These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6681#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 2627 fasta sequence [CTTGGGAGCTTCCTCATGGGTATGGCCGTGTTAAACCTGATGTTGTTGCGTATAGTCGTGATATAATGGGTTCAAAGATCAGCACAGGTTGTAAAACCCTTTCAGGCACCAGTGTTGCAAGCCCGGTGGTTGCTGGTGTAGTATGCTTGCTTGTTAGTGTTATACCAGAGGAGCATCGGAAATCCATCCTTAACCCTGCAACAATGAAACAAGCCCTTGTAGAGGGTGCTTCTAGGCTTTCAGGACCAAACATGTATGAGCAGGGCGCTGGCAAGATTGACCTCTGGCAATCATACGAAATCTTGAAAAGTTACCAACCGCGTGCAAGCATCTTTCCTAATACCCTTGACTTCACTGATTGTCCCTATTTCTGGCCTTTTTGCCGCCAACCTCTGTATGCTGGAGCTATGCCAGTGGTCTTCAATGCTACAATTCTGAACGGGATGGGGGTGATTGGTTATGTTAAGGATCCTCCTGTATGGCAGCCCTCTGAGGATGTCGGCAATATTCTTAGTGTTCACTTCACCTACTCAGATGTCATATGGCCTTGGACAGGTTATCTTGCCCTGCACTTACAAGTTAAAGATGAAGGATCTCAGTTTTCAGGCATAATCAGTGGCAAGGTCACATTGTCAATTTACAGCCCAGCAGCCCATGGGGAAAGCAGTCCACGAAGTAGTTCATGTGTTCTTTACCTGAAGGTCAAGGTGGTGCCAACACCTGTTAGGTCCAGAAGAATATTGTGGGACCAATTTCATAATATCAAATACCCATCTGGTTTTGTTCCAAGAGATTCACTTAATGTGCATAATGATATCCTTGACTGGCATGGCGATCACTTGCACACGAATTTTCATATACTGTTCAACATGCTGAGAGATGCAGGATACTACATTGAGACCCTTGGATCTCCACTTACCTGCTTTGATGCTAGCAATTATGGGACACTGCTTATGGTTGACCTTGAGGATGAGTACTTCAGTGAGGAGATTCAGAAACTTAAGGATGATGTTGTACACAAAGGGCTTGGCGTTGTTGTTTTTGCAGAGTGGTATCATGTCGACACAATGGTTAAGATGACATTCTTTGATGAAAATACACGCAGTTGGTGGACTCCAATTACTGGGGGTGCAAATGTTCCTGCACTTAATGAACTTTTGGCACCATTTGGCATTGCTTTTGGGGACAAAGTACTAAGTGGTGACTTCTCAATCAATGGTGAGCAGACCCACTATGCTTCTGGGACTGATATAGTGCAATTCCCAGCAGGAGGTTTTTTGCATAGCTTCCAACTCCAGGACAACTCTAAAATTTCTCAGGATAACTCAAGAAGCGCAGATACACAAAATACCCCAGATAAAAGCAAGCTCTCTTCTATTCTTGGAATGATGGAAGCAGGCAAAGGTCGGGTTGCAGTCTATGGAGATTCAAATTGCCTTGACAGTAGTCACATGGTAACAAACTGCTATTGGCTTTTGAGAAAACTTGTGGAGTTCACTGGCAATAGAATCAAAGATCCTGTTCTTTTCTCAGAATCTGCTCAGTTAAAATTTCCAGTTTTTGAGAGCATCCATCAACTGTCACGTAGACCAGATGTGAACTTCTCAACATATTCAACTGTCGTTGGCAATGAATTGATCTGTCACCAGGATTCCCGATTTGAGGTTTGGGGAACGAAAGGTTATGGTACCCAACAAACAGGCACAACAAGAAAGTTGCCAGAGTACCAGAAAAGTGAAGCTTACAACATTTCAACACCAATAGCTTCTGACAGCACACCAGATGAAGCTGGCCTGCAAAGAAATATTTCAACACCAATAGCTTCTAAGTTTGATAAAAGAATGGACTATTTTGGTTTTCTCGGGCACGAAGAGATTGACATAGGAATGCTAGTGGCAAGCCAATGGATGGTACCTTGCTTTGCTGCTACTGCCTGCCTTATGTTGTACCTAAGTTGCAGAGTGCAACAAAAGCGCCGACGACGAAAGAAGGGGTCAACAGCTGCTAGATTGTCAAGTATGGACCGTATGGTCTAACATGACATACACACACTGTTGGGGGCCAGGATGAATATATGAATTTCGGCACTCGCATTGCAAACCTTCATGGGAATATACAGTTCGCTCCATATACAACAGAGTGGACAGGACGTGGTGAGCTTGAGTTATACCGGAATTTCCAGATCCTGTTTTCAGCTCGCAACGGGAGGCCTCTTGTCTTGAGGCACAATTTTTGCACCGTGACTGGAGGCACATGGCTC--ATTTTTTTTCTGAGCAAGGAGCTGATTCAGCTGTTCGGCAGCAGCATGGAGAGGTAT-TTCCAC-TTCAATTTCAGAT-GGTGCGTATTGACATGATGTTGTT-TGTAGTTC-GTC--AAT-TTTGCCAATGTAATAATACGTTAAT-T-TTGACGCACGATCACTGAGCTAATTCC-TTTAGGAAGGGA-CTAGAGCTAACTATTTCATTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGTCTGAAAGTGAAGGGTTTCGATCGTCTCTGTAGATCGGTTAGCTTGAGCTGCTTGTAAG-TATAGAAGAGGAAAAGGCTGTTTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGCCAGCAAGTCATTTTCAAGTTATTTCTTCAGAAAAA] [+] EMBL