These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6608#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1307 fasta sequence [AAACATCTTGGCTAGCAATTTCCATGGAGAAAATCCAAGTGACCACACCCATGGCAGACTCCTCGTTCAATCCGGAGTTTCTGCAAGCACATGCAGAGCTTTGGAATCTCACCTTTAGCTACCTGAAAGCCATGGCGCTTGAGTGTGCTATCAAGCTTGGGATCCCCAACGCCATTCATCGTTGTGGTGGTTCTGCCTCACTATCGGAACTGGTCATCTCCATTCCAGTGCCTGAGACTAGAAAGCCTCATCTGCCTCGCCTCATGAGGTTTCTTGCCGCGGTATGTGTTTTTTCCCTCGATAACCCAACTATTGATGAAGAGGTGACCGAGAAAGGCATGGGCATATACTGCCTCACACCATTGTCTCGCCTCCTTGTGGATGGTAGCATCGGTGGGCATGGAAGCTTCTCTCCGTTTGTGCTCTCCCAAACCACCAAGTATCATGTGTCTGCAGCTATGAATCTATCTGACTGGTTCATGACTGAGGACAAAGAGGTTGCCATAGAGATACCATTTAGGGCTGCTCATGGCACAGACTTGTGGGGTGNTATGAGTCGTGATGCTAACATGAATGGAGGTGTTCAATGCTGGCATGGGTTCCGATAGTCGTCTTGCAATCAATTTTATTATTAGCAAATGTGGTGAGGTGTTTGAGGGGATTAGCTCATTGGTTGATG-TTGGTGGTGGTACTGGCACAACAGCAAGAGCCATTGCTAAGGCTTTCCCACATATCAAGTGCTCGGTACTGGATCTTCCAAATGTAATCGATACTATCAC-GGTGGATGGCATAGTTGAGTATATTGCA-GGTGACATGATGGAACAAATCCCACCAACT-GATGCCGTGCTGCTCAAGTATATTCTACATGACTGGAACGATGAGGATTGTGTAAAGATCCTAAAACAATGTAGAAATGCTATTCATGCTCAGAAGCCAGGAGGAAAAGTTATTATCATAGACATAGTGGTTGGATCCCCTTCTAAAGACATGTTTGAAGCTCAAGTTTCATTTGATCTATTGATGATGGTGATAACATCAGGCAAGGAACGTGATCAGCATGAATGGCATAAGATATTCATGGATGCGGGATTTAGTCATTACAAGACAAGGCCTGTTTTGGGGTTTTTGGCCATCACTGAGCTCTATCCGTAGAAGGAATCCCAACATGTGTTTGCTTTTCAATATGCATGTTTTAGCTTGGGCCCAATAAAGTGAATATGCATGCCTCCATTGGTTTGCATATTTACTATGATCGGTTGAAAGTCCAAGATGGAAATTAATAAAGACAATACTTTAGCAAAAAAAAA] [+] EMBL CB096268 [AAACATCTTGGCTAGCAATTTCCATGGAGAAAATCCAAGTGACCACACCCATGGCAGACTCCTCGTTCAATCCGGAGTTTCTGCAAGCACATGCAGAGCTTTGGAATCTCACCTTTAGCTACCTGAAAGCCATGGCGCTTGAGTGTGCTATCAAGTTTGGGATCCCCAACGCCATTCATCGTTGTGGCGGTTCTGCCTCACTATCGGAACTGGTCATCTCCATTCCAGTGCCTGAGACTAGAAAGCCTCATCTGCCTCGCCTCATGAGGTTTCTTGCCGCGGTATGTGTTTTTTCCCTCGATAACCCAACTATTGATGAAGAGGTGACCGAGAAAGGCATGGGCATATACTGCCTCACACCATTGTCTCGCCTCCTTGTGGATGGTAGCATCGGTGGGCATGGAAGCTTCTCTCCGTTTGTGCTCTCCCAAACCACCAAGTATCATGTGTCTGCAGCTATGAATCTATCTGACTGGTTCATGACTGAGGACAAAGAGGTTGCCATAGAGATACCATTTAGGGCTGCTCATGGCACAGACTTGTGGGGTGNTATGAGTCGTGATGCTAACATGAATGGAGGTGTTCAATGCTGGCATGGGTTCCGATAGTCGTCTTGCAATCAATTTTATTATTAGCAAATGTGGTGAGGTGGTTGAGGGGATTAGCTCATTGGTTGATGNTGGGGGGGGGGACTGGCACAACAGCAAGAGCCATTGCTAANGCTTTTCCACATATCAAGNGCTCGGTACTGGATCTTTCCAATGTAATCGATACTATCACGGGNGGATGGCATAGTTGAGTTTNTTGCAGGGGGACATGATGGNACAAATNCCACC