCGTCCTCGACGAGCCCACCTCCGGCCTCGACTCCACCGCCGCCGCGCGCCTCGTCGCCACGCTCTCGTCGCTGGCGCGCAGGGGCCGCACCGTCGTCATGTCCGTCCACCAGCCGTCCACCCGCGTCTACCGCATGTTCGACTCCGTCCTCCTCCTCGCCGAGGGGACCTGCCTCTACTTCGGCGCCGGCCGCGACGCCATGGACTACTTCGCCGCCGTCGGCTTCTCGCCGGCCTTCCACGTCAACCCCGCCGACTTCATGCTCGACCTTGCCAACGGATTCGCTCAAACAGAGTATGATAATTGCAACGCAGCCGATGGCGGCAACGTGAAGCAGTCGCTGATCTCGTCGTACAACCGAGTGCTCGCGCCGCGGGTGAAGGCGTCCATCAACGCCGGCGACGTCCACGGCGGCGAGCAGCAGCCACCGCCGCCGGCGGCGGAGAGCTGCAGCGGGTGCACGAGCTGGTCGAACCAGTTCGCGATCCTGCTGCGGCGGAGCCTCAAGGAGCGGCGGCACGAGGCGTTCACGTCGCTGCGGCTGTTCCAGATCATCGCGCCGGCGCTGGTGGCGGGGTCATGTGGTGGCGGTCGTCGCCGGCGGCGGTGGGCGACCGGATGGGGCTCCTCTTCTTCGTCTCCATCTTCTGGGGTGTGTTCGCCTCCTTCAACGCCGTGTTCGCGTTCCCGCAGGAGCGGCCCGTGCTGGCGCGGGAGCGCGCGTCGGGGATGTACGCGCTCTCGTCCTACTTCATGTCGCGCATGGCGGGCGACCTCCCCATGGAGCTCGCGCTCCCCGCCGCGTTCACCGTCATCGTCTACCTCATGGCCGGGCTCAACCCGTCGCCGGCCGCGTTCGCGCTCACGCTCGCCGTGATCCTCTCCTACGTGCTCGTCGCCGAGGGGCTCGGCCTCGCCGTCGGCGCCGTCATGATGGACGCCAAGCGCGCCTCCACGCTCGTCACCGTCGTCATGCTCGCCTACCTCCTCACCGGCGGCTTCTACGTCCACAACGTGCCGGGGTTCATGGCGTGGGCCAAGTACACCTCCTTCACCTACTACTGCTACCGGCTGCTCATCGCCGTGCAGTACAGCGGCCGCCTCGCCCGCCTCCTCCCGCCGGAGGAGGCCCGCGGCGAGGCCAGCCCGGCCGCCTGCGTCGCCGCGCTCGTCGCCATGTTCTTCGCCTACCGGCTGCTCGCCTACCTCGCGCTCCGCCGGGTCAGGAAGTGATCGAGCACCTTGGTTCGATCGCCGCCCGTGGTAATTAGGTAGTAAGCTCTATTAATTAATTCCGGCGAAGTGTAATCAAAGACGTAACGCCGGCGAGCGAGCGAGCTAGCGTGCGCCGCCGGCGACGGAGAAGACGTACGGCTCGATCTGACAATGGTGTAGTTGTTGGCATGGAGATCGACCATGGCTTCTGCCTTCTTCTCGTCCTCTTCGTTTTAATTTTTTTTTCTTTCTTTTTTCTGTTTTTCTCCTGATCCATTGATGGATCGAGGTGTCAAGTGTATTATTACTGCCAAATTAATTAAATTAAACTAAAAAAAT]

