cluster # 4645

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 4645 cluster # 4645 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_4645#0 length = 568 sequences # 3

consensusID : consensus_4645#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 568
fasta sequence

                              [CCTTCGGCTTCTCGTCGGATTGCCAGCCATGGTGGTGAACAACTTCACGGGCCCCGGGATTGGGCTGGGGTTCGGCATCGGGTGCGGGTTCGGCGTCGGATGGGGGTTCGGAGGAATGCCTCTGAATATGTTTGGCTTGGGCATCGGTACTAATTCTTGTACATTACTTTATTATTGTACATCACCTACAGTATCTCAGGTTTCAATTAAAGTTCTTCCTTCTTTTAAGGTGGGGGATGTGGAGTTGGTCTTGGGCTAGGGTGGGGCTTCGGCAAAGCGTATGGTTGTCAGTATCGCTCGTCTAGAGTCCAGTTTCAGGGCATTGAGTTTCAGAAGAAGACCGAAGGAGATGAAGCATCAAGCCTTGTTTCTCCAGAGCGTGTTGAAAAATCTCGTCCTTATGGATAGTATGGTTGTGCCTTATAATTCACATATGCTATGTTACCTTCCTTCCCTCAATTGTGCCTTAGTTGCATACCTGCATGTTTCTTCGGTAACATTTGATGCTTATGCTCAGCTTTGTCATTTTTGTTGTAATCAGAATGATGTTAATGGACAGGATTGTTAT]

[+] EMBL AK070613             [CCTTCGGCTTCTCGTCGGATTGCCAGCCATGGTGGTGAACAACTTCACGGGCCCCGGGATTGGGCTGGGGTTCGGCATCGGGTGCGGGTTCGGCGTCGGATGGGGGTTCGGAGGAATGCCTCTGAATATGTTTGGCTTGGGCATCGGTACTAATTCTTGTACATTACTTTATTATTGTACATCACCTACAGTATCTCAGGTTTCAATTAAAGTTCTTCCTTCTTTTAAGGTGGGGGATGTGGAGTTGGTCTTGGGCTAGGGTGGGGCTTCGGCAAAGCGTATGGTTGTCAGTATCGCTCGTCTAGAGTCCAGTTTCAGGGCATTGAGTTTCAGAAGAAGACCGAAGGAGATGAAGCATCAAGCCTTGTTTCTCCAGAGCGTGTTGAAAAATCTCGTCCTTATGGATAGTATGGTTGTGCCTTATAATTCACATATGCTATGTTACCTTCCTTCCCTCAATTGTGCCTTAGTTGCATACCTGCATGTTTCTTCGGTAACATTTGATGCTTATGCTCAGCTTTGTCATTTTTGTTGTAATCAGAATGATGTTAATGGA            ]
[-] EMBL BI306748             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGGCATTGAGTTTCAGAAGAAGACCGAAGGAGATGAAGCATCAAGCCTTGTTTCTCCAGAGCGTGTTGAAAAATCTCGTCCTTATGGATAGTATGGTTGTGCCTTATAATTCACATAAGCTATGTTACCTTCCTTCCCTCAATTGTGCCTTAGTTGCATACCTGCATGTTTCTTCGGTAACATTTGATGCTTATGCTCAGCTTTGTCATTTTTGTTGTAATCAGAATGATGTTAATGGACAGGA       ]
[+] EMBL AK058298             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ACCGAAGGAGATGAAGCATCAAGCCTTGTTTCTCCAGAGCGTGTTGAAAAATCTCGTCCTTATGGATAGTATGGTTGTGCCTTATAATTCACATATGCTATGTTACCTTCCTTCCCTCAATTGTGCCTTAGTTGCATACCTGCATGTTTCTTCGGTAACATTTGATGCTTATGCTCAGCTTTGTCATTTTTGTTGTAATCAGAATGATGTTAATGGACAGGATTGTTAT]




>consensus_4645#0
CCTTCGGCTTCTCGTCGGATTGCCAGCCATGGTGGTGAACAACTTCACGGGCCCCGGGAT
TGGGCTGGGGTTCGGCATCGGGTGCGGGTTCGGCGTCGGATGGGGGTTCGGAGGAATGCC
TCTGAATATGTTTGGCTTGGGCATCGGTACTAATTCTTGTACATTACTTTATTATTGTAC
ATCACCTACAGTATCTCAGGTTTCAATTAAAGTTCTTCCTTCTTTTAAGGTGGGGGATGT
GGAGTTGGTCTTGGGCTAGGGTGGGGCTTCGGCAAAGCGTATGGTTGTCAGTATCGCTCG
TCTAGAGTCCAGTTTCAGGGCATTGAGTTTCAGAAGAAGACCGAAGGAGATGAAGCATCA
AGCCTTGTTTCTCCAGAGCGTGTTGAAAAATCTCGTCCTTATGGATAGTATGGTTGTGCC
TTATAATTCACATATGCTATGTTACCTTCCTTCCCTCAATTGTGCCTTAGTTGCATACCT
GCATGTTTCTTCGGTAACATTTGATGCTTATGCTCAGCTTTGTCATTTTTGTTGTAATCA
GAATGATGTTAATGGACAGGATTGTTAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case