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Oryza sativa
cluster # 6051 cluster # 6051       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6051#0 length = 2375 sequences # 3  

consensusID : consensus_6051#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 2375
fasta sequence
                              [TCCCGCTCCACGCGGACCACTCGCGTCTCCTCTCCCGCTTCCGCCACGCCGTCCTCCCGGAGTCCGCTTCGCCGCTCCACTCGCCCGCTCCCGCCGCGGGCCTCGCCATCGGGTCCTTCGCTTCCGACCTCGGCGCCCCGTGGTTCTGCCCGCGTGGCCACCCCGTAAGCCTCCTCCCGATCGAAACCCCCGCCGCCGCCGCCAAGCAGGAGTCCCCGTTGTACTACCGGCCCAGCCACGCGGCGCGGGTGGCCGCCGCGATCGATGCGCTGAGCGCCGCGGCGAGGGATGAAGTGATCGATTTGGTGGCCGTCTCGTCGCGGTTGGCGCGGCGGGTTTGCAGGGTTTACGGCTTCTGGATGGGCCCCGAGGCGGCTCCGCTGTGGCTGCTCTCCGAGCGGCATTCCCGCGGAGTCTCCTGCTTGTTGGAGGAGAGGAGCCGACGAGAGGAGACGGTGGCTCTGATCAGAAATGTCGGAATGGAGGTCTGTGAAGCGTTCATGGGATTGCACGGAGAGGGGCTGGTACTGGGGTGCATAGGGCTAGGATGCTTCTGCCTCGATCGCTTTGGACACTGCCTACTCGACCTGAATCAGGTTTTGGCCTTGTGCCACGGGGTTCGGGTAGGGGTTTGCTCATCCAAGTCTAAGGCCTTCATGGCTCCTGAGGTGGCAGAGGTGGTGCATGACAAGTTGCAGATAAAGGATCATGATTTCAGTGGCTTGTTAGGGCCTAGTTCAGATGCTTGGTTGCTTGGTTGTTTATTGGTGGCACTTGTAACTGGGGATGAGCAGCTTGCAGCAGGATGGAGTACTGAGGGGTCATACGATGATTGGAAGAATGAAGTGCTTACGAAGGTTGATGCTTCATTGGTTGGCACACATATGGAACCATGGTCTGCAACCATAGTGTCATGTTTGAACTATGATCCAGAAGGCCGTCCAGAAATTGCTGATGTCTGGAAATGTATTAACGGCTCATTGATGAATTCCGACATTGAAGCTTTGATTCCTAATGTTGATCTTGCAGCTCGAAAGAGTTTTATGTGTTTGCTCCTTGGGGAGTTGTCCTCAATGTGCTCTAACCTTGGTGCTGTTGAGTCAGATGATACAATGCATCTTTCTCAGGATTTGGATGACAAACATTCAACTCCAGATGATGCAAGCAGTGGTGGTATTATAAACAACGAAGAAGTTGGTGCAGCTGGAATGGATGGGCCAAAATGTGGACTGTACAATTCTTCAACTCTGCTTGCTCACCGTGACTGTATTACGGGATTAGCCATTGGAGGAGGCTTTTTGTTTAGCTCTTCTTACGACAAGACAATCAATGTATGGTCACTGCAGGACTTCTCTCATAAACAAAGTTTGAAGGGCCATGAACACAAAATCACAGCAATTGTTGTTGTTGACAATGATAATCAGTCACTTTGTATAAGTGGAGACAGTGGTAGTGGAATATTTGTCTGGTGTGTTGATCCTTCACTCAGTAATGAACCATTGAATAAGTGGTATGAAAGTAATGATTGGATTTATCGAGGTGTTCACTGTTTGGCTGTTTCTGGAACTGGTTATCTTTACACTGGTAGTAGGGACAAATCTATTAAGGCTTGGTCTCTAGAGGTCACAAATCAACTGTTTCTTGCCTTGCGGTTGCCTGTGGTATTCTTTACAGTGGAAGTTGGGATGGTTCTATTAGATCATGGTGGCTCACTGATCACAGCCCGCTGTCTGTACTGGAAGATGGTACACCAGGAAGCATTACTCCTGTGCTGTCAATTTCAACAGAACTCGATTTTGTTGTTGCATCACATGAAAATGGCTGTTTGAAGATCTGGAAGGATGATGTCCTAGTAAAGTCAGAGAAACTTCAAAACGGTGCTATATATGCTGCTAAATTGAATGACAAGTGGCTCTATGCTGGTGGATGGGATAAAGTTGTAAATATTCAGGAGTTATTGGAAGATGATTCAGAGGTGGAAATCAGAGATGTTGCTACCTTTACTTGTGATTCAATTATAACTTCAATACTGTACTGGGATGGAAGGCTGATAGTTGGACTTTCTAACAGGGAGATTAAGGTTTTCTACAAGGCATCTTAACTCTAAATCAGGATTATTAATCATTTGTCACTCCATCTTGTATATATTGTGAATAGCACACTGTATAGTCGAATTGATAACGAAAGACTGATAGGACCATGTAATTAGAATTTGAATGCTGCTTTTGGTGAATGATGATAAACCTGTATGGTAAAGTTTGAGTGCAACTGCACAATAGGGTAAGGTTTTTTGTAACAGTAGTATCATATAGAAACCATCGAAGTCGTAGCTCATATCAATTTG-TTTCTTCTACTAGAAAAATCATGGAATTTGT]

[+] EMBL AK111886             [TCCCGCTCCACGCGGACCACTCGCGTCTCCTCTCCCGCTTCCGCCACGCCGTCCTCCCGGAGTCCGCTTCGCCGCTCCACTCGCCCGCTCCCGCCGCGGGCCTCGCCATCGGGTCCTTCGCTTCCGACCTCGGCGCCCCGTGGTTCTGCCCGCGTGGCCACCCCGTAAGCCTCCTCCCGATCGAAACCCCCGCCGCCGCCGCCAAGCAGGAGTCCCCGTTGTACTACCGGCCCAGCCACGCGGCGCGGGTGGCCGCCGCGATCGATGCGCTGAGCGCCGCGGCGAGGGATGAAGTGATCGATTTGGTGGCCGTCTCGTCGCGGTTGGCGCGGCGGGTTTGCAGGGTTTACGGCTTCTGGATGGGCCCCGAGGCGGCTCCGCTGTGGCTGCTCTCCGAGCGGCATTCCCGCGGAGTCTCCTGCTTGTTGGAGGAGAGGAGCCGACGAGAGGAGACGGTGGCTCTGATCAGAAATGTCGGAATGGAGGTCTGTGAAGCGTTCATGGGATTGCACGGAGAGGGGCTGGTACTGGGGTGCATAGGGCTAGGATGCTTCTGCCTCGATCGCTTTGGACACTGCCTACTCGACCTGAATCAGGTTTTGGCCTTGTGCCACGGGGTTCGGGTAGGGGTTTGCTCATCCAAGTCTAAGGCCTTCATGGCTCCTGAGGTGGCAGAGGTGGTGCATGACAAGTTGCAGATAAAGGATCATGATTTCAGTGGCTTGTTAGGGCCTAGTTCAGATGCTTGGTTGCTTGGTTGTTTATTGGTGGCACTTGTAACTGGGGATGAGCAGCTTGCAGCAGGATGGAGTACTGAGGGGTCATACGATGATTGGAAGAATGAAGTGCTTACGAAGGTTGATGCTTCATTGGTTGGCACACATATGGAACCATGGTCTGCAACCATAGTGTCATGTTTGAACTATGATCCAGAAGGCCGTCCAGAAATTGCTGATGTCTGGAAATGTATTAACGGCTCATTGATGAATTCCGACATTGAAGCTTTGATTCCTAATGTTGATCTTGCAGCTCGAAAGAGTTTTATGTGTTTGCTCCTTGGGGAGTTGTCCTCAATGTGCTCTAACCTTGGTGCTGTTGAGTCAGATGATACAATGCATCTTTCTCAGGATTTGGATGACAAACATTCAACTCCAGATGATGCAAGCAGTGGTGGTATTATAAACAACGAAGAAGTTGGTGCAGCTGGAATGGATGGGCCAAAATGTGGACTGTACAATTCTTCAACTCTGCTTGCTCACCGTGACTGTATTACGGGATTAGCCATTGGAGGAGGCTTTTTGTTTAGCTCTTCTTACGACAAGACAATCAATGTATGGTCACTGCAGGACTTCTCTCATAAACAAAGTTTGAAGGGCCATGAACACAAAATCACAGCAATTGTTGTTGTTGACAATGATAATCAGTCACTTTGTATAAGTGGAGACAGTGGTAGTGGAATATTTGTCTGGTGTGTTGATCCTTCACTCAGTAATGAACCATTGAATAAGTGGTATGAAAGTAATGATTGGATTTATCGAGGTGTTCACTGTTTGGCTGTTTCTGGAACTGGTTATCTTTACACTGGTAGTAGGGACAAATCTATTAAGGCTTGGTCTCTAGAGGTCACAAATCAACTGTTTCTTGCCTTGCGGTTGCCTGTGGTATTCTTTACAGTGGAAGTTGGGATGGTTCTATTAGATCATGGTGGCTCACTGATCACAGCCCGCTGTCTGTACTGGAAGATGGTACACCAGGAAGCATTACTCCTGTGCTGTCAATTTCAACAGAACTCGATTTTGTTGTTGCATCACATGAAAATGGCTGTTTGAAGATCTGGAAGGATGATGTCCTAGTAAAGTCAGAGAAACTTCAAAACGGTGCTATATATGCTGCTAAATTGAATGACAAGTGGCTCTATGCTGGTGGATGGGATAAAGTTGTAAATATTCAGGAGTTATTGGAAGATGATTCAGAGGTGGAAATCAGAGATGTTGCTACCTTTACTTGTGATTCAATTATAACTTCAATACTGTACTGGGATGGAAGGCTGATAGTTGGACTTTCTAACAGGGAGATTAAGGTTTTCTACAAGGCATCTTAACTCTAAATCAGGATTATTAATCATTTGTCACTCCATCTTGTATATATTGTGAATAGCACACTGTATAGTCGAATTGATAACGAAAGACTGATAGGACCATGTAATTAGAATTTGAATGCTGCTTTTGGTGAATGATGATAAACCTGTATGGTAAAGTTTGAGTGCAACTGCACAATAGGGTAAGGTTTTTTGTAACAGTAGTATCATATAGAAACCATCGAAGTCGTAGCTCATATCAATTTG TTTCTTCTACTAGAAAAATCATGGAATTTGT]
[+] EMBL CB636533             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCCCGAGGCGGCTCCGCTGTGGCTGCTCTCCGAGCGGCATTCCCGCGGAGTCTCCTGCTTGTTGGAGGAGAGGAGCCGACGAGAGGAGACGGTGGCTCTGATCAGAAATGTCGGAATGGAGGTCTGTGAAGCGTTCATGGGATTGCACGGAGAGGGGCTGGTACTGGGGTGCATATGGCTAGGATGCTTCTGCCTCGATCGCTTTGGACACTGCCTGCTCGACCTGAATCAGGTTTTGGCCTTGTGCCACGGGGTTCGGGTAGGGGTTTGCTCATCCAAGTCTAAGGCCTTCATGGCTCCTGAGGTGGCAGAGGTGGTGCATGACAAGTTGCAGATAAAGGATCATGATTTCAGTGGCTTGTTAGGGCCTAGTTCAGATGCTTGGTTGCTTGGTTGTTTATTGGTGGCACTTGTAACTGGGGATGAGCAGCTTGCAGCAGGATGGAGTACTGAGGGGTCATACGATGATTGGAAGAATGAAGTGCTTACGAAGGTTGATGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CB636534             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAGTCAGAGACACTTCAAAACGGTGCTATATATGCTGCTAAATTGAATGACAAGTGGCTCTATGCTGGTGGATGGGATAAAGTTGTAAATATTCAGGAGTTATTGGAAGATGATTCAGAGGTGGAAATCAGAGATGTTGCTACCTTTACTTGTGATTCAATTATAACTTCAATACTGTACTGGGATGGAAGGCTGATAGTTGGACTTTCTAACAGGGAGATTAAGGTTTTCTACAAGGCATCTTAACTCTAAATCAGGATTATTAATCATTTGTCACTCCATCTTGTATATATTGTGAATAGCACACTGTATAGTCGAATTGATAACGAAAGACTGATAGGACCATGTAATTAGAATAAAAAAGCTGCTTTTGGTGAATGATGATAAACCTGTATGGTAAAGTTTGAGTGCAACTGCACAATAGGGTAAGGTTTTTTGTAACAGTAGTATCATATAGAAACCATCGAAGTCGTAGCTCATATCAATTTGTTTTTTTCTACTAG                  ]