ACTGGATGCCGGGCTGCTCAAGGATATTCTACATGACTGGAACGATG ] [+] EMBL AK071201 [ AACATCTTGGCTAGCAATTTCCATGGAGAAAATCCAAGTGACCACACCCATGGCAGACTCCTCGTTCAATCCGGAGTTTCTGCAAGCACATGCAGAGCTTTGGAATCTCACCTTTAGCTACCTGAAAGCCATGGCGCTTGAGTGTGCTATCAAGCTTGGGATCCCCAACGCCATTCATCGTTGTGGTGGTTCTGCCTCACTATCGGAACTGGTCATCTCCATTCCAGTGCCTGAGACTAGAAAGCCTCATCTGCCTCGCCTCATGAGGTTTCTTGCCGCGGTAGGTGTTTTTTCCCTCGATAACCCAACTATTGATGAAGAGGTGACCGAGAAAGGCATGGGCATATACCGCCTCACACCATTGTCTCGCCTCCTTGTGGATGGTAGCATCGGTGGGCATGGAAGCCTCTCTCCGTTTGTGCTCTCCCAAACCACCAAGTATCATGTGTCTGCAGCTATGAATCTATCTGACTGGTTCATGACTGAGGACAAAGAGGTTGCCATAGAGATGCCATTTAGGGCTGCTCATGGCACAGACTTGTGGGGTGTTATGAGTCGTGATGCTAACATGAAT GAGGTGTTCAATGCTGGCATGGGTTCCGATAGTCGTCTTGCAATCAATTTTATTATTAGCAAATGTGGTGAGGTGTTTGAGGGGATTAGCTCATTGGTTGATG TTGGTGGTGGTACTGGCACAACAGCAAGAGACATTGCTAAGGCTTTCCCACATATCAAGTGCTCGGTACTGGATCTTCCAAATGTAATCGATACTATCAC GGTGGATGGCATAATTGAGTATATTGCA GGTGACATGATGGAACAAATCCCACCAACT GATGCCGTGCTGCTCAAGTATATTCTACATGACTGGTACGATGAGGATTGTGTAAAGATCCTAAAACAATGTAGAAATGCTATTCATGCTCAGAAGCCAGGAGGAAAAGTTATTATCATAGACATAGTGGTTGGATCCCCTTCTAAAGACATGTTTGAAGCTCAAGTTTCATTTGATCTATTGATGATGGTGATAACATCAGGCAAGGAACGTGATCAGCATGAATGGCATAAGATATTCATGGATGCGGGATTTAGTCATTACAAGACAAGGCCTGTTTTGGGGTTTTTGGCCATCACTGAGCTCTATCCGTAGAAGGAATCCCAACATGTGTTTGCTTTTCAATATGCATGTTTTAGCTTGGGCCCAATAAAGTGAATATGCATGCCTCCATTGGTTTGCATATTTACTATGATCGGTTGAAAGTCCAAGATGGAAATTAATAAAGACA ] [+] EMBL AA749564 [ AAGCACATGCAGAGCTTTGGAATCTCACCTTTAGCTACCTGAAAGCCAT GC CTTGAGTGTGCTATCAAGCTTGGGATCCCCAACGCCATTCATCGTTGTGGTGGTTCTG CTCACTATCGGAACTGGTCATCTCCATTCCAGTG CTGAGACTAGAAAG CTCATCTGCCTCG CTCATGAGTTT ] [-] EMBL CA759713 [ ggggATCAATTTTATTATTAGCAAATGTGNTGAGGTGTNTGAGGGGATTAGCTCGTTGGTTGATG TTGGTGGTGGTACTGGCACAACAGCAAGAGCCATTGCTAAGGCTTTCCCACATATCAAGTGCTCGGTACTGGATCTTCCAAATGTAATCGATACTATCAC GGTGGATGGCATAGTTGAGTATATTGCA GGTGACATGATGGAACAAATCCCACCAACT GATGCCGTGCTGCTCAAGTATATTCTACATGACTGGAACGATGAGGATTGTGTAAAGATCCTAAAACAATGTAGAAATGCTATTCATGCTCAGAAACCAGGAGGAAAAGTTATTATCATAGACATAGTGGTTGGATCCCCTTCTAAAGACATGTTTGAAGCTCAAGTTTCATTTGATCTATTGATGATGGTGATAACATCAGGCAAGGAACGTGATCAGCATGAATGGCATAAGATATTCATGGATGCGGGATTTAGTCATTACAAGACAAGGCCTGTTTTGGGGTTTTTGGCCATCACTGAGCTCTATCCGTAGAAGGAATCCCAACATGTGTTTGCTTTTCAATATGCATGTTTTAGCTTGGGCCCAATAAAGTGTATATGCATGCCTCTATTGGTTTGCATATTTACTATGATCAGTTGAAAGTCCAAGATGGAAATTAATAAAGACAATACTTTAGCAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||