cluster # 4613

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 4613 cluster # 4613 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4613#0 length = 842 sequences # 3

consensusID : consensus_4613#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 842
fasta sequence

                              [CAAGGCTGTATTGGCTAAGTGTTGTTTTTCTAGCATTTGATGTCTTCTTCGCTGTGTTTTGCGTTGCTATGGCCTGCTTCATCGGGATCGCATTGTGCTGCTGCTTGCCTTGTGTCATTGCAATTCTATATGCACTGGCTGGCCAGGAGGGTGCATCAGATGCGGATATTGGCTTTCTTCCCAGATATAGATATTCTGATCCCAGTGAGGATGGACAAAAAGGAACTGACGAGGGAGTTATGATCCCTGTTCTGAATAATAGCGGAACATCAACCAGTGAACGTATTCTCCTTCATGAGGATGCTGAATGCTGTATCTGCCTCTCATCATATGAGGATGGAGCGGAGCTATCTGCCCTCCCTTGCAACCATCACTTCCATTGGACATGTATTACCAAATGGCTACGCATGCATGCAACCTGTCCACTTTGCAAGTACAACATTCTTAAAGGCAGTGAAAGTGCATGACCAACTTACACTGACACAATTTCCATACTCAAAGGCTGTATGATTGGAGATCCTACTTGACCACTTGTAGAGAAAGCAGCAAGTGATGCTTTGTGATTCCGATCTGTTTGTAAGCTGATGATAAGAGTTTTTCCCCCCTTCTAAGTGAGAATTGGTCGTGTGCCTTCCTGTTTAGGATGTGGTGACGGCCTGTACATGAGTAAACTCACTATACCGTGCTAATATCAGTTGTAAAGATCTTCTCAAGTTGTGCTGTCTT-TTTTTCCTTTTGTACATAATGGGGTTTGAAATTGATGAAAAGTCCTGGTTATGAACTCGTCAGACTTTACAACATTGTCTGGTGGAAGCTGGTGAATTTCTATTTGAATAGAAGCA]

