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Oryza sativa
cluster # 45 cluster # 45       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_45#0 length = 692 sequences # 2  

consensusID : consensus_45#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 692
fasta sequence
                              [TTTTTTTTATCTTGAACAGTAAATTCAATGTTGACAATTAATGTAGTAATGATTTCTTAAGGAATGAATACTAATTTTGTGTTCATGGGGATCGATAGTCTTTTTTAAACATCATGCTTAAACACGATCATTACTGGTGCTTTGAGTAGAGCCTAATACTGCATTACTATTTATTGCTTGCTGTTATAGTTTGTTACGTACCATGTCCATTCCTTAAGGAAGCTAACAATAGATCTATCTTTTGTATTTTCCTCTTCGTGACACCTTTTTCAATTGGATACGTGCAGTATAAAACTATCGAATTCACATTAAGAGTGCGATATATTTTGGGATCTTCATTCTCCTTATTTGAATCATGATCTTGTTCACAGTATATATTCTATGTAATATGAGTATGACTACATGGAACACCTACTATGTCCTCGATAAATTATAAGTAGCTTTTGTTCCTCCTAAGATTTTTATCTTATGAACACATGATTACCATTGACTGTTTTCTTGGGAAAAAAATTAACATGACCCGCTTGTTTCAGGTCAGCTTGTGACCTGTATTCGACGTTAGTATTATTGTTTTATGGTGCAATTGCTAGTAGGTATCAACCCATGCACCTGTACGGGCTAGAAATTTAAAACATGGTCTGCCTAGCGCCGAATAATTGTAGATTTACTAAATCCTACCCCATGGTCTGGGA]

[+] EMBL CA761389             [TTTTTTTTATCTTGAACAGTAAATTCAATGTTGACAATTAATGTAGTAATGATTTCTTAAGGAATGAATACTAATTTTGTGTTCATGGGGATCGATAGTCTTTTTTAAACATCATGCTTAAACACGATCATTACTGGTGCTTTGAGTAGAGCCTAATACTGCATTACTATTTATTGCTTGCTGTTATAGTTTGTTACGTACCATGTCCATTCCTTAAGGAAGCTAACAATAGATCTATCTTTTGTATTTTCCTCTTCGTGACACCTTTTTCAATTGGATACGTGCAGTATAAAACTATCGAATTCACATTAAGAGTGCGATATATTTTGGGATCTTCATTCTCCTTATTTGAATCATGATCTTGTTCACAGTATATATTCTATGTAATATGAGTATGACTACATGGAACACCTACTATGTCCTCGATAAATTATAAGTAGCTTTTGTTCCTCCTAAGATTTTTATCTTATGAACACATGATTACCATTGACTGTTTTCTTGGGAAAAAAATTAACATGACCCGCTTGTTTCAGGTCAGCTTGTGACCTGTATTCGACGTTAGTATTATTGTTTTATGGTGCAATTGCTAGTAGGTATCAACCCATGCACCTGTACGGGCTAGAAATTTAAAACATGGTCTGCCTAGCGCCGAATAATTGTAGATTTACTAAATCCTACCCCATGGTCTGGGA]
[+] EMBL CA766407             [                                                                                                                        AACACGATCNTTACTGGTGCTTTGAGTAGAGCCTAATACTGCATTACTATTTATTGCTTGCTGTTATAGTTTGTTACGTACCATGTCCATTCCTTAAGGAAGCTAACAATAGATCTATCTTTTGTATTTTCCTCTTCGTGACACCTTTTTCAATTGGATACGNGCNGGATAAAACTATCGTTTTTTTTTTAAGAGTGCGATATATTTTGGGATCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]


>consensus_45#0 TTTTTTTTATCTTGAACAGTAAATTCAATGTTGACAATTAATGTAGTAATGATTTCTTAA GGAATGAATACTAATTTTGTGTTCATGGGGATCGATAGTCTTTTTTAAACATCATGCTTA AACACGATCATTACTGGTGCTTTGAGTAGAGCCTAATACTGCATTACTATTTATTGCTTG CTGTTATAGTTTGTTACGTACCATGTCCATTCCTTAAGGAAGCTAACAATAGATCTATCT TTTGTATTTTCCTCTTCGTGACACCTTTTTCAATTGGATACGTGCAGTATAAAACTATCG AATTCACATTAAGAGTGCGATATATTTTGGGATCTTCATTCTCCTTATTTGAATCATGAT CTTGTTCACAGTATATATTCTATGTAATATGAGTATGACTACATGGAACACCTACTATGT CCTCGATAAATTATAAGTAGCTTTTGTTCCTCCTAAGATTTTTATCTTATGAACACATGA TTACCATTGACTGTTTTCTTGGGAAAAAAATTAACATGACCCGCTTGTTTCAGGTCAGCT TGTGACCTGTATTCGACGTTAGTATTATTGTTTTATGGTGCAATTGCTAGTAGGTATCAA CCCATGCACCTGTACGGGCTAGAAATTTAAAACATGGTCTGCCTAGCGCCGAATAATTGT AGATTTACTAAATCCTACCCCATGGTCTGGGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)