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Oryza sativa
cluster # 6164 cluster # 6164       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6164#0 length = 3597 sequences # 4  

consensusID : consensus_6164#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 3597
fasta sequence
                              [TCTCCGTTAATTAATAAATTTCCCCCCTCCTCTTCCTTCCTTCCTCCACCGGCTACGCGCTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTTTGCTTCGACCAAGCTAGGGTTTCGCCGCCGAATCGAGCTCGGTGGCGCGGGGATTTTGCGGTGGGGCGGAGCGCCCGCGGCGGTGGGGAGGCTTCGGGTGGCCTCGGCCTCCGTCCGGCTCGATCCGATCGGCACACAGCCATAAGTTGGTGTTCCATGAGCTTATAAGAGTGATGCCATTATTGGCATGTTTCTATAGCATCTAGCATCTCCCAATGTTATGCATGTACTGGGCTCCCTTAAAAGATGGAAATTCAGAAGTCTGATCATCATGAGCAGAATCTTACTTCACCAAGAGGGCTAATCCATAAAGTGCTGCGTCGCACAAGTAGCAGGCGTTCTCCAACTGCAGCAGACCATAACCCTTCTCCTGTATTCCTGGAGACAAGCAATTCAAAATTCTTAAAGCAAAAGGATATTGATGATGCCATCAAGGATCCAGAGAAGGCAGGCACACACGACAACAGAATTGAAGATGAGAAGTCTGATTTGTTAGGGTATGAAATTTGTTCTGGGAAGCTTACATTGGATAACAAAGCCAAAAGTGCATCAGGTGAACAGTCTGGATCAGGGTCCAGTAGCAATTGCTTTGATGCTAGACTCACTACTGAAGCCTTGGTATGGGGTTCTAATATCCTTAAGCTCGAGGACATTGTATCTGTATCATATCATTCCGGGCTCCGTCACTTCACTGTGCATGCATGCCCTCTTGAAAAAAGATCCAGTGGACTTTCCTGCTTTATGAAGCCTAGAAAAATTCAAAAGGACTTACGTTTCCTATCCACTTCTCCACACGAGGCTTTTCGGTGGGTTAATGGTTTTGCAGATCAACAATGCTATGTAAATCTATTACCTCACCCCATGGCATCTAGCAAGAAGCATTCATCTGAACTCATTCCATTTGATAATATGTTTGATCCATGTGTTAAATGCCGGTCTCCCCCAAAGATACTTGTCATCTTGAATCCTCGATCTGGACATGGTAGATCTAGCAAAGTTTTCCACGGAAAAGTGGAACCTATATTCAAGCTTGCAGGTTTCAAGATGGAAGTGGTCAAAACTACACATGCTGGTCATGCAAAATCTCTTGTATCAACAATAGATTTCAGTACCTGTCCAGATGGAATTGTATGTGTGGGTGGCGATGGGATTGTTAATGAGGTTCTCAATGGTCTCCTTTGTAGAGATGATCAAAATGTGGCTGTATCTGTTCCAATTGGTATAATACCAGCAGGGTCCGATAACTCACTTGTTTGGACAGTATTGGGTGTTAAAGATCCGATTTCTGCAGC-ATGTCAATTGTCAGGGGAGGTTTTACACCCATTGATGTTTTTGCCGTTGAATGGATTCAAAGTGGGACTATCCATTTTGGCACAACAGTCTCATATTTTGGTTTTGTTAGTGATGTTCTTGAACTCTCAGAGAGATACCAGAAGCGTTTTGGTCCTCTCCGTTACTTTGTAGCCGGTTTTCTGAAATTCTTGTGCTTGCCAAAGTATAACTTTGAATTGGAGTATCTTCCAATATCAGATGGTGGTGGTGGTGAGCATAAAATTGTGGAAGGGCAAGATAAAGTTGATGCATCAGACCTCTATGATGATGTAGTTCGGAGGTCGCGAGTAGAATGTCTACCTCGTGCCTCAAGTTTATCTAGCATTGATTCAATCATGTCTACAGGAATAATGTCAGGTGGAGATCTAGAGGTTTCGAGTCCACATGCTAATAATGAACCCTCTGAACTTGTTCGTGCACTTGACCCAAAATCAAAGCGCCTATCATTAGGGAGAACAAGTACTTTCAAAGAACCAGAAGAAGTGATCCATCCTCAGGCTCATGTTTCATCGACTCCCAACTGGCGTAGATCCAAATCGAAATCAAGGACAGAAAAGGCATGGCCAGGCTCGGGTGCTACAAATGATGCAAATTCCTCTCGTGGTACCACAACACATGACAAAGAAGACGCCTCCTCCACAATTTCAGATCCTGGGCCTGTGTGGGATTCAGGACCCAAGTGGGATGATGAGCCTAAATGGGATAATCAACCTAACTGGGAACCAGAGACTCCCATTGACTTACCTGGTCCATTGGATGATATTGAACTTGGTCTGACTAAGGAACTAGTCCCAAGCTTAGATGAAAGATGGACAGTTAGGAAGGGGCGGTATCTTGGTGTACTGGTATGCAACCATTCATGCAAGACTGTGCAGAGTTTAAGCTCTCAGGTTATTGCTCCTAAGGCTGAATACGATGACAATTGCCTGGACCTACTGTTGGTTGGTGGAAGTGGGAGGCTGAGGTTACTGAAATTTTTGGTGCTTTTGCAGTTTGGAAAGCATATTTCTCTTCCCAATGTGGAATATCTGAAGGTTAAGTCTGTGAGGCTCAAGGCTGGGCCCAACACACATGATGGATGTGGTATTGATGGTGAACTATTGCATGTCAAGGGGCAAGTTCGATGCAGTTTGCTGCCTCAGCAATGTCGATTAATCGGCAGGCCAGCCAAAAATCCTGTACAGTAGCTGTAAATACATGACTCCAAAGTCTGCACAGTTCTCAAGTTTGCCCGATATCCTGTTCATGTACAATCGGCAAAGGTGTGGATTATTTTTGTCCACGCCCACAGATTCATAGCTACAGTCAAGAGGTCAGAACAGCTTTGCTGGCACCTTGCTTCAGAGGTGTACATCGTGTGCTTGATCATAGCTAAAGTCAGAAGTCAGAACAGCCTTGCTGACACCCAACTTCAGAGGTGTGCATCGTGTGCTTGACGAGCAAAAGTGCCTGGTGAGGTGATGTCTATCCAAATGTAAAAGCCTATCCGGAGTCTGGACTGCAGCTTGTTGTGTAGTACATCTCGTGGTTTCTCCTTTTTACCTTGCTGATATCTAATACAACTACTATAGAGTAATCTCGAATCGGTGTACTTGCATTCGAAACAACACAGTGGCTGCCACCCCCAGTGTGCGCGGTTGTTTGGAGGTCCCTGTTTGTGTGGTTGTTTTGAGGTCCCTGATGCCGGCCACTTGATGTTCATCGCCCCCATTAAAGGGACAGCACCCCGAATGTGATGTCCTTGATCAGCTTGAGCCTTGTAGTGTTTACAAAGTGTGAATAAGACTTGTGTCCTGCGGTGTTTGTGTTCTCAGTACAGTATAGGATTTTTCAACAGGAAAAAAAAGATGGACAATCTGTAGTGCAGAACTGCTCATGTACCTTTCTATCCCCTCCCTTGTAACTTGTTCTTCGTGAATTGTGGTGATGTATGAGTTGTATTTGTACGTGTTGTCTGCCACATGAGCTAGATGATGATGATCATCTTGTGAAGATAGAGTTACTGATGTGTATTGTTGTCGTTTGGAGGATAAGCAATTTGGTGGTTGGGTGGGCTTTCTTTACTTGCCTGTTATATTCTCACAGGAATGCGCACATCTTGTAGTAGTACTACTCTCCGTTTCACAATATAAGTTATTCTAATATTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANANAAA]

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[+] EMBL CF330043             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CATGCAAGACTGTGCAGAGTTTAAGCTCTCAGGTTATTGCTCCTAAGGCTGAATACGATGACAATTGCCTGGACCTACTGTTGGTTGGTGGAAGTGGGAGGCTGAGGTTACTGAAATTTTTGGTGCTTTTGCAGTTTGGAAAGCATATTTCTCTTCCCAATGTGGAATATCTGAAGGTTAAGTCTGTGAGGCTCAAGGCTGGGCCCAACACACATGATGGATGTGGTATTGATGGTGAACTATTGCATGTCAAGGGGCAAGTTCGATGCAGTTTGCTGCCTCAGCAATGTCGATTAATCGGCAGGCCAGCCAAAAATCCTGTACAGTAGCTGTAAATACATGACTCCAAAGTCTGCACAGTTCTCAAGTTTGCCCGATATCCTGTTCATGTACAATCGGCAAAGGTGTGGATTATTTTTGTCCACGCCCACAGATTCATAGCTACAGTCAAGAGGTCAGAACAGCTTTGCTGGCACCTTGCTTCAGAGGTGTACATCGTGTGCTTGATCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AU090487             