cluster # 5900

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Oryza sativa
cluster # 5900 cluster # 5900 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_5900#0 length = 1804 sequences # 3
consensusID : consensus_5900#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1804
fasta sequence
                              [GCACAGATCCACACGATTCCAAACTCCCAACTCTCGACTAGAACCGACTCCAATGGCGGCGGCGGCGGCTGCTGCTCCGCCCTTCGCCGCCGGCGACTCGCCGCCCCCGACCGCCTTGCTCCTCCCCCGCACCACCACCACCACCGCCGGCGCCGCCCCCGCGCCCCGGCGTTCCTCCGCCTCCTCCCGCCTCCACCTCCTCCTCACCGCCGCGCTCGCCGTCGCGACCTCCTACCTCCTCCTCATCCTCCCCCGCACGCCCCTCTCCGCCGCGCCGGCGCCTGCGGCCGCCGCGCGGGCGCAGGTGAAGCTCGAGAAGCCGGTGGTGATCCTCATCTCCTCCGACGGGTTCCGCTTCGGGTACCAGCACAAGGCCGCGACCCCGCACATCCACCGCCTCATCGGCAATGGCACCTCCGCCGCCACGGGCCTCGTCCCCATCTTCCCCACGCTCACGTTCCCCAATCACTACTCCATCGCCACCGGCCTCTACCCTTCCTCCCACGGCATCATCAACAACTACTTCCCCGACCCAATCTCCGGCGACTACTTCACCATGTCCTCGCATGAACCCAAGTGGTGGCTCGGGGAGCCCCTGTGGGTCACCGCCGCCGACCAGGGTATGCAGGCCGCCACCTACTTCTGGCCCGGCTCGGAGGTGAAGAAAGGCAGCTGGGATTGTCCCGACAAGTATTGCCGCCACTACAATGGCTCGGTACCATTCGAGGAGAGGGTCGATGCGATCCTTGGTTACTTTGATCTCCCATCTGATGAAATGCCGCAGTTCCTGACGCTTTATTTTGAAGATCCAGATCACCAGGGGCATCAGGTGGGTCCTGATGACCCGGCCATCACGGAGGCGGTGGTGCGGATCGATGAGATGATTGGGAGGCTCATTGCTGGTCTGGAAGAAAGAGGAGTGTTTGAGGATGTCAATGTTATATTGGTTGGTGACCATGGGATGGTTGGGACTTGCGACAAGAAGCTGGTGTTTCTCGACGAATTGGCTCCATGGATTAAGTTGGAGGAAGATTGGGTTTTATCAATGACCCCGTTGCTGGCCATCAGGCCGCCAGATGACATGTCGCTGCCAGATGTTGTGGCCAAGATGAATGAAGGGCTTGGGTCTGGGAAGGTGGAGAATGGTGAATATCTAAGAATGTACTTAAAGGAGGATTTGCCTTCTCGACTTCACTACGCAGATAGTTATAGAATCCCACCGATAATTGGGTTGCCAGAGGAAGGGTATAAAGTGGAGATGAAGCGATCGGACAAAAATGAATGTGGAGGAGCACATGGTTATGACAATGCCTTCTTCTCAATGAGAACCATATTTATCGCGCATGGTCCTCGTTTTGAAGGTGGTAGAGTCGTGCCATCCTTTGAGAACGTGGAGATATACAACGTTATTGCTTCCATTCTCAATTTGGAGCCAGCTCCAAACAATGGTTCATCTTCTTTTCCTGACACAATTCTTTTGCCGAGTGAATGATCACATATACATGTGACTGCTGTGGTTTTGGATGAGAAAGGTCTTGCTGTTGGTATCCTCCTTTAGTCGTAATTGCACTTGTACACTTATCATATTAGATTCGTGTCACTAGTGGCTATTCACTGCCTGAATGCAAATGCTGCTAGTAGAGAGTATCTTTGTCCTTATGGACAACATTTGCTGTTGTTATCATGTCTTATCCTTAGCGGTTTTCTTATGCTTAAATTTTCATGCAAGTTCAATTAAGCTCGCATTCTCTGCTTAAAATGATGTCCATCCTGTTGATAAGAGATTAACCAGTCCTAGTTCTAT]

