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Oryza sativa
cluster # 5266 cluster # 5266       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5266#0 length = 1392 sequences # 3  
consensusID : consensus_5266#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1392
fasta sequence 
                              [TGCCGACCGGGCTGCTCGCTACGCCGTTGCCATCGCCCGCTCGAAGGGGATGCCCTCGATGCCTGCTTTCCTCGCAGCGCCGTCATTGGCTCCCGCTCTCCTTGCTACGCCGGCGCCGGCGCCCGCTCGTCGGGGAGGGCGTGGGTGCCGGATCCGACAGCCACGGTGTCCCCGCCGGCCGATCTGGTCACCCGGAGTCGACGGCAAGCGGTACCACAGCAGGCTCATCGCGGGGAGCTCCACACGGAAAGTTCCACTCTCCAGCACTCGGTTTGGTGGTGGCCAGAAGGGGATTGTCGCGATTGAGCGGAACAATGTGTGGATCCGCATCTCAGTCTCTACATCCCGACAACGCATCCAACATCAGCCATCGACAAGATTCCTTTGCTAGATCGCAAACTAGCCGATCTAGAGGTGTGGTGCCGGAAATTATGTTAGAGGTGACAGTGGCCAGCGACAAGGTCAACCTGGCGGTGTAGAAGTCTGTCTCGAGGACAACGCGCTCATTGCGGCCATGGGTGGCCATCGGCACTGCTTCTCCATGCAGGCATGCACCAACAACACTGGCATCCTTCCGGCACAATGCACAAATCTGTCTATGCTTCCAGCTGCAGCTACATGTCCCTGCAACCTGCATATTTGCATAGTCCAGGCACTCTGCAAGATTGTCTGACCAAAATGGAAGAGGTCAGTGTTGCAACCCACCACTATAGTTTCTTGATTTTCTATTGATGCCTGCTGTCTAATGTTAACATTGCAGGGGAAAAATATATTCTTTTCCTTTTCCTGTAATGCACTTGGCTAAGAAAATTGGCGGACAGTTAAGCTGCTAATGCTTCTTTGCTCATGCTCCTTGATCAGAACATAAATGGTGAGTGATAAAAATTGTATTGTCCCTCCATACAGATATTAGAGCAGTTTCCCCCATTTTTCCATTCATGTATGGTTTCGTTCCCCCTTGATCAGTCAACTACAGGACTGCTCTTGGGTGACTGAAACTGATTTCACTTTAGTTATTTTGGAGCAAATATTTTTCTAGAACAAATTGTTTTACTTTGATTATACTCCATCCCAC-TCTAAGTAACATCTCACCACACTTTATTATGTGAGCAAGC--ATATAAACCATGTGTGCAACCGTACCTCTGACATGCGTGTTTTTTCTTGTCTGCGGGTTAGTTGAAGATACACATGAGAAGGGCTTGATTAGGCCTGGTGTTATGGTGCTGAATTGTTGATTGAAAAAGCCGGTGATAATGTTGGTACCTTTTGGTATTAGTTGCTATTAAAGAAAGGTTGCAGGTTTCTTGCTATTATGCCGGCTTAATACTCACTTCACAGGCAGATACTACTGAGGTTTTTTTATGCTAAGTAACATTGACAGGTGATAACAGG]

[+] EMBL CB632581             [TGCCGACCGGGCTGCTCGCTACGCCGTTGCCATCGCCCGCTCGAAGGGGATGCCCTCGATGCCTGCTTTCCTCGCAGCGCCGTCATTGGCTCCCGCTCTCCTTGCTACGCCGGCGCCGGCGCCCGCTCGTCGGGGAGGGCGTGGGTGCCGGATCCGACAGCCACGGTGTCCCCGCCGGCCGATCTGGTCACCCGGAGTCGACGGCAAGCGGTACCACAGCAGGCTCATCGCGGGGAGCTCCACACGGAAAGTTCCACTCTCCAGCACTCGGTTTGGTGGTGGCCAGAAGGGGATTGTCGCGATTGAGCGGAACAATGTGTGGATCCGCATCTCAGTCTCTACATCCCGACAACGCATCCAACATCAGCCATCGACAAGATTCCTTTGCTAGATCGCAAACTAGCCGATCTAGAGGTGTGGTGCCGGAAATTATGTTAGAGGTGACAGTGGCCAGCGACAAGGTCAACCTGGCGGTGTAGAAGTCTGTCTCGAGGACAACGCGCTCATTGCGGCCATGGGTGGCCATCGGCACTGCTTCTCCATGCAGGCATGCACCAACAACACTGGCATCCTTCCGGCACAATGCACAAATCTGTCTATGCTTCCAGCTGCAGCTACATGTCCCTGCAACCTGCATATTTGCATAGTCCGGGCACTCTGCAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CF303432             