AK071415 [CTTGGGAGCTTCCTCATGGGTATGGCCGTGTTAAACCTGATGTTGTTGCGTATAGTCGTGATATAATGGGTTCAAAGATCAGCACAGGTTGTAAAACCCTTTCAGGCACCAGTGTTGCAAGCCCGGTGGTTGCTGGTGTAGTATGCTTGCTTGTTAGTGTTATACCAGAGGAGCATCGGAAATCCATCCTTAACCCTGCAACAATGAAACAAGCCCTTGTAGAGGGTGCTTCTAGGCTTTCAGGACCAAACATGTATGAGCAGGGCGCTGGCAAGATTGACCTCTGGCAATCATACGAAATCTTGAAAAGTTACCAACCGCGTGCAAGCATCTTTCCTAATACCCTTGACTTCACTGATTGTCCCTATTTCTGGCCTTTTTGCCGCCAACCTCTGTATGCTGGAGCTATGCCAGTGGTCTTCAATGCTACAATTCTGAACGGGATGGGGGTGATTGGTTATGTTAAGGATCCTCCTGTATGGCAGCCCTCTGAGGATGTCGGCAATATTCTTAGTGTTCACTTCACCTACTCAGATGTCATATGGCCTTGGACAGGTTATCTTGCCCTGCACTTACAAGTTAAAGATGAAGGATCTCAGTTTTCAGGCATAATCAGTGGCAAGGTCACATTGTCAATTTACAGCCCAGCAGCCCATGGGGAAAGCAGTCCACGAAGTAGTTCATGTGTTCTTTACCTGAAGGTCAAGGTGGTGCCAACACCTGTTAGGTCCAGAAGAATATTGTGGGACCAATTTCATAATATCAAATACCCATCTGGTTTTGTTCCAAGAGATTCACTTAATGTGCATAATGATATCCTTGACTGGCATGGCGATCACTTGCACACGAATTTTCATATACTGTTCAACATGCTGAGAGATGCAGGATACTACATTGAGACCCTTGGATCTCCACTTACCTGCTTTGATGCTAGCAATTATGGGACACTGCTTATGGTTGACCTTGAGGATGAGTACTTCAGTGAGGAGATTCAGAAACTTAAGGATGATGTTGTACACAAAGGGCTTGGCGTTGTTGTTTTTGCAGAGTGGTATCATGTCGACACAATGGTTAAGATGACATTCTTTGATGAAAATACACGCAGTTGGTGGACTCCAATTACTGGGGGTGCAAATGTTCCTGCACTTAATGAACTTTTGGCACCATTTGGCATTGCTTTTGGGGACAAAGTACTAAGTGGTGACTTCTCAATCAATGGTGAGCAGACCCACTATGCTTCTGGGACTGATATAGTGCAATTCCCAGCAGGAGGTTTTTTGCATAGCTTCCAACTCCAGGACAACTCTAAAATTTCTCAGGATAACTCAAGAAGCGCAGATACACAAAATACCCCAGATAAAAGCAAGCTCTCTTCTATTCTTGGAATGATGGAAGCAGGCAAAGGTCGGGTTGCAGTCTATGGAGATTCAAATTGCCTTGACAGTAGTCACATGGTAACAAACTGCTATTGGCTTTTGAGAAAACTTGTGGAGTTCACTGGCAATAGAATCAAAGATCCTGTTCTTTTCTCAGAATCTGCTCAGTTAAAATTTCCAGTTTTTGAGAGCATCCATCAACTGTCACGTAGACCAGATGTGAACTTCTCAACATATTCAACTGTCGTTGGCAATGAATTGATCTGTCACCAGGATTCCCGATTTGAGGTTTGGGGAACGAAAGGTTATGGTACCCAACAAACAGGCACAACAAGAAAGTTGCCAGAGTACCAGAAAAGTGAAGCTTACAACATTTCAACACCAATAGCTTCTGACAGCACACCAGATGAAGCTGGCCTGCAAAGAAATATTTCAACACCAATAGCTTCTAAGTTTGATAAAAGAATGGACTATTTTGGTTTTCTCGGGCACGAAGAGATTGACATAGGAATGCTAGTGGCAAGCCAATGGATGGTACCTTGCTTTGCTGCTACTGCCTGCCTTATGTTGTACCTAAGTTGCAGAGTGCAACAAAAGCGCCGACGACGAAAGAAGGGGTCAACAGCTGCTAGATTGTCAAGTATGGACCGTATGGTCTAACATGACATACACACACTGTTGGGGGCCAGGATGAATATATGAATTTCGGCACTCGCATTGCAAACCTTCATGGGAATATACAGTTCGCTCCATATACAACAGAGTGGACAGGACGTGGTGAGCTTGAGTTATACCGGAATTTCCAGATCCTGTTTTCAGCTCGCAACGGGAGGCCTCTTGTCTTGAGGCACAATTTTTGCACCGTGACTGGAGGCACATGGCTC