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Oryza sativa
cluster # 6019 cluster # 6019       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6019#0 length = 1173 sequences # 3  

consensusID : consensus_6019#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1173
fasta sequence
                              [CCGTGGAAGGGAACGGAAAGGGGGAAGAAGAGCTGCAGCGAGCGACGAGGGCATCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGCGCGCGACGGTTTATCCCGTCCCCGATCCGATCGTCGCCGGGGCTCCTCCTCCTCCACCCTCGCCGCGGGCAATATTTGGAACCCCCCAGGGAAGTATCTCTCACCGCCGATCGCCTCTCATGCCGTGCTGAGTGGAGCGCCTACCGAATCCCTACCCCCACCCGCCGCCGCCGCAGCAGCTCGTGCCGTATCCTGTTTACAGCGGTTTGTGGGTGATGGCTTCCAACGCCGACCAGCACGCGGCGGCGAACGGTGGTGGGGGGACGACGCCGGCTGCGACCGGTAGCCCCCCTGCCGGGAAGAAGGCGGCGGCCGCTGCAGCGTGGAAGAGGCCGGGGAACGGGGCGGCGGTGCCGGTCGTGGTGGCGCCTGGGAGCCCCATCATGGACGCCGACTCATGGCCGGCGCTGCCCGGGCTGGCGTCTCCGCCGCCGACGACGCTGACGCCGACGCCGATGCCGCCCAAGGCATCGCCCAAGGTGGCTCCTCTACCGCCACCCGCTGAGGCGGTGATCCCACCGATCTCCTTGGGGAATTCCGGCGCTCCGGATGCTAATCCTGATCACGAAGCACCGGTGCGGAATCCGCCGGCTAGGCGTGCCCTGGTGATGCCTGTGGGGGATGGGCTGGACAAGCGTGCCCCTGGCTCAGAGCCATCCCCAGTCTACACCCCTAATGCCAGGAGCAATGGAGGCGGTGATCACCACCAGAATGGTCGATATGGTTCCCATCCCCATAGCCGAGGTAGTGGCTATGGTGGTGGGGGGAACAGGAGGGGCAATGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTCGCCGTGGACAGGAGCACCATGGTGGTTTTGATGGGCAACGCCGTGGCGGTGGCCGCAGGGACGGCCAT-GGGCCTGGACACCAGCAGCGCGG-CCACCATCCATCTTACATAA-GGGCTCCTCTGGCTGTTGTGACTGCGGMGCCTTCTACAMCCAACAACCATTTGTTAACCCTGCTACTTCACAAACACCACCTTATGGAGSTYCCATAAGCTTBYCTTGTAGTTCAAGCAMTGSCCTTTTGYDGCTCAVCCAGCAAGTGCTTTCAGATCAWGKGTAADTGCCTCAATTTGRTCC]