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCACAAATCTGTCTATGCTTCCAGCTGCAGCTACATGTCCCTGCAACCTGCATATTTGCATAGTCCAGGCACTCTGCAAGATTGTCTGACCAAAATGGAAGAGGTCAGTGTTGCAACCCACCACTATAGTTTCTTGATTTTCTATTGATGCCTGCTGTCTAATGTTAACATTGCAGGGGAAAAATATATTCTTTTCCTTTTCCTGTAATGCACTTGGCTAAGAAAATTGGCGGACAGTTAAGCTGCTAATGCTTCTTTGCTCATGCTCCTTGATCAGAACATAAATGGTGAGTGATAAAAATTGTATTGTCCCTCCATACAGATATTAGAGCAGTTTCCCCCATTTTTCCATTCATGTATGGTTTCGTTCCCCCTTGATCAGTCAACTACAGGACTGCTCTTGGGTGACTGAAACTGATTTCACTTTAGTTATTTTGGAGCAAATATTTTTCTAGAACAAATTGTTTTACTTTGATTATACTCCATCCCACTTCTAAGTAACATCTCACCACACTTTATTATGTGAGCAAGC  ATATAAACCATGTGTGCAACCGTACCTCTGACATGCGTGTTT                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CB629243             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACAAATCTGTCTATGCTTCCAGCTGCAGCTACATGTCCCTGCAACCTGCATATTTGCATAGTCCAGGCACTCTGCAAGATTGTCTGACCAAAATGGAAGAGGTCAGTGTTGCAACCCACCACTATAGTTTCTTGATTTTCTATTGATGCCTGCTGTCTAATGTTAACATTGCAGGGGAAAAATATATTCTTTTCCTTTTCCTGTAATGCACTTGGCTAAGAAAATTGGCGGACAGTTAAGCTGCTAATGCTTCTTTGCTCATGCTCCTTGATCAGAACATAAATGGTGAGTGATAAAAATTGTATTGTCCCTCCATACAGATATTAGAGCAGTTTCCCCCATTTTTCCATTCATGTATGGTTTCGTTCCCCCTTGATCAGTCAACTACAGGACTGCTCTTGGGTGACTGAAACTGATTTCACTTTAGTTATTTTGGAGCAAATATTTTTCTAGAACAAATTGTTTTACTTTGATTATACTCCATCCCAC TCTAAGTAACATCTCACCACACTTTATTATGTGAGCAAGCATATATAAACCATGTGTGCAACCGTACCTCTGACATGCGTGTTTTTTCTTGTCTGCGGGTTAGTTGAAGATACACATGAGAAGGGCTTGATTAGGCCTGGTGTTATGGTGCTGAATTGTTGATTGAAAAAGCCGGTGATAATGTTGGTACCTTTTGGTATTAGTTGCTATTAAAGAAAGGTTGCAGGTTTCTTGCTATTATGCCGGCTTAATACTCACTTCACAGGCAGATACTACTGAGGTTTTTTTATGCTAAGTAACATTGACAGGTGATAACAGG]




>consensus_5266#0
TGCCGACCGGGCTGCTCGCTACGCCGTTGCCATCGCCCGCTCGAAGGGGATGCCCTCGAT
GCCTGCTTTCCTCGCAGCGCCGTCATTGGCTCCCGCTCTCCTTGCTACGCCGGCGCCGGC
GCCCGCTCGTCGGGGAGGGCGTGGGTGCCGGATCCGACAGCCACGGTGTCCCCGCCGGCC
GATCTGGTCACCCGGAGTCGACGGCAAGCGGTACCACAGCAGGCTCATCGCGGGGAGCTC
CACACGGAAAGTTCCACTCTCCAGCACTCGGTTTGGTGGTGGCCAGAAGGGGATTGTCGC
GATTGAGCGGAACAATGTGTGGATCCGCATCTCAGTCTCTACATCCCGACAACGCATCCA
ACATCAGCCATCGACAAGATTCCTTTGCTAGATCGCAAACTAGCCGATCTAGAGGTGTGG
TGCCGGAAATTATGTTAGAGGTGACAGTGGCCAGCGACAAGGTCAACCTGGCGGTGTAGA
AGTCTGTCTCGAGGACAACGCGCTCATTGCGGCCATGGGTGGCCATCGGCACTGCTTCTC
CATGCAGGCATGCACCAACAACACTGGCATCCTTCCGGCACAATGCACAAATCTGTCTAT
GCTTCCAGCTGCAGCTACATGTCCCTGCAACCTGCATATTTGCATAGTCCAGGCACTCTG
CAAGATTGTCTGACCAAAATGGAAGAGGTCAGTGTTGCAACCCACCACTATAGTTTCTTG
ATTTTCTATTGATGCCTGCTGTCTAATGTTAACATTGCAGGGGAAAAATATATTCTTTTC
CTTTTCCTGTAATGCACTTGGCTAAGAAAATTGGCGGACAGTTAAGCTGCTAATGCTTCT
TTGCTCATGCTCCTTGATCAGAACATAAATGGTGAGTGATAAAAATTGTATTGTCCCTCC
ATACAGATATTAGAGCAGTTTCCCCCATTTTTCCATTCATGTATGGTTTCGTTCCCCCTT
GATCAGTCAACTACAGGACTGCTCTTGGGTGACTGAAACTGATTTCACTTTAGTTATTTT
GGAGCAAATATTTTTCTAGAACAAATTGTTTTACTTTGATTATACTCCATCCCACTCTAA
GTAACATCTCACCACACTTTATTATGTGAGCAAGCATATAAACCATGTGTGCAACCGTAC
CTCTGACATGCGTGTTTTTTCTTGTCTGCGGGTTAGTTGAAGATACACATGAGAAGGGCT
TGATTAGGCCTGGTGTTATGGTGCTGAATTGTTGATTGAAAAAGCCGGTGATAATGTTGG
TACCTTTTGGTATTAGTTGCTATTAAAGAAAGGTTGCAGGTTTCTTGCTATTATGCCGGC
TTAATACTCACTTCACAGGCAGATACTACTGAGGTTTTTTTATGCTAAGTAACATTGACA
GGTGATAACAGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)