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Oryza sativa
cluster # 6059 cluster # 6059       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6059#0 length = 2530 sequences # 3  

consensusID : consensus_6059#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 2530
fasta sequence
                              [GCATGCTTCATTTTTCAGAGAGAAAGTACTGAAGAAGTCAAATTCAAGTGTGCTTTTCTGGTTATCTCAGCCAAGGTCCAACAACAATAGCCATGAGCAGTTCTCAAGTATTTTTCAGCTTGCTAACAGTGAGAACATCGAAGTCTTTTTTGATACTTTGTGGGAAATATCTGCTCATCCTGTGGATATCTGCACTGCTTTTGTGGATGAAGGAATGAATTGCTTTCCTTTAAACAGCATTAGTTTAACACGATCCTGGAAGGCTATGACAGAAGCTACATTAGTTGAGTCTGAAAATAATTTTGCTCAAAGAAGTGAAGAAAATCGTGACAATTTAAGTTCCAAGAACAACGAGAAAATACAGAGATCAATTGACAATACCCCTTATGGTGTGGAAGTCACTCTTGAACCTAAAAGGAAAGGTTTAATTGCAGATTTTGAAAGACCCAGAGTACTTGTAAGGAGAAATGGTGAACTTCTTGAGGCAATATGTCTCAACTCTATCAATGAGCAACAAGGTGCTATCGCCACCAATCGGAAGGGCCTTGTTTTCTTCAACTGGAATGACAAGCAAGATAACAAAAATTTAGCAGAGTATATATGGGCAGGATCTGATTGGCCCTTGGATGGGTGGGCTGGTTGCGAATCTACACCTACTTCAACTTCTTTTTCTCCTAGTGTTGGTCTTGGCAGAAGAAAAGGATCCCATCTTAGTTCAGGTGGACCAGCTATTAGTTTAGGTTCATTGGCAAAACCTGGAAGGGACTTAACTGGTGGTGGAGCATTTGGAATTCCAGGTTATGCTGGTATCGGCGCATCTGGATTTGGGTGGGGGGAACCTGACGAATTCGAAGATTTCGTTGATCTTCCAGCAACACTCGAGAACATCCATTCAAGAGCATTGTCTCGCCACCCATCTTTGCCATTGTTGCTAGTTGGGTCAAGCAATACTCATGTTTATTTATGGGAGTTTGGCAAAGACAGTGCCATGGCTACCTATGGTGTTCTCCCTGCTGCTAATATCCCACCACCTTATGCCCTTGCTTCCATATCAGCTGTTCAATTTGATTATTATGGGCAGCAGTTTGCTACTGCTGCATTAGATGGTACAGTTTGTACATGGCAAGTTGAGGTGGGTGGAAGAAGCAATGTGCATCCTACCGAGTCATCCCTGTGCTTTAACACCCACGCATCGGATGTCGCATTTCTAACTGCAAGTGGATCAGTTCTTGCTGCAGCTGGATGCAGTTCAAATGGTGCAAATGTTGTTATTTGGGATACATTGGCGCCACCATCCACTTGTCAAACTTCTATTATGTGTCATGAAGGAGGAGTTCGTTCTCTTTCTGTGTTCGATAGAAATATAGGCTGTGGATCTATCTCACCGCTGATTGTAACTGGTGGGAAAAGTGGAGATGTAACTTTGCATGATTTTCGGTTCATCTCTACTGGAAAGACTAAGCATCACAGAAGTTCCAACGAGCATGATGTTAAGGCATCTTCAACTTCAATGCATGACACTAAGTCTGGAACTTCCAACGGTGTTAGCAACAGTGGGATGATCTGGCATATACCAAAGGCGCATACAGGTAGTGTCAGCAGTGTATCAACCATCCCAAATACCAGTTTGTTCTTAACTGGAAGCAAAGATGGAGATGTGAAGCTTTGGGATGCCAAAAGTTCTCAGCTAGTCTTCCATTGGCAAAAGTTGCACGAGCGGCACACCTTTTTTCAACCAACTTCTAGGGGCTTTGGTGGTGTTGTTAGGGCTGCTGTAACAGACATCCAAGTCTTACCTAATGGTTTTGTCTCGTGCGGTGGGGATGGTTCTGTGAAACTTGTGCAGGTAAAAAATGATTTTGCAGATGTACGCCCACATTAGAACAAACAGAAGGGAGGAGATATGCTAGCGATGGTTTTGTTGTGGTGGGTTCAGATTGTTCCTTTGATCAATTGATCTTATTCTGCAATTTTGTTTTCCCATGAGATGTTTTGCTGTTGCAAGGGATGGCATAGCAAGAATGTAGCCATAAAGTAAGAGCTGGGCAGAATCTGAACAGTTTAATGGGATTTGTATACAAAGGTACTCCTGTTAGCTGTCTGGATGTGGGGCATGGAACTCGCGTCTTGTATGCGGTAGGTCATGTAGGTGTCGATTTTTGTTTGTCCATGCATGTCCA-TTATATATACA-AGGAAATGCAAAATTTTCCATAAATCTGGATAGCATTGTTTATTTGTTTACCA-GGATGACAAT-GATTAACATGCAAGGCTGTAAACTAGCAGGGGTGACATACTATACAATCATTTTCTCTTGTGGTCTT-TT-CACTTGTATGAAATTGCTAAACTCTTTTGCTGATTCATGCTATAGACATATAGGCGGTGGCAACTAGACGTCAGGCTGACTCTCTACATTTATGTGGATCATATTTTAAGAGAATGAATTTTATGTATAGTATCATATGATGTAACATCTTTTTTTTCTGAAGATTAATGTAACATGTAATTGGCTCGCTCAGTTATTATTTAGCTG]

[+] EMBL AK105617             [GCATGCTTCATTTTTCAGAGAGAAAGTACTGAAGAAGTCAAATTCAAGTGTGCTTTTCTGGTTATCTCAGCCAAGGTCCAACAACAATAGCCATGAGCAGTTCTCAAGTATTTTTCAGCTTGCTAACAGTGAGAACATCGAAGTCTTTTTTGATACTTTGTGGGAAATATCTGCTCATCCTGTGGATATCTGCACTGCTTTTGTGGATGAAGGAATGAATTGCTTTCCTTTAAACAGCATTAGTTTAACACGATCCTGGAAGGCTATGACAGAAGCTACATTAGTTGAGTCTGAAAATAATTTTGCTCAAAGAAGTGAAGAAAATCGTGACAATTTAAGTTCCAAGAACAACGAGAAAATACAGAGATCAATTGACAATACCCCTTATGGTGTGGAAGTCACTCTTGAACCTAAAAGGAAAGGTTTAATTGCAGATTTTGAAAGACCCAGAGTACTTGTAAGGAGAAATGGTGAACTTCTTGAGGCAATATGTCTCAACTCTATCAATGAGCAACAAGGTGCTATCGCCACCAATCGGAAGGGCCTTGTTTTCTTCAACTGGAATGACAAGCAAGATAACAAAAATTTAGCAGAGTATATATGGGCAGGATCTGATTGGCCCTTGGATGGGTGGGCTGGTTGCGAATCTACACCTACTTCAACTTCTTTTTCTCCTAGTGTTGGTCTTGGCAGAAGAAAAGGATCCCATCTTAGTTCAGGTGGACCAGCTATTAGTTTAGGTTCATTGGCAAAACCTGGAAGGGACTTAACTGGTGGTGGAGCATTTGGAATTCCAGGTTATGCTGGTATCGGCGCATCTGGATTTGGGTGGGGGGAACCTGACGAATTCGAAGATTTCGTTGATCTTCCAGCAACACTCGAGAACATCCATTCAAGAGCATTGTCTCGCCACCCATCTTTGCCATTGTTGCTAGTTGGGTCAAGCAATACTCATGTTTATTTATGGGAGTTTGGCAAAGACAGTGCCATGGCTACCTATGGTGTTCTCCCTGCTGCTAATATCCCACCACCTTATGCCCTTGCTTCCATATCAGCTGTTCAATTTGATTATTATGGGCAGCAGTTTGCTACTGCTGCATTAGATGGTACAGTTTGTACATGGCAAGTTGAGGTGGGTGGAAGAAGCAATGTGCATCCTACCGAGTCATCCCTGTGCTTTAACACCCACGCATCGGATGTCGCATTTCTAACTGCAAGTGGATCAGTTCTTGCTGCAGCTGGATGCAGTTCAAATGGTGCAAATGTTGTTATTTGGGATACATTGGCGCCACCATCCACTTGTCAAACTTCTATTATGTGTCATGAAGGAGGAGTTCGTTCTCTTTCTGTGTTCGATAGAAATATAGGCTGTGGATCTATCTCACCGCTGATTGTAACTGGTGGGAAAAGTGGAGATGTAACTTTGCATGATTTTCGGTTCATCTCTACTGGAAAGACTAAGCATCACAGAAGTTCCAACGAGCATGATGTTAAGGCATCTTCAACTTCAATGCATGACACTAAGTCTGGAACTTCCAACGGTGTTAGCAACAGTGGGATGATCTGGCATATACCAAAGGCGCATACAGGTAGTGTCAGCAGTGTATCAACCATCCCAAATACCAGTTTGTTCTTAACTGGAAGCAAAGATGGAGATGTGAAGCTTTGGGATGCCAAAAGTTCTCAGCTAGTCTTCCATTGGCAAAAGTTGCACGAGCGGCACACCTTTTTTCAACCAACTTCTAGGGGCTTTGGTGGTGTTGTTAGGGCTGCTGTAACAGACATCCAAGTCTTACCTAATGGTTTTGTCTCGTGCGGTGGGGATGGTTCTGTGAAACTTGTGCAGGTAAAAAATGATTTTGCAGATGTACGCCCACATTAGAACAAACAGAAGGGAGGAGATATGCTAGCGATGGTTTTGTTGTGGTGGGTTCAGATTGTTCCTTTGATCAATTGATCTTATTCTGCAATTTTGTTTTCCCATGAGATGTTTTGCTGTTGCAAGGGATGGCATAGCAAGAATGTAGCCATAAAGTAAGAGCTGGGCAGAATCTGAACAGTTTAATGGGATTTGTATACAAAGGTACTCCTGTTAGCTGTCTGGATGTGGGGCATGGAACTCGCGTCTTGTATGCGGTAGGTCATGTAGGTGTCGATTTTTGTTTGTCCATGCATGTCCA TTATATATACA AGGAATTGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
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>consensus_6059#0 GCATGCTTCATTTTTCAGAGAGAAAGTACTGAAGAAGTCAAATTCAAGTGTGCTTTTCTG GTTATCTCAGCCAAGGTCCAACAACAATAGCCATGAGCAGTTCTCAAGTATTTTTCAGCT TGCTAACAGTGAGAACATCGAAGTCTTTTTTGATACTTTGTGGGAAATATCTGCTCATCC TGTGGATATCTGCACTGCTTTTGTGGATGAAGGAATGAATTGCTTTCCTTTAAACAGCAT TAGTTTAACACGATCCTGGAAGGCTATGACAGAAGCTACATTAGTTGAGTCTGAAAATAA TTTTGCTCAAAGAAGTGAAGAAAATCGTGACAATTTAAGTTCCAAGAACAACGAGAAAAT ACAGAGATCAATTGACAATACCCCTTATGGTGTGGAAGTCACTCTTGAACCTAAAAGGAA AGGTTTAATTGCAGATTTTGAAAGACCCAGAGTACTTGTAAGGAGAAATGGTGAACTTCT TGAGGCAATATGTCTCAACTCTATCAATGAGCAACAAGGTGCTATCGCCACCAATCGGAA GGGCCTTGTTTTCTTCAACTGGAATGACAAGCAAGATAACAAAAATTTAGCAGAGTATAT ATGGGCAGGATCTGATTGGCCCTTGGATGGGTGGGCTGGTTGCGAATCTACACCTACTTC