cluster # 4066

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Oryza sativa
cluster # 4066 cluster # 4066 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_4066#0 length = 1726 sequences # 3
consensusID : consensus_4066#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1726
fasta sequence
                              [TTTTTTCTTTTATATCACTGGCTCCCTCCAGCTCGTAGTGCTCGCCGCCGATGTCGAGCTCCTAATCGCTGGCGGCCGAAACGCCGGCCGCCTCCGCGGCCCGCATCGCCGGCCGCGACCTCAATCGTCCGTCGAGGAATCCCGTATTGCTCGATCGAATAATCGGGATGGTAATGACGCCGTCGCCTGGCTGCAAGCTGTGGCCGTCGCAGGGCGATGCGGGAACGGCGGCGGCGGCGGCCCTGGACTCCCTCCCGCCGGAGATGCTCGCCGACGTCATCTCCCGTCTCCCCATCCGCGAGACCGTCCGCACTTCGGCGCTCTCCCACGTGTCGCGCCGCTGCTGGGAGTCCGTCCCCTACCTCACCTTCTGTTGGCCACGCCGCACGCCCCCCGGCGCCATCAGCACCGCCCTCCGGCGCTAATCCGGCCTCGTCCGCAAGTTTACCAACTTGTATATCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGCCGTTCCGCTACTCCGACCGCTGGCTGCTCCTCCTCGCCGGGAAGGGGGTCCAATCCCTCTTCCTTGCTTTCTGACGGTCGGACGAGGAGATCCCTATGCTGCATTCTCTATCTTCTCGTGCTGCGAGCTCACCCAGCTCGAACTTGCAGACTGCTACATCCCAGGGTTGCCAACCTGCTTCGCGGGGTTCCCAAATCTAACCAGTCTAAGATTATCAGATGTTGGCTTCCCAGATGGAGCAAAAGGATTGGAGATATTGCTCGCTAGATCGCCATTGCTAAAGAGCCTTTCACTCCTGATGTTGCTGTTTCCTGCTAAAAACGGGGTGTATCACCAGTGGGTTATTCAGGCTCCAAATCTCCAGAACTTTTTTATTACTGGACTGTATGACGATGGTTGGCAGATCGGTGATCTCACGTTCCTTGA-GGAAGCAACAGTCGATTGGCCATTATACTCATATGACCGTGATTTCGTCAAGCTTATTACAGGGTTGTCTCAAGCAAGGGAGCTCGACTTTGCAATGCCGGTGAGAGATGTTAATGTTCTGGAGGGACTGTCGTGCTCCTTTAAGAATCTGAAATGTTTATCGTTATGTACAAGTCTTCACTTG-TTGTCAAATGTTTTGTCGTTTTTTTGTATAATCAGGAATGCCTCTAAACTCGAAACTTTGCGTATTAAGCTCTTTGATGATTCCACTCAAGACGATGAAGTTGATAATGATTTTCTAAATGGACAGTGGACTGATGACTTATTCTCCAATCTTAAAAGTGTTTACGTGAGAAATATGACGTGCAAGTTAAGTGAGATGCATTTTATTGAGTTTATTTTGTCAAAGGCAAGAAATCTTGAAAAAAATGATGTCTGCCTAGCTGAAGATTGTTCGAAATCTAATGAAGAGGCAGTTATAGAACTTGCAAAATAAAATATAGGCGAGCTTCTCCACAAGCCAAGGTATTCTTCAGCCGTGTTGAGTAAGATTAATTTTTGAAGTATCTGTAACTTGCGTGAATTAGGACCCAGGCTCCCAGCTTTGGTCCTCCTCCTAAGAAAAAAGAAAGTCAAGTTAAGCTTGAAACTTCAGGCGCTAGATCTGAATTATGTGGATGAAGCAGCTACGATTATTGTAAGAATTATTTGGATGCGGCACCTATGATTATTGTAAGTCTAACTCTGGGTGCGATGTAGAATTGTGGAAGTAGTAATAGATTGTTACTGAACAAAATGTTGGATTTTTTGTGCT]

