cluster # 522

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Oryza sativa
cluster # 522 cluster # 522 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_522#0 length = 815 sequences # 2

consensusID : consensus_522#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 815
fasta sequence

                              [TGTAGTGTCAGGCTGCTATATTTTGGAGATCAATCATTCCGAGGTTGCCTTTGTTCCAAATTCTATTGCGTTCGATTGAGATTTGCAGCGCACACGAAACGAGAAAGCTCATTAGCACATGATTAATTAAGGATTACCTATTATAAACTTGAAAATGGATTGATTTGACTTTTTAAGCTACTTCTATATAGATTATTCTTTTTTGCAGAATATGCACTGTTTAGCTGTTTGAAAAGCATTCAGACTGAGCCATTAAACAAAATACACTTATGTTCTGCATGGTTATCAATGGTTGACAATATATACTTCCATGATTTGGTTTTTGTTTGTGTAAATGAAATCATATAGGTACTATAGGAATGCAATTATCTGCTCACTGACTTGGCATAGTTTCTATTTCTATAAGATGTGTTCCTTTGTTCTTTTTTACGTTAAAATGACAGAAATCAAATTTGGTGGAAATGCTGCATTTATTCCATGGTAATTTATATCTATCTACTTTTTGGAGATCTCAATAAATATTGAGAATGTTCTTAGCTGCGGTATTTTGTTACAATATTTTCTAATATTTTGTTGATTCATGAGAAGGTGTTGTTATAACAATATTCATATTTATTCAAACATCATGGTCGATTAGTTGGATAATGGAAATTGAGTCAAGGATTGGAAATTATCACTTGGTCACTTAGATATGTGACACGATGTGTTTTTTTACTCCAGAGGCTGAATTAACAAATGTGCTTTCTTATTGTACTGATGCCATGACAATCGTTTTTAAATTTGTTGAANGGCAGTGTTCCTGATGGGGAGATTTC]

[+] EMBL CB667099             [TGTAGTGTCAGGCTGCTATATTTTGGAGATCAATCATTCCGAGGTTGCCTTTGTTCCAAATTCTATTGCGTTCGATTGAGATTTGCAGCGCACACGAAACGAGAAAGCTCATTAGCACATGATTAATTAAGGATTACCTATTATAAACTTGAAAATGGATTGATTTGACTTTTTAAGCTACTTCTATATAGATTATTCTTTTTTGCAGAATATGCACTGTTTAGCTGTTTGAAAAGCATTCAGACTGAGCCATTAAACAAAATACACTTATGTTCTGCATGGTTATCAATGGTTGACAATATATACTTCCATGATTTGGTTTTTGTTTGTGTAAATGAAATCATATAGGTACTATAGGAATGCAATTATCTGCTCACTGACTTGGCATAGTTTCTATTTCTATAAGATGTGTTCCTTTGTTCTTTTTTACGTTAAAATGACAGAAATCAAATTTGGTGGAAATGCTGCATTTATTCCATGGTAATTTATATCTATCTACTTTTTGGAGATCTCAATAAATATTGAGAATGTTCTTAGCTGCGGTATTTTGTTACAATATTTTCTAATATTTTGTTGATTCATGAGAAGGTGTTGTTATAACAATATTCATATTTATTCAAACATCATGGTCGATTAGTTGGATAATGGAAATTGAGTCAAGGATTGGAAATTATCACTTGGTCACTTAGATATGTGACACGATGTGTTTTTTTACTCCAGAGGCTGAATTAACAAATGTGCTTTCTTATTGTACTGATGCCATGACAATCGTTTTTAAATTTGTTGAANGGCAGTGTTCCTGATGGGGAGATTTC]
[+] EMBL CF306785             [                                                                            aGAGATTTGCAGCGCACACGAAACGAGAAAGCTCATTAGCACATGATTAATTAAGGATTACCTATTATAAACTTGAAAATGGATTGATTTGACTTTTTAAGCTACTTCTATATAGATTATTCTTTTTTGCAGAATATGCACTGTTTAGCTGTTTGAAAAGCATTCAGACTGAGCCATTAAACAAAATACACTTATGTTCTGCATGGTTATCAATGGTTGACAATATATACTTCCATGATTTGGTTTTTGTTTGTGTAAATGAAATCATATAGGTACTATAGGAATGCAATTATCTGCTCACTGACTTGGCATAGTTTCTATTTCTATAAGATGTGTTCCTTTGTTCTTTTTTACGTTAAAATGACAGAAATCAAATTTGGTGGAAATGCTGCATTTATTCCATGGTAATTTATATCTATCTACTTTTTGGAGATCTCAATAAATATTGAGAATGTTCTTAGCTGCGGTATTTTGTTACAATATTTTCTAATATTTTGTTGATTCATGAGAAGGTGTTGTTATAACAATATTCATATTTATTCAAACATCATGGTCGATTAGTTGGATAATGGAAATT                                                                                                                                                                  ]




>consensus_522#0
TGTAGTGTCAGGCTGCTATATTTTGGAGATCAATCATTCCGAGGTTGCCTTTGTTCCAAA
TTCTATTGCGTTCGATTGAGATTTGCAGCGCACACGAAACGAGAAAGCTCATTAGCACAT
GATTAATTAAGGATTACCTATTATAAACTTGAAAATGGATTGATTTGACTTTTTAAGCTA
CTTCTATATAGATTATTCTTTTTTGCAGAATATGCACTGTTTAGCTGTTTGAAAAGCATT
CAGACTGAGCCATTAAACAAAATACACTTATGTTCTGCATGGTTATCAATGGTTGACAAT
ATATACTTCCATGATTTGGTTTTTGTTTGTGTAAATGAAATCATATAGGTACTATAGGAA
TGCAATTATCTGCTCACTGACTTGGCATAGTTTCTATTTCTATAAGATGTGTTCCTTTGT
TCTTTTTTACGTTAAAATGACAGAAATCAAATTTGGTGGAAATGCTGCATTTATTCCATG
GTAATTTATATCTATCTACTTTTTGGAGATCTCAATAAATATTGAGAATGTTCTTAGCTG
CGGTATTTTGTTACAATATTTTCTAATATTTTGTTGATTCATGAGAAGGTGTTGTTATAA
CAATATTCATATTTATTCAAACATCATGGTCGATTAGTTGGATAATGGAAATTGAGTCAA
GGATTGGAAATTATCACTTGGTCACTTAGATATGTGACACGATGTGTTTTTTTACTCCAG
AGGCTGAATTAACAAATGTGCTTTCTTATTGTACTGATGCCATGACAATCGTTTTTAAAT
TTGTTGAANGGCAGTGTTCCTGATGGGGAGATTTC

clustalw multiple alignements is not computed in this case