These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6241#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1748 fasta sequence [CCTTTGAACACGGATTCTCGGACATGTGAAGATGTTATCACTGAGCTTGGGTACCCTTTTGAGGCTATAAAAGTTGTTACTTCAGATGGATATGCCCTACTGCTGGAGAGAATTCCAAGGCGTGATTCACAGAAGGTGGTATTGCTGCAACATGGAATACTGGACTCATCAATGGGTTGGGTATCGAATGGTGTTGTTGGCTCACCTGCATTTGCAGCATATGATCAAGGTTATGATGTTTTTCTTGGAAATCTGCGTGGTTTAGTCTCCAGGGAGCATGTTGATAAAAATATTTCTTCCTACAAGTACTGGAAATATTCTGTTAATGAACATGGAACCAAAGATATGCCAGCAATTGTTGAAGAAATTCACAAGATTAAAACTTCAGAACTTGGCAAAAGTAGACCTCACATAAGTGAGGAAACAGAAGATCAAAACGATAAGATAAAAAATTTGGAAGTGCAGGCTTCACAGGACGATGAAAGAGACAATCAACCATACAAGCTTTGTGCTGTCTGCCACAGCTTGGGTGGTGCGGTGATGTTAATGTATGTGGTGACATCAAGGATTGCGCAGAAGCCCCACAGGTTATCAAGATTGGTCTTGCTATCTCCTGCTGGCTTTCATGAGGATTCTAATGTGGTGTTCAGCATGGTAGAAAAGCTCATTTTGTTTGTTGGACCAGTACTAGCTCCATTTATACCTGGCCTTTACATACCAACACGTTTCTTCCGGATGCTACTGAACAAATTGGCCAGGGATTTCAACAACTATCCAGCTTTGGGCGGCCTTGTCCAAACTCTTATGGGCTATGTAGTTGGCGGTGACAGTTCAAATTGGGTGGGAGTGCTCGGCTTGCCACACTACAACATGGATGACATGCCTGGTGTATCATTCCATGTTGCACTTCACCTTGCACAAATAAAGAGGGCAAAAAGGTTCCAAATGTATGACTATGGAAGTCCAGTAGCAAATATGGAAGCATATGGAACACCAGAACCCTTGGACCTGGGAGCTCATTATGGTCTGATTGACATCCCAGTAGATTTAGTCGCTGGGCAAAGAGACAGAGTTATCTCACCATCCATGGTAAAGAAGCACTATAAGCTGATGCGCAAGGCTGGTGTAGAGGTTTCCTACAATGAATTCGAGTACGCCCACTTGGATTTCACATTCTCCCATAGGGAGGAGCTTTTGTCCTATGTTATGTCCCGCCTGCTCTTAGTGTCTGACCCAGGTAAAGGCCGCATCAAGCAGACTAGTGTCCGCCTTAGAAAGCTGAAGAAAGCTCAGTCAGAAATTGAGAATGACTCTGACAGCAAGGAGCACAATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGAGCAAAATGGGCATGTGCATGCTGC-GTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACA-TTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACACGTGCTGCCTCTGGCATATACCTTCTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCAGTTCTTTCTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAACAAGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGCTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAACTGACAGGGAGAAGCTACCGGTGTTAAGGATGTAGATTTTTGCACTTAACGCGTGCTTTCGTGTGTTCGCGTTTTGTTTTTGCTCTTCCTGTGAAGAGGTGATCGAAATGCAGTTTCTTAAAAAAAAA] [+] EMBL AK064554 [CCTTTGAACACGGATTCTCGGACATGTGAAGATGTTATCACTGAGCTTGGGTACCCTTTTGAGGCTATAAAAGTTGTTACTTCAGATGGATATGCCCTACTGCTGGAGAGAATTCCAAGGCGTGATTCACAGAAGGTGGTATTGCTGCAACATGGAATACTGGACTCATCAATGGGTTGGGTATCGAATGGTGTTGTTGGCTCACCTGCATTTGCAGCATATGATCAAGGTTATGATGTTTTTCTTGGAAATCTGCGTGGTTTAGTCTCCAGGGAGCATGTTGATAAAAATATTTCTTCCTACAAGTACTGGAAATATTCTGTTAATGAACATGGAACCAAAGATATGCCAGCAATTGTTGAAGAAATTCACAAGATTAAAACTTCAGAACTTGGCAAAAGTAGACCTCACATAAGTGAGGAAACAGAAGATCAAAACGATAAGATAAAAAATTTGGAAGTGCAGGCTTCACAGGACGATGAAAGAGACAATCAACCATACAAGCTTTGTGCTGTCTGCCACAGCTTGGGTGGTGCGGTGATGTTAATGTATGTGGTGACATCAAGGATTGCGCAGAAGCCCCACAGGTTATCAAGATTGGTCTTGCTATCTCCTGCTGGCTTTCATGAGGATTCTAATGTGGTGTTCAGCATGGTAGAAAAGCTCATTTTGTTTGTTGGACCAGTACTAGCTCCATTTATACCTGGCCTTTACATACCAACACGTTTCTTCCGGATGCTACTGAACAAATTGGCCAGGGATTTCAACAACTATCCAGCTTTGGGCGGCCTTGTCCAAACTCTTATGGGCTATGTAGTTGGCGGTGACAGTTCAAATTGGGTGGGAGTGCTCGGCTTGCCACACTACAACATGGATGACATGCCTGGTGTATCATTCCATGTTGCACTTCACCTTGCACAAATAAAGAGGGCAAAAAGGTTCCAAATGTATGACTATGGAAGTCCAGTAGCAAATATGGAAGCATATGGAACACCAGAACCCTTGGACCTGGGAGCTCATTATGGTCTGATTGACATCCCAGTAGATTTAGTCGCTGGGCAAAGAGACAGAGTTATCTCACCATCCATGGTAAAGAAGCACTATAAGCTGATGCGCAAGGCTGGTGTAGAGGTTTCCTACAATGAATTCGAGTACGCCCACTTGGATTTCACATTCTCCCATAGGGAGGAGCTTTTGTCCTATGTTATGTCCCGCCTGCTCTTAGTGTCTGACCCAGGTAAAGGCCGCATCAAGCAGACTAGTGTCCGCCTTAGAAAGCTGAAGAAAGCTCAGTCAGAAATTGAGAATGACTCTGACAGCAAGGAGCACAATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGAGCAAAATGGGCATGTGCATGCTGC GTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACA TTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACACGTGCTGCCTCTGGCATATACCTTCTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCAGTTCTTTCTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAACAAGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGCTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAAC ] [-] EMBL CB673674 [ GCATATGGAACACCAGAACCCTTGGACCTGGGAGCTCATTATGGTTTGATTGACATCCCAGTAGATTTAGTCGCTGGGCAAAGAGACAGAGTTATTTCCCCATCCATGGTAAAGAAGCCCTATAAGCTGATGCGCAAGGCTGGTGTAGAGGTTTCCTACAATGAATTTGAGTTCGCCCCCTTGGATTTCACATTTTCCCATAGGGGGGAGGTTTTGTCCTATGTTATGTCCCGCCTGCTTTTAGTGTTTGACCCAGGTAAAGGCCGCATCAAGCAGACTAGTGTCCCCCTTAGAAAGCTGAAGAAAGCTCAGTCAGAAATTGAGAATGATTTTGACAGCAAGGAGCCCAATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGAGCAAAATGGGCATGTGCATGCTGC GTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACA TTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACCCGTGCTGCCTTTGGCATATCCCTTTTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCAGTTTTTTTTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAACAAGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGGTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAACT ] [+] EMBL OSA417533 [ AGTGTCCGCCTTAGAAAGCTGAAGAAAGCTCAGTCAGAGATTGAGAATGACTCTGACAGCAAGGAGCACAATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGAGCAAAATGGGCATGTGCATGCTGC GTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACA TTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACACGTGCTGCCTCTGGCATATACCTTCTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCAGTTCTTTCTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAACAAGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGCTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAACTGACAGGGAGAAGCTACCGGTGTTAAGGATGTAGATTTTTGCACTTA ] [+] EMBL BI813567 [ TGAGAATGACTCTGACACCAAGGAGCAC ATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGA CCAAATGGGCATGTGCGTGCTGCTGTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACACTTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACACGTGCTGCCTCTGGCATATACCTTCTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCAGTTCTTTCTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAACAGGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGCTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAACTGACAGGGAGAAGCTACCGGTGTTAAGGATGTAGATTTTTGCACTTAACGCGTGCTTTCGTGTGTTCGCGTTTTGTTTTTGCTCTTCCTGTGAAGAGGTGATCGAAATGCAGTTTCTTAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||