[+] EMBL AK072424             [CAAGGCTGTATTGGCTAAGTGTTGTTTTTCTAGCATTTGATGTCTTCTTCGCTGTGTTTTGCGTTGCTATGGCCTGCTTCATCGGGATCGCATTGTGCTGCTGCTTGCCTTGTGTCATTGCAATTCTATATGCACTGGCTGGCCAGGAGGGTGCATCAGATGCGGATATTGGCTTTCTTCCCAGATATAGATATTCTGATCCCAGTGAGGATGGACAAAAAGGAACTGACGAGGGAGTTATGATCCCTGTTCTGAATAATAGCGGAACATCAACCAGTGAACGTATTCTCCTTCATGAGGATGCTGAATGCTGTATCTGCCTCTCATCATATGAGGATGGAGCGGAGCTATCTGCCCTCCCTTGCAACCATCACTTCCATTGGACATGTATTACCAAATGGCTACGCATGCATGCAACCTGTCCACTTTGCAAGTACAACATTCTTAAAGGCAGTGAAAGTGCATGACCAACTTACACTGACACAATTTCCATACTCAAAGGCTGTATGATTGGAGATCCTACTTGACCACTTGTAGAGAAAGCAGCAAGTGATGCTTTGTGATTCCGATCTGTTTGTAAGCTGATGATAAGAGTTTTTCCCCCCTTCTAAGTGAGAATTGGTCGTGTGCCTTCCTGTTTAGGATGTGGTGACGGCCTGTACATGAGTAAACTCACTATACCGTGCTAATATCAGTTGTAAAGATCTTCTCAAGTTGTGCTGTCTT TTTTTCCTTTTGTACATAATGGGGTTTGAAATTGATGAAAAGTCCTGGTTATGAACTCGTCAGACTTTACAACATTGTCTGGTGGAAGCTGGTGAATTTCTATTTGAATAGAAGCA]
[+] EMBL CA767271             [                                              CTTCGCTGTGTTTTGCGTTGCTATGGCCTGCTTCATCGGGATCGCATTGTGCTGCTGCTTGCCTTGTGTCATTGCAATTCTATATGCACTGGCTGGCCGGGAGGGTGCATCAGATGCGGATATTGGCTTTCTTCCCAGATATAGATATTCTGACCCCAGTGAGGATGGACAAAAAGGAACTGACGAGGGAGTTATGATCCCTGTTCTGAATAATAGCGGAACATCAACCAGTGAACGTATTCTCCTTCATGAGGATGCTGAATGCTGTATCTGCCTCTCATCATATGAGGATGGAGCGGAGCTATCTGCCCTCCCTTGCAACCATCACTTCCATTGGACATGTATTACCAAATGGCTACGCATGCATGCAACCTGTCCACTTTGCAAGTACAACATTCTTAAAGGCAGTGAAAGTGCATGACCAACTTACACTGACACAATTTCCATACTCAAAGGCTGTATGATTGGAGATCCTACTTGACCACTTGTAGAGGAAGCAGCAAGTGATGCTTTGTGATTCCGATCTGTTTGTAAGCTGATGATAAGAGTTTTTCCCCCCTTCTAAGTGAGAATTGGTCGTGTGCCTTCCTGTTTAGGATGTGGTGACGGCCTGTACATGAGTAAACTCACTATACCGNGCTAATATCAGTTGTAAAGATCTTCTCAAGNTGNGCTGGCTTGGTTTCCCTTTTGTACATAATGGGGTTTGAAAATGATGAAAAGGCCTGGNTATGAACTCGCCAGACTTTACAAAATTGTCTGGNGGAANCTGGTGAATTTCcta             ]
[-] EMBL C72900               [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AACTTACACTGACACAATTTCCATACTCAAAGGCTGTATGATTGGAGATCCTACTTGACCACTTGTAGAGAANGCAGCAAGTGATGCTTTGTGATTCCGATCTGTTTGTAAGCTGATGATAAGAGTTTTTCCCCCCTTCTAAGTGAGAATTGGTCGTGTGCCTTCCTGTTTAGGATGTGGTGACGGCCTGTACATGAGTAAACTCACTATACCGTGCTAATATCAGTTGTAAAGATCTTCTCAAGTTGTGCTGTCTT TTTTTCCTTTTGTACATAATGGGGTTTGAAATTGATGAAAAGTCCTGGTTA                                                                 ]




>consensus_4613#0
CAAGGCTGTATTGGCTAAGTGTTGTTTTTCTAGCATTTGATGTCTTCTTCGCTGTGTTTT
GCGTTGCTATGGCCTGCTTCATCGGGATCGCATTGTGCTGCTGCTTGCCTTGTGTCATTG
CAATTCTATATGCACTGGCTGGCCAGGAGGGTGCATCAGATGCGGATATTGGCTTTCTTC
CCAGATATAGATATTCTGATCCCAGTGAGGATGGACAAAAAGGAACTGACGAGGGAGTTA
TGATCCCTGTTCTGAATAATAGCGGAACATCAACCAGTGAACGTATTCTCCTTCATGAGG
ATGCTGAATGCTGTATCTGCCTCTCATCATATGAGGATGGAGCGGAGCTATCTGCCCTCC
CTTGCAACCATCACTTCCATTGGACATGTATTACCAAATGGCTACGCATGCATGCAACCT
GTCCACTTTGCAAGTACAACATTCTTAAAGGCAGTGAAAGTGCATGACCAACTTACACTG
ACACAATTTCCATACTCAAAGGCTGTATGATTGGAGATCCTACTTGACCACTTGTAGAGA
AAGCAGCAAGTGATGCTTTGTGATTCCGATCTGTTTGTAAGCTGATGATAAGAGTTTTTC
CCCCCTTCTAAGTGAGAATTGGTCGTGTGCCTTCCTGTTTAGGATGTGGTGACGGCCTGT
ACATGAGTAAACTCACTATACCGTGCTAATATCAGTTGTAAAGATCTTCTCAAGTTGTGC
TGTCTTTTTTTCCTTTTGTACATAATGGGGTTTGAAATTGATGAAAAGTCCTGGTTATGA
ACTCGTCAGACTTTACAACATTGTCTGGTGGAAGCTGGTGAATTTCTATTTGAATAGAAG
CA

clustalw multiple alignements is not computed in this case