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Oryza sativa
cluster # 4912 cluster # 4912       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4912#0 length = 2934 sequences # 3  

consensusID : consensus_4912#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 2934
fasta sequence
                              [CACGCGCACGGCGCACCCAGATCCAAGCGTCCATCGCCGCGGCCGCATCCGCCATGGCTCCGACGGCGCCCACGGCGGCGAAGTCCGCCTCCCCGTCCCAGCCATCCGGGAAGAGCGAGGTGGCGGATCTGAAGCAGCAGCTGCGGCAGCTGGCGGGGAGCCGCGCGCCCGACGCCGACGACCAGCGGAGGGACGTCTTCAAGCGGGTGATCTCCTGCATGACGGCCGGCATCGACGTGTCGGCGGCGTTCGGGGAGATGGTGCTCTGCTCCGCCACCTCCGACGTCGTGCTGAAGAAGATGTGCTACCTCTACGTCGGCGTCCACGCGCGCAACCACCCGGACCTCGCGCTCCTCACCATCAACTTCCTCCAGCGCGACTGCCACGACCAGGACCCCACCATACGCGGCCTGGCACTCCGCAGCCTCTGCTCCCTCCGCGTTCCCAACCTCGTCGAGTACCTTGTCTCGCCGCTCGCCACTGGGCTCAAGGACCCCAGTGCTTACGTCCGGATGATCGCTGCTGTTGGTGCTGCGAAGCTGTATCACATATCTGCCACCGCCTGCCTTGATGCTGACTTGCCTGCGGCGCTCAAAGCGCTTATGCTCTCTGATCCTGATGCACAGGTGAGTTGCCATTCCACAAACAATGTTGTGATTATCATGCAACTATGATGCTGCTACCTGTTGCAATGATTCATTATCTGTAGATTATAGTGCTCACAATACCGTTTAATTACCACCGAAAAGTCTATGACATCTGTAGTGCTGATTTAAAGTTGGAACTGGTAGACAATCAGTAAGGATTTAATACTTCTTGCATGCCAATGTGAGCTGTAACTTGAAATTTGGTTCAGCATGCAGCCGGCCAATCGTTTTCTACTTTGCAGTTTGTCTAATAGAACAGGTGGAGGGAAATGCCTAATGAAGCTGCATGCTAGTGATATTAATCTTCATTGATAATAGTTTGATTTTGATCTGATTGATCATATAGGTTGTTGGTAATTACTTGGACCGACATATTTTGTGATGGAAAGTATAGTGACTTAACATTGCTGAAGTAGCTTGAAGCCTTGAAGTGAAACCACAATGCTAGTCAAGACAAAACTACTGAACCTAGATACACCCTATTCTTTTAAGGTTACATAATGGAAGAAATCAACTCTGAACCAATCTGATCATGCATCTATGTGGGTTTGATTTCTGGGAAGGATTTGGAGGCTATTAGGTGAATTCATATATTTTTGCTCAAAACATTCTTGTTTTGGCTTAGGCTTTTAAGATTTCAGCCACAAGTTGAAGGGTAGAGTCATAATTTTCTTCTGGTTATTAGTTCTATCATGATCTTTGGCTTTTAAAAGTCCCTGTGGTAAAGCTGTCTGTTACTTAAGGCTTAGAATTTTTGGTTTATAAGCCAGCGAATTAGCTGAAGCAAGCAGGGCTCAACATATGAATGTGGTTCTGGGAAAATAGATACCATGGTACTCAAATATAACCTTGCAAGAATAAGAGTCTGAACACAGGTAAAAATGGTACTGAGAGGATAGATACCTTGGCTGCCTTTATTGGTTCTGTTTCTAACTCGCTATCCCCATTTTCTACCGCTCTTGTCCATTTTTCATTGTTGCATGCTGTTGCCACCTTGAGAGTCCCTGCCTCACCATGCCGCCACACCTTTGAAGTGTACTTTTGATATTCTGTTTGTCTGCTACATTTTACATGCGTATGATTTATAAATTTTGGAACAATTGTTTCAGTATTTGCCAACATAAATTCCTACAATACTATTGATGTATATTTCTATTATGTGCTTAACATTTCTGGAATGTTCATGCATAATATCCACATGTATTCATGACCATATTCATATTAAATCTATCTGCATGTAATTTGTATTTGATATTATACGAATCCATATCCCAAACTGAAAGAAACATTATATAGGATGTGAAAAACCCATACATGGCCACATTTTACAAGATTGCAGCCCTACATTCAGTATTGTTCCTGACTGCCTGTATAAGATGCTATTCTTCTATACACCTTTTGAATAAAGTTACACAACTCTTAATATTATTCAGATGTGTACAACTTAAGAAATTGGTCACACACTTTAAGTCTCAAATGATTGTACCTTGTGAGAGTAGTGTCAGTCGTCTCAGCCGTATGCTGTTTTATATCTAACAAATACTCCGCCTTTCCACTCCAAATGCACGATTGGCTATGGATTTTCTCACATGAACATATAGGAGAAATACTAAACACTGCAATTTGTTTTTGGAACAACACAGGAGAGCTGCATGTTATTTCATTAAGGAGGAAAAAACAAAGTACACATGGTCAAGAAGGAAATCCTGACCTGAATATACATATTCACACACACTAAACACTGCAGTTTGTGCAATTATTCTAGATTCAACAGCATTTTGCTTGTACCCTTGGGTTCTTGTTTTCTCACAATGCCTTCAACAGTATAATACAACATAATAGGTTTACATAGTGTTCACTAGCCAAACTAGATAGGGTACTTCAGAGATAGTATTTACCAAGAATTATATTGCAGTTTTTTAGTTATATTTAATGTTTAAAGACATCTCAATTTTGCCATTTATGATTTATCACTAGAACATATTGTAATTCTTTTTGTTCCACGAGTAATATTGGTGTTCTACCCAAAGTAATTGAAACCACAGTAGGTGTTGAACTGCCCAGGTGTTTGGCTTGCTAGTTTGCTGGCCAACAGCTGGTTCACTATTTAAATCGGTCATTGGTGGTCAAGTGAGTGGTAAACTCATGTTATATATAATACTAATAGGAGAGTAGCCAGGAGCCCAGGACAATAAGCCATGGTTGGCAACTTCCACAGCTCCTAGGTGGTCGGACCTCTTGGTATACTAGCATATTTGTCCATGCATTATCTCAATTCTCAAAAAAA]

[+] EMBL AK066892             [CACGCGCACGGCGCACCCAGATCCAAGCGTCCATCGCCGCGGCCGCATCCGCCATGGCTCCGACGGCGCCCACGGCGGCGAAGTCCGCCTCCCCGTCCCAGCCATCCGGGAAGAGCGAGGTGGCGGATCTGAAGCAGCAGCTGCGGCAGCTGGCGGGGAGCCGCGCGCCCGACGCCGACGACCAGCGGAGGGACGTCTTCAAGCGGGTGATCTCCTGCATGACGGCCGGCATCGACGTGTCGGCGGCGTTCGGGGAGATGGTGCTCTGCTCCGCCACCTCCGACGTCGTGCTGAAGAAGATGTGCTACCTCTACGTCGGCGTCCACGCGCGCAACCACCCGGACCTCGCGCTCCTCACCATCAACTTCCTCCAGCGCGACTGCCACGACCAGGACCCCACCATACGCGGCCTGGCACTCCGCAGCCTCTGCTCCCTCCGCGTTCCCAACCTCGTCGAGTACCTTGTCTCGCCGCTCGCCACTGGGCTCAAGGACCCCAGTGCTTACGTCCGGATGATCGCTGCTGTTGGTGCTGCGAAGCTGTATCACATATCTGCCACCGCCTGCCTTGATGCTGACTTGCCTGCGGCGCTCAAAGCGCTTATGCTCTCTGATCCTGATGCACAGGTGAGTTGCCATTCCACAAACAATGTTGTGATTATCATGCAACTATGATGCTGCTACCTGTTGCAATGATTCATTATCTGTAGATTATAGTGCTCACAATACCGTTTAATTACCACCGAAAAGTCTATGACATCTGTAGTGCTGATTTAAAGTTGGAACTGGTAGACAATCAGTAAGGATTTAATACTTCTTGCATGCCAATGTGAGCTGTAACTTGAAATTTGGTTCAGCATGCAGCCGGCCAATCGTTTTCTACTTTGCAGTTTGTCTAATAGAACAGGTGGAGGGAAATGCCTAATGAAGCTGCATGCTAGTGATATTAATCTTCATTGATAATAGTTTGATTTTGATCTGATTGATCATATAGGTTGTTGGTAATTACTTGGACCGACATATTTTGTGATGGAAAGTATAGTGACTTAACATTGCTGAAGTAGCTTGAAGCCTTGAAGTGAAACCACAATGCTAGTCAAGACAAAACTACTGAACCTAGATACACCCTATTCTTTTAAGGTTACATAATGGAAGAAATCAACTCTGAACCAATCTGATCATGCATCTATGTGGGTTTGATTTCTGGGAAGGATTTGGAGGCTATTAGGTGAATTCATATATTTTTGCTCAAAACATTCTTGTTTTGGCTTAGGCTTTTAAGATTTCAGCCACAAGTTGAAGGGTAGAGTCATAATTTTCTTCTGGTTATTAGTTCTATCATGATCTTTGGCTTTTAAAAGTCCCTGTGGTAAAGCTGTCTGTTACTTAAGGCTTAGAATTTTTGGTTTATAAGCCAGCGAATTAGCTGAAGCAAGCAGGGCTCAACATATGAATGTGGTTCTGGGAAAATAGATACCATGGTACTCAAATATAACCTTGCAAGAATAAGAGTCTGAACACAGGTAAAAATGGTACTGAGAGGATAGATACCTTGGCTGCCTTTATTGGTTCTGTTTCTAACTCGCTATCCCCATTTTCTACCGCTCTTGTCCATTTTTCATTGTTGCATGCTGTTGCCACCTTGAGAGTCCCTGCCTCACCATGCCGCCACACCTTTGAAGTGTACTTTTGATATTCTGTTTGTCTGCTACATTTTACATGCGTATGATTTATAAATTTTGGAACAATTGTTTCAGTATTTGCCAACATAAATTCCTACAATACTATTGATGTATATTTCTATTATGTGCTTAACATTTCTGGAATGTTCATGCATAATATCCACATGTATTCATGACCATATTCATATTAAATCTATCTGCATGTAATTTGTATTTGATATTATACGAATCCATATCCCAAACTGAAAGAAACATTATATAGGATGTGAAAAACCCATACATGGCCACATTTTACAAGATTGCAGCCCTACATTCAGTATTGTTCCTGACTGCCTGTATAAGATGCTATTCTTCTATACACCTTTTGAATAAAGTTACACAACTCTTAATATTATTCAGATGTGTACAACTTAAGAAATTGGTCACACACTTTAAGTCTCAAATGATTGTACCTTGTGAGAGTAGTGTCAGTCGTCTCAGCCGTATGCTGTTTTATATCTAACAAATACTCCGCCTTTCCACTCCAAATGCACGATTGGCTATGGATTTTCTCACATGAACATATAGGAGAAATACTAAACACTGCAATTTGTTTTTGGAACAACACAGGAGAGCTGCATGTTATTTCATTAAGGAGGAAAAAACAAAGTACACATGGTCAAGAAGGAAATCCTGACCTGAATATACATATTCACACACACTAAACACTGCAGTTTGTGCAATTATTCTAGATTCAACAGCATTTTGCTTGTACCCTTGGGTTCTTGTTTTCTCACAATGCCTTCAACAGTATAATACAACATAATAGGTTTACATAGTGTTCACTAGCCAAACTAGATAGGGTACTTCAGAGATAGTATTTACCAAGAATTATATTGCAGTTTTTTAGTTATATTTAATGTTTAAAGACATCTCAATTTTGCCATTTATGATTTATCACTAGAACATATTGTAATTCTTTTTGTTCCACGAGTAATATTGGTGTTCTACCCAAAGTAATTGAAACCACAGTAGGTGTTGAACTGCCCAGGTGTTTGGCTTGCTAGTTTGCTGGCCAACAGCTGGTTCACTATTTAAATCGGTCATTGGTGGTCAAGTGAGTGGTAAACTCATGTTATATATAATACTAATAGGAGAGTAGCCAGGAGCCCAGGACAATAAGCCATGGTTGGCAACTTCCACAGCTCCTAGGTGGTCGGACCTCTTGGTATACTAGCATATTTGTCCATGCATTAT                 ]