[+] EMBL AK101742             [GCACAGATCCACACGATTCCAAACTCCCAACTCTCGACTAGAACCGACTCCAATGGCGGCGGCGGCGGCTGCTGCTCCGCCCTTCGCCGCCGGCGACTCGCCGCCCCCGACCGCCTTGCTCCTCCCCCGCACCACCACCACCACCGCCGGCGCCGCCCCCGCGCCCCGGCGTTCCTCCGCCTCCTCCCGCCTCCACCTCCTCCTCACCGCCGCGCTCGCCGTCGCGACCTCCTACCTCCTCCTCATCCTCCCCCGCACGCCCCTCTCCGCCGCGCCGGCGCCTGCGGCCGCCGCGCGGGCGCAGGTGAAGCTCGAGAAGCCGGTGGTGATCCTCATCTCCTCCGACGGGTTCCGCTTCGGGTACCAGCACAAGGCCGCGACCCCGCACATCCACCGCCTCATCGGCAATGGCACCTCCGCCGCCACGGGCCTCGTCCCCATCTTCCCCACGCTCACGTTCCCCAATCACTACTCCATCGCCACCGGCCTCTACCCTTCCTCCCACGGCATCATCAACAACTACTTCCCCGACCCAATCTCCGGCGACTACTTCACCATGTCCTCGCATGAACCCAAGTGGTGGCTCGGGGAGCCCCTGTGGGTCACCGCCGCCGACCAGGGTATGCAGGCCGCCACCTACTTCTGGCCCGGCTCGGAGGTGAAGAAAGGCAGCTGGGATTGTCCCGACAAGTATTGCCGCCACTACAATGGCTCGGTACCATTCGAGGAGAGGGTCGATGCGATCCTTGGTTACTTTGATCTCCCATCTGATGAAATGCCGCAGTTCCTGACGCTTTATTTTGAAGATCCAGATCACCAGGGGCATCAGGTGGGTCCTGATGACCCGGCCATCACGGAGGCGGTGGTGCGGATCGATGAGATGATTGGGAGGCTCATTGCTGGTCTGGAAGAAAGAGGAGTGTTTGAGGATGTCAATGTTATATTGGTTGGTGACCATGGGATGGTTGGGACTTGCGACAAGAAGCTGGTGTTTCTCGACGAATTGGCTCCATGGATTAAGTTGGAGGAAGATTGGGTTTTATCAATGACCCCGTTGCTGGCCATCAGGCCGCCAGATGACATGTCGCTGCCAGATGTTGTGGCCAAGATGAATGAAGGGCTTGGGTCTGGGAAGGTGGAGAATGGTGAATATCTAAGAATGTACTTAAAGGAGGATTTGCCTTCTCGACTTCACTACGCAGATAGTTATAGAATCCCACCGATAATTGGGTTGCCAGAGGAAGGGTATAAAGTGGAGATGAAGCGATCGGACAAAAATGAATGTGGAGGAGCACATGGTTATGACAATGCCTTCTTCTCAATGAGAACCATATTTATCGCGCATGGTCCTCGTTTTGAAGGTGGTAGAGTCGTGCCATCCTTTGAGAACGTGGAGATATACAACGTTATTGCTTCCATTCTCAATTTGGAGCCAGCTCCAAACAATGGTTCATCTTCTTTTCCTGACACAATTCTTTTGCCGAGTGAATGATCACATATACATGTGACTGCTGTGGTTTTGGATGAGAAAGGTCTTGCTGTTGGTATCCTCCTTTAGTCGTAATTGCACTTGTACACTTATCATATTAGATTCGTGTCACTAGTGGCTATTCACTGCCTGAATGCAAATGCTGCTAGTAGAGAGTATCTTTGTCCTTATGGACAACATTTGCTGTTGTTATCATGTCTTATCCTTAGCGGTTTTCTTATGCTTAAATTTTCATGCAAGTTCAATTAAGCTCGCA                                                           ]
