cluster # 4114

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Oryza sativa
cluster # 4114 cluster # 4114 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4114#0 length = 4956 sequences # 3
consensusID : consensus_4114#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 4956
fasta sequence
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[+] EMBL AK107747             [CTCTAGCATTGAGCGCTGCCGCTTGTGCCTGAAACCTGTTTGTTAAAATGCGTCCGTGCGTCCGCGAGGCGGTTGAGGATGTGCTTGCCTTCCCTGCACCCGTCTGGAGGAAAGTTAGTGCTCGCATGGGTGGATGTAACATCACTTGCTCGTATCAAGTGCTGGAGAAGTGGAAACGGTCTACACGAGCACATAGCCCGGTCCTTCATCTCAAGTGGTGCTAATGCTTGTCTTGCCGTTTCGAGTGGAACCGGGAATCCCTGCACCTGTTGGATGTGAACTGCCCTATACGCTGGGCTGGGTGGATA TTTTTTTAGGGTAGGCTAGGTAGGTTACTGTTGTTTGAAAGGGTAATGGCGATACTGATCGATGTTAGTCATGGATGGTGATTGAAGTCTGAACGTGTAACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AK108628             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGGTGTTGATCTGAGAAGGATGCCAGCAGTATAAGGCAGTCACAATGGTTCATGTTATTGGCACACCAATGCATGCCCAGTTGGTGGCTTGGAGCTGGAATGAATATGACGCATGTTTACCTGGTGCTCCTGTAACCAAAAATCACAGTTCCTGGCTCTTTTGCGGCAGTGGCTGTGTGATATATAAAGAGTGCTGCACAGACT     GATAGTTGACAATTGATTGGCACGAAAGTGGAGAGGAAGATAAATACAATGGTTGTCCACAATACTTCTTTCTAATGGTATATATCTGCTGATTACATCTGTTGATTACATGTTCTAGATTAGCTTATCACATGCTCAGATAAGTTGGTTTTTGTTTATCCCAATACAGAGAACATTTTTTTGAATTTATTATTGCCTGGAATATTAGTGTTTGGGAACGTAAGCTGCCTCAAGAGTCAAGATAGTTTTAGTGGTTTCATGTTTTGTCTCTGCACTTAAACTGCAGAATTACTATGTTATCCAGTTATCCTCTTCATAAGCATAGGGTAAACTAGGAAACCCGGTTAAAGCTACAAGTCTTTGTCCAAAACCACCTACATATTGTGATACACTATAGATTCCATTGAAACTATATATATACAAGGGGAAGTATATATACAAGGGGAAGTACTTACATGTTTTAAAGTTTAATGGATCATTTGCTCTGGTATATAACTTATTATGATGGCTACATATTTCTTCCTTCGAATGTATATCATATGTTTGCTTTTCTCCTATTTGCTGCACCACTATTGATGGTTTTACCAGATGAAAATAATTATGCACTGTGCCTTCTACTGAGACAAAAGAACCTCCGGGAACAGAAACCGAAGATTTGCACTAGAAATACTCATTGGCAGATATGTTCCAGATAAGTGGTTTTTTGAAGCATTTAATATGCTACGTCTGTAGAGGCCCCAAATCATGAATACTTAGGAGAATGGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]




>consensus_4114#0
CTCTAGCATTGGGCGCTGCCGCTTGTGCCTGAAACCTGTTTGTTAAAATGCGTCCGTGCG
TCCGCGAGGCGGTTGAGGATGTGCTTGCCTTCCCTGCACCCGTCTGGAGGAAAGTTAGTG
CTCGCATGGGTGGATGTAACATCACTTGCTCGTATCAAGTGCTGGAGAAGTGGAAACGGT
CTACACGAGCACATAGCCCGGTCCTTCATCTCAAGTGGTGCTAATGCTTGTCTTGCCGTT
TCGAGTGGAACCGGGAATCCCTGCACCTGTTGGATGTGAACTGCCCTATACGCTGGGCTG
