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Oryza sativa
cluster # 5205 cluster # 5205       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5205#0 length = 1050 sequences # 3  
consensusID : consensus_5205#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1050
fasta sequence 
                              [CCGATTCTTTCCCCCAATCTCGCTGCTTCTCTCTCGAGTCTACA---GGCGGCGGCGGCTAGAGCACAGCTCCTCCCACCGGCGAGCAGGAGAGGGGTCGGCGGCGGCGAGAGGGCTAGGCTGGGGGGAGAGGGCTAGGTTGGGCGGCGGCGGCGGTGGCTGATAGGGTGGTTGGAGGAGCGAGGCGATCCCGTCCACCTCGCCGCGCCATCCCTCGCTGCCGCCAAGCAGATCCATGCGCGGGCGCTCCGGGCCGGTGTGCCCACCTCCCACCCGCTCCTCGCCAAGCACCTCCTCTTCCACCTCGCCGTCCTCCGCGCGCCGCCGCTCCGCTACGCCGTGGCGGTACTCTCCCGCCTCCTCCCGCACGGGCCACTAGACCCGTTCCCCCTCAACACCGTGCACCGCATCGCTGCGGGCTCGTTCCGCCCGTGCGTCGCGCTCGAGCTCCACCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGACACGCACACCTACCCGTCGCTGCTCCAGGCTTGCTCGCGCCTCCTCGCGCTCCGCGAAGGGGAGTGCCTCCATACCGAGGCCGCCAAGAACGGGTTCGTCCAAAACTCGCCCGTTCATCTCTACGGCGCGTGTGGCCTGTTCGAGAGCGTGCACAAGGTGTTCGATGAAATGCCGGTGCATGGGCAGAACCTCGTCTCGTGGAATTCGATGCTCAACAGCTTTGCGGCCAACGGGCGCCCTAACGAGGTTCTCACTGTCTTCCGGGAGATGCTGGGCGTCAACTTTGCGCCAGATGGAGTCACCATAGTCAGTGTTCTAACCGCTTGTGCAGAGATTGGGGCGCTTGCTCTTGGGAGGAGGGTTCATGTGTATGCGGAAAAGGTTGTGTTGGTGGACAATTCGCATGTGAGCAATGCCCTGATTAATCTGTATGCCAAGTGTGGTATTGTCAACGATGCAAGGCTGATATGACTTCATATGATTGTGTAAAATGTTGTTGAAATTTTGTCAAAATTTTTGCTCAATTTCTGTCAAAATGCTGCCGAAATTTTGTCNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK061334             [CCGATTCTTTCCCCCAATCTCGCTGCTTCTCTCTCGAGTCTACA   GGCGGCGGCGGCTAGAGCACAGCTCCTCCCACCGGCGAGCAGGAGAGGGGTCGGCGGCGGCGAGAGGGCTAGGCTGGGGGGAGAGGGCTAGGTTGGGCGGCGGCGGCGGTGGCTGATAGGGTGGTTGGAGGAGCGAGGCGATCCCGTCCACCTCGCCGCGCCATCCCTCGCTGCCGCCAAGCAGATCCATGCGCGGGCGCTCCGGGCCGGTGTGCCCACCTCCCACCCGCTCCTCGCCAAGCACCTCCTCTTCCACCTCGCCGTCCTCCGCGCGCCGCCGCTCCGCTACGCCGTGGCGGTACTCTCCCGCCTCCTCCCGCACGGGCCACTAGACCCGTTCCCCCTCAACACCGTGCACCGCATCGCTGCGGGCTCGTTCCGCCCGTGCGTCGCGCTCGAGCTCCACCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGACACGCACACCTACCCGTCGCTGCTCCAGGCTTGCTCGCGCCTCCTCGCGCTCCGCGAAGGGGAGTGCCTCCATACCGAGGCCGCCAAGAACGGGTTCGTCCAAAACTCGCCCGTTCATCTCTACGGCGCGTGTGGCCTGTTCGAGAGCGTGCACAAGGTGTTCGATGAAATGCCGGTGCATGGGCAGAACCTCGTCTCGTGGAATTCGATGCTCAACAGCTTTGCGGCCAACGGGCGCCCTAACGAGGTTCTCACTGTCTTCCGGGAGATGCTGGGCGTCAACTTTGCGCCAGATGGAGTCACCATAGTCAGTGTTCTAACCGCTTGTGCAGAGATTGGGGCGCTTGCTCTTGGGAGGAGGGTTCATGTGTATGCGGAAAAGGTTGTGTTGGTGGACAATTCGCATGTGAGCAATGCCCTGATTAATCTGTATGCCAAGTGTGGTATTGTCAACGATGCAAGGCTGATATGACTTCAT                                                                                                   ]
