These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6233#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 2567 fasta sequence [CTACCCACCCGCTACCAATCCCCTTCGCTCCGCTCCACTCCTCCGGATCTCCGCCCCGCCCCTTCCATCTCCGGCGCCGGCGAGAATGGAGCTGCTCTGCATCGGGACGGCGGACACCAAGCTGGACGAGCTGCTCTTCCTCGCCGCCCGCCTCCGCTCCACCCTCGCCGCCACCTCCTCCGCGCAGGTTCAAGTAAGCCTTGTGGATGTCTCCACAACTAAGAAGGTGACATCACAAGATTTTAAGGGCACCACATTTATCTCAAGAGATGCAGTTCTTTCGTGTCATTTAGGTGTCGATCAACATGAACTTCCTAGTGACAGAGGTGAAGCAATCACACTCATGTCAGAGGCTCTCCAGAGCTTTCTAAAAAGAAGATATGAAAGTGGTACTCTGCTAGGTGCTGTTGGATTAGGAGGCAGTGGAGGAACTGCCCTAATTGCTCCTGCTCTAAGATCCCTGCCACTCGGAGTGCCTAAGC-TATTGTATCTACTGTTGCTAGTGGCCAAACGGCACCATATGTTGGAACATCGGACTTGGTGTTGTTTCCTTCAGTTGTTGACATATGTGGCATAAACAGTGTCAGCCGTGTTATATTATCTAATGCTGCTGCAGCTGTTGCTGGAATGGTGCACGGAATATTAATGGAATCCAATGAATCTGATGAAACTGCCACAAAACCAACTATTGGTATTACAATGTTTGGTGTGACAACAACATGTGTAAATATGGTCAAAGAAAGACTGAGCAAAGAAGGTTATGAGACACTTGTATTCCATGCCACAGGTGTAGGAGGAAAAGCGATGGAAGAACTAGTTAAGGGAGGTTTCATACAGGGTGTATTAGATATAACGACAACAGAAGTTGCAGACCACATTGTTGGCGGTGTTATGGCATGTGATGATACAAGGTTTGATGCAATTATCGACAACAAAATCCCTCTTGTTCTCAGTGTTGGAGCCTTGGATATGGTCAACTTTGGAGCTCGAGATACGATACCTCCTGATTTCACAGGAAGAAAGATACATGTGCATAATGAGCAGGTTTCACTGATGCGAACTACAGTAGAAGAGAACAAAAAAAATTGCTGAGTTTATAGCTGATAAAATAAACAAATCTTCATCGAAGGTTATTGTTTGCCTGCCACAAAAGGGCATCTCTGCAATAGATGCACCTAAAATGCCATTTTACGATCTGGAGGCTACATCTACGCTGCTGGATGAATTATGTAGCCGTATAGAGAAAACTGACAACAGAGAGGTCAAGATGCTTCCATATCATATAAATGATCCGGAATTTGCTAATGTTTTGGTGGACGCATTCTTGAGTATGGATGTAAAGGCATCTAATACAATAAGTCCAGAAAACAGCATGGTCCAAACTAATCAAGATGTAAATACAAAAGAATATTGTTCAACACAGAGAACTTCAGATAGTTCTATCATATGGAGATCTCCAGTAGATTTTCCTGATGCAAGACCAGAAACTTTGC-AAAGACAAAGTCAGTATTACATAAACTAAAGCAACAAATTGTTGAGGGTACTCCTGTCATTGGAGCTGGTGCTGGCACTGGCATATCAGCCAAGTTTGAAGAAGCTGGTGGAGTTGATCTTATAGTTCTGTACAACTCCGGGCGGTTTCGCATGGCTGGGAGGGGTTCATTGGCAGGACTATTGCCATTTGCAGATGCAAACGCTATTGTACTTGAGATGGCCAATGAAGTGTTGCCTGTGGTTAAAGGAGTTCCGGTTCTTGCTGGGGTTTGCGCTACTGATCCATTCCGTAGAATGGAGTACTTCCTTAAACAACTAGAAGCTATTGGATTTTGTGGTGTCCAAAATTTCCCCACTGTTGGTCTTTTTGATGGCAATTTTCGACAGAACTTGGAAGAAACTGGAATGGGCTACAGCTTGGAAGTGGAGATGATCTCAAGAGCTCACAGCATGGGTTTTTTGACGACTCCATATGCTTTCAATCCTGAAGAAGCTGCTGCCATGGCCAAGGCTGGAGCTCATATAATAGTGGCACATATGGGTCTAACAACAGCTGGGTCTATTGGGGCAAAGACTGCTGTCACTTTAGATGACAGTGTCAAACGTGTTCAAGCCATTGCTGATGCAGCACTTGGGATTAATCCTGACATTATTGTTCTGTGTCATGGAGGTCCCATATCAGGGCCGCAGGAGGCAGAGTTTATCCTAAAGCGCACTAACAGGGTCCATGGATTCTATGGTGCATCAAGCATGGAGCGGCTACCAGTTGAGCAAGCTATCACAAACACCATGAGGGAGTATAAACGGATTTCCATAAAATAAGAATGATAGTTCAGACTTCAAATATGTCCTTTGCTCTACATGGTACTGATCTTCATACTGATTCAAAGAACAATAATGGAAGAGGAAGCCAGGTGTTTGTGCATTGTTGTACCATATGCGGCACATGTACTCGTGTATTTCAGTCGGAATAAAGAATGATAAGCGAATGATTTCGTGCTTACTTAATAACTATCCATACTAAGACGATAAGTTACTGTAACCATGACAAAATCTGTGATAAAGACCGAAAT] 