GGTGGATATTTTTTTTAGGGTAGGCTAGGTAGGTTACTGTTGTTTGAAAGGGTAATGGCG
ATACTGATCGATGTTAGTCATGGATGGTGATTGAAGTCTGAACATGTAACGGTTTCCTGT
TTCAGGGTTTTGTGGTGTTGATCTGAGAAGGATGCCAGCAGTATAAGGCAGTCACAATGG
TTCATGTTATTGGCACACCAATGCATGCCCAGTTGGTGGCTTGGAGCTGGAATGAATATG
ACGCATGTTTACCTGGTGCTCCTGTAACCAAAAATCACAGTTCCTGGCTCTTTTGCGGCA
GTGGCTGAGTGATATATAAAGAGTGCTGCACAGACTGTGCAGATAGTTGACAATTGATTG
GCACGAAAGTGGAGAGGAAGATAAATACAATGGTTGTCCACAATACTTCTTTCTAATGGT
ATATATCTGCTGATTACATCTGTTGATTACATGTTCTAGATTAGCTTATCACATGCTCAG
ATAAGTTGGTTTTTGTTTATCCCAATACAGAGAACATTTTTTTGAATTTATTATTGCCTG
GAATATTAGTGTTTGGGAACGTAAGCTGCCTCAAGAGTCAAGATAGTTTTAGTGGTTTCA
TGTTTTGTCTCTGCACTTAAACTGCAGAATTACTATGTTATCCAGTTATCCTCTTCATAA
GCATAGGGTAAACTAGGAAACCCGGTTAAAGCTACAAGTCTTTGTCCAAAACCACCTACA
TATTGTGATACACTATAGATTCCATTGAAACTATATATATACAAGGGGAAGTATATATAC
AAGGGGAAGTACTTACATGTTTTAAAGTTTAATGGATCATTTGCTCTGGTATATAACTTA
TTATGATGGCTACATATTTCTTCCTTCGAATGTATATCATATGTTTGCTTTTCTCCTATT
TGCTGCACCACTATTGATGGTTTTACCAGATGAAAATAATTATGCACTGTGCCTTCTACT
GAGACAAAAGAACCTCCGGGAACAGAAACCGAAGATTTGCACTAGAAATACTCATTGGCA
GATATGTTCCAGATAAGTGGTTTTTTGAAGCATTTAATATGCTACGTCTGTAGAGGCCCC
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ATCTTTTTTGTTTTATCAAATTTTGTGTAACTCATTGGTTTGCACTGGGTATGCTTCTTG
CAGAGAGTTATGGTGTTGGAACATGGTTGTGTCATTCGCACTTAATTGGTTTGTGTCTTG
CAGAGAGTTGTGATCTTTTGTATTAGCTTATCTTTTCCCTGAGCAATTCTTTTGGACTCT
CCTTGACTGCTCTAGACTGTTTATAGAGATCATGTTTAGACTGTTTTGTGGTAAAGTACA
GACCAAATAACTAACAATGTGGTCACAAAGATAAAAATAACTATGACTTACCCTACAACT
GCTCCCATTTATAATATACTGTTATTTTTTAAAGAGTGCAAACTTATGTTACTGACACCA
TTGGAAGAGCACTGCAGTGTGCAATAGATTTTGAGATCCTATTTGCAGAACTATAAATCC
TGACTTCAATCCAAGTATTCAACTTAGCCTTTGGCAGTAACATTGAGCATTTCACAACTA
TGAAAAATACAAAAAAAATAATGAGATACAACTGTAATAACCATACAACCAAGGTTCTGA
AAGCAATGGCAGAAAATTCCGACATCCAGCTTATCAGCTAACTGAACATTTCCTTCGTCT
TTACCAATCTTAAGTCTAATAGGACAGTTTCTAGACCTGCTAGGCTGCTGCGCAAAACTA
ACCGTTTGGACTTCATCTCAAGAAAAAAGTTCTTTCAGTATTNTAGGTGCAAACTTTTGC
TTTTGTGTATTATCAAGATAACAGAAGAAGTTCTGGAAGCATGCCAGCTTTATGAAGGAT
GAATAATCTCTTTAACTACTATTTAGTCATTTGTTCATTATAGATATTAAAAGGAAGGTT
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TTCTTTTTTAAAAGGAAGATCTTTTTTACTTTTTATATTAGATCATTGTAATGAATGTAA
CTTTGGACCTTTGGTATTTCTGCTTGTTGAAAGGGCAACCATGGTTAGTGAGCTTCATTC
AATCTCTGTTGGTGGTGAATAGTGATTCTTCCCTTGTTGTGTCATGAATGTTGTTTTTTT
