cluster # 460

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Oryza sativa
cluster # 460 cluster # 460 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_460#0 length = 1006 sequences # 2

consensusID : consensus_460#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1006
fasta sequence

                              [CCCCGCGATTCCCTCCACTCCCCACTCGGCAGCTCGCCATTCCACCACCACCGCGCCGCCGCGGCGCATCGGGCCATGGCGCCCGCCGCCGCCGCCGCGTGCGCCGCCTCCGTCCGCGCCGACCCGCCGGGCATCCTCGACTACGGCGCCATCCACGCCTGCCTCCTGGGCGGGGACCGCCGCGCCTCCCTCCCGGCGCTCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCCGCGTCCTCGCCGCCGCCGCGGGGACCCACTTCTCCCCCGCGGTCTCCCGCCTCGCGGCCCGCCTCCGCCTCTCCCCGTCCATGGCCGCCGTCACGCTCCTCGCGCTCGGCAACGGCGCCCCCGATGCGTTCGCCTCCGCCGCCGCGCTCGGCGGGGCCGGCGGGATGCGGCGTGCGGGGCTCGCCGCGATCCTCTCCGCCGGAGCCTTCGTCTCCGCGTTCGTCGTCGGGGCCGTCGCGCTCATCGCCGCGCCGTTCGCTGTCCCGCCCGCGTCGTTCGCCCGCGACGTCTTCTTCTACCTCCTCGCCGCCTCCGGCCTCTTCTACATCTACCTTAGCGCCGAGATATACCTCTGGCAGGCCATCGGGCTCGTGCTCTTCTACGTCTTCTTCGTGGGCTTAGTGGTATACATGGATTTGGATGCTGAGGGGAAGGCGGTGAGCACCACCGAGCTGGAGGTGGTGAATGGCATTGGTCGCGTGGTGATGGACTTGCCGGTAACAGTGGAGGATCGCAAGCAACAACACCCTACTTTGTGCACGATGTTCAGTAAGTTGCTGCAGAGCAATGGTTCATTTCGATGGGGATGGTTCACGAGGTGCAAGATGCCTCCAGGCTGCAATACAACTTCTTATCTTGGCAGCTGATGCATACAGCCCTTCACACTGAATTGGCTTGTACTGGTCTGGCATGTTCCTGTGGATTCTTCTGTACCTTCATTTTACGAGTTCATGAGTTCAGGCCAGAGGGGAGATCTTGCTGGCGATGTGCATCAGTGCA]

