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Oryza sativa
cluster # 4657 cluster # 4657       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4657#0 length = 1968 sequences # 3  

consensusID : consensus_4657#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1968
fasta sequence
                              [CCCCGAAGCACTAGGCCCTAGAAGCGGGGGGCACGCGGCGCCAGAGCCACCGACTCCGCCGGCGGCGGCCGGATCCGGCGAGCTTGCGGCGCCAGGCTAGGGCTCCTCCTCGCCGTCGTCGTCGACCGGCGGCTAATCCACCAGCGCCTGGGTGATCGGTGAGTCGGCTCTTCGTTTCTTGCCGCGCGGTGCCCTTCGCCCGCCACCTGTTCGACGGAATGCCTCCTAGGCGAAGGGGCTCGAGAGGCGAGGAGATGGCGGAGGCCAGCAAGGAGGGCGGGATCAACGCCCTCCCCGACGAGCTCCTCCAGCACGTCCTGTCCTTGCTGTCAGCCGATGAGGCCGTCAAGACCTGCGTCCTGTCCCGGCGATGGCGCCACCTCTGGAGATCCACGGACGTCCTGCGCCTTGATGCTGATAAGGAGAGATGGAAGAGCTCCAAGCGGTTCAAGAAGTTTGTCAACCATCTAGTGCTCTTCCGGGGCTGCTCGCCTCTACGCGAGTTTGATTTGGAATTCAGTTCATGTCGAGAGAAGGATGAAAAGGGTGAAGACAGTGACGAGGATGAATCAGACGATGACAGAGGTGAGGATGAATCAGATGAAGACAGTGATGGCGATGAATCAGATGAACACAGTGACGACGGTGAATCAGATGACGACAGTGACGAGGACGAAGACAGTAATCCATTCCAATGTGTCATGATGTGGGTCATGTATGCTCTAATATGCCAAGTTCAGGTGCTCAAAATCCACAACTTCAATGAAAGATACATTGAAATAGATGGCGGCATGCCTCTCGTCTCACAGCACTTGACTAAGATAGAACTTTCTGGTATAGTGTTAAAGGATTGTTTTCTTAACTTCTCAAGCTGTCCCGCATTGAAAGAGCTATATTTCACCAAGAATTGCTGCTTTGACTCTGTCAAGAAGATCTTCTTCCAGTCAATGCAATGCCTTCGGATCTTCTGTTGTCAATTCAGTGAATATCACCGCACACTCATTTATGCACCAAGCCTCATTAGGCTCTTTCTTGAAGGTTTTTGGGGCAGAACTCCTTTTCTGGAAAGAATGCCCTCATTAGTTGAAGCATCTGTCAGACCCCACCAGGATTGTGATGACTGGTGTAGTAATACTTACACTGGTAATTGTGAAGATGAAGACTGTGATGGTTGTCATGGTATGATAGATAAGATCGGCAACAGTTCCAATTGTGTGCTCCTTGGAGGTCTATCAGAAGCTAAGAGTTTGAAGTTGATAGCTGGACCTGAAATAATTATTTTTGGAAGTGATTTGAGATGGTG-CCCTATGTTTAGCAAGCTGAAGAATTTGTTACTCAATGAGTGGTGTCTTCTGTCTAATTTCTGGGCACTAGCCTGTATTCTTGAACACTCACCAGTTCTACGGAAGCTCACTCTTCAAATTTCCAAGGAAGCTAAATCTATGATGCAAACAGAAGAGAATGGCAATCCATTGCGGAAACCAGCTGCAATATCTGAACACCTT-AAGGTAGTGAAAGTCCACTGTAAAGAAGTTGATGAGGTGGTTTACAAAATTGGGAAGTGGTTGAGTACATTGGACATAAAAGTTCTTATCAAACGGAGGAATCAATCACCAAAACGTTTCTGTTCAAGTAAGGTCTAAAAACTGGATTGTCCATGGATCTACAGGTCTAAAATGGTTTCACCGCGTTGGTGCTTACTGCTTAATTTGCTGTGACAACTGAGAAGGTTGCCATTTTCTGTCTGTAGGTGTCATATGTCAGTTCCAGTCATATTGACAGTTGGAAATATAAGTCAGAATTTGTAATTGTAGGGCCCTAAAAAAAAGGATTTGGAAGTGCAGGTAATCTATGGGTTTCTGGTTTGATAAATCTGCTACCTTTAACATGTCTAGCTCTGTGAACATTGCTCCGTCTGAAATGTTTGATAGTATGCACATCTGGTAATGTGTTTGAAAAAAAAAAAAA]