[+] EMBL AK066915             [        TTCCCCCAATCTCGCTGCTTCTCTCTCGAGTCTACAGGCGGCGGCGGCGGCTAGAGCACAGCTCCTCCCACCGGCGAGCAGGAGAGGGGTCGGCGGCGGCGAGAGGGCTAGGCTGGGGGGAGAGGGCTAGGTTGGGCGGCGGCGGCGGTGGCTGATAGGGTGGTTGGAGGAGCGAGGCGATCCCGTCCACCTCGCCGCGCCATCCCTCGCTGCCGCCAAGCAGATCCATGCGCGGGCGCTCCGGGCCGGTGTGCCCACCTCCCACCCGCTCCTCGCCAAGCACCTCCTCTTCCACCTCGCCGTCCTCCGCGCGCCGCCGCTCCGCTACGCCGTGGCGGTACTCTCCCGCCTCCTCCCGCACGGGCCACTAGACCCGTTCCCCCTCAACACCGTGCACCGCATCGCTGCGGGCTCGTTCCGCCCGTGCGTCGCGCTCGAGCTCCACCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGACACGCACACCTACCCGTCGCTGCTCCAGGCTTGCTCGCGCCTCCTCGCGCTCCGCGAAGGGGAGTGCCTCCATACCGAGGCCGCCAAGAACGGGTTCGTCCAAAACTCGCCCGTTCATCTCTACGGCGCGTGTGGCCTGTTCGAGAGCGTGCACAAGGTGTTCGATGAAATGCCGGTGCATGGGCAGAACCTCGTCTCGTGGAATTCGATGCTCAACAGCTTTGCGGCCAACGGGCGCCCTAACGAGGTTCTCACTGTCTTCCGGGAGATGCTGGGCGTCAACTTTGCGCCAGATGGAGTCACCATAGTCAGTGTTCTAACCGCTTGTGCAGAGATTGGGGCGCTTGCTCTTGGGAGGAGGGTTCATGTGTATGCGGAAAAGGTTGTGTTGGTGGACAATTCGCATGTGAGCAATGCCCTGATTAATCTGTATGCCAAGTGTGGTATTGTCAACGATGCAAGGCTGATATGACTTCATATGATTGTGTAAAATGTTGTTG                                                                             ]
[+] EMBL AU172867             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTTGCTCTTGGGAGGAGGGTTCATGTGTATNCGGAAAAGGTTGTGTTGGTGGACAATTCGCATGTGAGCAATGCCCTGATTAATCTGTATGCCAAGTGTGGTATTGTCAACGATGCAAGGCTGATATGACTTCATATGATTGTGTAAAATGTTGTTGAAATTTTGTCAAAATTTTTGCTCAATTTCTGTCAAAATGCTGCCGAAATTTTGTCNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_5205#0
CCGATTCTTTCCCCCAATCTCGCTGCTTCTCTCTCGAGTCTACAGGCGGCGGCGGCTAGA
GCACAGCTCCTCCCACCGGCGAGCAGGAGAGGGGTCGGCGGCGGCGAGAGGGCTAGGCTG
GGGGGAGAGGGCTAGGTTGGGCGGCGGCGGCGGTGGCTGATAGGGTGGTTGGAGGAGCGA
GGCGATCCCGTCCACCTCGCCGCGCCATCCCTCGCTGCCGCCAAGCAGATCCATGCGCGG
GCGCTCCGGGCCGGTGTGCCCACCTCCCACCCGCTCCTCGCCAAGCACCTCCTCTTCCAC
CTCGCCGTCCTCCGCGCGCCGCCGCTCCGCTACGCCGTGGCGGTACTCTCCCGCCTCCTC
CCGCACGGGCCACTAGACCCGTTCCCCCTCAACACCGTGCACCGCATCGCTGCGGGCTCG
TTCCGCCCGTGCGTCGCGCTCGAGCTCCACCGCCGCCGCCTCGCGCCGCCCGACACGCAC
ACCTACCCGTCGCTGCTCCAGGCTTGCTCGCGCCTCCTCGCGCTCCGCGAAGGGGAGTGC
CTCCATACCGAGGCCGCCAAGAACGGGTTCGTCCAAAACTCGCCCGTTCATCTCTACGGC
GCGTGTGGCCTGTTCGAGAGCGTGCACAAGGTGTTCGATGAAATGCCGGTGCATGGGCAG
AACCTCGTCTCGTGGAATTCGATGCTCAACAGCTTTGCGGCCAACGGGCGCCCTAACGAG
GTTCTCACTGTCTTCCGGGAGATGCTGGGCGTCAACTTTGCGCCAGATGGAGTCACCATA
GTCAGTGTTCTAACCGCTTGTGCAGAGATTGGGGCGCTTGCTCTTGGGAGGAGGGTTCAT
GTGTATGCGGAAAAGGTTGTGTTGGTGGACAATTCGCATGTGAGCAATGCCCTGATTAAT
CTGTATGCCAAGTGTGGTATTGTCAACGATGCAAGGCTGATATGACTTCATATGATTGTG
TAAAATGTTGTTGAAATTTTGTCAAAATTTTTGCTCAATTTCTGTCAAAATGCTGCCGAA
ATTTTGTCNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)