[+] EMBL AK103466             [CCGTGGAAGGGAACGGAAAGGGGGAAGAAGAGCTGCAGCGAGCGACGAGGGCATCGCCGCCTCCGCCGCCGCCGCGCGCGACGGTTTATCCCGTCCCCGATCCGATCGTCGCCGGGGCTCCTCCTCCTCCACCCTCGCCGCGGGCAATATTTGGAACCCCCCAGGGAAGTATCTCTCACCGCCGATCGCCTCTCATGCCGTGCTGAGTGGAGCGCCTACCGAATCCCTACCCCCACCCGCCGCCGCCGCAGCAGCTCGTGCCGTATCCTGTTTACAGCGGTTTGTGGGTGATGGCTTCCAACGCCGACCAGCACGCGGCGGCGAACGGTGGTGGGGGGACGACGCCGGCTGCGACCGGTAGCCCCCCTGCCGGGAAGAAGGCGGCGGCCGCTGCAGCGTGGAAGAGGCCGGGGAACGGGGCGGCGGTGCCGGTCGTGGTGGCGCCTGGGAGCCCCATCATGGACGCCGACTCATGGCCGGCGCTGCCCGGGCTGGCGTCTCCGCCGCCGACGACGCTGACGCCGACGCCGATGCCGCCCAAGGCATCGCCCAAGGTGGCTCCTCTACCGCCACCCGCTGAGGCGGTGATCCCACCGATCTCCTTGGGGAATTCCGGCGCTCCGGATGCTAATCCTGATCACGAAGCACCGGTGCGGAATCCGCCGGCTAGGCGTGCCCTGGTGATGCCTGTGGGGGATGGGCTGGACAAGCGTGCCCCTGGCTCAGAGCCATCCCCAGTCTACACCCCTAATGCCAGGAGCAATGGAGGCGGTGATCACCACCAGAATGGTCGATATGGTTCCCATCCCCATAGCCGAGGTAGTGGCTATGGTGGTGGGGGGAACAGGAGGGGCAATGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTCGCCGTGGACAGGAGCACCATGGTGGTTTTGATGGGCAACGCCGTGGCGGTGGCCGCAGGGACGGCCAT GGGCCTGGACACCAGCAGCGCGG CCACCATCCATCTTACATAA GGGCTCCTCTGGCTGTT                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CF306494             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGGGGGAACAGGAGGGGC ATGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTCNCCGTGGACAGGAGCACCATGGTGGTTTTGATGG                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AA752634             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AGGTCGCCGTGGACAGGAGCACCATGGTGGTTTTGATGGGCAACGCCGTGGCGRTGGCCGCAGGGACGGCCATGGGGCCTGGACACCAGCAGCGCGGTCCACCATCCATCTTACATAAGGGGCTCCTCTKGCTGTTGTGACTGCGGMGCCTTCTACAMCCAACAACCATTTGTTAACCCTGCTACTTCACAAACACCACCTTATGGAGSTYCCATAAGCTTBYCTTGTAGTTCAAGCAMTGSCCTTTTGYDGCTCAVCCAGCAAGTGCTTTCAGATCAWGKGTAADTGCCTCAATTTGRTCC]


>consensus_6019#0 CCGTGGAAGGGAACGGAAAGGGGGAAGAAGAGCTGCAGCGAGCGACGAGGGCATCGCCGC CTCCGCCGCCGCCGCGCGCGACGGTTTATCCCGTCCCCGATCCGATCGTCGCCGGGGCTC CTCCTCCTCCACCCTCGCCGCGGGCAATATTTGGAACCCCCCAGGGAAGTATCTCTCACC GCCGATCGCCTCTCATGCCGTGCTGAGTGGAGCGCCTACCGAATCCCTACCCCCACCCGC CGCCGCCGCAGCAGCTCGTGCCGTATCCTGTTTACAGCGGTTTGTGGGTGATGGCTTCCA ACGCCGACCAGCACGCGGCGGCGAACGGTGGTGGGGGGACGACGCCGGCTGCGACCGGTA GCCCCCCTGCCGGGAAGAAGGCGGCGGCCGCTGCAGCGTGGAAGAGGCCGGGGAACGGGG CGGCGGTGCCGGTCGTGGTGGCGCCTGGGAGCCCCATCATGGACGCCGACTCATGGCCGG CGCTGCCCGGGCTGGCGTCTCCGCCGCCGACGACGCTGACGCCGACGCCGATGCCGCCCA AGGCATCGCCCAAGGTGGCTCCTCTACCGCCACCCGCTGAGGCGGTGATCCCACCGATCT CCTTGGGGAATTCCGGCGCTCCGGATGCTAATCCTGATCACGAAGCACCGGTGCGGAATC CGCCGGCTAGGCGTGCCCTGGTGATGCCTGTGGGGGATGGGCTGGACAAGCGTGCCCCTG GCTCAGAGCCATCCCCAGTCTACACCCCTAATGCCAGGAGCAATGGAGGCGGTGATCACC ACCAGAATGGTCGATATGGTTCCCATCCCCATAGCCGAGGTAGTGGCTATGGTGGTGGGG GGAACAGGAGGGGCAATGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGTCGCCGTGGACAGGAGCACCATG GTGGTTTTGATGGGCAACGCCGTGGCGGTGGCCGCAGGGACGGCCATGGGCCTGGACACC AGCAGCGCGGCCACCATCCATCTTACATAAGGGCTCCTCTGGCTGTTGTGACTGCGGMGC CTTCTACAMCCAACAACCATTTGTTAACCCTGCTACTTCACAAACACCACCTTATGGAGS TYCCATAAGCTTBYCTTGTAGTTCAAGCAMTGSCCTTTTGYDGCTCAVCCAGCAAGTGCT TTCAGATCAWGKGTAADTGCCTCAATTTGRTCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)