cluster # 5897

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 5897 cluster # 5897 Sequences # 3 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_5897#0 length = 563 sequences # 3

consensusID : consensus_5897#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 563
fasta sequence

                              [TGTGGATGAAGTTGCTAGAAGCTTGGAAAGAGTTCTACTTACTATGCGGATAACTACTTCTGAACCTAAGGAGCTAGCTTTTGTTGTGGATGGTTGGGCTCTTGAAATCATCCTGTCACGCTACAATGAAGCCTTTACTGAATTAGCAGCTCTTTCAAAAACAGCAATATGCTGCCGGGTTACACCGTCTCAGAAAGCACAGCTTGTAAAGCTTCTAAAATCATGTGACTATCGAACTTTGGCTATTGGAGATGGTGGGAATGATGTCAGGATGATACAACAGGCTGATATTGGTGTAGGAATTAGTGGCAGAGAAGGTCTTCAAGCAGCAAGGGCTGCTGACTATAGCGTTGGCAGTAAGTCTTTCTTATCAAATTGCCCTTCATGTTATCCCCCATTACTTAATGAAGTTTTGTACCTCATCTTACTATGAATCTGGAGCTAAAACTATGAATCTGGTGCCTATCCAGATTCGTAGTACTATGATGTGTCCCATCCAGTACTAGGTTCTTATATTTTGGGGCAGAGTTAGTATGTGTTTTCATTTTCTTCTAATGTGAATT]

[+] EMBL CF303847             [TGTGGATGAAGTTGCTAGAAGCTTGGAAAGAGTTCTACTTACTATGCGGATAACTACTTCTGAACCTAAGGAGCTAGCTTTTGTTGTGGATGGTTGGGCTCTTGAAATCATCCTGTCACGCTACAATGAAGCCTTTACTGAATTAGCAGCTCTTTCAAAAACAGCAATATGCTGCCGGGTTACACCGTCTCAGAAAGCACAGCTTGTAAAGCTTCTAAAATCATGTGACTATCGAACTTTGGCTATTGGAGATGGTGGGAATGATGTCAGGATGATACAACAGGCTGATATTGGTGTAGGAATTAGTGGCAGAGAAGGTCTTCAAGCAGCAAGGGCTGCTGACTATAGCGTTGGCAGTAAGTCTTTCTTATCAAATTGCCCTTCATGTTATCCCCCATTACTTAATGAAGTTTTGTACCTCATCTTACTATGAATCTGGAGCTAAAACTATGAATCTGGTGCCTATCCAGATTCGTAGTACTATGATGTGTCCCATCCAGTACTAGGTTCTTATATTTTGGGGCAGAGTTAGTATGTGTTTTCATTTTCTTCTAATGTGAATT]
[+] EMBL CF303395             [TGTGGATGAAGTTGCTAGAAGCTTGGAAAGAGTTCTACTTACTATGCGGATAACTACTTCTGAACCTAAGGAGCTAGCTTTTGTTGTGGATGGTTGGGCTCTTGAAATCATCCTGTCACGCTACAATGAAGCCTTTACTGAATTAGCAGCTCTTTCAAAAACAGCAATATGCTGCCGGGTTACACCGTCTCAGAAAGCACAGCTTGTAAAGCTTCTAAAATCATGTGACTATCGAACTTTGGCTATTGGAGATGGTGGGAATGATGTCAGGATGATACAACAGGCTGATATTGGTGTAGGAATTAGTGGCAGAGAAGGTCTTCAAGCAGCAAGGGCTGCTGACTATAGCGTTGGCAGTAAGTCTTTCTTATCAAATTGCCCTTCATGTTATCCCCCATTACTTAATGAAGTTTTGTACCTCATCTTACTATGAATCTGGAGCTAAAACTATGAATCTGGTGCCTATCCAGATTCGTAGTACTATGATGTGTCCC                                                                     ]
[+] EMBL CF305120             [TGTGGATGAAGTTGCTAGAAGCTTGGAAAGAGTTCTACTTACTATGCGGATAACTACTTCTGAACCTAAGGAGCTAGCTTTTGTTGTGGATGGTTGGGCTCTTGAAATCATCCTGTCACGCTACAATGAAGCCTTTACTGAATTAGCAGCTCTTTCAAAAACAGCAATATGCTGCCGGGTTACACCGTCTCAGAAAGCACAGCTTGTAAAGCTTCTAAAATCATGTGACTATCGAACTTTGGCTATTGGAGATGGTGGGAATGATGTCAGGATGATACAACAGGCTGATATTGGTGTAGGAATTAGTGGCAGAGAAGGTCTTCAAGCAGCAAGGGCTGCTGACTATAGCGTTGGCAGTAAGTCTTTCTTATCAAATTGCCCTTCATGTTATCCCCCATTACTTAATGAAGTTTTGTACCTCATCTTACTATGAATCTGGAGCTAAAACTATGAATC                                                                                                           ]




>consensus_5897#0
TGTGGATGAAGTTGCTAGAAGCTTGGAAAGAGTTCTACTTACTATGCGGATAACTACTTC
TGAACCTAAGGAGCTAGCTTTTGTTGTGGATGGTTGGGCTCTTGAAATCATCCTGTCACG
CTACAATGAAGCCTTTACTGAATTAGCAGCTCTTTCAAAAACAGCAATATGCTGCCGGGT
TACACCGTCTCAGAAAGCACAGCTTGTAAAGCTTCTAAAATCATGTGACTATCGAACTTT
GGCTATTGGAGATGGTGGGAATGATGTCAGGATGATACAACAGGCTGATATTGGTGTAGG
AATTAGTGGCAGAGAAGGTCTTCAAGCAGCAAGGGCTGCTGACTATAGCGTTGGCAGTAA
GTCTTTCTTATCAAATTGCCCTTCATGTTATCCCCCATTACTTAATGAAGTTTTGTACCT
CATCTTACTATGAATCTGGAGCTAAAACTATGAATCTGGTGCCTATCCAGATTCGTAGTA
CTATGATGTGTCCCATCCAGTACTAGGTTCTTATATTTTGGGGCAGAGTTAGTATGTGTT
TTCATTTTCTTCTAATGTGAATT

clustalw multiple alignements is not computed in this case