[+] EMBL OS25430              [                      ACTCCCAACTCTCGACTAGAACCGACTCCAATGGCGGCGGCGGCGGCTGCTGCTCCGCCCTTCGCCGCCGGCGACTCGCCGCCCCCGACCGCCTTGCTCCTCCCCCGCACCACCACCACCACCGCCGGCGCCGCCCCCGCGCCCCGGCGTTCCTCCGCCTCCTCCCGCCTCCACCTCCTCCTCACCGCCGCGCTCGCCGTCGCGACCTCCTACCTCCTCCTCATCCTCCCCCGCACGCCCCTCTCCGCCGCGCCGGCGCCTGCGGCCGCCGCGCGGGCGCAGGTGAAGCTCGAGAAGCCGGTGGTGATCCTCATCTCCTCCGACGGGTTCCGCTTCGGGTACCAGCACAAGGCCGCGACCCCGCACATCCACCGCCTCATCGGCAATGGCACCTCCGCCGCCACGGGCCTCGTCCCCATCTTCCCCACGCTCACGTTCCCCAATCACTACTCCATCGCCACCGGCCTCTACCCTTCCTCCCACGGCATCATCAACAACTACTTCCCCGACCCAATCTCCGGCGACTACTTCACCATGTCCTCGCATGAACCCAAGTGGTGGCTCGGGGAGCCCCTGTGGGTCACCGCCGCCGACCAGGGTATCCAGGCCGCCACCTACTTCTGGCCCGGCTCGGAGGTGAAGAAAGGCAGCTGGGATTGTCCCGACAAGTATTGCCGCCACTACAATGGCTCGGTACCATTCGAGGAGAGGGTCGATGCGATCCTTGGTTACTTTGATCTCCCATCTGATGAAATGCCGCAGTTCCTGACGCTTTATTTTGAAGATCCAGATCACCAGGGGCATCAGGTGGGTCCTGATGACCCGGCCATCACGGAGGCGGTGGTGCGGATCGATGAGATGATTGGGAGGCTCATTGCTGGTCTGGAAGAAAGAGGAGTGTTTGAGGATGTCAATGTTATATTGGTTGGTGACCATGGGATGGTTGGGACTTGCGACAAGAAGCTGGTGTTTCTCGACGAATTGGCTCCATGGATTAAGTTGGAGGAAGATTGGGTTTTATCAATGACCCCGTTGCTGGCCATCAGGCCGCCAGATGACATGTCGCTGCCAGATGTTGTGGCCAAGATGAATGAAGGGCTTGGGTCTGGGAAGGTGGAGAATGGTGAATATCTAAGAATGTACTTAAAGGAGGATTTGCCTTCTCGACTTCACTACGCAGATAGTTATAGAATCCCACCGATAATTGGGTTGCCAGAGGAAGGGTATAAAGTGGAGATGAAGCGATCGGACAAAAATGAATGTGGAGGAGCACATGGTTATGACAATGCCTTCTTCTCAATGAGAACCATATTTATCGCGCATGGTCCTCGTTTTGAAGGTGGTAGAGTCGTGCCATCCTTTGAGAACGTGGAGATATACAACGTTATTGCTTCCATTCTCAATTTGGAGCCAGCTCCAAACAATGGTTCATCTTCTTTTCCTGACACAATTCTTTTGCCGAGTGAATGATCACATATACATGTGACTGCTGTGGTTTTGGATGAGAAAGGTCTTGCTGTTGGTATCCTCCTTTAGTCGTAATTGCACTTGTACACTTATCATATTAGATTCGTGTCACTAGTGGCTATTCACTGCCTGAATGCAAATGCTGCTAGTAGAGAGTATCTTTGTCCTTATGGACAACATTTGCTGTTGTTATCATGTCTTATCCTTAGCGGTTTTCTTATGCTTAAATTTTCATGCAAGTTCAATTAAGCTCGCATTCTCTGCTTAAAATGATGTCCATCCTGTTGATAAGAGATTAACCAGTCCTAGTTCTAT]
[+] EMBL OSC17701             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTGGTAGAGTCGTGCCATCCTTTGAGAACGTGGAGATATACAACGTTATTGCTTCCATTCTCAATTTGGAGCCAGCTCCAAACAATGGTTCATCTTCTTTTCCTGACACAATTCTTTTGCCGAGTGAATGATCACATATACATGTGACTGCTGTGGTTTTGGATGAGAAAGGTCTTGCTGTTGGTATCCTCCTTTAGTCGTAATTGCACTTGTACACTTATCATATTAGATTCGTGTCACTAGTGGCTATTCACTGCCTGAATGCAAATGCTGCTAGTAGAGAGTATCTTTGTCCTTATGGGCAACATTTGCTGTTGTTATCATGTCTTATCCTTAGCGGTTTTCTTATGCTTAAATTTTCATGCAAGTTCNAT                                                                     ]




