cluster # 5186

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 5186 cluster # 5186 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5186#0 length = 619 sequences # 3

consensusID : consensus_5186#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 619
fasta sequence

                              [TGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGACAGCCAGCCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCCAGTCCCTGTGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTTCATTCGTCTGCGGATGATGCACCGTCAGGTGTTCACTGGCGAGGCGGCCTTTACTGTCATAACCATAGTGCACCGTCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGGCTGATGTCTGTCAGCCAGCCGCGTTCGTCATACTGCCACCGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCGTGAGGCGGTCTGCTTCGTCATAGTGCCAGTGGGTGACCAGCCCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCGAGTAC]

[+] EMBL CF340069             [TGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGACAGCCAGCCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCCAGTCCCTGTGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTTCATTCGTCTGCGGATGATGCACCGTCAGGTGTTCACTGGCGAGGCGGCCTTTACTGTCATAACCATAGTGCACCGTCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGGCTGATGTCTGTCAGCCAGCCGCGTTCGTCATACTGCCACCGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCGTGAGGCGGTCTGCTTCGTCATAGTGCCAGTGGGTGACCAGCCCCTCATCCTCGCTGCGGATAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCTGTATCAGCCGGTCGAGTAC]
[+] EMBL CF339664             [TGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGACAGCCAGCCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCCAGTCCCTGTGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTTCATTCGTCTGCGGATGATGCACCGTCAGGTGTTCACTGGCGAGGCGGCCTTTACTGTCATAACCATAGTGCACCGTCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGGCTGATGTCTGTCAGCCAGCCGCGTTCGTCATACTGCCACCGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCGTGAGGCGGTCTGCTTCGTCATAGTGCCA                                                                                                               ]
[+] EMBL CF338269             [TGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGACAGCCAGCCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCGGTATACAGCGGTTCGCCAGTCCCTGTGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGAGCAGTTCATTCGTCTGCGGATGATGCACCGTCAGGTGTTCACTGGCGAGGCGGCCTTTACTGTCATAACCATAGTGCACCGTCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGGCTGATGTCTGTCAGCCAGCCGCGTTCGTCATACTGCCACCGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCGTGAGGCGGTCTGCTTC                                                                                                                           ]




>consensus_5186#0
TGAGTTCGCCGTTGTCGTTCCAGGTGTAATCGCGGTCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCT
GGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC
GCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTT
TCATGCCTGACAGCCAGCCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCTGTCCG
GTATACAGCGGTTCGCCAGTCCCTGTGCGTTGTACGCATGTCTGGTCTCATGCTGCCAGA
GCAGTTCATTCGTCTGCGGATGATGCACCGTCAGGTGTTCACTGGCGAGGCGGCCTTTAC
TGTCATAACCATAGTGCACCGTCACCCGGTGCCCTTCGCTGATATGGCTGATGTCTGTCA
GCCAGCCGCGTTCGTCATACTGCCACCGCTCTGCGGTTTCGCCATTCACGGTGCGGTGCG
TGAGGCGGTCTGCTTCGTCATAGTGCCAGTGGGTGACCAGCCCCTCATCCTCGCTGCGGA
TAAGTTTGCCGGTCAGGTCGTGGTGATAACGCTGTGTGCGGCCGTCAAAGCCGGTTTCCT
GTATCAGCCGGTCGAGTAC

clustalw multiple alignements is not computed in this case