cluster # 5541

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Oryza sativa
cluster # 5541 cluster # 5541 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5541#0 length = 441 sequences # 3

consensusID : consensus_5541#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 441
fasta sequence

                              [ACCCCTTCATACAATGAGGGGCCTATTATTTCACGGGATAAAGTTAAGGAAGCCCTCCTGAGNCTTGTTCAGAATGACCAGTTCATCGATTTAGTCTATCGGGAGTTGCAGAATGCACA-TATGTAGACTAATTATTAAGCTGTATGGAGTTGTGGCCGCCACAAGAGTGCTTGTGTTCTTTGTGAGTTTTGTATGCTTTAGTGCTTGGACTTCTGTATAGCTGTCTTCATTGTGGTGATGTAGAGTCCTTATAGCAGTGGTTGGCAGTATTTATAATATTCCTTATTTCACGTACTGTCAATGTCATAGTATATTTATGTAACAAAAAACGGAAGTAAAACAGGACTTGTGTAA-GGGTGTTAAATATCATAATTTTTCGTGTGATTTACTGAGCAATGACCACCGCGGTGTCGGGGTTTTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU092201             [ACCCCTTCATACAATGAGGGGCCTATTATTTCACGGGATAAAGTTAAGGAAGCCCTCCTGAGNCTTGTTCAGAATGACCAGTTCATCGATTTAGTCTATCGGGAGTTGCAGAATGCACA TATGTAGACTAATTATTAAGCTGTATGGAGTTGTGGCCGCCACAAGAGTGCTTGTGTTCTTTGTGAGTTTTGTATGCTTTAGTGCTTGGACTTCTGTATAGCTGTCTTCATTGTGGTGATGTAGAGTCCTTATAGCAGTGGTTGGCAGTATTTATAATATTCCTTATTTCACGTACTGTCAATGTCATAGTATATTTATGTAACAAAAAACGGAAGTAAAACAGGACTTGTGTAA GGGTGTTAAATATCATAATTTTTCGTGTGATTTACTGAGCAATGACCACCGCGGTGTCGGGGTTTTC  AAAAA               ]
[+] EMBL AU175208             [                                                                                                             AGAAT CACAGTATGTAGACTAATTATTAAGCTGTATGGAGTTGTGGCCGCCACAAGAGTGCTTGTGTTCTTTGTGAGTTTTGTATGCTTTAGTGCTTGGACTTCTGTATAGCTGTCTTCATTGTGGTGATGTAGAGTCCTTATAGCAGTGGTTGGCAGTATTTATAATATTCCTTATTTCACGTACTGTCAATGTCATAGTATATTTATGTAACAAAAAACGGAAGTAAAACAGGACTTGTGTAAGGGGTGTTAAATATCATAATTTTTCGTGTGATTTACTGAG                                                  ]
[+] EMBL AU172467             [                                                                                                                                                                           TTGTGTTCTTTGTGAGTTTTGTATGCTTTAGTGCTTGGACTTNTGTATAGCTGTNTTCATTGTGGTGATGTAGAGTCCTTATAGCAGTGGTTGGCAGTATTTATAATATTCCTTATTTCACGTACTGTCAATGTCATAGTATATTTATGTAACAAAAAACGGAAGTAAAACAGGACTTGTGTAA GGGTGTTAAATATCATAATTTTTCGTGTGATTTACTGAGCAATGACCCCCCCGGTGTCGGGGTTTTCNTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_5541#0
ACCCCTTCATACAATGAGGGGCCTATTATTTCACGGGATAAAGTTAAGGAAGCCCTCCTG
AGNCTTGTTCAGAATGACCAGTTCATCGATTTAGTCTATCGGGAGTTGCAGAATGCACAT
ATGTAGACTAATTATTAAGCTGTATGGAGTTGTGGCCGCCACAAGAGTGCTTGTGTTCTT
TGTGAGTTTTGTATGCTTTAGTGCTTGGACTTCTGTATAGCTGTCTTCATTGTGGTGATG
TAGAGTCCTTATAGCAGTGGTTGGCAGTATTTATAATATTCCTTATTTCACGTACTGTCA
ATGTCATAGTATATTTATGTAACAAAAAACGGAAGTAAAACAGGACTTGTGTAAGGGTGT
TAAATATCATAATTTTTCGTGTGATTTACTGAGCAATGACCACCGCGGTGTCGGGGTTTT
CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case