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TATTGTATCTACTGTTGCTAGTGGCCAAACGGCACCATATGTTGGAACATCGGACTTGGTGTTGTTTCCTTCAGTTGTTGACATATGTGGCATAAACAGTGTCAGCCGTGTTATATTATCTAATGCTGCTGCAGCTGTTGCTGGAATGGTGCACGGAATATTAATGGAATCCAATGAATCTGATGAAACTGCCACAAAACCAACTATTGGTATTACAATGTTTGGTGTGACAACAACATGTGTAAATATGGTCAAAGAAAGACTGAGCAAAGAAGGTTATGAGACACTTGTATTCCATGCCACAGGTGTAGGAGGAAAAGCGATGGAAGAACTAGTTAAGGGAGGTTTCATACAGGGTGTATTAGATATAACGACAACAGAAGTTGCAGACCACATTGTTGGCGGTGTTATGGCATGTGATGATACAAGGTTTGATGCAATTATCGACAACAAAATCCCTCTTGTTCTCAGTGTTGGAGCCTTGGATATGGTCAACTTTGGAGCTCGAGATACGATACCTCCTGATTTCACAGGAAGAAAGATACATGTGCATAATGAGCAGGTTTCACTGATGCGAACTACAGTAGAAGAGAACAAAAAAAATTGCTGAGTTTATAGCTGATAAAATAAACAAATCTTCATCGAAGGTTATTGTTTGCCTGCCACAAAAGGGCATCTCTGCAATAGATGCACCTAAAATGCCATTTTACGATCTGGAGGCTACATCTACGCTGCTGGATGAATTATGTAGCCGTATAGAGAAAACTGACAACAGAGAGGTCAAGATGCTTCCATATCATATAAATGATCCGGAATTTGCTAATGTTTTGGTGGACGCATTCTTGAGTATGGATGTAAAGGCATCTAATACAATAAGTCCAGAAAACAGCATGGTCCAAACTAATCAAGATGTAAATACAAAAGAATATTGTTCAACACAGAGAACTTCAGATAGTTCTATCATATGGAGATCTCCAGTAGATTTTCCTGATGCAAGACCAGAAACTTTGC AAAGACAAAGTCAGTATTACATAAACTAAAGCAACAAATTGTTGAGGGTACTCCTGTCATTGGAGCTGGTGCTGGCACTGGCATATCAGCCAAGTTTGAAGAAGCTGGTGGAGTTGATCTTATAGTTCTGTACAACTCCGGGCGGTTTCGCATGGCTGGGAGGGGTTCATTGGCAGGACTATTGCCATTTGCAGATGCAAACGCTATTGTACTTGAGATGGCCAATGAAGTGTTGCCTGTGGTTAAAGGAGTTCCGGTTCTTGCTGGGGTTTGCGCTACTGATCCATTCCGTAGAATGGAGTACTTCCTTAAACAACTAGAAGCTATTGGATTTTGTGGTGTCCAAAATTTCCCCACTGTTGGTCTTTTTGATGGCAATTTTCGACAGAACTTGGAAGAAACTGGAATGGGCTACAGCTTGGAAGTGGAGATGATCTCAAGAGCTCACAGCATGGGTTTTTTGACGACTCCATATGCTTTCAATCCTGAAGAAGCTGCTGCCATGGCCAAGGCTGGAGCTCATATAATAGTGGCACATATGGGTCTAACAACAGCTGGGTCTATTGGGGCAAAGACTGCTGTCACTTTAGATGACAGTGTCAAACGTGTTCAAGCCATTGCTGATGCAGCACTTGGGATTAATCCTGACATTATTGTTCTGTGTCATGGAGGTCCCATATCAGGGCCGCAGGAGGCAGAGTTTATCCTAAAGCGCACTAACAGGGTCCATGGATTCTATGGTGCATCAAGCATGGAGCGGCTACCAGTTGAGCAAGCTATCACAAACACCATGAGGGAGTATAAACGGATTTCCATAAAATAAGAATGATAGTTCAGACTTCAAATATGTCCTTTGCTCTACATGGTACTGATCTTCATACTGATTCAAAGAACAATAATGGAAGAGGAAGCCAGGTGTTTGTGCATTGTTGTACCATATGCGGCACATGTACTCGTGTATTTCAGTCGGAATAAAGAATGATAAGCGAATGATTTCGTGCTTACTTAATAACTATCCATACTAAGACGATAAGTTACTGTAACCATGACAAAATCTGTGATAAAGACCGAAAT] [+] EMBL