cluster # 5877

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 5877 cluster # 5877 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5877#0 length = 623 sequences # 3

consensusID : consensus_5877#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 623
fasta sequence

                              [TTACTTTATGCATTGTATTATACACTCTTCAATTGAGCTTTGCTTGTTATCTCTTGGTCATCACTATGCTATGCATGTATCACTCTTATGCTAGTTTGATCTCTTGTCTAGCTTTCATTTGCTTAAGTAGCTTGTGTGATCATGTTATGCTGTTCAAGCGTGTTGAAACCTGCTTAAATTAACTATTCATTTGAACTCAATCAATGTGCAATGCTTGCTCTAGAAGTTTGTTTAAATTGAAGTATCCATCTCATACTCATGCCATGTTTACATTCTTTTTGCAATAACTGTCAGTACATGCTTATGAATGCTCATGCTTATGCGTCCATACTTTGTATCAATCATGCTTTACAAGTTTTATCTCTGTTTTTGTCCGGGCTACTGAGTGCGTTTACGCATGAGTAGTGCCGAAGATAGCACTGAGACAGCCTGTAATGGGAACTCTAGCTGGAAAACTTGATTGAGGTCAGACGGCAGTGTTTGGCACAACCATCACTTGCTGACTGATAAGATCAGGTGGACCGTCGTGATTGTGCTATTGTCTTTAAAGAAATTAAAAAAAATCATAAAAATAAAAGTCAAGAGAAAAGATTAAAAGCTCATGTTCTATGCTTTGTTATCAT]

[+] EMBL CF304223             [TTACTTTATGCATTGTATTATACACTCTTCAATTGAGCTTTGCTTGTTATCTCTTGGTCATCACTATGCTATGCATGTATCACTCTTATGCTAGTTTGATCTCTTGTCTAGCTTTCATTTGCTTAAGTAGCTTGTGTGATCATGTTATGCTGTTCAAGCGTGTTGAAACCTGCTTAAATTAACTATTCATTTGAACTCAATCAATGTGCAATGCTTGCTCTAGAAGTTTGTTTAAATTGAAGTATCCATCTCATACTCATGCCATGTTTACATTCTTTTTGCAATAACTGTCAGTACATGCTTATGAATGCTCATGCTTATGCGTCCATACTTTGTATCAATCATGCTTTACAAGTTTTATCTCTGTTTTTGTCCGGGCTACTGAGTGCGTTTACGCATGAGTAGTGCCGAAGATAGCACTGAGACAGCCTGTAATGGGAACTCTAGCTGGAAAACTTGATTGAGGTCAGACGGCAGTGTTTGGCACAACCATCACTTGCTGACTGATAAGATCAGGTGGACCGTCGTGATTGTGCTATTGTCTTTAAAGAAATTAAAAAAAATCATAAAAATAAAAGTCAAGAGAAAAGATTAAAAGCTCATGTTCTATGCTTTGTTATCAT]
[+] EMBL CF303217             [TTACTTTATGCATTGTATTATACACTCTTCAATTGAGCTTTGCTTGTTATCTCTTGGTCATCACTATGCTATGCATGTATCACTCTTATGCTAGTTTGATCTCTTGTCTAGCTTTCATTTGCTTAAGTAGCTTGTGTGATCATGTTATGCTGTTCAAGCGTGTTGAAACCTGCTTAAATTAACTATTCATTTGAACTCAATCAATGTGCAATGCTTGCTCTAGAAGTTTGTTTAAATTGAAGTATCCATCTCATACTCATGCCATGTTTACATTCTTTTTGCAATAACTGTCAGTACATGCTTATGAATGCTCATGCTTATGCGTCCATACTTTGTATCAATCATGCTTTACAAGTTTTATCTCTGTTTTTGTCCGGGCTACTGAGTGCGTTTACGCATGAGTAGTGCCGAAGATAGCACTGAGACAGCCTGTAATGGGAACTCTAGCTGGAAAACTTGATTGAGGTCAGACGGCAGTGTTTGGCACAACCATCACTTGCTGACTGATAAGATCAGGTGGACCGTCGTGATTGTGCTATTGTCTTTAAAGAAATTAAAAAAAATCATAAAAATAAAAGTCAAGAGAAAAGATTAAAAGCTCA                     ]
[+] EMBL CF304724             [TTACTTTATGCATTGTATTATACACTCTTCAATTGAGCTTTGCTTGTTATCTCTTGGTCATCACTATGCTATGCATGTATCACTCTTATGCTAGTTTGATCTCTTGTCTAGCTTTCATTTGCTTAAGTAGCTTGTGTGATCATGTTATGCTGTTCAAGCGTGTTGAAACCTGCTTAAATTAACTATTCATTTGAACTCAATCAATGTGCAATGCTTGCTCTAGAAGTTTGTTTAAATTGAAGTATCCATCTCATACTCATGCCATGTTTACATTCTTTTTGCAATAACTGTCAGTACATGCTTATGAATGCTCATGCTTATGCGTCCATACTTTGTATCAATCATGCTTTACAAGTTTTATCTCTGTTTTTGTCCGGGCTACTGAGTGCGTTTACGCATGAGT                                                                                                                                                                                                                            ]




>consensus_5877#0
TTACTTTATGCATTGTATTATACACTCTTCAATTGAGCTTTGCTTGTTATCTCTTGGTCA
TCACTATGCTATGCATGTATCACTCTTATGCTAGTTTGATCTCTTGTCTAGCTTTCATTT
GCTTAAGTAGCTTGTGTGATCATGTTATGCTGTTCAAGCGTGTTGAAACCTGCTTAAATT
AACTATTCATTTGAACTCAATCAATGTGCAATGCTTGCTCTAGAAGTTTGTTTAAATTGA
AGTATCCATCTCATACTCATGCCATGTTTACATTCTTTTTGCAATAACTGTCAGTACATG
CTTATGAATGCTCATGCTTATGCGTCCATACTTTGTATCAATCATGCTTTACAAGTTTTA
TCTCTGTTTTTGTCCGGGCTACTGAGTGCGTTTACGCATGAGTAGTGCCGAAGATAGCAC
TGAGACAGCCTGTAATGGGAACTCTAGCTGGAAAACTTGATTGAGGTCAGACGGCAGTGT
TTGGCACAACCATCACTTGCTGACTGATAAGATCAGGTGGACCGTCGTGATTGTGCTATT
GTCTTTAAAGAAATTAAAAAAAATCATAAAAATAAAAGTCAAGAGAAAAGATTAAAAGCT
CATGTTCTATGCTTTGTTATCAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case