[+] EMBL AK120669             [TCTTCTGCGCCATGCTCCGCCTCCCGGCCTCCTCCCCCGCAGCCGCCAAGGCCGCCGCCGCCGAGGCCGTGATCGCCGAGCTGGGGCTCGCGCCGTGCGCCGACACCATCGTCGGCAACGCGTTCGTCCGCGGCGTGTCGGGGGGCGAGCGGAAGCGCGTCAGCATCGGGCACGAGCTGCTTGTGAACCCGAGCCTCCTCGTCCTCGACGAGCCCACCTCCGGCCTCGACTCCACCGCCGCCGCGCGCCTCGTCGCCACGCTCTCGTCGCTGGCGCGCAGGGGCCGCACCGTCGTCATGTCCGTCCACCAGCCGTCCACCCGCGTCTACCGCATGTTCGACTCCGTCCTCCTCCTCGCCGAGGGGACCTGCCTCTACTTCGGCGCCGGCCGCGACGCCATGGACTACTTCGCCGCCGTCGGCTTCTCGCCGGCCTTCCACGTCAACCCCGCCGACTTCATGCTCGACCTTGCCAACGGATTCGCTCAAACAGAGTATGATAATTGCAACGCAGCCGATGGCGGCAACGTGAAGCAGTCGCTGATCTCGTCGTACAACCGAGTGCTCGCGCCGCGGGTGAAGGCGTCCATCAACGCCGGCGACGTCCACGGCGGCGAGCAGCAGCCACCGCCGCCGGCGGCGGAGAGCTGCAGCGGGTGCACGAGCTGGTCGAACCAGTTCGCGATCCTGCTGCGGCGGAGCCTCAAGGAGCGGCGGCACGAGGCGTTCACGTCGCTGCGGCTGTTCCAGATCATCGCGCCGGCGCTGGTGGCGGGGTCATGTGGTGGCGGTCGTCGCCGGCGGCGGTGGGCGACCGGATGGGGCTCCTCTTCTTCGTCTCCATCTTCTGGGGTGTGTTCGCCTCCTTCAACGCCGTGTTCGCGTTCCCGCAGGAGCGGCCCGTGCTGGCGCGGGAGCGCGCGTCGGGGATGTACGCGCTCTCGTCCTGCTTCATGTCGCGCATGGCGGGCGACCTCCCCATGGAGCTCGCGCTCCCCGCCGCGTTCACCGTCATCGTCTACCTCATGGCCGGGCTCAACCCGTCGCCGGCCGCGTTCGCGCTCACGCTCGCCGTGATCCTCTCCTACGTGCTCGTCGCCGAGGGGCTCGGCCTCGCCGTCGGCGCCGTCATGATGGACGCCAAGCGCGCCTCCACGCTCGTCACCGTCGTCATGCTCGCCTACCTCCTCACCGGCGGCTTCTACGTCCACAACGTGCCGGGGTTCATGGCGTGGGCCAAGTACACCTCCTTCACCTACTACTGCTACCGGCTGCTCATCGCCGTGCAGTACAGCGGCCGCCTCGCCCGCCTCCTCCCGCCGGAGGAGGCCCGCGGCGAGGCCAGCCCGGCCGCCTGCGTCGCCGCGCTCGTCGCCATGTTCTTCGCCTACCGGCTGCTCGCCTACCTCGCGCTCCGCCGGGTCAGGAAGTGATCGAGCACCTTGGTTCGATCGCCGCCCGTGGTAATTAGGTAGTAAGCTCTATTAATTAATTCCGGCGAAGTGTAATCAAAGACGTAACGCCGGCGAGCGAGCGAGCTAGCGTGCGCCGCCGGCGACGGAGAAGACGTACGGCTCGATCTGACAATGGTGTAGTTGTTGGCATGGAGATCGACCATGGCTTCTGCCTTCTTCTCGTCCTCTTCGTTTTAATTTTTTTTTCTTTCTTTTTTCTGTTTTTCTCCTGATCCATTGATGGATCGAGGTGTCAAGTGTATTATTACTGCCAAATTAATTAAATTAAACTAAAAAAAT]
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>consensus_4055#0 TCTTCTGCGCCATGCTCCGCCTCCCGGCCTCCTCCCCCGCAGCCGCCAAGGCCGCCGCCG CCGAGGCCGTGATCGCCGAGCTGGGGCTCGCGCCGTGCGCCGACACCATCGTCGGCAACG CGTTCGTCCGCGGCGTGTCGGGGGGCGAGCGGAAGCGCGTCAGCATCGGGCACGAGCTGC TTGTGAACCCGAGCCTCCTCGTCCTCGACGAGCCCACCTCCGGCCTCGACTCCACCGCCG CCGCGCGCCTCGTCGCCACGCTCTCGTCGCTGGCGCGCAGGGGCCGCACCGTCGTCATGT CCGTCCACCAGCCGTCCACCCGCGTCTACCGCATGTTCGACTCCGTCCTCCTCCTCGCCG AGGGGACCTGCCTCTACTTCGGCGCCGGCCGCGACGCCATGGACTACTTCGCCGCCGTCG GCTTCTCGCCGGCCTTCCACGTCAACCCCGCCGACTTCATGCTCGACCTTGCCAACGGAT TCGCTCAAACAGAGTATGATAATTGCAACGCAGCCGATGGCGGCAACGTGAAGCAGTCGC TGATCTCGTCGTACAACCGAGTGCTCGCGCCGCGGGTGAAGGCGTCCATCAACGCCGGCG ACGTCCACGGCGGCGAGCAGCAGCCACCGCCGCCGGCGGCGGAGAGCTGCAGCGGGTGCA CGAGCTGGTCGAACCAGTTCGCGATCCTGCTGCGGCGGAGCCTCAAGGAGCGGCGGCACG AGGCGTTCACGTCGCTGCGGCTGTTCCAGATCATCGCGCCGGCGCTGGTGGCGGGGTCAT GTGGTGGCGGTCGTCGCCGGCGGCGGTGGGCGACCGGATGGGGCTCCTCTTCTTCGTCTC CATCTTCTGGGGTGTGTTCGCCTCCTTCAACGCCGTGTTCGCGTTCCCGCAGGAGCGGCC CGTGCTGGCGCGGGAGCGCGCGTCGGGGATGTACGCGCTCTCGTCCTACTTCATGTCGCG CATGGCGGGCGACCTCCCCATGGAGCTCGCGCTCCCCGCCGCGTTCACCGTCATCGTCTA CCTCATGGCCGGGCTCAACCCGTCGCCGGCCGCGTTCGCGCTCACGCTCGCCGTGATCCT CTCCTACGTGCTCGTCGCCGAGGGGCTCGGCCTCGCCGTCGGCGCCGTCATGATGGACGC CAAGCGCGCCTCCACGCTCGTCACCGTCGTCATGCTCGCCTACCTCCTCACCGGCGGCTT CTACGTCCACAACGTGCCGGGGTTCATGGCGTGGGCCAAGTACACCTCCTTCACCTACTA CTGCTACCGGCTGCTCATCGCCGTGCAGTACAGCGGCCGCCTCGCCCGCCTCCTCCCGCC GGAGGAGGCCCGCGGCGAGGCCAGCCCGGCCGCCTGCGTCGCCGCGCTCGTCGCCATGTT CTTCGCCTACCGGCTGCTCGCCTACCTCGCGCTCCGCCGGGTCAGGAAGTGATCGAGCAC CTTGGTTCGATCGCCGCCCGTGGTAATTAGGTAGTAAGCTCTATTAATTAATTCCGGCGA AGTGTAATCAAAGACGTAACGCCGGCGAGCGAGCGAGCTAGCGTGCGCCGCCGGCGACGG AGAAGACGTACGGCTCGATCTGACAATGGTGTAGTTGTTGGCATGGAGATCGACCATGGC TTCTGCCTTCTTCTCGTCCTCTTCGTTTTAATTTTTTTTTCTTTCTTTTTTCTGTTTTTC TCCTGATCCATTGATGGATCGAGGTGTCAAGTGTATTATTACTGCCAAATTAATTAAATT AAACTAAAAAAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)