AK063108 [ GCCCCGCCCCTTCCATCTCCGGCGCCGGCGAGAATGGAGCTGCTCTGCATCGGGACGGCGGACACCAAGCTGGACGAGCTGCTCTTCCTCGCCGCCCGCCTCCGCTCCACCCTCGCCGCCACCTCCTCCGCGCAGGTTCAAGTAAGCCTTGTGGATGTCTCCACAACTAAGAAGGTGACATCACAAGATTTTAAGGGCACCACATTTATCTCAAGAGATGCAGTTCTTTCGTGTCATTTAGGTGTCGATCAACATGAACTTCCTAGTGACAGAGGTGAAGCAATCACACTCATGTCAGAGGCTCTCCAGAGCTTTCTAAAAAGAAGATATGAAAGTGGTACTCTGCTAGGTGCTGTTGGATTAGGAGGCAGTGGAGGAACTGCCCTAATTGCTCCTGCTCTAAGATCCCTGCCACTCGGAGTGCCTAAGCTTATTGTATCTACTGTTGCTAGTGGCCAAACGGCACCATATGTTGGAACATCGGACTTGGTGTTGTTTCCTTCAGTTGTTGACATATGTGGCATAAACAGTGTCAGCCGTGTTATATTATCTAATGCTGCTGCAGCTGTTGCTGGAATGGTGCACGGAATATTAATGGAATCCAAT ] [+] EMBL CB670506 [ GTTATGGCATTTGATGATACAAGGTTTGATGCAATTATCGACAACAAAATCCCTCTTGTTCTCAGTGTTGGAGCCTTGGATCCGGACAACTTTGGAGCTCGAGATACGATACCTCCTGATTTCACAGGAAGAAAGATACATGTGCATAATGAGCAGGTTTCACTGATGCGAACTACAGTAGAAGAGAAC AAAAAAATTGCTGAGTTTATAGCTGATAAAATAAACAAATCTTCATCGAAGGTTATTGTTTGCCTGCCACAAAAGGGCATCTCTGCAATAGATGCACCTAAAATGCCATTTTACGATCTGGAGGCTACATCTACGCTGCTGGATGAATTATGTAGCCGTATAGAGAAAACTGACAACAGAGAGGTCAAGATGCTTCCATATCATATAAATGATCCGGAATTTGCTAATGTTTTGGTGGACGCATTCTTGAGTATGGATGTAAAGGCATCTAATACAATAAGTCCAGAAAACAGCATGGTCCAAACTAATCAAGATGTAAATACAAAAGAATATTGTTCAACACAGAGAACTTCAGATAGTTCTATCATATGGAGATCTCCAGTAGATTTTCCTGATGCAAGACCAGAAACTTTGCAAAAGACAAAGTCAGTATTACATAAACTAAAGCAACAAATTGTTGAGGGTACTCCTGTCATTGGAGCTGGTGCTGGCACTGGCATATCAGCCAAGTTTGAAGAAGCTGGTGGAGTTGATCTTATAGTTCTGTACAACTCCGGGCGGTTTCGCATGGCTGGGAGGGGTTCATTGGCAGGACTAT ] [-] EMBL CB670507 [ ACTAGAAGCTATTGGATTTTGTGGTGTCCAAAATTTCCCCACT TTGGTCTTTTTGATGGCAATTTTTGACAGAACTTGGAAGAAACTGGAATGGGCTACAGCTTGGAAGTGGAGATGATCTCAAGAGCTCACAGCATGGGTTTTTTGACGACTCCATATGCTTTCAATCCTGAAGAAGCTGCTGCCATGGCCAAGGGTGGAGCTCATATAATAGTGGCACATATGGGTTTAACAACAGCTGGGTTTATTGGGGCAAAGACTGCTGTCCCTTTAGATGACAGTGTCAAACGTGTTCAAGCCATTGGTGATGCAGCACTTGGGATTAATCCTGACATTATTGTTTTGTGTCATGGAGGTCCCATATCAGGGCCGCAGGAGGCAGAGTTTTTCCTAAAGCGCACTAACAGGGTCCATGGATTTTATGGTGCATCAAGCATGGAGCGGGTTCCAGTTGAGCAAGCTATCACAAACCCCATGAGGGAGTATAAACGGATTTCCATAAAATAAGAATGATAGTTCAGACTTCAAATATGTCCTTTGCTTTACATGGTTCTGATTTTCATTCTGATTCAAAGAACAATAATGGAAGAGGAAGCCAGGTGTTTGTGCATTGTTGTTCCATATGCGGCCCATGTACTGGTGTATTTCAGTCGGAATAAAGAATGATAAGCGAATGATTTCGTGCTTACTTAATAACTATCCATAGTAAGACGATA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||