cluster # 4624

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Oryza sativa
cluster # 4624 cluster # 4624 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4624#0 length = 615 sequences # 3

consensusID : consensus_4624#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 615
fasta sequence

                              [TTTTCTCTGAATAGAAGTCCGATTGGTGAGGCGAGGCGACGCCAGGGAGCCAGCGAGGCAGCGACGTGCCTCCAGGCCGCGCGCCGCCGTCGCCGCCTCGAAGCTCCCTGCGCCGCCGTCGTAGGTTAGTAGCGTGCCGCTGCCGCTGCCGTGTGTGTGGAGCCGCCGTCGCATGTGATGTGTACTCTGTTGAACTCCAAAACATGTGAGCTTGTTATGTACTGCATGTGATGTGCTGCTATGATGCTATGCATGCACCGATGTACTGCTTAAGTTTATGTGATGAACTTGTTAAGTTTAAAAAAAAAAGGAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCTTTCCCCCCCTTCCAAAACCTTTTTTTAACCAAAGGGGGAAATTCCCCCCCCCAAAAAAAAAACCCCCCCTAAAGGGACCCTTTTAAAAATCCCCGCCCCCTTTTTTAAAACCCCGAAAAGGGAAAAACCCCTGGTTTCCCCCAAAAAAACCCCTTGAAAAAAACCCCCCTTTTCCCCAGGGGGGAAAAAAAA]

[+] EMBL AK059426             [TTTTCTCTGAATAGAAGTCCGATTGGTGAGGCGAGGCGACGCCAGGGAGCCAGCGAGGCAGCGACGTGCCTCCAGGCCGCGCGCCGCCGTCGCCGCCTCGAAGCTCCCTGCGCCGCCGTCGTAGGTTAGTAGCGTGCCGCTGCCGCTGCCGTGTGTGTGGAGCCGCCGTCGCATGTGATGTGTACTCTGTTGAACTCCAAAACATGTGAGCTTGTTATGTACTGCATGTGATGTGCTGCTATGATGCTATGCATGCACCGATGTACTGCTTAAGTTTATGTGATGAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI800817             [                                      ACGCCAGGGAGCCAGCGAGGCAGCGACGTGCCTCCAGGCCGCGCGCCGCCGTCGCCGCCTCGAAGCTCCCTGCGCCGCCGTCGTAGGTTAGTAGCGTGCCGCTGCCGCTGCCGTGTGTGTGGAGCCGCCGTCGCATGTGATGTTTACTCTTTTGAACTCC AAACATGTGAGCTTGTTATGTACTGCATGTGATGTGTTGCTATGATGCTATGCATGCACCGATGTACTGCTTAAGTTTATGTGATGAACTTGTTAAGTTTAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CF326972             [                                                                                                                                                                                                                                                       TATGCATGCACCGATGTACTGCTTAAGTTTATGTGATGAACTTGTTAAGTTTAATGTTTGTTGGAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCCTTTCCCCCCCTTCCAAAACCTTTTTTTAACCAAAGGGGGAAATTCCCCCCCCCAAAAAAAAAACCCCCCCTAAAGGGACCCTTTTAAAAATCCCCGCCCCCTTTTTTAAAACCCCGAAAAGGGAAAAACCCCTGGTTTCCCCCAAAAAAACCCCTTGAAAAAAACCCCCCTTTTCCCCAGGGGGGAAAAAAAA]




>consensus_4624#0
TTTTCTCTGAATAGAAGTCCGATTGGTGAGGCGAGGCGACGCCAGGGAGCCAGCGAGGCA
GCGACGTGCCTCCAGGCCGCGCGCCGCCGTCGCCGCCTCGAAGCTCCCTGCGCCGCCGTC
GTAGGTTAGTAGCGTGCCGCTGCCGCTGCCGTGTGTGTGGAGCCGCCGTCGCATGTGATG
TGTACTCTGTTGAACTCCAAAACATGTGAGCTTGTTATGTACTGCATGTGATGTGCTGCT
ATGATGCTATGCATGCACCGATGTACTGCTTAAGTTTATGTGATGAACTTGTTAAGTTTA
AAAAAAAAAGGAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACC
CCTTTCCCCCCCTTCCAAAACCTTTTTTTAACCAAAGGGGGAAATTCCCCCCCCCAAAAA
AAAAACCCCCCCTAAAGGGACCCTTTTAAAAATCCCCGCCCCCTTTTTTAAAACCCCGAA
AAGGGAAAAACCCCTGGTTTCCCCCAAAAAAACCCCTTGAAAAAAACCCCCCTTTTCCCC
AGGGGGGAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case