cluster # 548

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Oryza sativa
cluster # 548 cluster # 548 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_548#0 length = 876 sequences # 2

consensusID : consensus_548#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 876
fasta sequence

                              [GCTACCTACCAAATTCCCCTACCTGAAGTACTTGAGTATTTCTCTCATTGGATTGACCAATTCGCCAGCTTATGATTATCTCTCTCTAGTTTCCTTTCTTGCTGCTTCNCCTTTATTGGAGACTTTCTTCTTGGCTATATCTCAGCAACAAGCAGAACAGGAATCGATATTTGGAAGTTCCTCACTTATGAGGCAGATTCCGGAGCACCGATATGAGTACCTCAAGAGTGTGACGATCAACGGTTTCTGTCCGCGAAGAGCATGGTTGAGCTAACATGTCATATTCTTGAGAACGCAGCATCTCTTGAGCACCTTACTCTGAACACGAACCTTGGCTTGGCTAATCGTTCTGAACAGAGTCCTGGTATTCTCAAGGAAGTGCCTAAAGCTCTCTCGGCTATCCAGAAATACATCGCAGGGAAAGTTCCCTCTACTGTTAGATTAAGTGTTCTGGATGCTAGTGAATGAAACGCTATAGGGCATCAATTATCATTTTGTGAACCACGCGTCCACGCTCATTTTGTGCAACTTTTTGATGAACCACGCTCTGTTTACTAAATTATTGGGGTCGTTAAAAGTTTAGTTGGAGTATGCTTTCTTGGTTACAATCTTTGTAAGACTTTTGTGGTGTTCTTATAATATATAAAATATAACTGGTGGGCGAATGCCTGTCAGTTTTCCTGGTCAAAAAAAAAGGGGGGGTTTAGTTTTTCAGTAATTTATCAGCACCAAAGCGGGCTGCTAATAGGGGGTAACTGTGCTGTAAAGTTGTCCTGTAAAATATAGATTTTGAATGCCCTGGAGTTCGGTTGGATGTGTTGTGACTCCAATACTTGTAGGGGTAAATTTGGCTAAAATGTTAAATGTTGCCCCCTT]

[+] EMBL AU096588             [GCTACCTACCAAATTCCCCTACCTGAAGTACTTGAGTATTTCTCTCATTGGATTGACCAATTCGCCAGCTTATGATTATCTCTCTCTAGTTTCCTTTCTTGCTGCTTCNCCTTTATTGGAGACTTTCTTCTTGGCTATATCTCAGCAACAAGCAGAACAGGAATCGATATTTGGAAGTTCCTCACTTATGAGGCAGATTCCGGAGCACCGATATGAGTACCTCAAGAGTGTGACGATCAACGGTTTCTGTCCGCGAAGAGCATGGTTGAGCTAACATGTCATATTCTTGAGAACGCAGCATCTCTTGAGCACCTTACTCTGAACACGAACCTTGGCTTGGCTAATCGTTCTGAACAGAGTCCTGGTATTCTCAAGGAAGTGCCTAAAGCTCTCTCGGCTATCCAGAAATACATCGCAGGGAAAGTTCCCTCTACTGTTAGATTAAGTGTTCTGGATGCTAGTGAATGAAACGCTATAGGGCATCAATTATCATTTTGTGAACCACGCGTCCACGCTCATTTTGTGCAACTTTTTGATGAACCACGCTCTGTTTACTAAATTATTGGGGTCGTTAAAAGTTTAGTTGGAGTATGCTTTCTTGGTTACAATCTTTGTAAGACTTTTGTGGTGTTCTTATAATATATAAAATATAACTGGTGGGCGAATGCCTGTCAGTTTTCCTGGTCAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CB621045             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCTTACTTTGAACACGACCCTTGGCTTGGTTAATCGTTTTGAACAGAGTCCTGGTATTTTCAAGGAAGTGCCTAAAGCTTTTTCGGCTATCCAGAAATACATCGCAGGGAAAGTTCCCTCTGCTGTTAGATTAAGTGTTCTGGATGCTAGGGAATGAAACGCTATAGGGCATCAATTTTCATTTTGTGACCCCCGCGTCCCCGCTCATTTTGTGCAACTTTTTGATGACCCCCGCTCTGTTTACTAAATTATTGGGGTCGTTAAAAGTTTAGTTGGAGTATGCTTTTTTGGTTCCAATCTTTGTAAGACTTTTGGGGGGTTCTTATAATATATAAAATATAACTGGGGGGGGAATCCCTGTCAGTTTTCCTGGTCAAAAAAAAGGGGGGGGTTTAGTTTTTCAGTAATTTATCAGCACCAAAGCGGGCTGCTAATAGGGGGTAACTGTGCTGTAAAGTTGTCCTGTAAAATATAGATTTTGAATGCCCTGGAGTTCGGTTGGATGTGTTGTGACTCCAATACTTGTAGGGGTAAATTTGGCTAAAATGTTAAATGTTGCCCCCTT]




>consensus_548#0
GCTACCTACCAAATTCCCCTACCTGAAGTACTTGAGTATTTCTCTCATTGGATTGACCAA
TTCGCCAGCTTATGATTATCTCTCTCTAGTTTCCTTTCTTGCTGCTTCNCCTTTATTGGA
GACTTTCTTCTTGGCTATATCTCAGCAACAAGCAGAACAGGAATCGATATTTGGAAGTTC
CTCACTTATGAGGCAGATTCCGGAGCACCGATATGAGTACCTCAAGAGTGTGACGATCAA
CGGTTTCTGTCCGCGAAGAGCATGGTTGAGCTAACATGTCATATTCTTGAGAACGCAGCA
TCTCTTGAGCACCTTACTCTGAACACGAACCTTGGCTTGGCTAATCGTTCTGAACAGAGT
CCTGGTATTCTCAAGGAAGTGCCTAAAGCTCTCTCGGCTATCCAGAAATACATCGCAGGG
AAAGTTCCCTCTACTGTTAGATTAAGTGTTCTGGATGCTAGTGAATGAAACGCTATAGGG
CATCAATTATCATTTTGTGAACCACGCGTCCACGCTCATTTTGTGCAACTTTTTGATGAA
CCACGCTCTGTTTACTAAATTATTGGGGTCGTTAAAAGTTTAGTTGGAGTATGCTTTCTT
GGTTACAATCTTTGTAAGACTTTTGTGGTGTTCTTATAATATATAAAATATAACTGGTGG
GCGAATGCCTGTCAGTTTTCCTGGTCAAAAAAAAAGGGGGGGTTTAGTTTTTCAGTAATT
TATCAGCACCAAAGCGGGCTGCTAATAGGGGGTAACTGTGCTGTAAAGTTGTCCTGTAAA
ATATAGATTTTGAATGCCCTGGAGTTCGGTTGGATGTGTTGTGACTCCAATACTTGTAGG
GGTAAATTTGGCTAAAATGTTAAATGTTGCCCCCTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case