cluster # 4501

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Oryza sativa
cluster # 4501 cluster # 4501 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4501#0 length = 537 sequences # 3

consensusID : consensus_4501#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 537
fasta sequence

                              [GTNCCCCGTGGCTGGNCTTCGGCCAGACCTTNAGCGGGGCCNAGTTCAACTGATTCCGCTCAATTTTACTCGAGCATCGTCGTGGTAGTTGCAGTAGTACTCCCAACTGGACCGTGCTGGGAAGTGCCATTGTTTTATGATTGGTACTCAGTCTCGCCTTGGTTCTTGGGAAAGTATTTAGTGGGTAGTTTGGCCTAGTATCAACATGGGCTTTGTGCTGGTGTCACTGCTAGTGGTAGTTTGTTACAAGTACCATTAGTTGAGCTTTTGTGGTATCTTTTGGCTAGGGATTGGAAGTGGTGGTAAGGCT-GTGGCTTGATTG-ACAGAGGCCGCCTTGTATCACCCGCCAAAATAGCAAAATTGGGCCTAATGGGAATGGCCTTCTGCTAGTAATGGTTTTGCCTGGTTGTTGTCTGTACC-GGACCCCAGTACCGGACCTCATTTTGGGGGTGCCAAACAGTTTAGGCATCTGGGGTATGCCCTGTGTGC-TGCTTATGAACAATTTCTTTTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU078691             [GTNCCCCGTGGCTGGNCTTCGGCCAGACCTTNAGCGGGGCCNAGTTCAACTGATTCCGCTCAATTTTACTCGAGCATCGTCGTGGTAGTTGCAGTAGTACTCCCAACTGGACCGTGCTGGGAAGTGCCATTGTTTTATGATTGGTACTCAGTCTCGCCTTGGTTCTTGGGAAAGTATTTAGTGGGTAGTTTGGCCTAGTATCAACATGGGCTTTGTGCTGGTGTCACTGCTAGTGGTAGTTTGTTACAAGTACCATTAGTTGAGCTTTTGTGGTATCTTTTGGCTAGGGATTGGAAGTGGTGGTAAGGCT GTGGCTTGATTG ACAGAGGCCGCCTTGTATCACCCGCCAAAATAGCAAAATTGGGCCTAATGGGAATGGCCTTCTGCTAGTAATGGTTTTGCCTGGTTGTTGTCTGTACC GGACCCCAGTACCGGACCTCATTTTGGGGGTGCCAAACAGTTTAGGCATCTGGGGTATGCCCTGTGTGC TGCTTATGAACAATTTCTTTTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL CB645780             [                  TCGGCCAGACCTTCAGCGGGGCCCAGTTCAACTGATTCCGCTCAATTTTACTCGAGCATCGTCGTGGTAGTTGCAGTAGTACTCCCAACTGGACCGTGCTGGGAAGTGCCATTGTTTTATGATTGGTACTCAGTCTCGCCTTGGTTCTTGGGAAAGTATTTAGTGGGTAGTTTGGCCTAGTATCAACATGGGCTTTGTGCTGGTGTCACTGCTAGTGGTAGTTTGTTACAAGTACCATTAGTTGAGCTTTTGTGGTATCTTTTGGCTAGGGATTGGAAGTGGTGGTAAGGCT GTGGCTTGATTG ACAGAGGCCGCCTTGTATCACCCGCCAAAATAGCAAAATTGGGCCTAATGGGAATGGCCTTATGCTAGTAATGGTTTTGCCTGGTTGTTGTCTGTACC GGACCCCAGTACCGGACCTCATTTTGGGGGTGCCAAACAGTAAGGGCATCTGGG                                                                ]
[+] EMBL AU183760             [                                                                                                                                                                                                                                                                                 ntTCTTTTGGCTAGGNATTGAAAGTGGTGGTAAGGCTCGTGGCTTNATTGAACAAAGGCCGCCNTG ATCACCCNCCAAAATAAGAAAATTGGGCCTAATGGGAATGGCCTTCTCCNAGTAATGGTTTTGCCTGGTTGTTGTTTGTACCGGGACCCCAGTACCGGACCTCATTTTGGGGGTGCCAAACAGTTTAGGCATCTGGGGTATGCCCTGTGTGCTTGCTTATGAACAATTTCTTTTTA  AAAAAAAAAAAAAAAA       ]




>consensus_4501#0
GTNCCCCGTGGCTGGNCTTCGGCCAGACCTTNAGCGGGGCCNAGTTCAACTGATTCCGCT
CAATTTTACTCGAGCATCGTCGTGGTAGTTGCAGTAGTACTCCCAACTGGACCGTGCTGG
GAAGTGCCATTGTTTTATGATTGGTACTCAGTCTCGCCTTGGTTCTTGGGAAAGTATTTA
GTGGGTAGTTTGGCCTAGTATCAACATGGGCTTTGTGCTGGTGTCACTGCTAGTGGTAGT
TTGTTACAAGTACCATTAGTTGAGCTTTTGTGGTATCTTTTGGCTAGGGATTGGAAGTGG
TGGTAAGGCTGTGGCTTGATTGACAGAGGCCGCCTTGTATCACCCGCCAAAATAGCAAAA
TTGGGCCTAATGGGAATGGCCTTCTGCTAGTAATGGTTTTGCCTGGTTGTTGTCTGTACC
GGACCCCAGTACCGGACCTCATTTTGGGGGTGCCAAACAGTTTAGGCATCTGGGGTATGC
CCTGTGTGCTGCTTATGAACAATTTCTTTTTACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case