cluster # 4246

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Oryza sativa
cluster # 4246 cluster # 4246 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4246#0 length = 774 sequences # 3

consensusID : consensus_4246#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 774
fasta sequence

                              [GCGCCAGGACGAGCGCCTCCCCCGCGGCGGCGAGCAGAAGTCCGTCGTCATACTCTCCCACGCGCCCTACTCCTCCCTGTTCCGCCTGCTGCTGCAGATCCTCGGCCCGCTCTGCTTCGACGTCGGCCCCTCCGCGCTGTCCATGGTGGCGTCCCACGTTGCCGCCTGGCCAGCGCCGGTGCCGGGCCGCCCCATGGAGCTTCCAATCGGCAGCGCGGCTCTGCGGGTGCACCTCCCGCCCGCGGCCGACGACCCTGGCCCGCCGCCCGCGCTGCTGCCGGCGAACCCGTCGGTGCCGTACGGCCTCTTCCACGACGCCGACCTGTTTGCGGCTTTCCGCGGCCTGCTTCTCCACCTATGGACGCTCTGGGAGCTCATGGTGGTTGGCGAGCCTGTACTGGTGGTTGCACCGTCTCCACCTCAATGCTCGGAGGCTGTGGCTGGGCTTGTTAGCCTTGTTGCTCCGCTCTTGTACAGCGTGGATTTCCGGCCGTACTTCACCATCCATGATCCAGATTTCGCTCGCCTGAATGCGCTTGCTGAAGGCGAGGTTTTTCCTCCGATGGTGCTTGGTGTGACCAACTTGTTTTTCTTGAAGAGTCTTAAGAGCATTCCCAATGTCGTGTCCGTGGGGAGCCCAAACCCGAATTCCACTAGGGTGCTCCCAGTGGGTGGCCAGTCCCACGGATCAGGCAATGGGATCAATGGGACGCCTGNGAAAGCTCAGCTTGACAAACTCGCAATCAACAAGTTTTCTCCGACTGGCCTATTGAA]

[+] EMBL CB656538             [GCGCCAGGACGAGCGCCTCCCCCGCGGCGGCGAGCAGAAGTCCGTCGTCATACTCTCCCACGCGCCCTACTCCTCCCTGTTCCGCCTGCTGCTGCAGATCCTCGGCCCGCTCTGCTTCGACGTCGGCCCCTCCGCGCTGTCCATGGTGGCGTCCCACGTTGCCGCCTGGCCAGCGCCGGTGCCGGGCCGCCCCATGGAGCTTCCAATCGGCAGCGCGGCTCTGCGGGTGCACCTCCCGCCCGCGGCCGACGACCCTGGCCCGCCGCCCGCGCTGCTGCCGGCGAACCCGTCGGTGCCGTACGGCCTCTTCCACGACGCCGACCTGTTTGCGGCTTTCCGCGGCCTGCTTCTCCACCTATGGACGCTCTGGGAGCTCATGGTGGTTGGCGAGCCTGTACTGGTGGTTGCACCGTCTCCACCTCAATGCTCGGAGGCTGTGGCTGGGCTTGTTAGCCTTGTTGCTCCGCTCTTGTACAGCGTGGATTTCCGGCCGTACTTCACCATCCATGATCCAGATTTCGCTCGCCTGAATGCGCTTGCTGAAGGCGAGGTTTTTCCTCCGATGGTGCTTGGTGTGACCAACTTGTTTTTCTTGAAGAGTCTTAAGAGCATTCCCAATGTCGTGTCCGTGGGGAGCCCAAACCCGAATTCCACTAGGGTGCTCCCAGTGGGTGGCCAGTCCCACGGATCAGGCAATGGGATCAATGGGACGCCTGNGAAAGCTCAGCTTGACAAACTCGCAATCAACAAGTTTTCTCCGACTGGCCTATTGAA]
[+] EMBL CB640516             [                                                                                   GCCTGCTGCTGCAGATCCTCGGCCCGCTCTGCTTCGACGTCGGCCCCTCCGCGCTGTCCATGGTGGCGTCCCACGTTGCCGCCTGGCCAGCGCCGGTGCCGGGCCGCCCCATGGAGCTTCCAATCGGCAGCGCGGCTCTGCGGGTGCACCTCCCGCCCGCGGCCGACGACCCTGGCCCGCCGCCCGCGCTGCTGCCGGCGAACCCGTCGGTGCCGTACGGCCTCTTCCACGACGCCGACCTGTTTGCGGCTTTCCGCGGCCTGCTTCTCCACCTATGGACGCTCTGGGAGCTCATGGTGGTTGGCGAGCCTGTACTGGTGGTTGCACCGTCTCCACCTCAATGCTCGGAGGCTGTGGCTGGGCTTGTTAGCCTTGCTGCTCCGCTCTTGTACAGCGTGGATTTACGGCCGTACTTCACC                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CB640515             [                                                                                   GCCTGCTGCTGCAGATCCTCGGCCCGCTCTGCTTCGACGTCGGCCCCTCCGCGCTGTCCATGGTGGCGTCCCACGTTGCCGCCTGGCCAGCGCCGGTGCCGGGCCGCCCCATGGAGCTTCCAATCGGCATCGCGGCTCTGCGGGTGCACCTCCCGCCCGCGGCCGACGACCCTGGTCCGCCGCCCGCGCTGCTGCCGGCGAACCCGTCGGTGCCGTACGGCCTCTTTCACCACGCCCACCTGTTTGCGGCTTTCCGCGGCCTGCTCCTCCACCTATGGACGCTCTGGGAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]




>consensus_4246#0
GCGCCAGGACGAGCGCCTCCCCCGCGGCGGCGAGCAGAAGTCCGTCGTCATACTCTCCCA
CGCGCCCTACTCCTCCCTGTTCCGCCTGCTGCTGCAGATCCTCGGCCCGCTCTGCTTCGA
CGTCGGCCCCTCCGCGCTGTCCATGGTGGCGTCCCACGTTGCCGCCTGGCCAGCGCCGGT
GCCGGGCCGCCCCATGGAGCTTCCAATCGGCAGCGCGGCTCTGCGGGTGCACCTCCCGCC
CGCGGCCGACGACCCTGGCCCGCCGCCCGCGCTGCTGCCGGCGAACCCGTCGGTGCCGTA
CGGCCTCTTCCACGACGCCGACCTGTTTGCGGCTTTCCGCGGCCTGCTTCTCCACCTATG
GACGCTCTGGGAGCTCATGGTGGTTGGCGAGCCTGTACTGGTGGTTGCACCGTCTCCACC
TCAATGCTCGGAGGCTGTGGCTGGGCTTGTTAGCCTTGTTGCTCCGCTCTTGTACAGCGT
GGATTTCCGGCCGTACTTCACCATCCATGATCCAGATTTCGCTCGCCTGAATGCGCTTGC
TGAAGGCGAGGTTTTTCCTCCGATGGTGCTTGGTGTGACCAACTTGTTTTTCTTGAAGAG
TCTTAAGAGCATTCCCAATGTCGTGTCCGTGGGGAGCCCAAACCCGAATTCCACTAGGGT
GCTCCCAGTGGGTGGCCAGTCCCACGGATCAGGCAATGGGATCAATGGGACGCCTGNGAA
AGCTCAGCTTGACAAACTCGCAATCAACAAGTTTTCTCCGACTGGCCTATTGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case