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Oryza sativa
cluster # 5578 cluster # 5578       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5578#0 length = 2667 sequences # 3  

consensusID : consensus_5578#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 2667
fasta sequence
                              [TTTCCTCTCGCTCTCCCCCGTGCCGCCGCCCGCCGCATCCTCAGGTCTCACTGCCATCGCCGCCGCTCCACCTCACACGCCGGCCGCTGCTCCCTGCCTCCGGCGGCCGCCCCGCAGCCGCTGCCGGCCTGAATCGGTTTCATGGCTCCTCATGAGCCTGCCCCCAAGCTAACCCTCTCCAATCGATGCTGCTGCCCAACGACGAAGACACCCGCCTAGAGTTCCAGATTGGGATTTTCCCCAGCTTCAGCACCCCTTGAGCCAAGCATGGCTTGTCTCCCCCGAGTTCCTCCTTTCTGATCATCCCCTTTTCTCCCTACTTCTGTGATGTGATTTGATTGGTACTCTCTTGTGTGATAGCATGCTCTGAATTGTGATGCTTGTGAACTAATCCTAGCGACCAACTTGATGATGCTATAATCAGGATTGTACTTACTGTTTCTAGGGTTCTAGATAAATTGGCTTGCTAGGGTTGGACGAATAAATTTCTGTATGCCATGAGTGAATGAATGAATGCTGATGCAAGTGCAGTACTGGAATTAGAAAAGCTAATGAAAATCACACTAACATAATTAAGTCCTTGTATATGCTTGCATGATGAAATAACTGAATTTGGCACAACAGCAGGATCATATTCTAGAATAAATCTTATTGAATGATGCAGTAATTTACATGGTACTATACTTTGAAAATCATGCCAAGATATGTACTATAGAGAATGGAACACCTTGAATACAGATAGATGGTAACTGATTTCTTTGGATGATTTACTGCTACTGACTGTATGTCATGACTATAATTTACTAGATTAGAGTTGTTGATGCAGGGAAAAAAATAAACTATTGATTAACTAACTATTTACTGTGGTTTTATTCTGAGAGTATGATTTTAAACATTCGTTCTGCTACACAAATGATTTGGTAGAAAAAAAAAACTTATATGTTCTGTTAAGTTATTGAAATTTAGTAGAACTACGACTATTTATCACTATATGCATACTTAGATGTACTTCTATTGTCTCTTTTCTGTGTTTCGTAGTAAAGAACTAGATACATATGCAAACTTAACCCAGATTCATAACCAACTGGTTTCGCATGCTATTCTACAATTCAAATGATTAATAATTTATGATGGTTCCTCTATTAAGTCTGGGTTGATTTTCAATACTTTTAAATGAAATCAGATTAATATACACATACCCTAACCTTTCCAAGAATATGCACAGCTTAGATTTTACTTTGTTTGTATGACCAAAATCTGAAAGTTCTATATTTTTTTTTTAAGTGCACATGCATGATCAACTATCTGAATAAAATTCATGTCTTTCTTTACTAATTTCCCGTTCCTGGTTATATAAGCAGTTACATTGTGAGTTTTTGACTGTGTACATAGGCATAGGTAGCTTAGTTTCAGCTACAGAGATTGAGCAGATTACATTCTATTGCTGTCTCAAAAGGTTTCTGATGGACATTATGGTGTTACAACTATCTTAATTTCCAAGTTCTTAACGTATGGGGCAAACTGAAAAGTGATCTGTGCTCATGCCAGATCCTAACAGGGGACAAATGAAGTGCAGTGTTAAAGTTGCAATGGCATTTC-AAAAAAAAAAAAAAAAACATTCATCTTTGATTTCTTGACTGGGGCTCATGTCGTGGCCACCTCCATCCTCCTGGTTGCCAACCGCTGAGGAGGCGCGGTGCAGCCCACCGCTTCCATCTGAGATTGTTGCGTGGGCGACTGGAAGCGGCCAGAGGTTGAGTTCCTGCTGGACAACTGTGGGCGAAGAGGCAAAATGGCTGACGAAGGCCAGCGGTGGCTGGAGATTGATGATGAAGCAGCAGTCTGTGGAATTCCTCTTCTCCATAGCCACTTAGCCCCTCCTTTCAAGATAACTTCTGTATGTTTGATGCCCCTCTAATAATAGCTTAGGATTTTTTGAGATATCGATAGCTACAACCAGTGCTCGTTCCATCATTCAATGACCTGTAACAATTTCAAAATAACTATGTTGGGCACCAGATGAACCCAGGCAGAGGTTCTTTGGATGGGTTTTTGTACACCACAAGGGTCTATCTGCAGAAAATTTAACAAAAATAAACTGGCCGTGCATCTTACTATGTTCGCTATGCAATGGAGTTTATGGGGGAAAGTTCAGTTGCTTTTTGTTCCATGTAATATCCTCGAATTGTATTCCGAAACCAACTTCTTAATATAATGGGCAGAGCTCCAACCTTTACTTCAGAAAAAGAGAAAAGGTCACCTTCTCCTAACTTACTCGCTTTGTTGTTTTTTCCATTCACATGCGTTTGCAGCTTGGCAACTAGAGGAGCTGACTTCTGGATTGATCTCCTCTCTTATTTTCCAACAATGAGCATTTGTTGCAGGTACAACTAATATTCAAGTTTTATCTGTGCTAATCCCACTGTCGATATCGTTCAACCGCCGTTGTCTGCACTCTGCACTCTGCAGCACTGTGACTGCCGTCGTTTGCAGGCAACAGTTGAAGATGCCACTAATCTGTATGGATGGCCCCCTTGCATTGACACTCTACTATGTGTCTGTAATTTTGCTTCTGTTGCTTATGACCCCAACAGAATTTGATGATTCAGATTTGATGTACACCAATAAAGAATGTAAGCAAATATAAGAGAAGAGAAACGATGATGT]

[+] EMBL AK068439             [TTTCCTCTCGCTCTCCCCCGTGCCGCCGCCCGCCGCATCCTCAGGTCTCACTGCCATCGCCGCCGCTCCACCTCACACGCCGGCCGCTGCTCCCTGCCTCCGGCGGCCGCCCCGCAGCCGCTGCCGGCCTGAATCGGTTTCATGGCTCCTCATGAGCCTGCCCCCAAGCTAACCCTCTCCAATCGATGCTGCTGCCCAACGACGAAGACACCCGCCTAGAGTTCCAGATTGGGATTTTCCCCAGCTTCAGCACCCCTTGAGCCAAGCATGGCTTGTCTCCCCCGAGTTCCTCCTTTCTGATCATCCCCTTTTCTCGCTACTTCTGTGATGTGATTTGATTGGTACTCTCTTGTGTGATAGCATGCTCTGAATTGTGATGCTTGTGAACTAATCCTAGCGACCAACTTGATGATGCTATAATCAGGATTGTACTTACTGTTTCTAGGGTTCTAGATAAATTGGCTTGCTAGGGTTGGACGAATAAATTTCTGTATGCCATGAGTGAATGAATGAATGCTGATGCAAGTGCAGTACTGGAATTAGAAAAGCTAATGAAAATCACACTAACATAATTAAGTCCTTGTATATGCTTGCATGATGAAATAACTGAATTTGGCACAACAGCAGGATCATATTCTAGAATAAATCTTATTGAATGATGCAGTAATTTACATGGTACTATACTTTGAAAATCATGCCAAGATATGTACTATAGAGAATGGAACACCTTGAATACAGATAGATGGTAACTGATTTCTTTGGATGATTTACTGCTACTGACTGTATGTCATGACTATAATTTACTAGATTAGAGTTGTTGATGCAGGGAAAAAAATAAACTATTGATTAACTAACTATTTACTGTGGTTTTATTCTGAGAGTATGATTTTAAACATTCGTTCTGCTACACAAATGATTTGGTAGAAAAAAAAAACTTATATGTTCTGTTAAGTTATTGAAATTTAGTAGAACTACGACTATTTATCACTATATGCATACTTAGATGTACTTCTATTGTCTCTTTTCTGTGTTTCGTAGTAAAGAACTAGATACATATGCAAACTTAACCCAGATTCATAACCAACTGGTTTCGCATGCTATTCTACAATTCAAATGATTAATAATTTATGATGGTTCCTCTATTAAGTCTGGGTTGATTTTCAATACTTTTAAATGAAATCAGATTAATATACACATACCCTGACCTTTCCAAGAATATGCACAGCTTAGATTTTACTTTGTTTGTATGACCAAAATCTGAAAGTTCTATATTTTTTTTTTAAGTGCACATGCATGATCAACTATCTGAATAAAATTCATGTCTTTCTTTACTAATTTCCCGTTCCTGGTTATATAAGCAGTTACATTGTGAGTTTTTGACTGTGTACATAGGCATAGGTAGCTTAGTTTCAGCTACAGAGATTGAGCAGATTACATTCTATTGCTGTCTCAAAAGGTTTCTGATGGACATTATGGTGTTACAACTATCTTAATTTCCAAGTTCTTAACGTATGGGGCAAACTGAAAAGTGATCTGTGCTCATGCCAGATCCTAACAGGGGACAAATGAAGTGCAGTGTTAAAGTTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
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[+] EMBL AK068808             [                                       CTCAGGTCTCACTGCCATCGCCGCCGCTCCACCTCACACGCCGGCCGCTGCTCCCTGCCTCCGGCGGCCGCCCCGCAGCCGCTGCCGGCCTGAATCGGTTTCATGGCTCCTCATGAGCCTGCCCCCAAGCTAACCCTCTCCAATCGATGCTGCTGCCCAACGACGAAGACACCCGCCTAGAGTTCCAGATTGGGATTTTCCCCAGCTTCAGCACCCCTTGAGCCAAGCATGGCTTGTCTCCCCCGAGTTCCTCCTTTCTGATCATCCCCTTTTCTCCCTACTTCTGTGATGTGATTTGATTGGTACTCTCTTGTGTGATAGCATGCTCTGAATTGTGATGCTTGTGAACTAATCCTAGCGACCAACTTGATGATGCTATAATCAGGATTGTACTTACTGTTTCTAGGGTTCTAGATAAATTGGCTTGCTAGGGTTGGACGAATAAATTTCTGTATGCCATGAGTGAATGAATGAATGCTGATGCAAGTGCAGTACTGGAATTAGAAAAGCTAATGAAAATCACACTAACATAATTAAGTCCTTGTATATGCTTGCATGATGAAATAACTGAATTTGGCACAACAGCAGGATCATATTCTAGAATAAATCTTATTGAATGATGCAGTAATTTACATGGTACTATACTTTGAAAATCATGCCAAGATATGTACTATAGAGAATGGAACACCTTGAATACAGATAGATGGTAACTGATTTCTTTGGATGATTTACTGCTACTGACTGTATGTCATGACTATAATTTACTAGATTAGAGTTGTTGATGCAGGGAAAAAAATAAACTATTGATTAACTAACTATTTACTGTGGTTTTATTCTGAGAGTATGATTTTAAACATTCGTTCTGCTACACAAATGATTTGGTAGAAAAAAAAAACTTATATGTTCTGTTAAGTTATTGAAATTTAGTAGAACTACGACTATTTATCACTATATGCATACTTAGATGTACTTCTATTGTCTCTTTTCTGTGTTTCGTAGTAAAGAACTAGATACATATGCAAACTTAACCCAGATTCATAACCAACTGGTTTCGCATGCTATTCTACAATTCAAATGATTAATAATTTATGATGGTTCCTCTATTAAGTCTGGGTTGATTTTCAATACTTTTAAATGAAATCAGATTAATATACACATACCCTAACCTTTCCAAGAATATGCACAGCTTAGATTTTACTTTGTTTGTATGACCAAAATCTGAAAGTTCTATATTTTTTTTTTAAGTGCACATGCATGATCAACTATCTGAATAAAATTCATGTCTTTCTTTACTAATTTCCCGTTCCTGGTTATATAAGCAGTTACATTGTGAGTTTTTGACTGTGTACATAGGCATAGGTAGCTTAGTTTCAGCTACAGAGATTGAGCAGATTACATTCTATTGCTGTCTCAAAAGGTTTCTGATGGACATTATGGTGTTACAACTATCTTAATTTCCAAGTTCTTAACGTATGGGGCAAACTGAAAAGTGATCTGTGCTCATGCCAGATCCTAACAGGGGACAAATGAAGTGCAGTGTTAAAGTTGCAATGGCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAACATTCATCTTTGATTTCTTGACTGGGGCTCATGTCGTGGCCACCTCCATCCTCCTGGTTGCCAACCGCTGAGGAGGCGCGGTGCAGCCCACCGCTTCCATCTGAGATTGTTGCGTGGGCGACTGGAAGCGGCCAGAGGTTGAGTTCCTGCTGGACAACTGTGGGCGAAGAGGCAAAATGGCTGACGAAGGCCAGCGGTGGCTGGAGATTGATGATGAAGCAGCAGTCTGTGGAATTCCTCTTCTCCATAGCCACTTAGCCCCTCCTTTCAAGATAACTTCTGTATGTTTGATGCCCCTCTAATAATAGCTTAGGATTTTTTGAAATATCGATAGCTACAACCAGTGCTCGTTCCATCATTCAATGACCTGTAACAATTTCAAAATAACTATGTTGGGCACCAGATGAACCCAGGCAGAGGTTCTTTGGATGGGTTTTTGTACACCACAAGGGTCTATCTGCAGAAAATTTAACAAAAATAAACTGGCCGTGCATCTTACTATGTTCGCTATGCAATGGAGTTTATGGGGGAAAGTTCAGTTGCTTTTTGTTCCATGTAATATCCTCGAATTGTATTCCGAAACCAACTTCTTAATATAATGGGCAGAGCTCCAACCTTTACTTCAGAAAAAGAGAAAAGGTCACCTTCTCCTAACTTACTCGCTTTGTTGTTTTTTCCATTCACATGCGTTTGCAGCTTGGCAACTAGAGGAGCTGACTTCTGGATTGATCTCCTCTCTTATTTTCCAACAATGAGCATTTGTTGCAGGTACAACTAATATTCAAGTTTTATCTGTGCTAATCCCACTGTCGATATCGTTCAACCGCCGTTGTCTGCACTCTGCACTCTGCAGCACTGTGACTGCCGTCGTTTGCAGGCAACAGTTGAAGATGCCACTAATCTGTATGGATGGCCCCCTTGCATTGACACTCTACTATGTGTCTGTAATTTTGCTTCTGTTGCTTATGACCCCAACAGAATTTGATGATTCAGATTTGATGTACACCAATAAAGAATGTAAGCAAATATAAGAGAAGAGAAACGATGATGT]


>consensus_5578#0 TTTCCTCTCGCTCTCCCCCGTGCCGCCGCCCGCCGCATCCTCAGGTCTCACTGCCATCGC CGCCGCTCCACCTCACACGCCGGCCGCTGCTCCCTGCCTCCGGCGGCCGCCCCGCAGCCG CTGCCGGCCTGAATCGGTTTCATGGCTCCTCATGAGCCTGCCCCCAAGCTAACCCTCTCC AATCGATGCTGCTGCCCAACGACGAAGACACCCGCCTAGAGTTCCAGATTGGGATTTTCC CCAGCTTCAGCACCCCTTGAGCCAAGCATGGCTTGTCTCCCCCGAGTTCCTCCTTTCTGA TCATCCCCTTTTCTCCCTACTTCTGTGATGTGATTTGATTGGTACTCTCTTGTGTGATAG CATGCTCTGAATTGTGATGCTTGTGAACTAATCCTAGCGACCAACTTGATGATGCTATAA TCAGGATTGTACTTACTGTTTCTAGGGTTCTAGATAAATTGGCTTGCTAGGGTTGGACGA ATAAATTTCTGTATGCCATGAGTGAATGAATGAATGCTGATGCAAGTGCAGTACTGGAAT TAGAAAAGCTAATGAAAATCACACTAACATAATTAAGTCCTTGTATATGCTTGCATGATG AAATAACTGAATTTGGCACAACAGCAGGATCATATTCTAGAATAAATCTTATTGAATGAT GCAGTAATTTACATGGTACTATACTTTGAAAATCATGCCAAGATATGTACTATAGAGAAT