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Oryza sativa
cluster # 4982 cluster # 4982       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_4982#0 length = 796 sequences # 3  

consensusID : consensus_4982#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 796
fasta sequence
                              [GGGCCATGCCAACCACGCAGCCACAATTTTCCTATAAGGAAAATTGGAGGTAAGCCTCGGCGCTTCCTTCCTAGTTGGTATGACGAATTTAAATGGCTTGAATATAGTGTGGAACAAGATGCTGCATTCTGTTTTATTTGTTACTTATTCAAGCATAAAATTAATAATTCTGGTGGAGATGCATTTGTAAATAGGGGATTTAGGAATTGGCACATGAGAAAAAGGATTGCAAAACATGTTGGTGGTATGACTAGCTTTCACAATGTGGCACAAGATAAATACAATCACTTCCTTGCACCTAAAACAAATATTGTTGAGAGCTTTGCTGCCACCAATGAACAAGACAAGGCTAGATATATGGCTCGTTTAACCTATTCAATGAAGTGCTTGAAGTTTCTTTTAAGGCAAGGTTTGGCTGCCCGTGGACATTATGAAAGTGAAAAGTCACTTAATAAAGGAAATTTCCTTGAGATGTTGAGTATGCTAGCAGAAAACTTTGAAGAAGTTGGTAAGGTGGTTTTGAATAATGCTCCAAAGAATTGTAAGTTGACTGCTCCCGAAATACAAAAACAGATAGCTAATTGTTGTGCCAAAGAAACTACTAAGCTTATCATGGAAGACCTTGGTGATGAATATTTTGCAATACTTGCCGATGAATCTAGTGATGTGTACCAAAAAGAACAGTTGGCTCTTTGTTTGAGATATGTTGATAAAAAAGGAAGGGTAGTTGAGAGGTTCCTTGGTGTTGTTCATGTTGAAAATACTACTTCCTTGACACTTAAAGCTGCAATTGAAT]

[+] EMBL CB675011             [GGGCCATGCCAACCACGCAGCCACAATTTTCCTATAAGGAAAATTGGAGGTAAGCCTCGGCGCTTCCTTCCTAGTTGGTATGACGAATTTAAATGGCTTGAATATAGTGTGGAACAAGATGCTGCATTCTGTTTTATTTGTTACTTATTCAAGCATAAAATTAATAATTCTGGTGGAGATGCATTTGTAAATAGGGGATTTAGGAATTGGCACATGAGAAAAAGGATTGCAAAACATGTTGGTGGTATGACTAGCTTTCACAATGTGGCACAAGATAAATACAATCACTTCCTTGCACCTAAAACAAATATTGTTGAGAGCTTTGCTGCCACCAATGAACAAGACAAGGCTAGATATATGGCTCGTTTAACCTATTCAATGAAGTGCTTGAAGTTTCTTTTAAGGCAAGGTTTGGCTGCCCGTGGACATTATGAAAGTGAAAAGTCACTTAATAAAGGAAATTTCCTTGAGATGTTGAGTATGCTAGCAGAAAACTTTGAAGAAGTTGGTAAGGTGGTTTTGAATAATGCTCCAAAGAATTGTAAGTTGACTGCTCCCGAAATACAAAAACAGATAGCTAATTGTTGTGCCAAAGAAACTACTAAGCTTATCATGGAAGACCTTGGTGATGAATATTTTGCAATACTTGCCGATGAATCTAGTGATGTGTACCAAAAAGAACAGTTGGCTCTTTGTTTGAGATATGTTGATAAAAAAGGAAGGGTAGTTGAGAGGTTCCTTGGTGTTGTTCATGTTGAAAATACTACTTCCTTGACACTTAAAGCTGCAATTGAAT]
