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Oryza sativa
cluster # 5832 cluster # 5832       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5832#0 length = 1024 sequences # 3  
consensusID : consensus_5832#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1024
fasta sequence 
                              [TTCCATTGACTACGTGGTCACTAAGATTCCACGGTTTGCATTTGAAAAGTTCCCTGGGTCTGAGCCAGTATTAACCACACAGATGAAGTCTGTTGGTGAGGCCATGGCTCTAGGACGGACCTTCCAGGAGTCTTTCCAGAAGGCTGTCCGTTCATTGGAGACTGGCTTTGCAGGATGGGGTTGTGCACCCATCAAGGAACTTGACTGGGACTGGGAAAAGTTAAAATATAGTTTACGGGTACCTAACCCAGATCGGATTCATGCTATTTATGCAGCTTTTAAGAAAGGCATGAGGATTCAGGATATCCATGAAATTAGCTTTATTGATAAATGGTTCCTTACTGAGCTCAAGGAGCTAGTGGATGTTGAGCAATTCCTTATTTCAAGGGGCCTAGATCAGCTGTCAAAAGATGACTTCTATCAAGTGAAGCGGAGGGGTTTTAGTGACACGCAGATTGCCTTTGCGACATCTTCTTCAGAAACTGATGTGAGATTAAGGCGCCTGGCACTAGAAGTTGCTCCAACATACAAGCGGGTTGATACTTGTGCGGCTGAGTTTGAAGCCAATACACCTTACATGTATTCCTCGTATGAGTATGAATGTGAGTCTGTTCCAACTAATAAGAAAAAGGTGTTGATTTTGGGTGGCGGGCCCAATCGGATAGGCCAGGGTATTGAGTTTGATTATTGTTGTTGCCATGCTTCATTTGCCCTTCGAGAGGCTGGATATGAAACTATAATGATGAACTCCAACCCAGAGACAGTTTCAACTGACTATGATACCAGTGACCGTTTGTACTTTGAGCCATTAACGGTTGAGGATGTAACCAATGTTATTGATTTGGAACGCCCAGATGGTATAATTGTGCAGTTTGGAGGGCAAACTCCTCTCAAGCTTGCGCTTCCTATACAACAGTATCTGGAGGACAAGAAGCTGGTGTCTGCCTCAGGCACTGGACTTGTGAAGATATGGGGGACCTCACCAGATTCTATTGATGCTGCTGAGGACAGAAAAGATTTAATG]

[+] EMBL CB641288             [TTCCATTGACTACGTGGTCACTAAGATTCCACGGTTTGCATTTGAAAAGTTCCCTGGGTCTGAGCCAGTATTAACCACACAGATGAAGTCTGTTGGTGAGGCCATGGCTCTAGGACGGACCTTCCAGGAGTCTTTCCAGAAGGCTGTCCGTTCATTGGAGACTGGCTTTGCAGGATGGGGTTGTGCACCCATCAAGGAACTTGACTGGGACTGGGAAAAGTTAAAATATAGTTTACGGGTACCTAACCCAGATCGGATTCATGCTATTTATGCAGCTTTTAAGAAAGGCATGAGGATTCAGGATATCCATGAAATTAGCTTTATTGATAAATGGTTCCTTACTGAGCTCAAGGAGCTAGTGGATGTTGAGCAATTCCTTATTTCAAGGGGCCTAGATCAGCTGTCAAAAGATGACTTCTATCAAGTGAAGCGGAGGGGTTTTAGTGACACGCAGATTGCCTTTGCGACATCTTCTTCAAAAACTGATGTGAGATTAAGGCGCCTGGCACTANAAGTTGCTCCAACATACAAGCGGGTTGATACTTGTGCGGCTGAGTTTGAAGCCAATACACCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CB627646             [                                                                                                                                                                                                                                                               