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AGAGAAACAAACTAATTCACCTTTTTACTAGGTTTTCCAAGAGGAAACTTATTTATTCAC
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CACCTGTGCACCATGCACAGTACCCTTTTTCTTCTTGTTCACATACATCATGTAAGATGG
TAGTTTCTTTTTCCTATACCAAGTCTCAGATCGTGCAAGTTCGGTACACTTCAGTTTCAT
CTATAGCATGTAGATAGTAGAAGGCCCCTATACCATATTCCCTTTATTAGTAACTTAGTT
TTCTTTCCATTTTACGGGTACAGCCATATTTCGTTCTATTTCATGCATCCAAAGTAGTAG
CCGGTCTCAGCATCCTTTTCCTTCTTGATGACGCTAAAGCTGAATATTGCGTCTGCTTGA
GTGGCTCCAGGCCTCCGGTTCCATATCTCTTGCAAATTCTGCAGGTCCGATTGTGCCAAA
AGGAATGCCAATTGTTCGGAGAACATACATCTTAGCTGCTGGATTATTGCTTGGCATCAG
GGCTGTGGGAATCACTGACTACCTGGAGATAACGATTCCTCTGGCATATTTATCTGTGGC
ATGGCTTCAGCCAGTTGTATCAATTGCGTCAGAACATGGGAATGCTGAATGCTCGAATAC
CACCAAGGAAACTAGTTTCCAATCGGGCATGAGCAGAATATGTTCAGCAACCTCTATAAT
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GACGACATCTACCTGCCCAGTACAATAATTCTGCATCTATGCAAATATGCAATAGTCCAT
GTTGAAGCATGCAATATTTCTATCTGCTACCCCATCAACCACGGGAAGCATGTCAACTAC
GCCAGAAGCTGAGAGTTCGCTGTACCTACCAAGATGATCGATCTTCTATAACCAAATTGG
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TGGCGTCGATGATGCTTTCACTCTCCCTGCCGTGCCCAATGGCAGAGCAAATGCTGGAAA
GGAGCGCACCACCGCCAGTACTGGCACTTTCCTCCACCTCGCACGAACAAAAGTCGCTGG
AGCACAACACAAAGCGGCAGTAGCACCGGTGCCACTCTACACACACCCCGTACCGCGTGA
TGGTCACCGTTGCCATCTCCCAGGGAGGAGAAGGGCCAAAAGAATATTAAAGTAAACCAG
AGGACGAAAGCGAAAGCAAAGGCAAAGCACGGGGCTTGCGCCCTGCGTCGCGTTGGATTT
GCATGAATCTTGCGTGCCCCGGGGAGGGGCCCCTCGGCCGGCCGGCAAGTTGCAGCCAGA
GCTGGCTCTCGGCTTGTGGCTGGAGCCAAGGCAGCAGCACTGCCTTGTGTAAATGAGCAG
TACATGGCAATGGCCGCCATGCATTGTGGTTGTGGAGGCACAGAGGTAAAAGGCGAAGGC
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GAATTCAGAGACTGGGTCATGTGGCGCGCGCAGGCTGCAGCACCGGTGAGTTTTTCAGTC
TAGTTTTCAGGTCAGCTTTCCACGCTCTGTCGTGGCCGGGCGAGACACCCCATTCGCCGG
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GTTGAAACTGCGCAAAAGAGCAGCAGACGATGACTCGTGAAGGAGAAAGCGGAGAGTGGT
CACCGGTCAGGTCAGGTGATGCCTTAACGCGTGACGTGACCGAACTGGAATTTCCCGACG
AAGAGCTGAGTCCCCTGCGAGAGCTGAGTCAGATACCACGCGATGCAACAGAGCAAAGTG
GCATTGAGCCGCTGACACACTCACTTATCTCCGGTCTGTGATCTCCTATTTCACCATGCA
TTCGGTCGGGAATCGGGATCGCCGACGGCGTCGGCGTTGAGATACACTGACCTCCGGCTG
AGGCTGGTCGGTGCGGCTTGCCGAACAAACAATCAAGTGAAAGATTCATGCAGTGAATTG
TATAGTCGCATCGATCAAGCAGAGCCTTTCGCTTTC
clustalw multiple alignements is not computed in this case