cluster # 4440

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Oryza sativa
cluster # 4440 cluster # 4440 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_4440#0 length = 1876 sequences # 3
consensusID : consensus_4440#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1876
fasta sequence
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[+] EMBL CF324290             [GAATCCATCTCTGTTGCTGGACCTGGTTACATTAACATAACGTTATCCAGCAATTGGATTGCACAGAGGATACAAGACATGCTTGTTTGTGGTATCAAAACATGGGCACCAATCTTACCTGTTAAGAGGGCAGTGCTGGATTTTTCATCCCCTAATATTGCAAAAGAGATGCATGTTGGACATATAAGGTCCACCATAATTGGAGATACTCTAGCTCACATGTTTGAGTTCACAAATGTTGAAGTTCTTCGACGTAACCATGTGGGAGACTGGGGTACACAGGTATTGAATTTGAATGTATTGATATTTAAACAATTTTGATCTATTTCTGAACTAATAATAATGTTTCTTCAGTTTGGGATGTTGATAGAAGTTTCTGTTTGAGCAATTCCCAGATTGGNAGGATGTTGGGAACCAGGCTGTTGGAGATCTTCAGAGCTTCTACAAGGCATCCAAGAAAAGATTTGACGATGATCCTGATTTTAAGGAGAGGGCTCGGCAAGCGGTAGTTCGACTGCAGGGAGGAGAAGATAAATACCGAGCTGCTTGGAAAAAAATATGTCAAATCAGCCGAATGGAGTTTGATTTGGTATACAAACGCCTTAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CB665676             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CTTCTACCTGGCATCCAAGAAAAGATTTGACGATGATCCTGATTTTAAGGAGAGGGCTCGGCAAGCGGTAGTTCGACTGCCCGGAGGAGAAGATAAATACCGAGCTGCTTGGAAAAAAATATGTCAAATCAGCCGAATGGAGTTTGATTTGGTATACAAACGCCTTAATGTGAAGCTTGAAGAAAAGGGAGAGAGCTTTTACAACCCCTACATTCCACCTGTTTTGGAGGAATTGACTAACAAAGGTTTGATTGTGGAAAGTAAAGGCGCTCGAGTAATATTCGTTGAAGACCACCCTTTGATAGTGATTAAACAAGATGGCGGCTTCAACTATGCCTCCACAGACTTGGCAGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGTGGAGAAGGCAGAATGGATAATATATGTAACGGATGTAGGTCAGCAACGACACTTTCATATGTTGTTCACTGCTGCAAAGATGGCTGGCTGGCTCCCACAACAAAATGGAAAGAAATACCCGAAAGCAAGCCATGTTGGATTTGGCCTAGTTCTTGGTTCAGATGGCAAGCGCTTCCGGACTCGTTGTTCTGAAGTTGTTCGACTGGTTGATCTACTTGATGAGGCTAAAGCTCGGAGCAAAGCACAACTCATCAAACGTTTCACTGGAAATGGTTCTTGTTGTTTTTCTTTTGTTTCTTTTGTCTTATTTTTTATAGAAATTCTTGCCATGGATACAATTATGATGATTTTGTTCAGGTCAAATTGCTGACTGGACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CB665677             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATAGAAATTCTTGCCATGGATACAATTATGAGGATTTTGTTCAGGTCAAATTGCTGACTGGACAGATGATGAGCTCGATAGGACTTCAGAGGCTATAGGATATGGTGCTGTTAAGTATTCAGATCTTAAAAACAATCGGCTGACAGACTACACATTTAGTTTTGATCAAATGCTGAGTGACAAGGGAAATACTGCTGTCTACCTTCAGTATGCACATGCCCGTATCTGTTCCATTATCAGGAAAGCCAGCAAGGATGTAGAGAAGTTAAAAATGACTGGAGCCATTACCCTTGGCCATCCATACGAGCGTTTCCTCGGATTACATCTCATCCAGTTTACCGAGGTTGTGGAGCAGGCTTGTGCCGATTTACAGCCCCATCGTTTGTGCGACTACTTGTATAGCTTATCCTTAACATTCTCCAAGTTTTACACAAACTGCCAGGTGGTTGGTTCACCTGAAGAAACGAGCCGTCTGCTGCTATGTGAAGCAACAGGCATCATCATGAGGCAGTGTTTCCCCCTGTTGGGCATAACCCCAGTGCACAAGCTATGACAATCCACGCCCCAATCCAATGCCATTTGGAAGAATTTCCAAGCTATAAATGTAAATAGTATATTCCCTTAAAAGCTAATGTAAATATTGAGTGGTGGTAGTGTCTTGTAAATAGGCGGTGGCTGTAAGGCCTCGCCATCTCTGTACATTCTTCAATTTTTTAAGATACTACGGTCGGCGTTCTTTCCCGTCCCTGC]




>consensus_4440#0
GAATCCATCTCTGTTGCTGGACCTGGTTACATTAACATAACGTTATCCAGCAATTGGATT
GCACAGAGGATACAAGACATGCTTGTTTGTGGTATCAAAACATGGGCACCAATCTTACCT
GTTAAGAGGGCAGTGCTGGATTTTTCATCCCCTAATATTGCAAAAGAGATGCATGTTGGA
CATATAAGGTCCACCATAATTGGAGATACTCTAGCTCACATGTTTGAGTTCACAAATGTT
GAAGTTCTTCGACGTAACCATGTGGGAGACTGGGGTACACAGGTATTGAATTTGAATGTA
TTGATATTTAAACAATTTTGATCTATTTCTGAACTAATAATAATGTTTCTTCAGTTTGGG
ATGTTGATAGAAGTTTCTGTTTGAGCAATTCCCAGATTGGNAGGATGTTGGGAACCAGGC
TGTTGGAGATCTTCAGAGCTTCTACAAGGCATCCAAGAAAAGATTTGACGATGATCCTGA
TTTTAAGGAGAGGGCTCGGCAAGCGGTAGTTCGACTGCAGGGAGGAGAAGATAAATACCG
AGCTGCTTGGAAAAAAATATGTCAAATCAGCCGAATGGAGTTTGATTTGGTATACAAACG
CCTTAATGTGAAGCTTGAAGAAAAGGGAGAGAGCTTTTACAACCCCTACATTCCACCTGT
TTTGGAGGAATTGACTAACAAAGGTTTGATTGTGGAAAGTAAAGGCGCTCGAGTAATATT
CGTTGAAGACCACCCTTTGATAGTGATTAAACAAGATGGCGGCTTCAACTATGCCTCCAC
AGACTTGGCAGCTCTTTGGTATCGGCTTAATGTGGAGAAGGCAGAATGGATAATATATGT
AACGGATGTAGGTCAGCAACGACACTTTCATATGTTGTTCACTGCTGCAAAGATGGCTGG
CTGGCTCCCACAACAAAATGGAAAGAAATACCCGAAAGCAAGCCATGTTGGATTTGGCCT
AGTTCTTGGTTCAGATGGCAAGCGCTTCCGGACTCGTTGTTCTGAAGTTGTTCGACTGGT
TGATCTACTTGATGAGGCTAAAGCTCGGAGCAAAGCACAACTCATCAAACGTTTCACTGG
AAATGGTTCTTGTTGTTTTTCTTTTGTTTCTTTTGTCTTATTTTTTATAGAAATTCTTGC
CATGGATACAATTATGATGATTTTGTTCAGGTCAAATTGCTGACTGGACAGATGATGAGC
TCGATAGGACTTCAGAGGCTATAGGATATGGTGCTGTTAAGTATTCAGATCTTAAAAACA
ATCGGCTGACAGACTACACATTTAGTTTTGATCAAATGCTGAGTGACAAGGGAAATACTG
CTGTCTACCTTCAGTATGCACATGCCCGTATCTGTTCCATTATCAGGAAAGCCAGCAAGG
ATGTAGAGAAGTTAAAAATGACTGGAGCCATTACCCTTGGCCATCCATACGAGCGTTTCC
TCGGATTACATCTCATCCAGTTTACCGAGGTTGTGGAGCAGGCTTGTGCCGATTTACAGC
CCCATCGTTTGTGCGACTACTTGTATAGCTTATCCTTAACATTCTCCAAGTTTTACACAA
ACTGCCAGGTGGTTGGTTCACCTGAAGAAACGAGCCGTCTGCTGCTATGTGAAGCAACAG
GCATCATCATGAGGCAGTGTTTCCCCCTGTTGGGCATAACCCCAGTGCACAAGCTATGAC
AATCCACGCCCCAATCCAATGCCATTTGGAAGAATTTCCAAGCTATAAATGTAAATAGTA
TATTCCCTTAAAAGCTAATGTAAATATTGAGTGGTGGTAGTGTCTTGTAAATAGGCGGTG
GCTGTAAGGCCTCGCCATCTCTGTACATTCTTCAATTTTTTAAGATACTACGGTCGGCGT
TCTTTCCCGTCCCTGC
clustalw multiple alignements is not computed in this case