cluster # 483

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Oryza sativa
cluster # 483 cluster # 483 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_483#0 length = 600 sequences # 2

consensusID : consensus_483#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 600
fasta sequence

                              [AATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTTTTTATTGGTGTATGATCTGGATTTTTAGGTGCTAGTATAAGTTTAATTATTCGTACTGAGCTTGGTATGGTAGGGAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTGACTGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTCTTTTTTGTTATGCCTGTAGCTGTAGGTGGATTTGGAAATTGATTGTTACCTTTAATAATAAATGCTATAGATATAGCTTTTCCTCGATTGAATAATTTGAGGTTTTGATTAGTACCTGTAGCTTTATTGTTTATAAGTTTGAGGTTATTAGTTGGGTTAGGTCCTGGTACTGGTTGAACAGTTTATCCTCCTTTGTCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGTTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGTCTTCATGTGGCTGGTGTGTCTTCTATTCTGGGAAGAATTAATTTTATTACTACTTGTTTAAAGGGTAAGATTAGTTATGTTTTAAGATTAGAATTTTTAACTTTATTTACTTGAGCTATAGTTGTTACTAGGTTTTTATTATTGTTTAGTCTACCTGTGTTGGCTGGTGGGATTACTATGTTA]

[+] EMBL CA758782             [AATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTTTTTATTGGTGTATGATCTGGATTTTTAGGTGCTAGTATAAGTTTAATTATTCGTACTGAGCTTGGTATGGTAGGGAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTGACTGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTCTTTTTTGTTATGCCTGTAGCTGTAGGTGGATTTGGAAATTGATTGTTACCTTTAATAATAAATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CA755393             [         GATATTGGAACTTTATATTTTATTATTGGTGTATGATCTGGATTTTTAGGTGCTAGTATAAGTTTAATTATTCGTACTGAGCTTGGTATGGTAGGGAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTGACTGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTCTTTTTTGTTATGCCTGTAGCTGTAGGTGGATTTGGAAATTGATTGTTACCTTTAATAATAAATGCTATAGATATAGCTTTTCCTCGATTGAATAATTTGAGGTTTTGATTAGTACCTGTAGCTTTATTGTTTATAAGTTTGAGGTTATTAGTTGGGTTAGGTCCTGGTACTGGTTGAACAGTTTATCCTCCTTTGTCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGTTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGTCTTCATGTGGCTGGTGTGTCTTCTATTCTGGGAAGAATTAATTTTATTACTACTTGTTTAAAGGGTAAGATTAGTTATGTTTTAAGATTAGAATTTTTAACTTTATTTACTTGAGCTATAGTTGTTACTAGGTTTTTATTATTGTTTAGTCTACCTGTGTTGGCTGGTGGGATTACTATGTTA]




>consensus_483#0
AATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTTTTTATTGGTGTATGATCTGGATTTTTAGGT
GCTAGTATAAGTTTAATTATTCGTACTGAGCTTGGTATGGTAGGGAGAATTATTATAGAT
GATCAGATTTATAATTCTATGGTGACTGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTCTTTTTTGTT
ATGCCTGTAGCTGTAGGTGGATTTGGAAATTGATTGTTACCTTTAATAATAAATGCTATA
GATATAGCTTTTCCTCGATTGAATAATTTGAGGTTTTGATTAGTACCTGTAGCTTTATTG
TTTATAAGTTTGAGGTTATTAGTTGGGTTAGGTCCTGGTACTGGTTGAACAGTTTATCCT
CCTTTGTCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGTTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGTCTT
CATGTGGCTGGTGTGTCTTCTATTCTGGGAAGAATTAATTTTATTACTACTTGTTTAAAG
GGTAAGATTAGTTATGTTTTAAGATTAGAATTTTTAACTTTATTTACTTGAGCTATAGTT
GTTACTAGGTTTTTATTATTGTTTAGTCTACCTGTGTTGGCTGGTGGGATTACTATGTTA

clustalw multiple alignements is not computed in this case