cluster # 4965

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Oryza sativa
cluster # 4965 cluster # 4965 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4965#0 length = 1204 sequences # 3
consensusID : consensus_4965#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1204
fasta sequence
                              [TACCACCTATAGGTGTGCAACGATTTGCTAATCACATCATAATGGCCACACATTCTTTAGGTACTATGTTTGCCTCTGAAATGTACTGCGTATTTTTTATTGTCTTAGTATTCCACATTATCTTTTACTTTTGCATCTTGTACAGCACAAATGGTGAATTAACATAGAGAAAATTCTATTGTTTCAGTGGTTTATACAACTAAAGTTCTTTTCAAATTTAATTCAGGTCAATCAAAGAGCAAGGGAAAAAAAGATGACAGAAAATCAGTATAATTCTATCTCTTTTTTCATATTGAACTTCTTGCTGAATGTTCTTATATGAATAAAAGTATGATTTTGCAGATTAGCATTAGTTATCAGCTGAAAAATCAAAAAAGGGATTTTAGTAAGCAACAAGGAAGATCTCAAGCAAAGATACCTTCAGATATACCACTTCAGTATGGCATCGTAGAGGATCTTGATTCTGAATTGATATTTGATTTCAAGAATGCAGATGCAAGTGGACATCACTGCATACAAATTATGACAGAATGCTTTCATGAAAACATATTGCACGCTCCAGTTGTTGAACATAAAAATGAGGAAGGTCCCTATTCAATTTGGCATGAGCCCTACACAGGCAATCTTAAGTCATATCTGGAATCAACTTCATTAGGGACTAATATGATGCATGGGAGCAAAGTTATGCTGCCAACACCTATGCTACAAAGTATTATAAGCAAAATTTTTGATGGTATGGAGCTGCTGAGGCTGTGTGGAAAGTACCATGGGAATTTTTCTCTGGAGAATACATATTATCTCATAAAGGAACGTAAAATTGTTGTAAAGCTTGCAAACTTTAAAAAGAAAGAGACGAAGAGCTCTACCCGAGTATACCAGGCTGAGGACTTCCAAGCTATTGGTGTCGCACTGCAGGAGATCTCGAAATTCGCTAAAGAACATAAATATTATCGTTTTGACTGCAGTCAAATTGATGATCTTGCTGAAGATCTCAGAGAGTTTGCTTTGTAAGTATGTAGTGACCTAAACTACAGAGTAAATAATTTCAGTATATGNTCTGATGTATGCTAAAATTATGCCGTAGTTGTGTCACAAATATTGGAGATGTCCAAGTAAGCTGNGTCTATTGGAAA-CCAATTCGNGATGGCAAGTCTCGGAATCTTGGNGGTTTTGGGTTAACAATACTGGCATANTTCTTTTTTCT]