>consensus_6051#0 TCCCGCTCCACGCGGACCACTCGCGTCTCCTCTCCCGCTTCCGCCACGCCGTCCTCCCGG AGTCCGCTTCGCCGCTCCACTCGCCCGCTCCCGCCGCGGGCCTCGCCATCGGGTCCTTCG CTTCCGACCTCGGCGCCCCGTGGTTCTGCCCGCGTGGCCACCCCGTAAGCCTCCTCCCGA TCGAAACCCCCGCCGCCGCCGCCAAGCAGGAGTCCCCGTTGTACTACCGGCCCAGCCACG CGGCGCGGGTGGCCGCCGCGATCGATGCGCTGAGCGCCGCGGCGAGGGATGAAGTGATCG ATTTGGTGGCCGTCTCGTCGCGGTTGGCGCGGCGGGTTTGCAGGGTTTACGGCTTCTGGA TGGGCCCCGAGGCGGCTCCGCTGTGGCTGCTCTCCGAGCGGCATTCCCGCGGAGTCTCCT GCTTGTTGGAGGAGAGGAGCCGACGAGAGGAGACGGTGGCTCTGATCAGAAATGTCGGAA TGGAGGTCTGTGAAGCGTTCATGGGATTGCACGGAGAGGGGCTGGTACTGGGGTGCATAG GGCTAGGATGCTTCTGCCTCGATCGCTTTGGACACTGCCTACTCGACCTGAATCAGGTTT TGGCCTTGTGCCACGGGGTTCGGGTAGGGGTTTGCTCATCCAAGTCTAAGGCCTTCATGG CTCCTGAGGTGGCAGAGGTGGTGCATGACAAGTTGCAGATAAAGGATCATGATTTCAGTG GCTTGTTAGGGCCTAGTTCAGATGCTTGGTTGCTTGGTTGTTTATTGGTGGCACTTGTAA CTGGGGATGAGCAGCTTGCAGCAGGATGGAGTACTGAGGGGTCATACGATGATTGGAAGA ATGAAGTGCTTACGAAGGTTGATGCTTCATTGGTTGGCACACATATGGAACCATGGTCTG CAACCATAGTGTCATGTTTGAACTATGATCCAGAAGGCCGTCCAGAAATTGCTGATGTCT GGAAATGTATTAACGGCTCATTGATGAATTCCGACATTGAAGCTTTGATTCCTAATGTTG ATCTTGCAGCTCGAAAGAGTTTTATGTGTTTGCTCCTTGGGGAGTTGTCCTCAATGTGCT CTAACCTTGGTGCTGTTGAGTCAGATGATACAATGCATCTTTCTCAGGATTTGGATGACA AACATTCAACTCCAGATGATGCAAGCAGTGGTGGTATTATAAACAACGAAGAAGTTGGTG CAGCTGGAATGGATGGGCCAAAATGTGGACTGTACAATTCTTCAACTCTGCTTGCTCACC GTGACTGTATTACGGGATTAGCCATTGGAGGAGGCTTTTTGTTTAGCTCTTCTTACGACA AGACAATCAATGTATGGTCACTGCAGGACTTCTCTCATAAACAAAGTTTGAAGGGCCATG AACACAAAATCACAGCAATTGTTGTTGTTGACAATGATAATCAGTCACTTTGTATAAGTG GAGACAGTGGTAGTGGAATATTTGTCTGGTGTGTTGATCCTTCACTCAGTAATGAACCAT TGAATAAGTGGTATGAAAGTAATGATTGGATTTATCGAGGTGTTCACTGTTTGGCTGTTT CTGGAACTGGTTATCTTTACACTGGTAGTAGGGACAAATCTATTAAGGCTTGGTCTCTAG AGGTCACAAATCAACTGTTTCTTGCCTTGCGGTTGCCTGTGGTATTCTTTACAGTGGAAG TTGGGATGGTTCTATTAGATCATGGTGGCTCACTGATCACAGCCCGCTGTCTGTACTGGA AGATGGTACACCAGGAAGCATTACTCCTGTGCTGTCAATTTCAACAGAACTCGATTTTGT TGTTGCATCACATGAAAATGGCTGTTTGAAGATCTGGAAGGATGATGTCCTAGTAAAGTC AGAGAAACTTCAAAACGGTGCTATATATGCTGCTAAATTGAATGACAAGTGGCTCTATGC TGGTGGATGGGATAAAGTTGTAAATATTCAGGAGTTATTGGAAGATGATTCAGAGGTGGA AATCAGAGATGTTGCTACCTTTACTTGTGATTCAATTATAACTTCAATACTGTACTGGGA TGGAAGGCTGATAGTTGGACTTTCTAACAGGGAGATTAAGGTTTTCTACAAGGCATCTTA ACTCTAAATCAGGATTATTAATCATTTGTCACTCCATCTTGTATATATTGTGAATAGCAC ACTGTATAGTCGAATTGATAACGAAAGACTGATAGGACCATGTAATTAGAATTTGAATGC TGCTTTTGGTGAATGATGATAAACCTGTATGGTAAAGTTTGAGTGCAACTGCACAATAGG GTAAGGTTTTTTGTAACAGTAGTATCATATAGAAACCATCGAAGTCGTAGCTCATATCAA TTTGTTTCTTCTACTAGAAAAATCATGGAATTTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)