[+] EMBL CB638000             [  GCCATGCCAACCACGCAGCCACAATTTTCCTATAAGGAAAATTGGAGGTAAGCCTCGGCGCTTCCTTCCTAGTTGGTATGACGAATTTAAATGGCTTGAATATAGTGTGGAACAAGATGCTGCATTCTGTTTTATTTGTTACTTATTCAAGCATAAAATTAATAATTCTGGTGGAGATGCATTTGTAAATAGGGGATTTAGGAATTGGCACATGAGAAAAAGGATTGCAAAACATGTTGGTGGTATGACTAGCTTTCACAATGTGGCACAAGATAAATACAATCACTTCCTTGCACCTAAAACAAATATTGTTGAGAGCTTTGCTGCCACCAATGAACAAGACAAGGCTAGATATATGGCTCGTTTAACCTATTCAATGAAGTGCTTGAAGTTTCTTTTAAGGCAAGGTTTGGCTGCCCGTGGACATTATGAAAGTGAAAAGTCACTTAATAAAGGAAATTTCCTTGAGATGTTGAGTATGCTAGCAGAAAACTTTGAAGAAGTTGGTAAGGTGGTTTTGAATAATGCTCCAAAGAATTGTAAGTTGACTGCTCCCG                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CB637998             [                                TATAAGGAAAATTGGAGGTAAGCCTCGGCGCTTCCTTCCTAGTTGGTATGACGAATTTAAATGGCTTGAATATAGTGTGGAACAAGATGCTGCATTCTGTTTTATTTGTTACTTATTCAAGCATAAAATTAATAATTCTGGTGGAGATGCATTTGTAAATAGGGGATTTAGGAATTGGCACATGAGAAAAAGGATTGCAAAACATGTTGGTGGTCTGACTAGCTTTCACAATGTGGCCCAAGATAAATACAATCACTTCCTTGCACCTAAAACAAATATTGTTGAGAGCTTTGCTGCTCCCAATGAACAAGACAAGGCTATATATATGGCTCGTTTAACCTATTCAATGAAGTGCTTGAAGTTTCTTTTAAAGCAAGGTTTGGCTGCCCGTGGACATTTTGAAAGTGAAAAGTCACTTAATAAAGGAAATTTCCTTGAGATGTTGAGTCTGCTtcca                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_4982#0 GGGCCATGCCAACCACGCAGCCACAATTTTCCTATAAGGAAAATTGGAGGTAAGCCTCGG CGCTTCCTTCCTAGTTGGTATGACGAATTTAAATGGCTTGAATATAGTGTGGAACAAGAT GCTGCATTCTGTTTTATTTGTTACTTATTCAAGCATAAAATTAATAATTCTGGTGGAGAT GCATTTGTAAATAGGGGATTTAGGAATTGGCACATGAGAAAAAGGATTGCAAAACATGTT GGTGGTATGACTAGCTTTCACAATGTGGCACAAGATAAATACAATCACTTCCTTGCACCT AAAACAAATATTGTTGAGAGCTTTGCTGCCACCAATGAACAAGACAAGGCTAGATATATG GCTCGTTTAACCTATTCAATGAAGTGCTTGAAGTTTCTTTTAAGGCAAGGTTTGGCTGCC CGTGGACATTATGAAAGTGAAAAGTCACTTAATAAAGGAAATTTCCTTGAGATGTTGAGT ATGCTAGCAGAAAACTTTGAAGAAGTTGGTAAGGTGGTTTTGAATAATGCTCCAAAGAAT TGTAAGTTGACTGCTCCCGAAATACAAAAACAGATAGCTAATTGTTGTGCCAAAGAAACT ACTAAGCTTATCATGGAAGACCTTGGTGATGAATATTTTGCAATACTTGCCGATGAATCT AGTGATGTGTACCAAAAAGAACAGTTGGCTCTTTGTTTGAGATATGTTGATAAAAAAGGA AGGGTAGTTGAGAGGTTCCTTGGTGTTGTTCATGTTGAAAATACTACTTCCTTGACACTT AAAGCTGCAATTGAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)