GATTCCTGCTATTTATGCAGCTTTTAAGAAAGGCATGAGGATTCAGGATATCCATGAAATTAGCTTTATTGATAAATGGTTCCTTACTGAGCTCAAGGAGCTAGTGGATGTTGAGCAATTCCTTATTTCAAGGGGCCTAGATCAGCTGTCAAAAGATGACTTCTATCAAGTGAAGCGGAGGGGTTTTAGTGACACGCAGATTGCCTTTGCGACATCTTCTTCAGAAACTGATGTGAGATTAAGGCGCCTGGCACTAGAAGTTGCTCCAACATACAAGCGGGTTGATACTTGTGCGGCTGAGTTTGAAGCCAATACACCTTACATGTATTCCTCGTATGAGTATGAATGTGAGTCTGTTCCAACTAATAAGAAAAAGGTGTTGATTTTGGGTGGCGGGCCCAATCGGATAGGCCAGGGTATTGAGTTTGATTATTGTTGTTGCCATGCTTCATTTGCCCTTCGAGAGGCTGGATATGAAACTATAATGATGAACTCCAACCCAGAGACAGTTTCAACTGACTATGATACCAGTGACCGTTTGTACTTTGAGCCATTAACGGTTGAGGATGTAACCAATGTTATTGATTTGGAACGCCCAGATGGTATAATTGTGCAGTTTGGAGGGCAAACTCCTCTCAAGCTTGCGCTTCCTATACAACAGTATCTGGAGGACAAGAAGCTGGTGTCTGCCTCAGGCACTGGACTTGTGAAGATATGGGGGACCTCACCAGATTCTATTGATGCTGCTGAGGACAGAAAAGATTTAATG]
[+] EMBL AU181267             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CATGAAATTAGCTTTATTGATAAATGGTTCCTTACTGAGCTCAAGGAGCTAGTGGATGTTGAGCAATTCCTTATTTCAAGGGGCCTAGATCAGCTGTCAAAAGATGACTTCTATCAAGTGAAGCGGAGGGGTTTTAGTGACACGCAGATTGCCTTTGCGACATCTTCTTCAGAAACTGATGTGAGATTAAGGCGCCTGGCACTAGAAGTTGCTCCAACATACAAGCGGGTTGATACTTGTGCGGCTGAGTTTGAAGCCAATACACCTTACATGTATTCCTCGTATGAGTATGAATGTGAGTCTGTTCCAACTAATAAGAAAAAGGTGTTGATTTTGGGTGGCGGGCCCAATCGGATAGGCCAGGGTATTGAGTTTGATTATTGTTGTTGCCATGCTTCATTTGCCCTTCGAGAGGCTGGATATGAAACTATAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]




>consensus_5832#0
TTCCATTGACTACGTGGTCACTAAGATTCCACGGTTTGCATTTGAAAAGTTCCCTGGGTC
TGAGCCAGTATTAACCACACAGATGAAGTCTGTTGGTGAGGCCATGGCTCTAGGACGGAC
CTTCCAGGAGTCTTTCCAGAAGGCTGTCCGTTCATTGGAGACTGGCTTTGCAGGATGGGG
TTGTGCACCCATCAAGGAACTTGACTGGGACTGGGAAAAGTTAAAATATAGTTTACGGGT
ACCTAACCCAGATCGGATTCATGCTATTTATGCAGCTTTTAAGAAAGGCATGAGGATTCA
GGATATCCATGAAATTAGCTTTATTGATAAATGGTTCCTTACTGAGCTCAAGGAGCTAGT
GGATGTTGAGCAATTCCTTATTTCAAGGGGCCTAGATCAGCTGTCAAAAGATGACTTCTA
TCAAGTGAAGCGGAGGGGTTTTAGTGACACGCAGATTGCCTTTGCGACATCTTCTTCAGA
AACTGATGTGAGATTAAGGCGCCTGGCACTAGAAGTTGCTCCAACATACAAGCGGGTTGA
TACTTGTGCGGCTGAGTTTGAAGCCAATACACCTTACATGTATTCCTCGTATGAGTATGA
ATGTGAGTCTGTTCCAACTAATAAGAAAAAGGTGTTGATTTTGGGTGGCGGGCCCAATCG
GATAGGCCAGGGTATTGAGTTTGATTATTGTTGTTGCCATGCTTCATTTGCCCTTCGAGA
GGCTGGATATGAAACTATAATGATGAACTCCAACCCAGAGACAGTTTCAACTGACTATGA
TACCAGTGACCGTTTGTACTTTGAGCCATTAACGGTTGAGGATGTAACCAATGTTATTGA
TTTGGAACGCCCAGATGGTATAATTGTGCAGTTTGGAGGGCAAACTCCTCTCAAGCTTGC
GCTTCCTATACAACAGTATCTGGAGGACAAGAAGCTGGTGTCTGCCTCAGGCACTGGACT
TGTGAAGATATGGGGGACCTCACCAGATTCTATTGATGCTGCTGAGGACAGAAAAGATTT
AATG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)