These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6164#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 3597 fasta sequence [TCTCCGTTAATTAATAAATTTCCCCCCTCCTCTTCCTTCCTTCCTCCACCGGCTACGCGCTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTTTGCTTCGACCAAGCTAGGGTTTCGCCGCCGAATCGAGCTCGGTGGCGCGGGGATTTTGCGGTGGGGCGGAGCGCCCGCGGCGGTGGGGAGGCTTCGGGTGGCCTCGGCCTCCGTCCGGCTCGATCCGATCGGCACACAGCCATAAGTTGGTGTTCCATGAGCTTATAAGAGTGATGCCATTATTGGCATGTTTCTATAGCATCTAGCATCTCCCAATGTTATGCATGTACTGGGCTCCCTTAAAAGATGGAAATTCAGAAGTCTGATCATCATGAGCAGAATCTTACTTCACCAAGAGGGCTAATCCATAAAGTGCTGCGTCGCACAAGTAGCAGGCGTTCTCCAACTGCAGCAGACCATAACCCTTCTCCTGTATTCCTGGAGACAAGCAATTCAAAATTCTTAAAGCAAAAGGATATTGATGATGCCATCAAGGATCCAGAGAAGGCAGGCACACACGACAACAGAATTGAAGATGAGAAGTCTGATTTGTTAGGGTATGAAATTTGTTCTGGGAAGCTTACATTGGATAACAAAGCCAAAAGTGCATCAGGTGAACAGTCTGGATCAGGGTCCAGTAGCAATTGCTTTGATGCTAGACTCACTACTGAAGCCTTGGTATGGGGTTCTAATATCCTTAAGCTCGAGGACATTGTATCTGTATCATATCATTCCGGGCTCCGTCACTTCACTGTGCATGCATGCCCTCTTGAAAAAAGATCCAGTGGACTTTCCTGCTTTATGAAGCCTAGAAAAATTCAAAAGGACTTACGTTTCCTATCCACTTCTCCACACGAGGCTTTTCGGTGGGTTAATGGTTTTGCAGATCAACAATGCTATGTAAATCTATTACCTCACCCCATGGCATCTAGCAAGAAGCATTCATCTGAACTCATTCCATTTGATAATATGTTTGATCCATGTGTTAAATGCCGGTCTCCCCCAAAGATACTTGTCATCTTGAATCCTCGATCTGGACATGGTAGATCTAGCAAAGTTTTCCACGGAAAAGTGGAACCTATATTCAAGCTTGCAGGTTTCAAGATGGAAGTGGTCAAAACTACACATGCTGGTCATGCAAAATCTCTTGTATCAACAATAGATTTCAGTACCTGTCCAGATGGAATTGTATGTGTGGGTGGCGATGGGATTGTTAATGAGGTTCTCAATGGTCTCCTTTGTAGAGATGATCAAAATGTGGCTGTATCTGTTCCAATTGGTATAATACCAGCAGGGTCCGATAACTCACTTGTTTGGACAGTATTGGGTGTTAAAGATCCGATTTCTGCAGC-ATGTCAATTGTCAGGGGAGGTTTTACACCCATTGATGTTTTTGCCGTTGAATGGATTCAAAGTGGGACTATCCATTTTGGCACAACAGTCTCATATTTTGGTTTTGTTAGTGATGTTCTTGAACTCTCAGAGAGATACCAGAAGCGTTTTGGTCCTCTCCGTTACTTTGTAGCCGGTTTTCTGAAATTCTTGTGCTTGCCAAAGTATAACTTTGAATTGGAGTATCTTCCAATATCAGATGGTGGTGGTGGTGAGCATAAAATTGTGGAAGGGCAAGATAAAGTTGATGCATCAGACCTCTATGATGATGTAGTTCGGAGGTCGCGAGTAGAATGTCTACCTCGTGCCTCAAGTTTATCTAGCATTGATTCAATCATGTCTACAGGAATAATGTCAGGTGGAGATCTAGAGGTTTCGAGTCCACATGCTAATAATGAACCCTCTGAACTTGTTCGTGCACTTGACCCAAAATCAAAGCGCCTATCATTAGGGAGAACAAGTACTTTCAAAGAACCAGAAGAAGTGATCCATCCTCAGGCTCATGTTTCATCGACTCCCAACTGGCGTAGATCCAAATCGAAATCAAGGACAGAAAAGGCATGGCCAGGCTCGGGTGCTACAAATGATGCAAATTCCTCTCGTGGTACCACAACACATGACAAAGAAGACGCCTCCTCCACAATTTCAGATCCTGGGCCTGTGTGGGATTCAGGACCCAAGTGGGATGATGAGCCTAAATGGGATAATCAACCTAACTGGGAACCAGAGACTCCCATTGACTTACCTGGTCCATTGGATGATATTGAACTTGGTCTGACTAAGGAACTAGTCCCAAGCTTAGATGAAAGATGGACAGTTAGGAAGGGGCGGTATCTTGGTGTACTGGTATGCAACCATTCATGCAAGACTGTGCAGAGTTTAAGCTCTCAGGTTATTGCTCCTAAGGCTGAATACGATGACAATTGCCTGGACCTACTGTTGGTTGGTGGAAGTGGGAGGCTGAGGTTACTGAAATTTTTGGTGCTTTTGCAGTTTGGAAAGCATATTTCTCTTCCCAATGTGGAATATCTGAAGGTTAAGTCTGTGAGGCTCAAGGCTGGGCCCAACACACATGATGGATGTGGTATTGATGGTGAACTATTGCATGTCAAGGGGCAAGTTCGATGCAGTTTGCTGCCTCAGCAATGTCGATTAATCGGCAGGCCAGCCAAAAATCCTGTACAGTAGCTGTAAATACATGACTCCAAAGTCTGCACAGTTCTCAAGTTTGCCCGATATCCTGTTCATGTACAATCGGCAAAGGTGTGGATTATTTTTGTCCACGCCCACAGATTCATAGCTACAGTCAAGAGGTCAGAACAGCTTTGCTGGCACCTTGCTTCAGAGGTGTACATCGTGTGCTTGATCATAGCTAAAGTCAGAAGTCAGAACAGCCTTGCTGACACCCAACTTCAGAGGTGTGCATCGTGTGCTTGACGAGCAAAAGTGCCTGGTGAGGTGATGTCTATCCAAATGTAAAAGCCTATCCGGAGTCTGGACTGCAGCTTGTTGTGTAGTACATCTCGTGGTTTCTCCTTTTTACCTTGCTGATATCTAATACAACTACTATAGAGTAATCTCGAATCGGTGTACTTGCATTCGAAACAACACAGTGGCTGCCACCCCCAGTGTGCGCGGTTGTTTGGAGGTCCCTGTTTGTGTGGTTGTTTTGAGGTCCCTGATGCCGGCCACTTGATGTTCATCGCCCCCATTAAAGGGACAGCACCCCGAATGTGATGTCCTTGATCAGCTTGAGCCTTGTAGTGTTTACAAAGTGTGAATAAGACTTGTGTCCTGCGGTGTTTGTGTTCTCAGTACAGTATAGGATTTTTCAACAGGAAAAAAAAGATGGACAATCTGTAGTGCAGAACTGCTCATGTACCTTTCTATCCCCTCCCTTGTAACTTGTTCTTCGTGAATTGTGGTGATGTATGAGTTGTATTTGTACGTGTTGTCTGCCACATGAGCTAGATGATGATGATCATCTTGTGAAGATAGAGTTACTGATGTGTATTGTTGTCGTTTGGAGGATAAGCAATTTGGTGGTTGGGTGGGCTTTCTTTACTTGCCTGTTATATTCTCACAGGAATGCGCACATCTTGTAGTAGTACTACTCTCCGTTTCACAATATAAGTTATTCTAATATTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANANAAA] [+] EMBL AK070811 [TCTCCGTTAATTAATAAATTTCCCCCCTCCTCTTCCTTCCTTCCTCCACCGGCTACGCGCTCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGTTTGCTTCGACCAAGCTAGGGTTTCGCCGCCGAATCGAGCTCGGTGGCGCGGGGATTTTGCGGTGGGGCGGAGCGCCCGCGGCGGTGGGGAGGCTTCGGGTGGCCTCGGCCTCCGTCCGGCTCGATCCGATCGGCACACAGCCATAAGTTGGTGTTCCATGAGCTTATAAGAGTGATGCCATTATTGGCATGTTTCTATAGCATCTAGCATCTCCCAATGTTATGCATGTACTGGGCTCCCTTAAAAGATGGAAATTCAGAAGTCTGATCATCATGAGCAGAATCTTACTTCACCAAGAGGGCTAATCCATAAAGTGCTGCGTCGCACAAGTAGCAGGCGTTCTCCAACTGCAGCAGACCATAACCCTTCTCCTGTATTCCTGGAGACAAGCAATTCAAAATTCTTAAAGCAAAAGGATATTGATGATGCCATCAAGGATCCAGAGAAGGCAGGCACACACGACAACAGAATTGAAGATGAGAAGTCTGATTTGTTAGGGTATGAAATTTGTTCTGGGAAGCTTACATTGGATAACAAAGCCAAAAGTGCATCAGGTGAACAGTCTGGATCAGGGTCCAGTAGCAATTGCTTTGATGCTAGACTCACTACTGAAGCCTTGGTATGGGGTTCTAATATCCTTAAGCTCGAGGACATTGTATCTGTATCATATCATTCCGGGCTCCGTCACTTCACTGTGCATGCATGCCCTCTTGAAAAAAGATCCAGTGGACTTTCCTGCTTTATGAAGCCTAGAAAAATTCAAAAGGACTTACGTTTCCTATCCACTTCTCCACACGAGGCTTTTCGGTGGGTTAATGGTTTTGCAGATCAACAATGCTATGTAAATCTATTACCTCACCCCATGGCATCTAGCAAGAAGCATTCATCTGAACTCATTCCATTTGATAATATGTTTGATCCATGTGTTAAATGCCGGTCTCCCCCAAAGATACTTGTCATCTTGAATCCTCGATCTGGACATGGTAGATCTAGCAAAGTTTTCCACGGAAAAGTGGAACCTATATTCAAGCTTGCAGGTTTCAAGATGGAAGTGGTCAAAACTACACATGCTGGTCATGCAAAATCTCTTGTATCAACAATAGATTTCAGTACCTGTCCAGATGGAATTGTATGTGTGGGTGGCGATGGGATTGTTAATGAGGTTCTCAATGGTCTCCTTTGTAGAGATGATCAAAATGTGGCTGTATCTGTTCCAATTGGTATAATACCAGCAGGGTCCGATAACTCACTTGTTTGGACAGTATTGGGTGTTAAAGATCCGATTTCTGCAGC ATGTCAATTGTCAGGGGAGGTTTTACACCCATTGATGTTTTTGCCGTTGAATGGATTCAAAGTGGGACTATCCATTTTGGCACAACAGTCTCATATTTTGGTTTTGTTAGTGATGTTCTTGAACTCTCAGAGAGATACCAGAAGCGTTTTGGTCCTCTCCGTTACTTTGTAGCCGGTTTTCTGAAATTCTTGTGCTTGCCAAAGTATAACTTTGAATTGGAGTATCTTCCAATATCAGATGGTGGTGGTGGTGAGCATAAAATTGTGGAAGGGCAAGATAAAGTTGATGCATCAGACCTCTATGATGATGTAGTTCGGAGGTCGCGAGTAGAATGTCTACCTCGTGCCTCAAGTTTATCTAGCATTGATTCAATCATGTCTACAGGAATAATGTCAGGTGGAGATCTAGAGGTTTCGAGTCCACATGCTAATAATGAACCCTCTGAACTTGTTCGTGCACTTGACCCAAAATCAAAGCGCCTATCATTAGGGAGAACAAGTACTTTCAAAGAACCAGAAGAAGTGATCCATCCTCAGGCTCATGTTTCATCGACTCCCAACTGGCGTAGATCCAAATCGAAATCAAGGACAGAAAAGGCATGGCCAGGCTCGGGTGCTACAAATGATGCAAATTCCTCTCGTGGTACCACAACACATGACAAAGAAGACGCCTCCTCCACAATTTCAGATCCTGGGCCTGTGTGGGATTCAGGACCCAAGTGGGATGATGAGCCTAAATGGGATAATCAACCTAACTGGGAACCAGAGACTCCCATTGACTTACCTGGTCCATTGGATGATATTGAACTTGGTCTGACTAAGGAACTAGTCCCAAGCTTAGATGAAAGATGGACAGTTAGGAAGGGGCGGTATCTTGGTGTACTGGTATGCAACCATTCATGCAAGACTGTGCAGAGTTTAAGCTCTCAGGTTATTGCTCCTAAGGCTGAATACGATGACAATTGCCTGGACCTACTGTTGGTTGGTGGAAGTGGGAGGCTGAGGTTACTGAAATTTTTGGTGCTTTTGCAGTTTGGAAAGCATATTTCTCTTCCCAATGTGGAATATCTGAAGGTTAAGTCTGTGAGGCTCAAGGCTGGGCCCAACACACATGATGGATGTGGTATTGATGGTGAACTATTGCATGTCAAGGGGCAAGTTCGATGCAGTTTGCTGCCTCAGCAATGTCGATTAATCGGCAGGCCAGCCAAAAATCCTGTACAGTAGCTGTAAATACATGACTCCAAAGTCTGCACAGTTCTCAAGTTTGCCCGATATCCTGTTCATGTACAATCGGCAAAGGTGTGGATTATTTTTGTCCACGCCCACAGATTCATAGCTACAGTCAAGAGGTCAGAACAGCTTTGCTGGCACCTTGCTTCAGAGGTGTACATCGTGTGCTTGATCATAGCTAAAGTCAGAAGTCAGAACAGCCTTGCTGACACCCAACTTCAGAGGTGTGCATCGTGTGCTTGACGAGCAAAAGTGCCTGGTGAGGTGATGTCTATCCAAATGTAAAAGCCTATCCGGAGTCTGGACTGCAGCTTGTTGTGTAGTACATCTCGTGGTTTCTCCTTTTTACCTTGCTGATATCTAATACAACTACTATAGAGTAATCTCGAATCGGTGTACTTGCATTCGAAACAACACAGTGGCTGCCACCCCCAGTGTGCGCGGTTGTTTGGAGGTCCCTGTTTGTGTGGTTGTTTTGAGGTCCCTGATGCCGGCCACTTGATGTTCATCGCCCCCATTAAAGGGACAGCACCCCGAATGTGATGTCCTTGATCAGCTTGAGCCTTGTAGTGTTTACAAAGTGTGAATAAGACTTGTGTCCTGCGGTGTTTGTGTTCTCAGTACAGTATAGGATTTTTCAACAGGAAAAAAAAGATGGACAATCTGTAGTGCAGAACTGCTCATGTACCTTTCTATCCCCTCCCTTGTAACTTGTTCTTCGTGAATTGTGGTGATGTATGAGTTGTATTTGTACGTGTTGTCTGCCACATGAGCTAGATGATGATGATCATCTTGTGAAGATAGAGT ] [+] EMBL AK121309 [ CGACCAAGCTAGGGTTTCGCCGCCGAATCGAGCTCGGTGGCGCGGGGATTTTGCGGTGGGGCGGAGCGCCCGCGGCGGTGGGGAGGCTTCGGGTGGCCTCGGCCTCCGTCCGGCTCGATCCGATCGGCACACAGCCATAAGTTGGTGTTCCATGAGCTTATAAGAGTGATGCCATTATTGGCATGTTTCTATAGCATCTAGCATCTCCCAATGTTATGCATGTACTGGGCTCCCTTAAAAGATGGAAATTCAGAAGTCTGATCATCATGAGCAGAATCTTACTTCACCAAGAGGGCTAATCCATAAAGTGCTGCGTCGCACAAGTAGCAGGCGTTCTCCAACTGCAGCAGACCATAACCCTTCTCCTGTATTCCTGGAGACAAGCAATTCAAAATTCTTAAAGCAAAAGGATATTGATGATGCCATCAAGGATCCAGAGAAGGCAGGCACACACGACAACAGAATTGAAGATGAGAAGTCTGATTTGTTAGGGTATGAAATTTGTTCTGGGAAGCTTACATTGGATAACAAAGCCAAAAGTGCATCAGGTGAACAGTCTGGATCAGGGTCCAGTAGCAATTGCTTTGATGCTAGACTCACTACTGAAGCCTTGGTATGGGGTTCTAATATCCTTAAGCTCGAGGACATTGTATCTGTATCATATCATTCCGGGCTCCGTCACTTCACTGTGCATGCATGCCCTCTTGAAAAAAGATCCAGTGGACTTTCCTGCTTTATGAAGCCTAGAAAAATTCAAAAGGACTTACGTTTCCTATCCACTTCTCCACACGAGGCTTTTCGGTGGGTTAATGGTTTTGCAGATCAACAATGCTATGTAAATCTATTACCTCACCCCATGGCATCTAGCAAGAAGCATTCATCTGAACTCATTCCATTTGATAATATGTTTGATCCATGTGTTAAATGCCGGTCTCCCCCAAAGATACTTGTCATCTTGAATCCTCGATCTGGACATGGTAGATCTAGCAAAGTTTTCCACGGAAAAGTGGAACCTATATT AAGCTTGCAGGTTTCAAGATGGAAGTGGTCAAAACTACACATGCTGGTCATGCAAAATCTCTTGTATCAACAATAGATTTCAGTACCTGTCCAGATGGAATTGTATGTGTGGGTGGCGATGGGATTGTTAATGAGGTTCTCAATGGTCTCCTTTGTAGAGATGATCAAAATGTGGCTGTATCTGTTCCAATTGGTATAATACCAGCAGGGTCCGATAACTCACTTGTTTGGACAGTATTGGGTGTTAAAGATCCGATTTCTGCAGCAATGTCAATTGTCAGGGGAGGTTTTACACCCATTGATGTTTTTGCCGTTGAATGGATTCAAAGTGGGACTATCCATTTTGGCACAACAGTCTCATATTTTGGTTTTGTTAGTGATGTTCTTGAACTCTCAGAGAGATACCAGAAGCGTTTTGGTCCTCTCCGTTACTTTGTAGCCGGTTTTCTGAAATTCTTGTGCTTGCCAAAGTATAACTTTGAATTGGAGTATCTTCCAATATCAGATGGTGGTGGTGGTGAGCATAAAATTGTGGAAGGGCAAGATAAAGTTGATGCATCAGACCTCTATGATGATGTAGTTCGGAGGTCGCGAGTAGAATGTCTACCTCGTGCCTCAAGTTTATCTAGCATTGATTCAATCATGTCTACAGGAATAATGTCAGGTGGAGATCTAGAGGTTTCGAGTCCACATGCTAATAATGAACCCTCTGAACTTGTTCGTGCACTTGACCCAAAATCAAAGCGCCTATCATTAGGGAGAACAAGTACTTTCAAAGAACCAGAAGAAGTGATCCATCCTCAGGCTCATGTTTCATCGACTCCCAACTGGCGTAGATCCAAATCGAAATCAAGGACAGAAAAGGCATGGCCAGGCTCGGGTGCTACAAATGATGCAAATTCCTCTCGTGGTACCACAACACATGACAAAGAAGACGCCTCCTCCACAATTTCAGATCCTGGGCCTGTGTGGGATTCAGGACCCAAGTGGGATGATGAGCCTAAATGGGATAATCAACCTAACTGGGAACCAGAGACTCCCATTGACTTACCTGGTCCATTGGATGATATTGAACTTGGTCTGACTAAGGAACTAGTCCCAAGCTTAGATGAAAGATGGACAGTTAGGAAGGGGCGGTATCTTGGTGTACTGGTATGCAACCATTCATGCAAGACTGTGCAGAGTTTAAGCTCTCAGGTTATTGCTCCTAAGGCTGAATACGATGACAATTGCCTGGACCTACTGTTGGTTGGTGGAAGTGGGAGGCTGAGGTTACTGAAATTTTTGGTGCTTTTGCAGTTTGGAAAGCATATTTCTCTTCCCAATGTGGAATATCTGAAGGTTAAGTCTGTGAGGCTCAAGGCTGGGCCCAACACACATGATGGATGTGGTATTGATGGTGAACTATTGCATGTCAAGGGGCAAGTTCGATGCAGTTTGCTGCCTCAGCAATGTCGATTAATCGGCAGGCCAGCCAAAAATCCTGTACAGTAGCTGTAAATACATGACTCCAAAGTCTGCACAGTTCTCAAGTTTGCCCGATATCCTGTTCATGTACAATCGGCAAAGGTGTGGATTATTTTTGTCCACGCCCACAGACTCATAGCTACAGTCAAGAGGTCAGAACAGCTTTGCTGGCACCTTGCTTCAGAGGTGTACATCGTGTGCTTGATCATAGCTAAAGTCAGAAGTCAGAACAGCCTTGCTGACACCCAACTTCAGAGGTGTGCATCGTGTGCTTGACGAGCAAAAGTGCCTGGTGAGGTGATGTCTATCCAAATGTAAAAGCCTATCCGGAGTCTGGACTGCAGCTTGTTGTGTAGTACATCTCGTGGTTTCTCCTTTTTACCTTGCTGATATCTAATACAACTACTATAGAGTAATCTCGAATCGGTGTACTTGCATTCGAAACAACACAGTGGCTGCCACCCCCAGTGTGCGCGGTTGTTTGGAGGTCCCTGTTTGTGTGGTTGTTTTGAGGTCCCTGATGCCGGCCACTTGATGTTCATCGCCCCCATTAAAGGGACAGCACCCCGAATGTGATGTCCTTGATCAGCTTGAGCCTTGTAGTGTTTACAAAGTGTGAATAAGACTTGTGTCCTGCGGTGTTTGTGTTCTCAGTACAGTATAGGATTTTTCAACAGG AAAAAAAGATGGACAATCTGTAGTGCAGAACTGCTCATGTACCTTTCTATCCCCTCCCTTGTAACTTGTTCTTCGTGAATTGTGGTGATGTATGAGTTGTATTTGTACGTGTTGTCTGCCACATGAGCTAGATGATGATGATCA ] [+] EMBL CF330043 [ CATGCAAGACTGTGCAGAGTTTAAGCTCTCAGGTTATTGCTCCTAAGGCTGAATACGATGACAATTGCCTGGACCTACTGTTGGTTGGTGGAAGTGGGAGGCTGAGGTTACTGAAATTTTTGGTGCTTTTGCAGTTTGGAAAGCATATTTCTCTTCCCAATGTGGAATATCTGAAGGTTAAGTCTGTGAGGCTCAAGGCTGGGCCCAACACACATGATGGATGTGGTATTGATGGTGAACTATTGCATGTCAAGGGGCAAGTTCGATGCAGTTTGCTGCCTCAGCAATGTCGATTAATCGGCAGGCCAGCCAAAAATCCTGTACAGTAGCTGTAAATACATGACTCCAAAGTCTGCACAGTTCTCAAGTTTGCCCGATATCCTGTTCATGTACAATCGGCAAAGGTGTGGATTATTTTTGTCCACGCCCACAGATTCATAGCTACAGTCAAGAGGTCAGAACAGCTTTGCTGGCACCTTGCTTCAGAGGTGTACATCGTGTGCTTGATCAT ] [+] EMBL AU090487 [ TGCAGAACTGCTCATGTACCTTTCTATCCCCTCCCTTGTAACTTGTTCTTCGTGAATTGT GTGATGTATGAGTTGTATTTGTACGTGTTGTCTGCCACATGAGCTAGATGATGATGATCATCTTGTGAAGATAGAGTTACTGATGTGTATTGTTGTCGTTTGGAGGATAAGCAATTTGGTGGTTGGGTGGGCTTTCTTTACTTGCCTGTTATATTCTCACAGGAATGCGCACATCTTGTAGTAGTACTACTCTCCGTTTCACAATATAAGTTATTCTAATATTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAANANAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||