[+] EMBL AU165843             [                                                       GGCTCCGACGGCGCCCACGGCGGCGAAGTCCGCCTCCCCGTCCCAGCCATCCGGGAAGAGCGAGGTGGCGGATCTGAAGCAGCAGCTGCGGCAGCTGGNGGGGAGCCGCGCGCCCGACGCCGACGACCAGCGGAGGGACGTCTTCAAGCGGGTGATCNCCTGCATGACGGCCGGCATCGACGTGTCGGCGGCGTTCGGGGAGATGGTGCTCTGCTCCGCCACCTCCGACGTCGTGCTGAAGAAGATGTGCTACCTCTACGTCGGCGTCCACGCGCGCAACCACCCGGACCTCGCGCTCCTCACCATCAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CA761935             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aggacgagACA AGGAGAGCTGCATGTTATTTCATTAAGGAGGAAAAAACAAAGTACACATGGTCAAGAAGGAAATCCTGACCTGAATATACATATTCACACACACTAAACACTGCAGTTTGTGCAATTATTCTAGATTCAACAGCATTTTGCTTGTACCCTTGGGTTCTTGTTTTCTCACAATGCCTTCAACAGTATGATACAACATAATAGGTTTACATAGTGTTCACTAGCCAAACTAGATAGGGTACTTCAGAGATAGTATTTACCAAGAATTATATTGCAGTTTTTTAGTTATATTTAATGTTTAAAGACATCTCAATTTTGCCATTTATGATTTATCACTAGAACATATTGTAATTCTTTTTGTTCCACGAGTAATATTGGTGTTCTACCCAAAGTAATTGAAACCACAGTAGGTGTTGAACTGCCCAGGTG TTGGCTTGCTAGTTTGCTGGCCAACAGCTGGTTCACTATTTAAATCGGTCATTGGTGGTCAAGTGAGTGGTAAACTCATGTTATATATAATACTAATAGGAGAGTAGCCAGGAGCCCAGGACAATAAGCTATGGTTGGCAACTTCCACAGCTCCTAGGTGGTCGGACCTCTTGGTATACTAGCATATTTGTCCATGCATTATCTCAATTCTCAAAAAAA]


>consensus_4912#0 CACGCGCACGGCGCACCCAGATCCAAGCGTCCATCGCCGCGGCCGCATCCGCCATGGCTC CGACGGCGCCCACGGCGGCGAAGTCCGCCTCCCCGTCCCAGCCATCCGGGAAGAGCGAGG TGGCGGATCTGAAGCAGCAGCTGCGGCAGCTGGCGGGGAGCCGCGCGCCCGACGCCGACG ACCAGCGGAGGGACGTCTTCAAGCGGGTGATCTCCTGCATGACGGCCGGCATCGACGTGT CGGCGGCGTTCGGGGAGATGGTGCTCTGCTCCGCCACCTCCGACGTCGTGCTGAAGAAGA TGTGCTACCTCTACGTCGGCGTCCACGCGCGCAACCACCCGGACCTCGCGCTCCTCACCA TCAACTTCCTCCAGCGCGACTGCCACGACCAGGACCCCACCATACGCGGCCTGGCACTCC GCAGCCTCTGCTCCCTCCGCGTTCCCAACCTCGTCGAGTACCTTGTCTCGCCGCTCGCCA CTGGGCTCAAGGACCCCAGTGCTTACGTCCGGATGATCGCTGCTGTTGGTGCTGCGAAGC TGTATCACATATCTGCCACCGCCTGCCTTGATGCTGACTTGCCTGCGGCGCTCAAAGCGC TTATGCTCTCTGATCCTGATGCACAGGTGAGTTGCCATTCCACAAACAATGTTGTGATTA TCATGCAACTATGATGCTGCTACCTGTTGCAATGATTCATTATCTGTAGATTATAGTGCT CACAATACCGTTTAATTACCACCGAAAAGTCTATGACATCTGTAGTGCTGATTTAAAGTT GGAACTGGTAGACAATCAGTAAGGATTTAATACTTCTTGCATGCCAATGTGAGCTGTAAC TTGAAATTTGGTTCAGCATGCAGCCGGCCAATCGTTTTCTACTTTGCAGTTTGTCTAATA