[+] EMBL AK068721             [TTTTTTCTTTTATATCACTGGCTCCCTCCAGCTCGTAGTGCTCGCCGCCGATGTCGAGCTCCTAATCGCTGGCGGCCGAAACGCCGGCCGCCTCCGCGGCCCGCATCGCCGGCCGCGACCTCAATCGTCCGTCGAGGAATCCCGTATTGCTCGATCGAATAATCGGGATGGTAATGACGCCGTCGCCTGGCTGCAAGCTGTGGCCGTCGCAGGGCGATGCGGGAACGGCGGCGGCGGCGGCCCTGGACTCCCTCCCGCCGGAGATGCTCGCCGACGTCATCTCCCGTCTCCCCATCCGCGAGACCGTCCGCACTTCGGCGCTCTCCCACGTGTCGCGCCGCTGCTGGGAGTCCGTCCCCTACCTCACCTTCTGTTGGCCACGCCGCACGCCCCCCGGCGCCATCAGCACCGCCCTCCGGCGCTAATCCGGCCTCGTCCGCAAGTTTACCAACTTGTATATCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGCCGTTCCGCTACTCCGACCGCTGGCTGCTCCTCCTCGCCGGGAAGGGGGTCCAATCCCTCTTCCTTGCTTTCTGACGGTCGGACGAGGAGATCCCTATGCTGCATTCTCTATCTTCTCGTGCTGCGAGCTCACCCAGCTCGAACTTGCAGACTGCTACATCCCAGGGTTGCCAACCTGCTTCGCGGGGTTCCCAAATCTAACCAGTCTAAGATTATCAGATGTTGGCTTCCCAGATGGAGCAAAAGGATTGGAGATATTGCTCGCTAGATCGCCATTGCTAAAGAGCCTTTCACTCCTGATGTTGCTGTTTCCTGCTAAAAACGGGGTGTATCACCAGTGGGTTATTCAGGCTCCAAATCTCCAGAACTTTTTTATTACTGGACTGTATGACGATGGTTGGCAGATCGGTGATCTCACGTTCCTTGA GGAAGCAACAGTCGATTGGCCATTATACTCATATGACCGTGATTTCGTCAAGCTTATTACAGGGTTGTCTCAAGCAAGGGAGCTCGACTTTGCAATGCCGGTGAGAGATGTTAATGTTCTGGAGGGACTGTCGTGCTCCTTTAAGAATCTGAAATGTTTATCGTTATGTACAAGTCTTCACTTG TTGTCAAATGTTTTGTCGTTTTTTTGTATAATCAGGAATGCCTCTAAACTCGAAACTTTGCGTATTAAGCTCTTTGATGATTCCACTCAAGACGATGAAGTTGATAATGATTTTCTAAATGGACAGTGGACTGATGACTTATTCTCCAATCTTAAAAGTGTTTACGTGAGAAATATGACGTGCAAGTTAAGTGAGATGCATTTTATTGAGTTTATTTTGTCAAAGGCAAGAAATCTTGAAAAAAATGATGTCTGCCTAGCTGAAGATTGTTCGAAATCTAATGAAGAGGCAGTTATAGAACTTGCAAAATAAAATATAGGCGAGCTTCTCCACAAGCCAAGGTATTCTTCAGCCGTGTTGAGTAAGATTAATTTTTGAAGTATCTGTAACTTGCGTGAATTAGGACCCAGGCTCCCAGCTTTGGTCCTCCTCCTAAGAAAAAAGAAAGTCAAGTTAAGCTTGAAACTTCAGGCGCTAGATCTGAATTATGTGGATGAAGCAGCTACGATTATTGTAAGAATTATTTGGATGCGGCACCTATGATTATTGTAAGTCTAACTCTGGGTGCGATGTAGAATTGTGGAAGTAGTAATAGATTGTTACTGAACAAAATGTTGGATTTTTTGTGCT]
