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Oryza sativa
cluster # 4169 cluster # 4169       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4169#0 length = 5078 sequences # 3  
consensusID : consensus_4169#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 5078
fasta sequence 
                              [TGAAAAGGAAGAAAACTAATCCTCCCCCAAACTTTCTCTGTTCTCTCCTCTGTTCTTCCTATCCCCTTCTGTTCTTCCCAAAATCCCCATCTATTTCTGAAATCATCGCTGCGAATATTACAGTGGTATCAGATTCAGGTCGTTCGTGGTCGATTTAGGCTCATATTCTCTCGATCCGGCTGGTAAAATTCCTATGCTCAGGTAGGCGGCTACCCTTGGGTGCGGCTGCTGTAAATCCGGTTCTGGTTCGGCTGGATTTGGAGGAGTCTTTCACCACGGCGCCGATCAAACTCTCCGCTCCCTTGCGCCAATCTCTCGACGCCATGGAGGCTAAGCTTCTCGAGAAGCTGGACTCCCTCACGCTGTGTATGGAGGCTTTGGACGACAAGTTAACCAAGCAGAGCGGCCGAATTGATCAAGTCGCTACCAAGGTGGATCTCGCCATGGATGCTGTGGCCGCTTTGCAGAAGGAGCAAGTGCAGGCGGCGCAGCTGCACAAGCAAGCCATGGCTTCAGAACCGGTGAGTATTTTGGGTTCCCCGTCTTCTCTATCAGTGGCAAGTCTGGGCACAACAACACCACCACCACCACCACCTCCTCCTCCTCCACCGCTGGTTTTTTCTAAGTCAATATCTCGTTGGGGGAATGGTGAATCTAGTGCGGGTTGTGATGGGGGGTTGCGCGCTAAGAGTTGTCTTCCGAAGATGGATTTTCCACGTTTTGATGGGGCTGATGTGAGAGTCTGGATTGATATGTGTGAGACATTTTGAGATGTACCAGATTCCTCCTGTATTTCAAGTTTCAGCAGCTGTTCTTCACATGTCGGGGAATGCTGCCCAGTGGTATCAATCGTTTAAGCTCGTGGAGGAAGTTGCTAATTGGTCTCAGTTTCGACATGCTGTTGTTTGTGAGTTTGAGAGCACCTCGCAACGTGAGAAGATTCAGGCTCTGCAAACTTTAAGACAGGCAGGTTCTGTGGCTGAATATAAGCATCAATTTGATTCTCTTGTCTATCAGATCCGTGTATTTGATCCATCAGTGGGAGGTTTGATGCTGGTGTATCGTTTTTATGTTGGGGCTTAAGGAGGACATTCGTGCAGCAGTGATGGTTCAGTTGCCTACCACAGTTCAGCAAGCTGCTGCTGTGGCATTGATGCAAGAGAGTGTTCTACTTGAATTGAGTACTAAGCAATCTAAGCGATTGATGTATAAACCATTGCCTACCAAAGGGGAGTTGCCTCAGGGTGGTACTGATACTCCTGCTATTAAGCCTGAACGAGCAGAACTATGGAAGGCTCGACAGTTAAGGGATTATCGAAGAGCCAATGGTCTTTGTTTCAAATGTGGGGATAAATATTCTCCTGAGCACCAGTGTGCGCTGGGTGGTCAGATTAAAGCTATGCAAGTTACTGAAGTGATTCCGGATGATCTTTTGAATGCAGTGACTGCTGAAGAAGACTCTGACCAGGATGAGAATTGTCATATTTCACTCAATTCCCTGTCTGGTGCTAGTCATGTGAACACTATCAGACTCCGAGCTTTGGTCCAGAATAAGGTGTTGCTCTTACTGGTCGACTCTGGCAGTTCTCATAGTTTCTTGGACTATAACTTTGCTCAACTCTTGGGATTGCAGTTGCAGCCCATTGCTCCCTCCCTGGTTAAAGTAGCTAATGGTGATTGTATACACTGTCAGTTTATGGTTCCTCAGTTTACTTGGTGGTTTCAAGGGCGTACTTTCACTTATGATATGAGAGTTGTTCCTTTGGGTGGACATGATGCTATTTTGGGGATGGACTGGTTGGCACAGTGGGGTGATATGTCTTGCAATTGGGCCAACAAAACTTTGAAGTTTATGTATCAGGGTACTTGGGTTGAACTTCAGGGAGTCCCTGATTCTCCTCCCCAAACTGAGTTGAGTGCTATGTCTTTGTCTCAGGTTCTTAAGTGTCAAAAAGGGTGTGATATATGGGCAGCTGCACTGCTGGAAACAGCTGACTTCCCTTCTGCTGATTCAGTTCCACCTGCTGTTTCTCAGTTAGTGCATGAGTTTGCTGATGTTTTTCAAGATCCACACAGTTTACCACCTCACAGAGTTTATGATCACGCTATTACTCTTTTCCCTGGTTCAGCTCCTGTGAATAGCAAACCTTATCGGTATTCTCCTTTGCAAAAAGATGAGATTGAAAGTCAGGTCAAGGACATGATTGATTCTGGGTTGATCACTCCCAGTATGAGCCCTTTTGCTTCTCCTGTTTTATTGGTTAAAAAGAAGGATGGCACGTGGCGTTTTTGTGTGGATTATCGCAAACTCAACTCTATTACTGTGAAAAGTAAGTTTCCTATGCCTATTGTTGATGAATTGCTTGATGAGCTTGCTGGTACTCGTTTCTTCTCTAAACTTGACTTGAAAGCTGGCTATCATCAAATATGGATGGTGGAGGATGATGAATATAAAACTGCTTTTAAAACACACCATGGTCAATTTCAATTCCATGTGATGCCGTTTGGGTTGACCAATGCCCCTTCTACTTTTCAATGTGTGATGAATTCAGTGTTTGCACCCTTAATCAGGAAGTATGTTTTGGTGTTTATGGATGATATTCTAGTGTACAGTCCTGATTTACCGTCTCATCTCACACACTTGAAACAAGTTTTTGAACTGCTGAGACAACACAAGTTATATGCCAAAAGGTCCAAGTGTTCTTTTGCCTGTTCTCAATTGGAGTATTTGGGACACATAATTTCAGATCAAGGAGTCAGTACTGATCCTACTAAGACTGCAGCTATGTTGGCTTGGCCAGTCCCTGCCAATGTGACAGAACTCAGAGGGTTTTTGGGGCTTACAGGGTATTATAGAAAGTTTGTTAAAAATTATAGTATCCTGGCAAAACCTTTAACTGTCTTACTACAGAAGAAAGCGTTCCAGTGGTCTGATGATGCTCAGCAGGCTTTTCAGAAGCTGAAACTTGCTATGAGTTCAACTCCTGTACTGGCTTTGCCCGATTTCTCCCAACCTTTTATTTTGGAAACTGATGCTTGTGCGTTTGGAGTGGGAGCTGTCCTCAGTCAGCATAATCATCCTATTGCATATTATAGCAAGACATTGGGAGTGGCTAATCAGAAGCTTTCTATATATGAAAAAGAGTTCCTGGTGATTATGATGGCTGTGGATAAGTGGCGTTGTTATTTGTAACGATGCCCTTTTATCATTCGCACTGATCACAAAAGTCTTTGTCATCTCAATATCAGGTTCTGGGGACTGATTTACAGCAAAAGGCAATGACTAAATTGATGGGGTTACAATATACTTTCCAGTATAAGAAAGGAGTGGAGAACGTGGTAGCTGATGCTTTGTCTCGAGTGCCTCCTCAGTCTCACTTATCTGCTCTGTCAGTGGCTAGCCCCATTTGGTTGCAGGAAGTGTTAAACTCGTATGCTGTGGATACTCAGGCTCAGAAGTTATTGGTAGAATTGGCAGTCCATTCTCCTAATGATCAGGGTTATTCTTTGACTGATGGTCTCATTCGTCATCATGGTCGCATTTGGATAGGAGCTAATCTGGGTTTGCAGACTAAGTTAATCACTGCTTTTCATTCCTCTCCAATTGGTGGTCACTCGGGCACTATGGCCACTTATCACCGGCTCAAAAAGTTGTTCTCTTGGGTTGGTCTGAAAACTGCAGTATTCAACTTTGTTAAACAGTGTCAAATCTGCCAACAAGCTAAACATGAGCATTGTCGATTGCCTGGGTTGTTAGTTCCTTTACCAGTACCGAAAGAAGCTTGGATCGACATCTCGATGGATTTTATTGAAGGTTTGCCCAAATCTGATGGTTACACTGTTATACTTGTTGTGGTGGATCGTTTCACTAAATTTGCTAGTTTCATTCCTTTGAGACACCCTTATACTGCTTCACAAGTAGCGGTCACAGTGGATAAATTTGTGTTTAAGACCCATGGCTTACCACAGTCAATTGTGTCGGATCATGACAAAGTGTTCACTAGTCGTTTTTGGGGTGATTTGTTTAAAGTATGGAACACTCAATTGAACATGAGTACGGCATATCATCCTCAAACCGACGGGCAAACCGAAAGAGTGAATCAGTGTCTCGAGATGTATTTGAGGTGCATGATTCAAGCTACTCCCACCAAATGGAACAGTTGGCTGCATTTGGCTGAGTACTGGTATAATACATCTTTTCATACATCTTTGGGTTGTTCCCCTCACAAAGCTTTGTTTGGAGTGGAACCTCATATCAGTCAAGTGCCGGTGCTGCTGTCCTCAGTTCATCATTCTGTGGTGGACTTAATTTCTGAACGCAATCAGTTGTCTGTCTTTTTACAGCAACAGTTACAACGAGCACAATTGCGTATGAAGCATAAGGCTGATAAAGGGCGATCTGAGCGTTCCTTTTCTGTTGGTGATCATGTCTTTCTTCGCTTGCAACCTTATGCTCAGTCTTCGGTGGTGAATCGCCCATATCCCAAACTGGCATTCAAGTTCTTTGGACCATTTCAAATCTTGGAGAAAGTTGGGTCGGCAGCTTATCGTCTGGCTTTACCTGAAGGCAGTGCGGTCCATCCTGTGTTTCATGTGTCTCAACTCAAAGCTCATGTGCCAGATCACACTCCAGTGTTTACTTCTCTACCCACACCGGTTGTACTGGATGCTGCCGATGTGTGGCCTGAACTGATTCTGGACAGGCGTCTGGTAAAAAAGGGGAATGCAGCTCATGTTCAGGTGCTTATCAAGTGGTCATCTCTGTCTGCTGATGATGCCACCTGGGAGGATTATGATGTGTTGAAGACACGATTCCCTTCTGCGCCAGCTTGGGGACAAGCTGCATCTTTGGCGGGCGGTACTGTCACAGCTGATGGTATTCAGTGCGACGCGCCACAGTAGTCGTGATGGACAGCTACAGTAGCGTTCCAGGAATAGAGTGAAATGGGCCTGCGCGCTCACATGAGTTATGTTGGGTTGTTGGGCCTGCGAGCTCATG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GATGGGGTTACAATATACTTTCCAGTATAAGAAAGGAGTGGAGAACGTGGTAGCTGATGCTTTGTCTCGAGTGCCTCCTCAGTCTCACTTATCTGCTCTGTCAGTGGCTAGCCCCATTTGGTTGCAGGAAGTGTTAAACTCGTATGCTGTGGATACTCAGGCTCAGAAGTTATTGGTAGAATTGGCAGTCCATTCTCCTAATGATCAGGGTTATTCTTTGACTGATGGTCTCATTCGTCATCATGGTCGCATTTGGATAGGAGCTAATCTGGGTTTGCAGACTAAGTTAATCACTGCTTTTCATTCCTCTCCAATTGGTGGTCACTCGGGCACTATGGCCACTTATCACCGGCTCAAAAAGTTGTTCTCTTGGGTTGGTCTGAAAACTGCAGTATTCAACTTTGTTAAACAGTGTCAAATCTGCCAACAAGCTAAACATGAGCATTGTCGATTGCCTGGGTTGTTAGTTCCTTTACCAGTACCGAAAGAAGCTTGGATCGACATCTCGATGGATTTTATTGAAGGTTTGCCCAAATCTGATGGTTACACTGTTATACTTGTTGTGGTGGATCGTTTCACTAAATTCGCTAGTTTCATTCCTTTGAGACACCCTTATACTGCTTCACAAGTAGCGGTCACAGTGGATAAATTTGTGTTTAAGACCCATGGCTTACCACAGTCAATTGTGTCGGATCATGACAAAGTGTTCACTAGTCGTTTTTGGGGTGATTTGTTTAAAGTATGGAACACTCAATTGAACATGAGTACGGCATATCATCCTCAAACCGACGGGCAAACCGAAAGAGTGAATCAGTGTCTCGAGATGTATTTGAGGTGCATGATTCAAGCTACTCCCACCAAATGGAACAGTTGGCTGCATTTGGCTGAGTACTGGTATAATACATCTTTTCATACATCTTTGGGTTGTTCCCCTCACAAAGCTTTGTTTGGAGTGGAACCTCATATCAGTCAAGTGCCGGTGCTGCTGTCCTCAGTTCATCATTCTGTGGTGGACTTAATTTCTGAACGCAATCAGTTGTCTGTCTTTTTACAGCAACAGTTACAACGAGCACAATTGCGTATGAAGCATAAGGCTGATAAAGGGCGATCTGAGCGTTCCTTTTCTGTTGGTGATCATGTCTTTCTTCGCTTGCAACCTTATGCTCAGTCTTCGGTGGTGAATCGCCCATATCCCAAACTGGCATTCAAGTTCTTTGGACCATTTCAAATCTTGGAGAAAGTTGGGTCGGCAGCTTATCGTCTGGCTTTACCTGAAGGCAGTGCGGTCCATCCTGTGTTTCATGTGTCTCAACTCAAAGCTCATGTGCCAGATCACACTCCAGTGTTTACTTCTCTACCCACACCGGTTGTACTGGATGCTGCCGATGTGTGGCCTGAACTGATTCTGGACAGGCGTCTGGTAAAAAAGGGGAATGCAGCTCATGTTCAGGTGCTTATCAAGTGGTCATCTCTGTCTGCTGATGATGCCACCTGGGAGGATTATGATGTGTTGAAGACACGATTCCCTTCTGCGCCAGCTTGGGGACAAGCTGCATCTTTGGCGGGCGGTACTGTCACAGCTGATGGTATTCAGTGCGACGCGCCACAGTAGTCGTGATGGACAGCT 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                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         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>consensus_4169#0
TGAAAAGGAAGAAAACTAATCCTCCCCCAAACTTTCTCTGTTCTCTCCTCTGTTCTTCCT
ATCCCCTTCTGTTCTTCCCAAAATCCCCATCTATTTCTGAAATCATCGCTGCGAATATTA
CAGTGGTATCAGATTCAGGTCGTTCGTGGTCGATTTAGGCTCATATTCTCTCGATCCGGC
TGGTAAAATTCCTATGCTCAGGTAGGCGGCTACCCTTGGGTGCGGCTGCTGTAAATCCGG
TTCTGGTTCGGCTGGATTTGGAGGAGTCTTTCACCACGGCGCCGATCAAACTCTCCGCTC
CCTTGCGCCAATCTCTCGACGCCATGGAGGCTAAGCTTCTCGAGAAGCTGGACTCCCTCA
CGCTGTGTATGGAGGCTTTGGACGACAAGTTAACCAAGCAGAGCGGCCGAATTGATCAAG
TCGCTACCAAGGTGGATCTCGCCATGGATGCTGTGGCCGCTTTGCAGAAGGAGCAAGTGC
AGGCGGCGCAGCTGCACAAGCAAGCCATGGCTTCAGAACCGGTGAGTATTTTGGGTTCCC
CGTCTTCTCTATCAGTGGCAAGTCTGGGCACAACAACACCACCACCACCACCACCTCCTC
CTCCTCCACCGCTGGTTTTTTCTAAGTCAATATCTCGTTGGGGGAATGGTGAATCTAGTG
CGGGTTGTGATGGGGGGTTGCGCGCTAAGAGTTGTCTTCCGAAGATGGATTTTCCACGTT
TTGATGGGGCTGATGTGAGAGTCTGGATTGATATGTGTGAGACATTTTGAGATGTACCAG
ATTCCTCCTGTATTTCAAGTTTCAGCAGCTGTTCTTCACATGTCGGGGAATGCTGCCCAG
