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Oryza sativa
cluster # 4838 cluster # 4838       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4838#0 length = 675 sequences # 3  

consensusID : consensus_4838#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 675
fasta sequence
                              [TTTTTTTTTTTTTGGGACAGAGGAGGACATGATAAGCATGTATAGTAGAAAAATATTAATTCTAAATCTTGACCTCATATAATTGTAGTTCAACTGTGACTTAGG-ATTGTTTATTGTA-AAATTATGCAATGAGATAATCCTTAACTACAATATTATGGACCACACAAATCTAACATACTGAGCATGGATATTTGTTGAATGTTAATTACAATTAGAAAAAATCTACCCATCATATGTCATGAAGAATTCTAGTAATAATGCTAGCGGAAGTTAACTAAACTGTGCCAACAAATAAATCAACCATATACGTTAGTCTTGCTAATGTTATGTGATTTCCAATCTCCATTAATAAGCCAATCCCCAGCCTGTCCATTTGAATCATTACATTTAGATTACTCTATGAGCCATTTCACGTCTCTAGTGCCAATCATTTTATGTAGAGTGGAGCCACTGTAGTGATAATCCATCCATAGCCCAGTGAGTAGACTAAACCGCATGTTAACAAAATGTATGTATCATGTGTGTTGGTTAGCTCCTAAATAGGCCATCATGACCATAGAAGGATTAAGAAGTCTTAGCCCCTAAGCTCTCTTGCCCATAAGGTGCTTGCATGTTGAGTAATTTAAAGCCTAAGCTACCTCAATTTTCCCCCTTGGCTCGTCCGGCTCACCTAAT]

[+] EMBL CA761520             [TTTTTTTTTTTTTGGGACAGAGGAGGACATGATAAGCATGTATAGTAGAAAAATATTAATTCTAAATCTTGACCTCATATAATTGTAGTTCAACTGTGACTTAGG ATTGTTTATTGTA AAATTATGCAATGAGATAATCCTTAACTACAATATTATGGACCACACAAATCTAACATACTGAGCATGGATATTTGTTGAATGTTAATTACAATTAGAAAAAATCTACCCATCATATGTCATGAAGAATTCTAGTAATAATGCTAGCGGAAGTTAACTAAACTGTGCCAACAAATAAATCAACCATATACGTTAGTCTTGCTAATGTTATGTGATTTCCAATCTCCATTAATAAGCCAATCCCCAGCCTGTCCATTTGAATCATTACATTTAGATTACTCTATGAGCCATTTCACGTCTCTAGTGCCAATCATTTTATGTAGAGTGGAGCCACTGTAGTGATAATCCATCCATAGCCCAGTGAGTAGACTAAACCGCATGTTAACAAAATGTATGTATCATGTGTGTTGGTTAGCTCCTAAATAGGCCATCATGACCATAGAAGGATTAAGAAGTCTTAGCCCCTAAGCTCTCTTGCCCATAAGGTGCTTGCATGTTGAGTAATTTAAAGCCTAAGCTACCTCAATTTTCCCCCTTGGCTCGTCCGGCTCACCTAAT]
[+] EMBL CA761240             [TTTTTTTTTTTTTGGGACAGAGGAGGACATGATAAGCATGTATAGTAGAAAAATATTAATTCTAAATCTTGACCTCATATAATTGTAGTTCAACTGTGACTTAGG ATTGTTTATTGTA AAATTATGCAATGAGATAATCCTTAACTACAATATTATGGACCACACAAATCTAACATACTGAGCATGGATATTTGTTGAATGTTAATTACAATTAGAAAAAATCTACCCATCATATGTCATGAAGAATTCTAGTAATAATGCTAGCGGAAGTTAACTAAACTGTGCCAACAAATAAATCAACCATATACGTTAGTCTTGCTAATGTTATGTGATTTCCAATCTCCATTAATAAGCCAATCCCCAGCCTGTCCATTTGAATCATTACATTTAGATTACTCTATGAGCCATTTCACGTCTCTAGTGCCAATCATTTTATGTAGAGTGGAGCCACTGTAGTGATAATCCATCCATAGCCCAGTGAGTAGACTAAACCGCATGTTAACAAAATGTATGTATCATGTGTGTTGGTTAGCTCCTAAATAGGCCATCATGACCATAGAAGGATTAAGAAGTCTTAGCCCCTAAGCTCTCTTGCCCATAAGGTGCTTGCATGTTGAGTAATTTAAAGCCTAAGCTACCTCAATTTTCCCCCTTGGCTCGTCCGGCTCACCTAAT]
[-] EMBL CA765593             [                                                                                        tcCACCTGNGACTTAGGAATTGTTTAGTGNAGAAATTATGCAATGAGATAATCCTTAGCTACAATATTATGGACCACACAAATCTAACATACTGAGCATGGATATTTGTTGAATGTTAATTACAATTAGAAAAAATCTACCCATCATATGTCATGAAGAATCCTAGTAATAATGCTAGCGGAAGTTAACTAANCTGTGCCAACAAATAAATCAACCATATACGTCAGTCTTGCTAATGTTATGTNATTTCCAATCTCCATaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]


>consensus_4838#0 TTTTTTTTTTTTTGGGACAGAGGAGGACATGATAAGCATGTATAGTAGAAAAATATTAAT TCTAAATCTTGACCTCATATAATTGTAGTTCAACTGTGACTTAGGATTGTTTATTGTAAA ATTATGCAATGAGATAATCCTTAACTACAATATTATGGACCACACAAATCTAACATACTG AGCATGGATATTTGTTGAATGTTAATTACAATTAGAAAAAATCTACCCATCATATGTCAT GAAGAATTCTAGTAATAATGCTAGCGGAAGTTAACTAAACTGTGCCAACAAATAAATCAA CCATATACGTTAGTCTTGCTAATGTTATGTGATTTCCAATCTCCATTAATAAGCCAATCC CCAGCCTGTCCATTTGAATCATTACATTTAGATTACTCTATGAGCCATTTCACGTCTCTA GTGCCAATCATTTTATGTAGAGTGGAGCCACTGTAGTGATAATCCATCCATAGCCCAGTG AGTAGACTAAACCGCATGTTAACAAAATGTATGTATCATGTGTGTTGGTTAGCTCCTAAA TAGGCCATCATGACCATAGAAGGATTAAGAAGTCTTAGCCCCTAAGCTCTCTTGCCCATA AGGTGCTTGCATGTTGAGTAATTTAAAGCCTAAGCTACCTCAATTTTCCCCCTTGGCTCG TCCGGCTCACCTAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)