GGAACACCTTGAATACAGATAGATGGTAACTGATTTCTTTGGATGATTTACTGCTACTGA CTGTATGTCATGACTATAATTTACTAGATTAGAGTTGTTGATGCAGGGAAAAAAATAAAC TATTGATTAACTAACTATTTACTGTGGTTTTATTCTGAGAGTATGATTTTAAACATTCGT TCTGCTACACAAATGATTTGGTAGAAAAAAAAAACTTATATGTTCTGTTAAGTTATTGAA ATTTAGTAGAACTACGACTATTTATCACTATATGCATACTTAGATGTACTTCTATTGTCT CTTTTCTGTGTTTCGTAGTAAAGAACTAGATACATATGCAAACTTAACCCAGATTCATAA CCAACTGGTTTCGCATGCTATTCTACAATTCAAATGATTAATAATTTATGATGGTTCCTC TATTAAGTCTGGGTTGATTTTCAATACTTTTAAATGAAATCAGATTAATATACACATACC CTAACCTTTCCAAGAATATGCACAGCTTAGATTTTACTTTGTTTGTATGACCAAAATCTG AAAGTTCTATATTTTTTTTTTAAGTGCACATGCATGATCAACTATCTGAATAAAATTCAT GTCTTTCTTTACTAATTTCCCGTTCCTGGTTATATAAGCAGTTACATTGTGAGTTTTTGA CTGTGTACATAGGCATAGGTAGCTTAGTTTCAGCTACAGAGATTGAGCAGATTACATTCT ATTGCTGTCTCAAAAGGTTTCTGATGGACATTATGGTGTTACAACTATCTTAATTTCCAA GTTCTTAACGTATGGGGCAAACTGAAAAGTGATCTGTGCTCATGCCAGATCCTAACAGGG GACAAATGAAGTGCAGTGTTAAAGTTGCAATGGCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAAACATT CATCTTTGATTTCTTGACTGGGGCTCATGTCGTGGCCACCTCCATCCTCCTGGTTGCCAA CCGCTGAGGAGGCGCGGTGCAGCCCACCGCTTCCATCTGAGATTGTTGCGTGGGCGACTG GAAGCGGCCAGAGGTTGAGTTCCTGCTGGACAACTGTGGGCGAAGAGGCAAAATGGCTGA CGAAGGCCAGCGGTGGCTGGAGATTGATGATGAAGCAGCAGTCTGTGGAATTCCTCTTCT CCATAGCCACTTAGCCCCTCCTTTCAAGATAACTTCTGTATGTTTGATGCCCCTCTAATA ATAGCTTAGGATTTTTTGAGATATCGATAGCTACAACCAGTGCTCGTTCCATCATTCAAT GACCTGTAACAATTTCAAAATAACTATGTTGGGCACCAGATGAACCCAGGCAGAGGTTCT TTGGATGGGTTTTTGTACACCACAAGGGTCTATCTGCAGAAAATTTAACAAAAATAAACT GGCCGTGCATCTTACTATGTTCGCTATGCAATGGAGTTTATGGGGGAAAGTTCAGTTGCT TTTTGTTCCATGTAATATCCTCGAATTGTATTCCGAAACCAACTTCTTAATATAATGGGC AGAGCTCCAACCTTTACTTCAGAAAAAGAGAAAAGGTCACCTTCTCCTAACTTACTCGCT TTGTTGTTTTTTCCATTCACATGCGTTTGCAGCTTGGCAACTAGAGGAGCTGACTTCTGG ATTGATCTCCTCTCTTATTTTCCAACAATGAGCATTTGTTGCAGGTACAACTAATATTCA AGTTTTATCTGTGCTAATCCCACTGTCGATATCGTTCAACCGCCGTTGTCTGCACTCTGC ACTCTGCAGCACTGTGACTGCCGTCGTTTGCAGGCAACAGTTGAAGATGCCACTAATCTG TATGGATGGCCCCCTTGCATTGACACTCTACTATGTGTCTGTAATTTTGCTTCTGTTGCT TATGACCCCAACAGAATTTGATGATTCAGATTTGATGTACACCAATAAAGAATGTAAGCA AATATAAGAGAAGAGAAACGATGATGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)