[+] EMBL CB675492             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCTCTCCCACGTGTCGCGCCGCTGCTGGGAGTCCGTCCCCTACCTCACCTTCTGTTGGCCACGCCGCACGCCCCCCGGCGCCATCAGCACCGCCCTCCGGCGCTAATCCGGCCTCGTCCGCAAGTTTACCAACTTGTATATCGGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGCGCCGTTCCGCTACTCCGACCGCTGGCTGCTCCTCCTCGCCGGGAAGGGGGTCCAATCCCTCTTCCTTGCTTTCTGACGGTCGGACGAGGAGATCCCTATGCTGCATTCTCTATCTTCTCGTGCTGCGAGCTCACCCAGCTCGAACTTGCAGACTGCTACATCCCAGGGTTGCCAACCTGCTTCGCGGGGTTCCCAAATCTAACCAGTCTAAGATTATCAGATGTTGGCTTCCCAGATGGAGCAAAAGGATTGGAGATATTGCTCGCTAGATCGCCATTGCTAAAGAGCCTTTCACTCCTGATGTTGCTGTTTCCTGCTAAAAACGGGGTGTATCACCAGTGGGTTATTCAGGCTCCAAATCTCCAGAACTTTTTTATTACTGGACTGTATGACGATGGTTGGCAGATCGGTGATCTCACGTTCCTTGA GGAAGCAACAGTCGATTGGCCATTATACTCATATGACCGTGATTTCGTCAAGCTTATTACAGGGTTGTCTCAAGCAAGGGAGCTCGACTTTGCAATGCCGGTGAGAGATGTTAATGTTCTGGAGGGACTGTCGTGCTCCTTTAAGAATCTGAAATGTTTATCGTTATGTACAAGTCTTCACTTGTTTGTC AATGTTTTGTCGTTTCTTTGTATAATCAAGAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CB675493             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTGGCAGATCGGTGATCTCACGTTCC TGAGGGAAGCAACAGTCGATTGGCCATTATACTCATATGACCGTGATTTCGTCAAGCTTATTACAGGGTTGTCTCAAGCAAGGGAGCTCGACTTTGCAATGCCGGTGAGAGATGTTAATGTTCTGGAGGGACTGTCGTGCTCCTTTAAGAATCTGAAATGTTTATCGTTATGTACAAGTCTTCACTTG TTGTCAAATGTTTTGTCGTTTTTTTGTATAATCAGGAATGCCTCTAAACTCGAAACTTTGCGTATTAAGCTCTTTGATGATTCCACTCAAGACGATGAAGTTGATAATGATTTTCTAAATGGACAGTGGACTGATGACTTATTCTCCAATCTTAAAAGTGTTTACGTGAGAAATATGACGTGCAAGTTAAGTGAGATGCATTTTATTGAGTTTATTTTGTCAAAGGCAAGAAATCTTGAAAAAAATGATGTCTGCCTAGCTGAAGATTGTTCGAAATCTAATGAAGAGGCAGTTATAGAACTTGCAAAATAAAATATAGGCGAGCTTCTCCACAAGCCAAGGTATTCTTCAGCCGTGTTGAGTAAGATTAATTTTTGAAGTATCTGTAACTTGCGTGAATTAGGACCCAGGCTCCCAGCTTTGGTCCTCCTCCTAAGAAAAAAGAAAGTCAAGTTAAGCTTGAAACTTCAGGCGCTAGATCTGAATTATGTGGATGAAGCAGCTACGATTATTGTAAGAATTATTTGGATGCGGCACCTATGATTATTGTAAGTCTAACTCTGGGTGCGATGTAGAATTGTGGAAGTAGTAATAGATTG                               ]