[+] EMBL AK108267             [CCCCGCGATTCCCTCCACTCCCCACTCGGCAGCTCGCCATTCCACCACCACCGCGCCGCCGCGGCGCATCGGGCCATGGCGCCCGCCGCCGCCGCCGCGTGCGCCGCCTCCGTCCGCGCCGACCCGCCGGGCATCCTCGACTACGGCGCCATCCACGCCTGCCTCCTGGGCGGGGACCGCCGCGCCTCCCTCCCGGCGCTCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCCGCGTCCTCGCCGCCGCCGCGGGGACCCACTTCTCCCCCGCGGTCTCCCGCCTCGCGGCCCGCCTCCGCCTCTCCCCGTCCATGGCCGCCGTCACGCTCCTCGCGCTCGGCAACGGCGCCCCCGATGCGTTCGCCTCCGCCGCCGCGCTCGGCGGGGCCGGCGGGATGCGGCGTGCGGGGCTCGCCGCGATCCTCTCCGCCGGAGCCTTCGTCTCCGCGTTCGTCGTCGGGGCCGTCGCGCTCATCGCCGCGCCGTTCGCTGTCCCGCCCGCGTCGTTCGCCCGCGACGTCTTCTTCTACCTCCTCGCCGCCTCCGGCCTCTTCTACATCTACCTTAGCGCCGAGATATACCTCTGGCAGGCCATCGGGCTCGTGCTCTTCTACGTCTTCTTCGTGGGCTTAGTGGTATACATGGATTTGGATGCTGAGGGGAAGGCGGTGAGCACCACCGAGCTGGAGGTGGTGAATGGCATTGGTCGCGTGGTGATGGACTTGCCGGTAACAGTGGAGGATCGCAAGCAACAACACCCTACTTTGTGCACGATGTTCAGTAAGTTGCTGCAGAGCAATGGTTCATTTCGATGGGGATGGTTCACGAGGTGCAAGATGCCTCCAGGCTGCAATACAACTTCTTATCTTGGCAGCTGATGCATACAGCCCTTCACACTGAATTGGCTTGTACTGGTCTGGCATGTTCCTGTGGATTCTTCTGTACCTTCATTTTACGAGTTCATGAGTTCAGGCCAGAGGGGAGATCTTGCTGGCGATGTGCATCAGTGCA]
[+] EMBL AU181285             [             TCCACTCCCCACTCGGCAGCTCGCCATTCCACCACCACCGCGCCGCCGCGGCGCATCGGGCCATGGCGCCCGCCGCCGCCGCCGCGTGCGCCGCCTCCGTCCGCGCCGACCCGCCGGGCATCCTCGACTACGGCGCCATCCACGCCTGCCTCCTGGGCGGGGACCGCCGCGCCTCCCTCCCGGCGCTCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCCGCGTCCTCGCCGCCGCCGCGGGGACCCACTTCTCCCCCGCGGTCTCCCGCCTCGCGGCCCGCCTCCGCCTCTCCCCGTCCATGGCCGCCGTCACGCTCCTCGCGCTCGGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]




>consensus_460#0
CCCCGCGATTCCCTCCACTCCCCACTCGGCAGCTCGCCATTCCACCACCACCGCGCCGCC
GCGGCGCATCGGGCCATGGCGCCCGCCGCCGCCGCCGCGTGCGCCGCCTCCGTCCGCGCC
GACCCGCCGGGCATCCTCGACTACGGCGCCATCCACGCCTGCCTCCTGGGCGGGGACCGC
CGCGCCTCCCTCCCGGCGCTCGCGCTCCTCCTCCTCCTCCACTTCCGCGTCCTCGCCGCC
GCCGCGGGGACCCACTTCTCCCCCGCGGTCTCCCGCCTCGCGGCCCGCCTCCGCCTCTCC
CCGTCCATGGCCGCCGTCACGCTCCTCGCGCTCGGCAACGGCGCCCCCGATGCGTTCGCC
TCCGCCGCCGCGCTCGGCGGGGCCGGCGGGATGCGGCGTGCGGGGCTCGCCGCGATCCTC
TCCGCCGGAGCCTTCGTCTCCGCGTTCGTCGTCGGGGCCGTCGCGCTCATCGCCGCGCCG
TTCGCTGTCCCGCCCGCGTCGTTCGCCCGCGACGTCTTCTTCTACCTCCTCGCCGCCTCC
GGCCTCTTCTACATCTACCTTAGCGCCGAGATATACCTCTGGCAGGCCATCGGGCTCGTG
CTCTTCTACGTCTTCTTCGTGGGCTTAGTGGTATACATGGATTTGGATGCTGAGGGGAAG
GCGGTGAGCACCACCGAGCTGGAGGTGGTGAATGGCATTGGTCGCGTGGTGATGGACTTG
CCGGTAACAGTGGAGGATCGCAAGCAACAACACCCTACTTTGTGCACGATGTTCAGTAAG
TTGCTGCAGAGCAATGGTTCATTTCGATGGGGATGGTTCACGAGGTGCAAGATGCCTCCA
GGCTGCAATACAACTTCTTATCTTGGCAGCTGATGCATACAGCCCTTCACACTGAATTGG
CTTGTACTGGTCTGGCATGTTCCTGTGGATTCTTCTGTACCTTCATTTTACGAGTTCATG
AGTTCAGGCCAGAGGGGAGATCTTGCTGGCGATGTGCATCAGTGCA

clustalw multiple alignements is not computed in this case