TGGTATCAATCGTTTAAGCTCGTGGAGGAAGTTGCTAATTGGTCTCAGTTTCGACATGCT
GTTGTTTGTGAGTTTGAGAGCACCTCGCAACGTGAGAAGATTCAGGCTCTGCAAACTTTA
AGACAGGCAGGTTCTGTGGCTGAATATAAGCATCAATTTGATTCTCTTGTCTATCAGATC
CGTGTATTTGATCCATCAGTGGGAGGTTTGATGCTGGTGTATCGTTTTTATGTTGGGGCT
TAAGGAGGACATTCGTGCAGCAGTGATGGTTCAGTTGCCTACCACAGTTCAGCAAGCTGC
TGCTGTGGCATTGATGCAAGAGAGTGTTCTACTTGAATTGAGTACTAAGCAATCTAAGCG
ATTGATGTATAAACCATTGCCTACCAAAGGGGAGTTGCCTCAGGGTGGTACTGATACTCC
TGCTATTAAGCCTGAACGAGCAGAACTATGGAAGGCTCGACAGTTAAGGGATTATCGAAG
AGCCAATGGTCTTTGTTTCAAATGTGGGGATAAATATTCTCCTGAGCACCAGTGTGCGCT
GGGTGGTCAGATTAAAGCTATGCAAGTTACTGAAGTGATTCCGGATGATCTTTTGAATGC
AGTGACTGCTGAAGAAGACTCTGACCAGGATGAGAATTGTCATATTTCACTCAATTCCCT
GTCTGGTGCTAGTCATGTGAACACTATCAGACTCCGAGCTTTGGTCCAGAATAAGGTGTT
GCTCTTACTGGTCGACTCTGGCAGTTCTCATAGTTTCTTGGACTATAACTTTGCTCAACT
CTTGGGATTGCAGTTGCAGCCCATTGCTCCCTCCCTGGTTAAAGTAGCTAATGGTGATTG
TATACACTGTCAGTTTATGGTTCCTCAGTTTACTTGGTGGTTTCAAGGGCGTACTTTCAC
TTATGATATGAGAGTTGTTCCTTTGGGTGGACATGATGCTATTTTGGGGATGGACTGGTT
GGCACAGTGGGGTGATATGTCTTGCAATTGGGCCAACAAAACTTTGAAGTTTATGTATCA
GGGTACTTGGGTTGAACTTCAGGGAGTCCCTGATTCTCCTCCCCAAACTGAGTTGAGTGC
TATGTCTTTGTCTCAGGTTCTTAAGTGTCAAAAAGGGTGTGATATATGGGCAGCTGCACT
GCTGGAAACAGCTGACTTCCCTTCTGCTGATTCAGTTCCACCTGCTGTTTCTCAGTTAGT
GCATGAGTTTGCTGATGTTTTTCAAGATCCACACAGTTTACCACCTCACAGAGTTTATGA
TCACGCTATTACTCTTTTCCCTGGTTCAGCTCCTGTGAATAGCAAACCTTATCGGTATTC
TCCTTTGCAAAAAGATGAGATTGAAAGTCAGGTCAAGGACATGATTGATTCTGGGTTGAT
CACTCCCAGTATGAGCCCTTTTGCTTCTCCTGTTTTATTGGTTAAAAAGAAGGATGGCAC
GTGGCGTTTTTGTGTGGATTATCGCAAACTCAACTCTATTACTGTGAAAAGTAAGTTTCC
TATGCCTATTGTTGATGAATTGCTTGATGAGCTTGCTGGTACTCGTTTCTTCTCTAAACT
TGACTTGAAAGCTGGCTATCATCAAATATGGATGGTGGAGGATGATGAATATAAAACTGC
TTTTAAAACACACCATGGTCAATTTCAATTCCATGTGATGCCGTTTGGGTTGACCAATGC
CCCTTCTACTTTTCAATGTGTGATGAATTCAGTGTTTGCACCCTTAATCAGGAAGTATGT
TTTGGTGTTTATGGATGATATTCTAGTGTACAGTCCTGATTTACCGTCTCATCTCACACA
CTTGAAACAAGTTTTTGAACTGCTGAGACAACACAAGTTATATGCCAAAAGGTCCAAGTG
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clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)