[+] EMBL CB633355             [TACCACCTATAGGTGTGCAACGATTTGCTAATCACATCATAATGGCCACACATTCTTTAGGTACTATGTTTGCCTCTGAAATGTACTGCGTATTTTTTATTGTCTTAGTATTCCACATTATCTTTTACTTTTGCATCTTGTACAGCACAAATGGTGAATTAACATAGAGAAAATTCTATTGTTTCAGTGGTTTATACAACTAAAGTTCTTTTCAAATTTAATTCAGGTCAATCAAAGAGCAAGGGAAAAAAAGATGACAGAAAATCAGTATAATTCTATCTCTTTTTTCATATTGAACTTCTTGCTGAATGTTCTTATATGAATAAAAGTATGATTTTGCAGATTAGCATTAGTTATCAGCTGAAAAATCAAAAAAGGGATTTTAGTAAGCAACAAGGAAGATCTCAAGCAAAGATACCTTCAGATATACCACTTCAGTATGGCATCGTAGAGGATCTTGATTCTGAATTGATATTTGATTTCAAGAATGCAGATGCAAGTGGACATCACTGCATACAAATTATGACAGAATGCTTTCATGAAAACATATTGCACGCTCCAGTTGTTGAACATAAAAATGAGGAAGGTCCCTATTCAATTTGGCATGAGCCCTACACAGGCAATCTTAAGTCATATCTGGAATCAACTTCATTAGGGACTAATATGATGCATGGGAGCAAAGTTATGCTGCCAACACCTATGCTACAAAGTATTATAAGCAAAATTTTTGATGGTATGGAGCTGCTGAGGCTGTGTGGAAAGTACCATGGGAATTTCTCTCTGGAGAATACATATTATCTCATAAAGGAACGTAAAATTGTTGTAAAGCTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CA765955             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAATCAAAAAAGGGATTTTAGTAAGCAACAAGGAAGATCTCAAGCAAAGATACCTTCAGATATACCACTTCAGTATGGCATCGTAGAGGATCTTGATTCTGAATTGATATTTGATTTCAAGAATGCAGATGCAAGTGGACATCACTGCATACAAATTATGACAGAATGCTTTCATGAAAACATATTGCACGCTCCAGTTGTTGAACATAAAAATGAGGAAGGTCCCTATTCAATTTGGCATGAGCCCTACACAGGCAATCTTAAGTCATATCTGGAATCAACTTCATTAGGGACTAATATGATGCATGGGAGCAAAGTTATGCTGCCAACACCTATGCTACAAAGTATTATAAGCAAAATTTTTGATGGTATGGAGCTGCTGAGGCTGTGTGGAAAGTACCATGGGAATTTTTCTCTGGAGAATACATATTATCTCATAAAGGAACGTAAAATTGTTGTAAAGCTTGCAAACTTTAAAAAGAAAGAGACGAAGAGCTCTACCCGAGTATACCAGGCTGAGGACTTCCAAGCTATTGGTGTCGCACTGCAGGAGATCTCGAAATTCGCTAAAGAACATAAATATTATCGTTTTGACTGCAGTCAAATTGATGATCTTGCTGAAGATCTCAGAGAGTTTGCTTTGTAAGTATGTAGTGACCTAAACTACAGAGTAAATAATTTCAGTATATGNTCTGATGTATGCTAAAATTATGCCGTAGTTGTGTCACAAATATTGGAGATGTCCAAGTAAGCTGNGTCTATTGGAAA CCAATTCGNGATGGCAAGTCTCGGAATCTTGGNGGTTTTGGGTTAACAATACTGGCATANTTCTTTTTTCT]
[+] EMBL CB096571             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TAGTAAGCAACAAGGAAGATCTCAAGCAAAGATACCTTCAGATATACCACTTCAGTATGGCATCGTAGAGGATCTTGATTCTGAATTGATATTTGATTTCAAGAATGCAGATGCAAGTGGACATCACTGCATACAAATTATGACAGAATGCTTTCATGAAAACATGTTGCACGCTCCAGTTGTTGAACATAAAAATGAGGAAGGTCCCTATTCAATTTGGCATGAGCCCTGCACAGGCAATCTTAAGTCATATCTGGAATCAACTTCATTAGGGACTAATATGATGCATGAGAGCAAAGTTATGCTGCCAACACCTATGCTACAAAGTATTATAAGCAAAATTTTTGATGGTATGGAGCTGCTGAGGCTGTGTGGAAAGTACCATGGGAATTTTTCTCTGGAGAATACATATTATCTCATAAAGGAACGTAAAATTGTTGTAAAGCTTGCAAACTTTAAAAAGAAAGAGACGAAGAGCTCTACCCGAGTATACCAGGCTGAGGACTTCCAAGCTATTGGTGTCGCACTGCAGGAGATCTCGAAATTCGCTAAAGAACATAAATATTATCGTTTTGACTGCAGTCAAATTGATGATCTTGCTGAAGATCTCAGAGAGTTTGCTTTGTAAGTACGTAGTGACCTAAACTACAGAGTAAATAATTTCAGTATATGTTCTGATGTATGCTAAAATTATGCCGTAGTTGTGTCACAAATATT GAGATGTCCAAGTAAGCTGTGTCTATTGTAAACCCAATTCGTGATGGCAAGTCTCGGAATCTTGGNGNTTTT GGTTAAa                        ]




>consensus_4965#0
TACCACCTATAGGTGTGCAACGATTTGCTAATCACATCATAATGGCCACACATTCTTTAG
GTACTATGTTTGCCTCTGAAATGTACTGCGTATTTTTTATTGTCTTAGTATTCCACATTA
TCTTTTACTTTTGCATCTTGTACAGCACAAATGGTGAATTAACATAGAGAAAATTCTATT
GTTTCAGTGGTTTATACAACTAAAGTTCTTTTCAAATTTAATTCAGGTCAATCAAAGAGC
AAGGGAAAAAAAGATGACAGAAAATCAGTATAATTCTATCTCTTTTTTCATATTGAACTT
CTTGCTGAATGTTCTTATATGAATAAAAGTATGATTTTGCAGATTAGCATTAGTTATCAG
CTGAAAAATCAAAAAAGGGATTTTAGTAAGCAACAAGGAAGATCTCAAGCAAAGATACCT
TCAGATATACCACTTCAGTATGGCATCGTAGAGGATCTTGATTCTGAATTGATATTTGAT
TTCAAGAATGCAGATGCAAGTGGACATCACTGCATACAAATTATGACAGAATGCTTTCAT
GAAAACATATTGCACGCTCCAGTTGTTGAACATAAAAATGAGGAAGGTCCCTATTCAATT
TGGCATGAGCCCTACACAGGCAATCTTAAGTCATATCTGGAATCAACTTCATTAGGGACT
AATATGATGCATGGGAGCAAAGTTATGCTGCCAACACCTATGCTACAAAGTATTATAAGC
AAAATTTTTGATGGTATGGAGCTGCTGAGGCTGTGTGGAAAGTACCATGGGAATTTTTCT
CTGGAGAATACATATTATCTCATAAAGGAACGTAAAATTGTTGTAAAGCTTGCAAACTTT
AAAAAGAAAGAGACGAAGAGCTCTACCCGAGTATACCAGGCTGAGGACTTCCAAGCTATT
GGTGTCGCACTGCAGGAGATCTCGAAATTCGCTAAAGAACATAAATATTATCGTTTTGAC
TGCAGTCAAATTGATGATCTTGCTGAAGATCTCAGAGAGTTTGCTTTGTAAGTATGTAGT
GACCTAAACTACAGAGTAAATAATTTCAGTATATGNTCTGATGTATGCTAAAATTATGCC
GTAGTTGTGTCACAAATATTGGAGATGTCCAAGTAAGCTGNGTCTATTGGAAACCAATTC
GNGATGGCAAGTCTCGGAATCTTGGNGGTTTTGGGTTAACAATACTGGCATANTTCTTTT
TTCT
clustalw multiple alignements is not computed in this case