AACTTCTTTTTCTCCTAGTGTTGGTCTTGGCAGAAGAAAAGGATCCCATCTTAGTTCAGG TGGACCAGCTATTAGTTTAGGTTCATTGGCAAAACCTGGAAGGGACTTAACTGGTGGTGG AGCATTTGGAATTCCAGGTTATGCTGGTATCGGCGCATCTGGATTTGGGTGGGGGGAACC TGACGAATTCGAAGATTTCGTTGATCTTCCAGCAACACTCGAGAACATCCATTCAAGAGC ATTGTCTCGCCACCCATCTTTGCCATTGTTGCTAGTTGGGTCAAGCAATACTCATGTTTA TTTATGGGAGTTTGGCAAAGACAGTGCCATGGCTACCTATGGTGTTCTCCCTGCTGCTAA TATCCCACCACCTTATGCCCTTGCTTCCATATCAGCTGTTCAATTTGATTATTATGGGCA GCAGTTTGCTACTGCTGCATTAGATGGTACAGTTTGTACATGGCAAGTTGAGGTGGGTGG AAGAAGCAATGTGCATCCTACCGAGTCATCCCTGTGCTTTAACACCCACGCATCGGATGT CGCATTTCTAACTGCAAGTGGATCAGTTCTTGCTGCAGCTGGATGCAGTTCAAATGGTGC AAATGTTGTTATTTGGGATACATTGGCGCCACCATCCACTTGTCAAACTTCTATTATGTG TCATGAAGGAGGAGTTCGTTCTCTTTCTGTGTTCGATAGAAATATAGGCTGTGGATCTAT CTCACCGCTGATTGTAACTGGTGGGAAAAGTGGAGATGTAACTTTGCATGATTTTCGGTT CATCTCTACTGGAAAGACTAAGCATCACAGAAGTTCCAACGAGCATGATGTTAAGGCATC TTCAACTTCAATGCATGACACTAAGTCTGGAACTTCCAACGGTGTTAGCAACAGTGGGAT GATCTGGCATATACCAAAGGCGCATACAGGTAGTGTCAGCAGTGTATCAACCATCCCAAA TACCAGTTTGTTCTTAACTGGAAGCAAAGATGGAGATGTGAAGCTTTGGGATGCCAAAAG TTCTCAGCTAGTCTTCCATTGGCAAAAGTTGCACGAGCGGCACACCTTTTTTCAACCAAC TTCTAGGGGCTTTGGTGGTGTTGTTAGGGCTGCTGTAACAGACATCCAAGTCTTACCTAA TGGTTTTGTCTCGTGCGGTGGGGATGGTTCTGTGAAACTTGTGCAGGTAAAAAATGATTT TGCAGATGTACGCCCACATTAGAACAAACAGAAGGGAGGAGATATGCTAGCGATGGTTTT GTTGTGGTGGGTTCAGATTGTTCCTTTGATCAATTGATCTTATTCTGCAATTTTGTTTTC CCATGAGATGTTTTGCTGTTGCAAGGGATGGCATAGCAAGAATGTAGCCATAAAGTAAGA GCTGGGCAGAATCTGAACAGTTTAATGGGATTTGTATACAAAGGTACTCCTGTTAGCTGT CTGGATGTGGGGCATGGAACTCGCGTCTTGTATGCGGTAGGTCATGTAGGTGTCGATTTT TGTTTGTCCATGCATGTCCATTATATATACAAGGAAATGCAAAATTTTCCATAAATCTGG ATAGCATTGTTTATTTGTTTACCAGGATGACAATGATTAACATGCAAGGCTGTAAACTAG CAGGGGTGACATACTATACAATCATTTTCTCTTGTGGTCTTTTCACTTGTATGAAATTGC TAAACTCTTTTGCTGATTCATGCTATAGACATATAGGCGGTGGCAACTAGACGTCAGGCT GACTCTCTACATTTATGTGGATCATATTTTAAGAGAATGAATTTTATGTATAGTATCATA TGATGTAACATCTTTTTTTTCTGAAGATTAATGTAACATGTAATTGGCTCGCTCAGTTAT TATTTAGCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)