These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6059#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 2530 fasta sequence [GCATGCTTCATTTTTCAGAGAGAAAGTACTGAAGAAGTCAAATTCAAGTGTGCTTTTCTGGTTATCTCAGCCAAGGTCCAACAACAATAGCCATGAGCAGTTCTCAAGTATTTTTCAGCTTGCTAACAGTGAGAACATCGAAGTCTTTTTTGATACTTTGTGGGAAATATCTGCTCATCCTGTGGATATCTGCACTGCTTTTGTGGATGAAGGAATGAATTGCTTTCCTTTAAACAGCATTAGTTTAACACGATCCTGGAAGGCTATGACAGAAGCTACATTAGTTGAGTCTGAAAATAATTTTGCTCAAAGAAGTGAAGAAAATCGTGACAATTTAAGTTCCAAGAACAACGAGAAAATACAGAGATCAATTGACAATACCCCTTATGGTGTGGAAGTCACTCTTGAACCTAAAAGGAAAGGTTTAATTGCAGATTTTGAAAGACCCAGAGTACTTGTAAGGAGAAATGGTGAACTTCTTGAGGCAATATGTCTCAACTCTATCAATGAGCAACAAGGTGCTATCGCCACCAATCGGAAGGGCCTTGTTTTCTTCAACTGGAATGACAAGCAAGATAACAAAAATTTAGCAGAGTATATATGGGCAGGATCTGATTGGCCCTTGGATGGGTGGGCTGGTTGCGAATCTACACCTACTTCAACTTCTTTTTCTCCTAGTGTTGGTCTTGGCAGAAGAAAAGGATCCCATCTTAGTTCAGGTGGACCAGCTATTAGTTTAGGTTCATTGGCAAAACCTGGAAGGGACTTAACTGGTGGTGGAGCATTTGGAATTCCAGGTTATGCTGGTATCGGCGCATCTGGATTTGGGTGGGGGGAACCTGACGAATTCGAAGATTTCGTTGATCTTCCAGCAACACTCGAGAACATCCATTCAAGAGCATTGTCTCGCCACCCATCTTTGCCATTGTTGCTAGTTGGGTCAAGCAATACTCATGTTTATTTATGGGAGTTTGGCAAAGACAGTGCCATGGCTACCTATGGTGTTCTCCCTGCTGCTAATATCCCACCACCTTATGCCCTTGCTTCCATATCAGCTGTTCAATTTGATTATTATGGGCAGCAGTTTGCTACTGCTGCATTAGATGGTACAGTTTGTACATGGCAAGTTGAGGTGGGTGGAAGAAGCAATGTGCATCCTACCGAGTCATCCCTGTGCTTTAACACCCACGCATCGGATGTCGCATTTCTAACTGCAAGTGGATCAGTTCTTGCTGCAGCTGGATGCAGTTCAAATGGTGCAAATGTTGTTATTTGGGATACATTGGCGCCACCATCCACTTGTCAAACTTCTATTATGTGTCATGAAGGAGGAGTTCGTTCTCTTTCTGTGTTCGATAGAAATATAGGCTGTGGATCTATCTCACCGCTGATTGTAACTGGTGGGAAAAGTGGAGATGTAACTTTGCATGATTTTCGGTTCATCTCTACTGGAAAGACTAAGCATCACAGAAGTTCCAACGAGCATGATGTTAAGGCATCTTCAACTTCAATGCATGACACTAAGTCTGGAACTTCCAACGGTGTTAGCAACAGTGGGATGATCTGGCATATACCAAAGGCGCATACAGGTAGTGTCAGCAGTGTATCAACCATCCCAAATACCAGTTTGTTCTTAACTGGAAGCAAAGATGGAGATGTGAAGCTTTGGGATGCCAAAAGTTCTCAGCTAGTCTTCCATTGGCAAAAGTTGCACGAGCGGCACACCTTTTTTCAACCAACTTCTAGGGGCTTTGGTGGTGTTGTTAGGGCTGCTGTAACAGACATCCAAGTCTTACCTAATGGTTTTGTCTCGTGCGGTGGGGATGGTTCTGTGAAACTTGTGCAGGTAAAAAATGATTTTGCAGATGTACGCCCACATTAGAACAAACAGAAGGGAGGAGATATGCTAGCGATGGTTTTGTTGTGGTGGGTTCAGATTGTTCCTTTGATCAATTGATCTTATTCTGCAATTTTGTTTTCCCATGAGATGTTTTGCTGTTGCAAGGGATGGCATAGCAAGAATGTAGCCATAAAGTAAGAGCTGGGCAGAATCTGAACAGTTTAATGGGATTTGTATACAAAGGTACTCCTGTTAGCTGTCTGGATGTGGGGCATGGAACTCGCGTCTTGTATGCGGTAGGTCATGTAGGTGTCGATTTTTGTTTGTCCATGCATGTCCA-TTATATATACA-AGGAAATGCAAAATTTTCCATAAATCTGGATAGCATTGTTTATTTGTTTACCA-GGATGACAAT-GATTAACATGCAAGGCTGTAAACTAGCAGGGGTGACATACTATACAATCATTTTCTCTTGTGGTCTT-TT-CACTTGTATGAAATTGCTAAACTCTTTTGCTGATTCATGCTATAGACATATAGGCGGTGGCAACTAGACGTCAGGCTGACTCTCTACATTTATGTGGATCATATTTTAAGAGAATGAATTTTATGTATAGTATCATATGATGTAACATCTTTTTTTTCTGAAGATTAATGTAACATGTAATTGGCTCGCTCAGTTATTATTTAGCTG] [+] EMBL AK105617 [GCATGCTTCATTTTTCAGAGAGAAAGTACTGAAGAAGTCAAATTCAAGTGTGCTTTTCTGGTTATCTCAGCCAAGGTCCAACAACAATAGCCATGAGCAGTTCTCAAGTATTTTTCAGCTTGCTAACAGTGAGAACATCGAAGTCTTTTTTGATACTTTGTGGGAAATATCTGCTCATCCTGTGGATATCTGCACTGCTTTTGTGGATGAAGGAATGAATTGCTTTCCTTTAAACAGCATTAGTTTAACACGATCCTGGAAGGCTATGACAGAAGCTACATTAGTTGAGTCTGAAAATAATTTTGCTCAAAGAAGTGAAGAAAATCGTGACAATTTAAGTTCCAAGAACAACGAGAAAATACAGAGATCAATTGACAATACCCCTTATGGTGTGGAAGTCACTCTTGAACCTAAAAGGAAAGGTTTAATTGCAGATTTTGAAAGACCCAGAGTACTTGTAAGGAGAAATGGTGAACTTCTTGAGGCAATATGTCTCAACTCTATCAATGAGCAACAAGGTGCTATCGCCACCAATCGGAAGGGCCTTGTTTTCTTCAACTGGAATGACAAGCAAGATAACAAAAATTTAGCAGAGTATATATGGGCAGGATCTGATTGGCCCTTGGATGGGTGGGCTGGTTGCGAATCTACACCTACTTCAACTTCTTTTTCTCCTAGTGTTGGTCTTGGCAGAAGAAAAGGATCCCATCTTAGTTCAGGTGGACCAGCTATTAGTTTAGGTTCATTGGCAAAACCTGGAAGGGACTTAACTGGTGGTGGAGCATTTGGAATTCCAGGTTATGCTGGTATCGGCGCATCTGGATTTGGGTGGGGGGAACCTGACGAATTCGAAGATTTCGTTGATCTTCCAGCAACACTCGAGAACATCCATTCAAGAGCATTGTCTCGCCACCCATCTTTGCCATTGTTGCTAGTTGGGTCAAGCAATACTCATGTTTATTTATGGGAGTTTGGCAAAGACAGTGCCATGGCTACCTATGGTGTTCTCCCTGCTGCTAATATCCCACCACCTTATGCCCTTGCTTCCATATCAGCTGTTCAATTTGATTATTATGGGCAGCAGTTTGCTACTGCTGCATTAGATGGTACAGTTTGTACATGGCAAGTTGAGGTGGGTGGAAGAAGCAATGTGCATCCTACCGAGTCATCCCTGTGCTTTAACACCCACGCATCGGATGTCGCATTTCTAACTGCAAGTGGATCAGTTCTTGCTGCAGCTGGATGCAGTTCAAATGGTGCAAATGTTGTTATTTGGGATACATTGGCGCCACCATCCACTTGTCAAACTTCTATTATGTGTCATGAAGGAGGAGTTCGTTCTCTTTCTGTGTTCGATAGAAATATAGGCTGTGGATCTATCTCACCGCTGATTGTAACTGGTGGGAAAAGTGGAGATGTAACTTTGCATGATTTTCGGTTCATCTCTACTGGAAAGACTAAGCATCACAGAAGTTCCAACGAGCATGATGTTAAGGCATCTTCAACTTCAATGCATGACACTAAGTCTGGAACTTCCAACGGTGTTAGCAACAGTGGGATGATCTGGCATATACCAAAGGCGCATACAGGTAGTGTCAGCAGTGTATCAACCATCCCAAATACCAGTTTGTTCTTAACTGGAAGCAAAGATGGAGATGTGAAGCTTTGGGATGCCAAAAGTTCTCAGCTAGTCTTCCATTGGCAAAAGTTGCACGAGCGGCACACCTTTTTTCAACCAACTTCTAGGGGCTTTGGTGGTGTTGTTAGGGCTGCTGTAACAGACATCCAAGTCTTACCTAATGGTTTTGTCTCGTGCGGTGGGGATGGTTCTGTGAAACTTGTGCAGGTAAAAAATGATTTTGCAGATGTACGCCCACATTAGAACAAACAGAAGGGAGGAGATATGCTAGCGATGGTTTTGTTGTGGTGGGTTCAGATTGTTCCTTTGATCAATTGATCTTATTCTGCAATTTTGTTTTCCCATGAGATGTTTTGCTGTTGCAAGGGATGGCATAGCAAGAATGTAGCCATAAAGTAAGAGCTGGGCAGAATCTGAACAGTTTAATGGGATTTGTATACAAAGGTACTCCTGTTAGCTGTCTGGATGTGGGGCATGGAACTCGCGTCTTGTATGCGGTAGGTCATGTAGGTGTCGATTTTTGTTTGTCCATGCATGTCCA TTATATATACA AGGAATTGCAA ] [+] EMBL AK111932 [ CTTCTTGAGGCAATATGTCTCAACTCTATCAATGAGCAACAAGGTGCTATCGCCACCAATCGGAAGGGCCTTGTTTTCTTCAACTGGAATGACAAGCAAGATAACAAAAATTTAGCAGAGTATATATGGGCAGGATCTGATTGGCCCTTGGATGGGTGGGCTGGTTGCGAATCTACACCTACTTCAACTTCTTTTTCTCCTAGTGTTGGTCTTGGCAGAAGAAAAGGATCCCATCTTAGTTCAGGTGGACCAACTATTAGTTTAGGTTCATTGGCAAAACCTGGAAGGGACTTAACTGGTGGTGGAGCATTTGGAATTCCAGGTTATGCTGGTATCGGCGCATCTGGATTTGGGTGGGGGGAACCTGACGAATTCGAAGATTTCGTTGATCCTCCAGCAACACTCGAGAACATCCATTCAAGAGCATTGTCTCGCCACCCATCTTTGCCATTGTTGCTAGTTGGGTCAAGCAATACTCATGTTTATTTATGGGAGTTTGGCAAAGACAGTGCCATGGCTACCTATGGTGTTCTCCCTGCTGCTAATATCCCACCACCTTATGCCCTTGCTTCCATATCAGCTGTTCAATTTGATTATTATGGGCAGCGGTTTGCTACTGCTGCATTAGATGGTACAGTTTGTACATGGCAAGTTGAGGTGGGTGGAAGAAGCAATGTGCATCCTACCGAGTCATCCCTGTGCTTTAACACCCACGCATCGGATGTCGCATTTCTGACTGCAAGTGGATCAGTTCTTGCTGCAGCTGGATGCAGTTCAAATGGTGCAAATGTTGTTATTTGGGATACATTGGCGCCACCATCCACTTGTCAAACTTCTATTATGTGTCATGAAGGAGGAGTTCGTTCTCTTTCTGTGTTCGATAGAAATATAGGCTGTGGATCTATCTCACCGCTGATTGTAACTGGTGGGAAAAGTGGAGATGTAACTTTGCATGATTTTCGGTTCATCTCTACTGGAAAGACTAAGCATCACAGAAGTTCCAACGAGCATGATGTTAAGGCATCTTCAACTTCAATGCATGACACTAAGTCTGGAACTTCCAACGGTGTTAGCAACAGTGGGATGATCTGGCATATACCAAAGGCGCATACAGGTAGTGTCAGCAGTGTATCAACCATCCCAAATACCAGTTTGTTCTTAACTGGAAGCAAAGATGGAGATGTGAAGCTTTGGGATGCCAAAAGTTCTCAGCTAGTCTTCCATTGGCAAAAGTTGCACGAGCGGCACACCTTTTTTCAACCAACTTCTAGGGGCTTTGGTGGTGTTGTTAGGGCTGCTGTAACAGACATCCAAGTCTTACCTAATGGTTTTGTCTCGTGCGGTGGGGATGGTTCTGTGAAACTTGTGCAGGTAAAAAATGATTTTGCAGATGTACGCCCACATTAGAACAAACAGAAGGGAGGAGATATGCTAGCGATGGTTTTGTTGTGGTGGGTTCAGATTGTTCCTTTGATCAATTGATCTTATTCTGCAATTTTGTTTTCCCATGAGATGTTTTGCTGTTGCAAGGGAAGGCATAGCAAGAATGTAGCCATAAAGTAAGAGCTGGGCAGAATCTGAACAGTTTAATGGGATTTGTATACAAAGGTACTCCTGTTAGCTGTCTGGATGTGGGGCATGGAACTCGCGTCTTGTATGCGGTAGGTCATGTAGGTGTCGATTTTTGTTTGTCCATGCATGTCCA TTATATATACA AGGAAATGCAAAATTTTCCATAAATCTGGATAGCATTGTTTATTTGTTTACCA GGATGACAAT GATTAACATGCAAGGCTGTAAACTAGCAGGGGTGACATACTATACAATCATTTTCTCTTGTGGTCTT TT CACTTGTATGAAATTGCTAAACTCTTTTGCTGATTCATGCTATAGACATATAGGCGGTGGCAACTAGACGTCAGGCTGACTCTCTACATTTATGTGGATCATATTTTAAGAGAATGAATTTTATGTATAGTATCATATGATGTAACATCTTTTTTTTCTGAAGATTAATGTAACATGTAATTGGCTCGCTCAGTTATTATTTAGCTG] [+] EMBL BM418855 [ taCTGTCTGGAT TGGGGCATGGAACTCGCGTCTTGTAT CGGTA GTCATGTAGGTGTTGATTTTTGTTTGTCCATGCATGTCCACTTATATATACACAGGAAAT CCAAATTTGCCATAAATCTGGATA CCTTGTTTATTTGTTTACCACGGATGACNATGGATTAACATGCAAGGCTGTAAACTAGTAGGGGTGACATACTATACNATCATTTTCTCTTGTGGTCTTGTTGCACTTGTATGAAATTGCTAAACTCTTTTGCTGATTCATGCTATAGACATATAGGCGGTGGCAACTAGACATCAGGCTGACTCTCTACATTTATGTGGATCATATTTTAAGAGAATGAATTTTATGTATAGTATCATATGATGTAACATCTTTTTTTTCTGAAGATTAATGTAACATGTAATTGGCTCGCTCAaaaaaa ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||