cluster # 5885

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Oryza sativa
cluster # 5885 cluster # 5885 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5885#0 length = 635 sequences # 3

consensusID : consensus_5885#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 635
fasta sequence

                              [ACGCCGAGCAGCGGCGTGCCGGCAATGTCCCTCCGCAAGCGCCAGCGTTCGGCGAGCAGCTCCCGCCTCAGCACCCTCTCCTCCTCGCCGGCTCCCCACACCNGCCGCCGCCGCCGCCTCCGCCTCCTCCCCTCCGCTCTCCTTCCCCAACGCCGACCTCGTCCTCCGCCTCCACCTCGACCCCTGCCCCGACGACGACGCGGACCTCGACGCCGGCGAGGATCACCGCCCCTCCCTCGACCTCCACGTCTCCTCGGCGTCCCTGCTCCGCTCCCGCTACTTCGCCGCTCTCCTCTCCGACCGCTGGAGCCCCGCCCCCACCTCCGCCGCGGGGGGGCACGGCCACCTCTCGCTGGCCGTGGCCGCTCCGCGCTCTGCCTCGCACCCTTTCCACGCCCACGTCGAGGTCGTCCGCCTCCTCCACACCCTCGACTTCGCCGGCGCCATCCACTCGCCCGCCGACGCCCTCGACATCCTCCCCGTCGCGCTCCAGCTCCTCTTCGACGCGTGCGTCGAGGCGTGCACGCGGTTCCTCGAGGCGGTACCCTGGTCGCCCGACGAGGAGGCCCGCGTCCTCGAGATCGCGCCTCTCCTCCCCGCCGATGAGGCTGCCGACCTCCTCGCTCGGATCACGC]

[+] EMBL AU181902             [ACGCCGAGCAGCGGCGTGCCGGCAATGTCCCTCCGCAAGCGCCAGCGTTCGGCGAGCAGCTCCCGCCTCAGCACCCTCTCCTCCTCGCCGGCTCCCCACACCNGCCGCCGCCGCCGCCTCCGCCTCCTCCCCTCCGCTCTCCTTCCCCAACGCCGACCTCGTCCTCCGCCTCCACCTCGACCCCTGCCCCGACGACGACGCGGACCTCGACGCCGGCGAGGATCACCGCCCCTCCCTCGACCTCCACGTCTCCTCGGCGTCCCTGCTCCGCTCCCGCTACTTCGCCGCTCTCCTCTCCGACCGCTGGAGCCCCGCCCCCACCTCCGCCGCGGGGGGGCACGGCCACCTCTCGCTGGCCGTGGCCGCTCCGCGCTCTGCCTCGCACCCTTTCCACGCCCACG                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CB642787             [                   CGGCAATGTCCCTCCGCAAGCGCCAGCGTTCGGCGAGCAGCTCCCGCCTCAGCACCCTCTCCTCCTCGCCGGCTCCCCACACC GCCGCCGCCGCCGCCTCCGCCTCCTCCCCTCCGCTCTCCTTCCCCAACGCCGACCTCGTCCTCCGCCTCCACCTCGACCCCTGCCCCGACGACGACGCGGACCTCGACGCCGGCGAGGATCACCGCCCCTCCCTCGACCTCCACGTCTCCTCGGCGTCCCTGCTCCGCTCCCGCTACTTCGCCGCTCTCCTCTCCGACCGCTGGAGCCCCGCCCCCACCTCCGCCGCGGGGGGGCACGGCCACCTCTCGCTGGCCGTGGCCGCTCCGCGCTCTGCCTCGCACCCTTTCCACGCCCACGTCGAGGTCGTCCGCCTCCTCCACACCCTCGACTTCGCCGGCGCCATCCACTCGCCCGCCGACGCCCTCGACATCCTCCCCGTCGCGCTCCAGCTCCTCTTCGACGCGTGCGTCGAGGCGTGCACGCGGTTCCTCGAGGCGGTACCCTGGTCGCCCGACGAGGAGGCCCGCGTCCTCGAGATCGCGCCTCTCCTCCCCGCCGATGAGGCTGCCGACCTCCTCGCTCGGATCACGC]
[+] EMBL CB671171             [                                                                                                                                                                                                                                            TCGACCTCCACGTCTCCTCGGCGTCCCTGCTCCGCTCCCGCTACTTCGCCGCTCTCCTCTCCGACCGCTGGAGCCCCGCCCCCACCTCCGCCGCGGGGGGGCACGGCCACCTCTCGCTGGCCGTGGCCGCTCCGCGCTCTGCCTCGCACCCTTTCCACGCCCACGTCGAGGTCGTCCGCCTCCTCCACACCCTCGACTTCGCCGGCGCCATCCACTCGCCCGCCGACGCCCTCGACATCCTCCCCGTCGCGCTCCAGCTCCTCTTCGACGCGTGCGTCGAGGCGTGCACGCGGTTCCTCGAGGCGGTACCCTGGTCGCCCGACGAGGAGGCCCGCGTCCTCGAGATCGCGCCTCTCCTCCCCGCCGATGAGGCTGCCGACCTCCTCGCTCGGATCACGC]




>consensus_5885#0
ACGCCGAGCAGCGGCGTGCCGGCAATGTCCCTCCGCAAGCGCCAGCGTTCGGCGAGCAGC
TCCCGCCTCAGCACCCTCTCCTCCTCGCCGGCTCCCCACACCNGCCGCCGCCGCCGCCTC
CGCCTCCTCCCCTCCGCTCTCCTTCCCCAACGCCGACCTCGTCCTCCGCCTCCACCTCGA
CCCCTGCCCCGACGACGACGCGGACCTCGACGCCGGCGAGGATCACCGCCCCTCCCTCGA
CCTCCACGTCTCCTCGGCGTCCCTGCTCCGCTCCCGCTACTTCGCCGCTCTCCTCTCCGA
CCGCTGGAGCCCCGCCCCCACCTCCGCCGCGGGGGGGCACGGCCACCTCTCGCTGGCCGT
GGCCGCTCCGCGCTCTGCCTCGCACCCTTTCCACGCCCACGTCGAGGTCGTCCGCCTCCT
CCACACCCTCGACTTCGCCGGCGCCATCCACTCGCCCGCCGACGCCCTCGACATCCTCCC
CGTCGCGCTCCAGCTCCTCTTCGACGCGTGCGTCGAGGCGTGCACGCGGTTCCTCGAGGC
GGTACCCTGGTCGCCCGACGAGGAGGCCCGCGTCCTCGAGATCGCGCCTCTCCTCCCCGC
CGATGAGGCTGCCGACCTCCTCGCTCGGATCACGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case