>consensus_5900#0
GCACAGATCCACACGATTCCAAACTCCCAACTCTCGACTAGAACCGACTCCAATGGCGGC
GGCGGCGGCTGCTGCTCCGCCCTTCGCCGCCGGCGACTCGCCGCCCCCGACCGCCTTGCT
CCTCCCCCGCACCACCACCACCACCGCCGGCGCCGCCCCCGCGCCCCGGCGTTCCTCCGC
CTCCTCCCGCCTCCACCTCCTCCTCACCGCCGCGCTCGCCGTCGCGACCTCCTACCTCCT
CCTCATCCTCCCCCGCACGCCCCTCTCCGCCGCGCCGGCGCCTGCGGCCGCCGCGCGGGC
GCAGGTGAAGCTCGAGAAGCCGGTGGTGATCCTCATCTCCTCCGACGGGTTCCGCTTCGG
GTACCAGCACAAGGCCGCGACCCCGCACATCCACCGCCTCATCGGCAATGGCACCTCCGC
CGCCACGGGCCTCGTCCCCATCTTCCCCACGCTCACGTTCCCCAATCACTACTCCATCGC
CACCGGCCTCTACCCTTCCTCCCACGGCATCATCAACAACTACTTCCCCGACCCAATCTC
CGGCGACTACTTCACCATGTCCTCGCATGAACCCAAGTGGTGGCTCGGGGAGCCCCTGTG
GGTCACCGCCGCCGACCAGGGTATGCAGGCCGCCACCTACTTCTGGCCCGGCTCGGAGGT
GAAGAAAGGCAGCTGGGATTGTCCCGACAAGTATTGCCGCCACTACAATGGCTCGGTACC
ATTCGAGGAGAGGGTCGATGCGATCCTTGGTTACTTTGATCTCCCATCTGATGAAATGCC
GCAGTTCCTGACGCTTTATTTTGAAGATCCAGATCACCAGGGGCATCAGGTGGGTCCTGA
TGACCCGGCCATCACGGAGGCGGTGGTGCGGATCGATGAGATGATTGGGAGGCTCATTGC
TGGTCTGGAAGAAAGAGGAGTGTTTGAGGATGTCAATGTTATATTGGTTGGTGACCATGG
GATGGTTGGGACTTGCGACAAGAAGCTGGTGTTTCTCGACGAATTGGCTCCATGGATTAA
GTTGGAGGAAGATTGGGTTTTATCAATGACCCCGTTGCTGGCCATCAGGCCGCCAGATGA
CATGTCGCTGCCAGATGTTGTGGCCAAGATGAATGAAGGGCTTGGGTCTGGGAAGGTGGA
GAATGGTGAATATCTAAGAATGTACTTAAAGGAGGATTTGCCTTCTCGACTTCACTACGC
AGATAGTTATAGAATCCCACCGATAATTGGGTTGCCAGAGGAAGGGTATAAAGTGGAGAT
GAAGCGATCGGACAAAAATGAATGTGGAGGAGCACATGGTTATGACAATGCCTTCTTCTC
AATGAGAACCATATTTATCGCGCATGGTCCTCGTTTTGAAGGTGGTAGAGTCGTGCCATC
CTTTGAGAACGTGGAGATATACAACGTTATTGCTTCCATTCTCAATTTGGAGCCAGCTCC
AAACAATGGTTCATCTTCTTTTCCTGACACAATTCTTTTGCCGAGTGAATGATCACATAT
ACATGTGACTGCTGTGGTTTTGGATGAGAAAGGTCTTGCTGTTGGTATCCTCCTTTAGTC
GTAATTGCACTTGTACACTTATCATATTAGATTCGTGTCACTAGTGGCTATTCACTGCCT
GAATGCAAATGCTGCTAGTAGAGAGTATCTTTGTCCTTATGGACAACATTTGCTGTTGTT
ATCATGTCTTATCCTTAGCGGTTTTCTTATGCTTAAATTTTCATGCAAGTTCAATTAAGC
TCGCATTCTCTGCTTAAAATGATGTCCATCCTGTTGATAAGAGATTAACCAGTCCTAGTT
CTAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case