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGCAGAACTGCTCATGTACCTTTCTATCCCCTCCCTTGTAACTTGTTCTTCGTGAATTGT GTGATGTATGAGTTGTATTTGTACGTGTTGTCTGCCACATGAGCTAGATGATGATGATCATCTTGTGAAGATAGAGTTACTGATGTGTATTGTTGTCGTTTGGAGGATAAGCAATTTGGTGGTTGGGTGGGCTTTCTTTACTTGCCTGTTATATTCTCACAGGAATGCGCACATCTTGTAGTAGTACTACTCTCCGTTTCACAATATAAGTTATTCTAATATTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANANAAA]


>consensus_6164#0 TCTCCGTTAATTAATAAATTTCCCCCCTCCTCTTCCTTCCTTCCTCCACCGGCTACGCGC TCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTTTGCTTCGACCAAGCTAGGGTTTCGCCGCCGAATC GAGCTCGGTGGCGCGGGGATTTTGCGGTGGGGCGGAGCGCCCGCGGCGGTGGGGAGGCTT CGGGTGGCCTCGGCCTCCGTCCGGCTCGATCCGATCGGCACACAGCCATAAGTTGGTGTT CCATGAGCTTATAAGAGTGATGCCATTATTGGCATGTTTCTATAGCATCTAGCATCTCCC AATGTTATGCATGTACTGGGCTCCCTTAAAAGATGGAAATTCAGAAGTCTGATCATCATG AGCAGAATCTTACTTCACCAAGAGGGCTAATCCATAAAGTGCTGCGTCGCACAAGTAGCA GGCGTTCTCCAACTGCAGCAGACCATAACCCTTCTCCTGTATTCCTGGAGACAAGCAATT CAAAATTCTTAAAGCAAAAGGATATTGATGATGCCATCAAGGATCCAGAGAAGGCAGGCA CACACGACAACAGAATTGAAGATGAGAAGTCTGATTTGTTAGGGTATGAAATTTGTTCTG GGAAGCTTACATTGGATAACAAAGCCAAAAGTGCATCAGGTGAACAGTCTGGATCAGGGT CCAGTAGCAATTGCTTTGATGCTAGACTCACTACTGAAGCCTTGGTATGGGGTTCTAATA TCCTTAAGCTCGAGGACATTGTATCTGTATCATATCATTCCGGGCTCCGTCACTTCACTG TGCATGCATGCCCTCTTGAAAAAAGATCCAGTGGACTTTCCTGCTTTATGAAGCCTAGAA AAATTCAAAAGGACTTACGTTTCCTATCCACTTCTCCACACGAGGCTTTTCGGTGGGTTA ATGGTTTTGCAGATCAACAATGCTATGTAAATCTATTACCTCACCCCATGGCATCTAGCA AGAAGCATTCATCTGAACTCATTCCATTTGATAATATGTTTGATCCATGTGTTAAATGCC GGTCTCCCCCAAAGATACTTGTCATCTTGAATCCTCGATCTGGACATGGTAGATCTAGCA AAGTTTTCCACGGAAAAGTGGAACCTATATTCAAGCTTGCAGGTTTCAAGATGGAAGTGG TCAAAACTACACATGCTGGTCATGCAAAATCTCTTGTATCAACAATAGATTTCAGTACCT GTCCAGATGGAATTGTATGTGTGGGTGGCGATGGGATTGTTAATGAGGTTCTCAATGGTC TCCTTTGTAGAGATGATCAAAATGTGGCTGTATCTGTTCCAATTGGTATAATACCAGCAG GGTCCGATAACTCACTTGTTTGGACAGTATTGGGTGTTAAAGATCCGATTTCTGCAGCAT GTCAATTGTCAGGGGAGGTTTTACACCCATTGATGTTTTTGCCGTTGAATGGATTCAAAG TGGGACTATCCATTTTGGCACAACAGTCTCATATTTTGGTTTTGTTAGTGATGTTCTTGA