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[-] EMBL CA759374             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATAATTATTTTTGGAAGTGATTTGAGATGGTG CCCTATGTTTAGCAAGCTGAAGAATTTGTTACTCAGTGAGTGGTGTCTTCTGTCTAATTTCTGGGCACTAGCCTGTATCCTTGAACACTCACCAGTTCTACGGAAGCTCACTCTTCAAATTTCCAAGGAAGCTAAATCTNTGATGCAAACAGAAGAGAATGGCAATCCATTGCGGAAACCAGCTGCAATATCTGAACACCTT AAGGTAGTGAAAGTCCCCTGTAAAGAAGTTGATGAGGTGGTTTACAAAATTGGGAAGTGGTTGAGTACATTGGACATAAAAGTTCTTATCAAACGGAGGAATCAATCCCCAAAACGTTTCTGTTCAAGTAAGGTCTAAAAACTGGATTGTCCATGGATCTACAGGTCTAAAATGGTTTCACCGCGTTGGTGCTTACTGCTTAATTTGCTGTGACAACTGAGAAGGTTGCCATTTTCTGTCTGTAGGTGTCATATGTCAGTTCCAGTCATATTGACAGTTGGAAATATAAGTCAGAATTTGTAATTGTAGGGCCCT AAAAAAAGGATTTGGAAGTGCAGGTAATCTATGGGTTTCTGGTTTGATAAATTTGCTACCTTTAACATATCTAGCTCTGTGAACATTGCTCCGTTTGAAATGTTTGATAGTATGCACATCTGGTAATGTGTTTGAAAAAAAAAAAAA]
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>consensus_4657#0 CCCCGAAGCACTAGGCCCTAGAAGCGGGGGGCACGCGGCGCCAGAGCCACCGACTCCGCC GGCGGCGGCCGGATCCGGCGAGCTTGCGGCGCCAGGCTAGGGCTCCTCCTCGCCGTCGTC GTCGACCGGCGGCTAATCCACCAGCGCCTGGGTGATCGGTGAGTCGGCTCTTCGTTTCTT GCCGCGCGGTGCCCTTCGCCCGCCACCTGTTCGACGGAATGCCTCCTAGGCGAAGGGGCT CGAGAGGCGAGGAGATGGCGGAGGCCAGCAAGGAGGGCGGGATCAACGCCCTCCCCGACG AGCTCCTCCAGCACGTCCTGTCCTTGCTGTCAGCCGATGAGGCCGTCAAGACCTGCGTCC TGTCCCGGCGATGGCGCCACCTCTGGAGATCCACGGACGTCCTGCGCCTTGATGCTGATA AGGAGAGATGGAAGAGCTCCAAGCGGTTCAAGAAGTTTGTCAACCATCTAGTGCTCTTCC GGGGCTGCTCGCCTCTACGCGAGTTTGATTTGGAATTCAGTTCATGTCGAGAGAAGGATG AAAAGGGTGAAGACAGTGACGAGGATGAATCAGACGATGACAGAGGTGAGGATGAATCAG ATGAAGACAGTGATGGCGATGAATCAGATGAACACAGTGACGACGGTGAATCAGATGACG ACAGTGACGAGGACGAAGACAGTAATCCATTCCAATGTGTCATGATGTGGGTCATGTATG CTCTAATATGCCAAGTTCAGGTGCTCAAAATCCACAACTTCAATGAAAGATACATTGAAA TAGATGGCGGCATGCCTCTCGTCTCACAGCACTTGACTAAGATAGAACTTTCTGGTATAG TGTTAAAGGATTGTTTTCTTAACTTCTCAAGCTGTCCCGCATTGAAAGAGCTATATTTCA CCAAGAATTGCTGCTTTGACTCTGTCAAGAAGATCTTCTTCCAGTCAATGCAATGCCTTC GGATCTTCTGTTGTCAATTCAGTGAATATCACCGCACACTCATTTATGCACCAAGCCTCA TTAGGCTCTTTCTTGAAGGTTTTTGGGGCAGAACTCCTTTTCTGGAAAGAATGCCCTCAT TAGTTGAAGCATCTGTCAGACCCCACCAGGATTGTGATGACTGGTGTAGTAATACTTACA CTGGTAATTGTGAAGATGAAGACTGTGATGGTTGTCATGGTATGATAGATAAGATCGGCA ACAGTTCCAATTGTGTGCTCCTTGGAGGTCTATCAGAAGCTAAGAGTTTGAAGTTGATAG CTGGACCTGAAATAATTATTTTTGGAAGTGATTTGAGATGGTGCCCTATGTTTAGCAAGC TGAAGAATTTGTTACTCAATGAGTGGTGTCTTCTGTCTAATTTCTGGGCACTAGCCTGTA TTCTTGAACACTCACCAGTTCTACGGAAGCTCACTCTTCAAATTTCCAAGGAAGCTAAAT CTATGATGCAAACAGAAGAGAATGGCAATCCATTGCGGAAACCAGCTGCAATATCTGAAC ACCTTAAGGTAGTGAAAGTCCACTGTAAAGAAGTTGATGAGGTGGTTTACAAAATTGGGA AGTGGTTGAGTACATTGGACATAAAAGTTCTTATCAAACGGAGGAATCAATCACCAAAAC GTTTCTGTTCAAGTAAGGTCTAAAAACTGGATTGTCCATGGATCTACAGGTCTAAAATGG TTTCACCGCGTTGGTGCTTACTGCTTAATTTGCTGTGACAACTGAGAAGGTTGCCATTTT CTGTCTGTAGGTGTCATATGTCAGTTCCAGTCATATTGACAGTTGGAAATATAAGTCAGA ATTTGTAATTGTAGGGCCCTAAAAAAAAGGATTTGGAAGTGCAGGTAATCTATGGGTTTC TGGTTTGATAAATCTGCTACCTTTAACATGTCTAGCTCTGTGAACATTGCTCCGTCTGAA ATGTTTGATAGTATGCACATCTGGTAATGTGTTTGAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)