cluster # 6480

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Oryza sativa
cluster # 6480 cluster # 6480 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6480#0 length = 698 sequences # 4

consensusID : consensus_6480#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 698
fasta sequence

                              [NATAGTCGGTAAGTGAAGGTNAAAGCCCCCCGAGAGTCCCTGGAAGAGGTCCCAANCCTTGAAATCTGNCATGGAACGAAGAAAAGTTCAATGGNCTGATACGTNTGGAAAAGAGCTTTTTGAGATAAGGGAATTTGAAGCTAGTGATGAAGGTTTGTCAGACGATGATATGGAAAATGAGGGTTTCAGGAAATGTGAGT-GTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACA-TT-GCGGCA-ATGGAATCGATGCTTCTCGTGTAGCTGAAGTTTTGCTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGATTTCTCATCGATCAGGGTAAGATACCTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCA-TGGTTGATCTTATGCCTTTTGCTGAATTATTTGCTGGTGACA-TGGTGGTTGTGTTTAGCTAATCTGCACACGTTAGGGTTACAGTTTTGATTCCCCACTGTACCATATCAAGATCTTAACTGCTCAATTTCTTGTTTTCGCCTTTCTTTCCCTTCACTTTGGTGCTCTCAAGTTCCAATGTACTATTTCCGTACAAGTCTGTCCAGTTAGTGTTGTAAGGGATGTTGGATCTCTACTATATTGTTTTGCTTCT---CTCACATGTTAATTGATGGATTTGTTGAAAAAATTTGTTCAAGTTGTTATGTTAATGCCTTGATGGCTGAGTGATGCCCTTGTAAAGAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU101194             [NATAGTCGGTAAGTGAAGGTNAAAGCCCCCCGAGAGTCCCTGGAAGAGGTCCCAANCCTTGAAATCTGNCATGGAACGAAGAAAAGTTCAATGGNCTGATACGTNTGGAAAAGAGCTTTTTGAGATAAGGGAATTTGAAGCTAGTGATGAAGGTTTGTCAGNCGATGATACGGAAAATGAGGGTTTCAGGAAATGTGAGT GTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACA TT GCGGCA ATGGAATCGATGCTTCTCGTGTAGCTGAAGTTTTGCTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGATTTCTCATCGATCAGGGTAAGATACCTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCA TGGTTGATCTTATGCCTTTTGCTGAATTATTTGCTGGTGACA TGGTGGTTGTGTTTAGCTAATCTGCACACGTTAGGGTTACAGTTTTGATTCCCCACTGTACCATATCAAGATCTTAACTGCTCAATTTCTTGTTTTCGCCTTTCTTTCCCTTCACTTTGGTGCTCTCAAGTTCCAATGTACTATTTCCGTACAAGTCTGTCCAGTTAGTGTTGTAAGGGATGTTGGATCTCTACTATATTGTTTTGCTTCT   CTCACATGTTAATTGATGGATTTGTTGAAAAAA                                                                ]
[+] EMBL CA998171             [                                                                  TGGCATGGAACGAAGAAAAGTTCAATGGACTGATACGTGTGGAAAAGAGCTTTTTGAGATAAGGGAATTTGAAGCTAGTGATGAAGGTTTGTCAGACGATGATATGGAAAATGAGGGTTTCAGGAAATGTGAGT GTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACA TT GCGGCA ATGGAATCGATGCTTCTCGTGTAGCTGAAGTTTTGCTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGATTTCTCATCGATCAGGGTAAGATACCTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCA TGGTTGATCTTATGCCTTTTGCTGAATTATTTGCTGGTGACA TGGTGGTTGTGTTTAGCTAATCTGCACACGTTAGGGTTACAGTTTTGATT                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CA766538             [                                                                                                                                                TGATGAAGGTTTGTCAGACGATGATATGGAAAATGAGGGTTTCAGGAAATGTGAGT GTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACA TT GCGGCA ATGGAATCGATGCTTCTCGTGTAGCTGAAGTTTTGCTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGATTTCTNATCGATCAGGGTAANATTNTTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCG TGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI796568             [                                                                                                                                                                                                   TGAGTGGTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACACTTGGCGGCACATGGAATCGATGCTTCTCGTGTA CTGAAGTTTT CTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGATTTCTCATCGATCAGGGTAAGATACCTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCACTGGTTGATCTTATGCCTTTTGCTGAATTATTTGCTGGTGACACTGGTGGTTGTGTTTAGCTAATCTGCACACGTTAGGGTTACAGTTTTGATTCCCCACTGTACCATATCAAGATCTTAACTGCTCAATTTCTTGTTTTCGCCTTTCTTTCCCTTCACTTTGGTGCTCTCAAGTTCC ATGTACTATTTCCGTACAAGTCTGTCCAGTTAGTGTTGTAAGGGATGTTGGATCTCTACTATATTGTTTTGCTTCTCTCCTCACATGTTAATTGATGGATTTGTTGACATTTTTTGTTCAAGTTGTTATGTTAATGCCTTGATGGCTGAGTGATGCCCTTGTAAAGAAAAAAAAAA]




>consensus_6480#0
NATAGTCGGTAAGTGAAGGTNAAAGCCCCCCGAGAGTCCCTGGAAGAGGTCCCAANCCTT
GAAATCTGNCATGGAACGAAGAAAAGTTCAATGGNCTGATACGTNTGGAAAAGAGCTTTT
TGAGATAAGGGAATTTGAAGCTAGTGATGAAGGTTTGTCAGACGATGATATGGAAAATGA
GGGTTTCAGGAAATGTGAGTGTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACATTGCGGCAAT
GGAATCGATGCTTCTCGTGTAGCTGAAGTTTTGCTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGAT
TTCTCATCGATCAGGGTAAGATACCTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCATGGTTGATCTTA
TGCCTTTTGCTGAATTATTTGCTGGTGACATGGTGGTTGTGTTTAGCTAATCTGCACACG
TTAGGGTTACAGTTTTGATTCCCCACTGTACCATATCAAGATCTTAACTGCTCAATTTCT
TGTTTTCGCCTTTCTTTCCCTTCACTTTGGTGCTCTCAAGTTCCAATGTACTATTTCCGT
ACAAGTCTGTCCAGTTAGTGTTGTAAGGGATGTTGGATCTCTACTATATTGTTTTGCTTC
TCTCACATGTTAATTGATGGATTTGTTGAAAAAATTTGTTCAAGTTGTTATGTTAATGCC
TTGATGGCTGAGTGATGCCCTTGTAAAGAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case