GAACAGGTGGAGGGAAATGCCTAATGAAGCTGCATGCTAGTGATATTAATCTTCATTGAT AATAGTTTGATTTTGATCTGATTGATCATATAGGTTGTTGGTAATTACTTGGACCGACAT ATTTTGTGATGGAAAGTATAGTGACTTAACATTGCTGAAGTAGCTTGAAGCCTTGAAGTG AAACCACAATGCTAGTCAAGACAAAACTACTGAACCTAGATACACCCTATTCTTTTAAGG TTACATAATGGAAGAAATCAACTCTGAACCAATCTGATCATGCATCTATGTGGGTTTGAT TTCTGGGAAGGATTTGGAGGCTATTAGGTGAATTCATATATTTTTGCTCAAAACATTCTT GTTTTGGCTTAGGCTTTTAAGATTTCAGCCACAAGTTGAAGGGTAGAGTCATAATTTTCT TCTGGTTATTAGTTCTATCATGATCTTTGGCTTTTAAAAGTCCCTGTGGTAAAGCTGTCT GTTACTTAAGGCTTAGAATTTTTGGTTTATAAGCCAGCGAATTAGCTGAAGCAAGCAGGG CTCAACATATGAATGTGGTTCTGGGAAAATAGATACCATGGTACTCAAATATAACCTTGC AAGAATAAGAGTCTGAACACAGGTAAAAATGGTACTGAGAGGATAGATACCTTGGCTGCC TTTATTGGTTCTGTTTCTAACTCGCTATCCCCATTTTCTACCGCTCTTGTCCATTTTTCA TTGTTGCATGCTGTTGCCACCTTGAGAGTCCCTGCCTCACCATGCCGCCACACCTTTGAA GTGTACTTTTGATATTCTGTTTGTCTGCTACATTTTACATGCGTATGATTTATAAATTTT GGAACAATTGTTTCAGTATTTGCCAACATAAATTCCTACAATACTATTGATGTATATTTC TATTATGTGCTTAACATTTCTGGAATGTTCATGCATAATATCCACATGTATTCATGACCA TATTCATATTAAATCTATCTGCATGTAATTTGTATTTGATATTATACGAATCCATATCCC AAACTGAAAGAAACATTATATAGGATGTGAAAAACCCATACATGGCCACATTTTACAAGA TTGCAGCCCTACATTCAGTATTGTTCCTGACTGCCTGTATAAGATGCTATTCTTCTATAC ACCTTTTGAATAAAGTTACACAACTCTTAATATTATTCAGATGTGTACAACTTAAGAAAT TGGTCACACACTTTAAGTCTCAAATGATTGTACCTTGTGAGAGTAGTGTCAGTCGTCTCA GCCGTATGCTGTTTTATATCTAACAAATACTCCGCCTTTCCACTCCAAATGCACGATTGG CTATGGATTTTCTCACATGAACATATAGGAGAAATACTAAACACTGCAATTTGTTTTTGG AACAACACAGGAGAGCTGCATGTTATTTCATTAAGGAGGAAAAAACAAAGTACACATGGT CAAGAAGGAAATCCTGACCTGAATATACATATTCACACACACTAAACACTGCAGTTTGTG CAATTATTCTAGATTCAACAGCATTTTGCTTGTACCCTTGGGTTCTTGTTTTCTCACAAT GCCTTCAACAGTATAATACAACATAATAGGTTTACATAGTGTTCACTAGCCAAACTAGAT AGGGTACTTCAGAGATAGTATTTACCAAGAATTATATTGCAGTTTTTTAGTTATATTTAA TGTTTAAAGACATCTCAATTTTGCCATTTATGATTTATCACTAGAACATATTGTAATTCT TTTTGTTCCACGAGTAATATTGGTGTTCTACCCAAAGTAATTGAAACCACAGTAGGTGTT GAACTGCCCAGGTGTTTGGCTTGCTAGTTTGCTGGCCAACAGCTGGTTCACTATTTAAAT CGGTCATTGGTGGTCAAGTGAGTGGTAAACTCATGTTATATATAATACTAATAGGAGAGT AGCCAGGAGCCCAGGACAATAAGCCATGGTTGGCAACTTCCACAGCTCCTAGGTGGTCGG ACCTCTTGGTATACTAGCATATTTGTCCATGCATTATCTCAATTCTCAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)