>consensus_4066#0
TTTTTTCTTTTATATCACTGGCTCCCTCCAGCTCGTAGTGCTCGCCGCCGATGTCGAGCT
CCTAATCGCTGGCGGCCGAAACGCCGGCCGCCTCCGCGGCCCGCATCGCCGGCCGCGACC
TCAATCGTCCGTCGAGGAATCCCGTATTGCTCGATCGAATAATCGGGATGGTAATGACGC
CGTCGCCTGGCTGCAAGCTGTGGCCGTCGCAGGGCGATGCGGGAACGGCGGCGGCGGCGG
CCCTGGACTCCCTCCCGCCGGAGATGCTCGCCGACGTCATCTCCCGTCTCCCCATCCGCG
AGACCGTCCGCACTTCGGCGCTCTCCCACGTGTCGCGCCGCTGCTGGGAGTCCGTCCCCT
ACCTCACCTTCTGTTGGCCACGCCGCACGCCCCCCGGCGCCATCAGCACCGCCCTCCGGC
GCTAATCCGGCCTCGTCCGCAAGTTTACCAACTTGTATATCGGGGAGGAGGAGGAGGAGG
AGGCGCCGTTCCGCTACTCCGACCGCTGGCTGCTCCTCCTCGCCGGGAAGGGGGTCCAAT
CCCTCTTCCTTGCTTTCTGACGGTCGGACGAGGAGATCCCTATGCTGCATTCTCTATCTT
CTCGTGCTGCGAGCTCACCCAGCTCGAACTTGCAGACTGCTACATCCCAGGGTTGCCAAC
CTGCTTCGCGGGGTTCCCAAATCTAACCAGTCTAAGATTATCAGATGTTGGCTTCCCAGA
TGGAGCAAAAGGATTGGAGATATTGCTCGCTAGATCGCCATTGCTAAAGAGCCTTTCACT
CCTGATGTTGCTGTTTCCTGCTAAAAACGGGGTGTATCACCAGTGGGTTATTCAGGCTCC
AAATCTCCAGAACTTTTTTATTACTGGACTGTATGACGATGGTTGGCAGATCGGTGATCT
CACGTTCCTTGAGGAAGCAACAGTCGATTGGCCATTATACTCATATGACCGTGATTTCGT
CAAGCTTATTACAGGGTTGTCTCAAGCAAGGGAGCTCGACTTTGCAATGCCGGTGAGAGA
TGTTAATGTTCTGGAGGGACTGTCGTGCTCCTTTAAGAATCTGAAATGTTTATCGTTATG
TACAAGTCTTCACTTGTTGTCAAATGTTTTGTCGTTTTTTTGTATAATCAGGAATGCCTC
TAAACTCGAAACTTTGCGTATTAAGCTCTTTGATGATTCCACTCAAGACGATGAAGTTGA
TAATGATTTTCTAAATGGACAGTGGACTGATGACTTATTCTCCAATCTTAAAAGTGTTTA
CGTGAGAAATATGACGTGCAAGTTAAGTGAGATGCATTTTATTGAGTTTATTTTGTCAAA
GGCAAGAAATCTTGAAAAAAATGATGTCTGCCTAGCTGAAGATTGTTCGAAATCTAATGA
AGAGGCAGTTATAGAACTTGCAAAATAAAATATAGGCGAGCTTCTCCACAAGCCAAGGTA
TTCTTCAGCCGTGTTGAGTAAGATTAATTTTTGAAGTATCTGTAACTTGCGTGAATTAGG
ACCCAGGCTCCCAGCTTTGGTCCTCCTCCTAAGAAAAAAGAAAGTCAAGTTAAGCTTGAA
ACTTCAGGCGCTAGATCTGAATTATGTGGATGAAGCAGCTACGATTATTGTAAGAATTAT
TTGGATGCGGCACCTATGATTATTGTAAGTCTAACTCTGGGTGCGATGTAGAATTGTGGA
AGTAGTAATAGATTGTTACTGAACAAAATGTTGGATTTTTTGTGCT
clustalw multiple alignements is not computed in this case