ACTCTCAGAGAGATACCAGAAGCGTTTTGGTCCTCTCCGTTACTTTGTAGCCGGTTTTCT GAAATTCTTGTGCTTGCCAAAGTATAACTTTGAATTGGAGTATCTTCCAATATCAGATGG TGGTGGTGGTGAGCATAAAATTGTGGAAGGGCAAGATAAAGTTGATGCATCAGACCTCTA TGATGATGTAGTTCGGAGGTCGCGAGTAGAATGTCTACCTCGTGCCTCAAGTTTATCTAG CATTGATTCAATCATGTCTACAGGAATAATGTCAGGTGGAGATCTAGAGGTTTCGAGTCC ACATGCTAATAATGAACCCTCTGAACTTGTTCGTGCACTTGACCCAAAATCAAAGCGCCT ATCATTAGGGAGAACAAGTACTTTCAAAGAACCAGAAGAAGTGATCCATCCTCAGGCTCA TGTTTCATCGACTCCCAACTGGCGTAGATCCAAATCGAAATCAAGGACAGAAAAGGCATG GCCAGGCTCGGGTGCTACAAATGATGCAAATTCCTCTCGTGGTACCACAACACATGACAA AGAAGACGCCTCCTCCACAATTTCAGATCCTGGGCCTGTGTGGGATTCAGGACCCAAGTG GGATGATGAGCCTAAATGGGATAATCAACCTAACTGGGAACCAGAGACTCCCATTGACTT ACCTGGTCCATTGGATGATATTGAACTTGGTCTGACTAAGGAACTAGTCCCAAGCTTAGA TGAAAGATGGACAGTTAGGAAGGGGCGGTATCTTGGTGTACTGGTATGCAACCATTCATG CAAGACTGTGCAGAGTTTAAGCTCTCAGGTTATTGCTCCTAAGGCTGAATACGATGACAA TTGCCTGGACCTACTGTTGGTTGGTGGAAGTGGGAGGCTGAGGTTACTGAAATTTTTGGT GCTTTTGCAGTTTGGAAAGCATATTTCTCTTCCCAATGTGGAATATCTGAAGGTTAAGTC TGTGAGGCTCAAGGCTGGGCCCAACACACATGATGGATGTGGTATTGATGGTGAACTATT GCATGTCAAGGGGCAAGTTCGATGCAGTTTGCTGCCTCAGCAATGTCGATTAATCGGCAG GCCAGCCAAAAATCCTGTACAGTAGCTGTAAATACATGACTCCAAAGTCTGCACAGTTCT CAAGTTTGCCCGATATCCTGTTCATGTACAATCGGCAAAGGTGTGGATTATTTTTGTCCA CGCCCACAGATTCATAGCTACAGTCAAGAGGTCAGAACAGCTTTGCTGGCACCTTGCTTC AGAGGTGTACATCGTGTGCTTGATCATAGCTAAAGTCAGAAGTCAGAACAGCCTTGCTGA CACCCAACTTCAGAGGTGTGCATCGTGTGCTTGACGAGCAAAAGTGCCTGGTGAGGTGAT GTCTATCCAAATGTAAAAGCCTATCCGGAGTCTGGACTGCAGCTTGTTGTGTAGTACATC TCGTGGTTTCTCCTTTTTACCTTGCTGATATCTAATACAACTACTATAGAGTAATCTCGA ATCGGTGTACTTGCATTCGAAACAACACAGTGGCTGCCACCCCCAGTGTGCGCGGTTGTT TGGAGGTCCCTGTTTGTGTGGTTGTTTTGAGGTCCCTGATGCCGGCCACTTGATGTTCAT CGCCCCCATTAAAGGGACAGCACCCCGAATGTGATGTCCTTGATCAGCTTGAGCCTTGTA GTGTTTACAAAGTGTGAATAAGACTTGTGTCCTGCGGTGTTTGTGTTCTCAGTACAGTAT AGGATTTTTCAACAGGAAAAAAAAGATGGACAATCTGTAGTGCAGAACTGCTCATGTACC TTTCTATCCCCTCCCTTGTAACTTGTTCTTCGTGAATTGTGGTGATGTATGAGTTGTATT TGTACGTGTTGTCTGCCACATGAGCTAGATGATGATGATCATCTTGTGAAGATAGAGTTA CTGATGTGTATTGTTGTCGTTTGGAGGATAAGCAATTTGGTGGTTGGGTGGGCTTTCTTT ACTTGCCTGTTATATTCTCACAGGAATGCGCACATCTTGTAGTAGTACTACTCTCCGTTT CACAATATAAGTTATTCTAATATTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANANAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)