ATTTTTTTTCTGAGCAAGGAGCTGATTCAGCTGTTCGGCAGCAGCATGGAGAGGTAT TTCCAC TTCAATTTCAGAT GGTGCGTATTGACATGATGTTGTT TGTAGTTC GTC AAT TTTGCCAATGTAATAATACGTTAAT T TTGACGCACGATCACTGAGCTAATTCC TTTAGGAAGGGA CTAGAGCTAACTATTTCATTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGTCTGAAAGTGAAGGGTTTCGATCGTCTCTGTAGATCGGTTAGCTTGAGCTGCTTGTAAG TATAGAAGAGGAAAAGGCTGTTTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGCCAGCAAGTCATTTTCAAG ] [+] EMBL CB676415 [ TTGGATCTCCACTTACCTGCTTTGATGCTAGCAATTATGGGACACTGCTTATGGTTGACCTTGAGGATGAGTACTTCAGTGAGGAGATTCAGAAACTTAAGGATGATGTTGTACACAAAGGGCTTGGCGTTGTTGTTTTTGCAGAGTGGTATCATGTCGACACAATGGTTAAGATGACATTCTTTGATGAAAATACACGCAGTTGGTGGACTCCAATTACTGGGGGTGCAAATGTTCCTGCACTTAATGAACTTTTGGCACCATTTGGCATTGCTTTTGGGGACAAAGTACTAAGTGGTGACTTCTCAATCAATGGTGAGCAGACCCACTATGCTTCTGGGACTGATATAGTGCAATTCCCAGCAGGAGGTTTTTTGCATAGCTTCCAACTCCAGGACAACTCTAAAATTTCTCAGGATAACTCAAGAAGCGCAGATACACAAAATACCCCAGATAAAAGCAAGCTCTCTTCTATTCTTGGAATGATGGAAGCAGGCAAAGGTCGGGTTGCAGTCTATGGAGATTCAAATTGCCTTGACAGTAGTCACATGGTAACAAACTGCTATTGGCTTTTGAGAAAACTTGTGGAGTTCACTGGCAATAGAATCAAAGATCCTGTTCTTTTCTCAGAATCTGCTCAGTTAAAATTTCCAGTTTTTGAGAGCATCCATCAACTGTCACGTAGACCAGATGTGAACTTCTCAACATATTCAACTGTCGTTGGCAATGAATTGATCTGTCACCAGGATTCCCGATTTG ] [-] EMBL CB676416 [ ACATAGGAATGCTAGTGGCAAGCCAATGGATGGTACCTTGCTTTGCTGCTACTGCCTGCCTTATGTTGTACCTAAGTTGCAGAGTGCAACAAAAGCGCCGACGACGAAAGAAGGGGTCAACAGCTGCTAGATTGTCAAGTATGGACCGTATGGTCTAACATGACATACACACACTGTTGGGGGCCAGGATGAATATATGAATTTCGGCACTCGCATTGCAAACCTTCATGGGAATATACAGTTCGCTCCATATACAACAGAGTGGACAGGACGTGGTGAGCTTGAGTTATACCGGAATTTCCAGATCCTGTTTTCAGCTCGCAACGGGAGGCCTCTTGTCTTGAGGCACAATTTTTGCACCGTGACTGGAGGCACATGGCTCATATTTTTTTTCTGAGCAAGGAGCTGATTCAGCTGTTCGGCAGCAGCATGGAGAGGTAT TTCCAC TTCAATTTCAGAT GGTGCGTATTGACATGATGTTGTT TGTAGTTC GTCAAAAT TTTGCCAATGTAATAATACGTTAAT T TTGACGCACGATCACTGAGCTAATTCC TTTAGGAAGGGA CTAGAGCTAACTATTTCATTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGTCTGAAAGTGAAGGGTTTCGATCGTCTCTGTAGATCGGTTAGCTTGAGCTGCTTGTAAG TATAGAAGAGGAAAAGGCTGTTTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGCCAGCAAGTCATTTTCAAGT ] [+] EMBL BM419990 [ GTATNTTCCACATTCAATTTCAGATCGGTGCGTATTGACATGATGTTGTTGTGTAGTTCTGTCCAAATCTTTGCCAATGTAATAATACGTTAATCTCTTGACGCACGATCACTGAGCTAATTCCATTTAGGAAGGGATCTAGAGCTAACTATTTCATTCTTTGNTACCTTTTTACTCCGGATNTCTGAAA TGAA GGTTTCGATCGTCTCTNTAGATCGGTTAGCTTGA CTGCTTGTAAGCTATAGAAGAGGAAAAGGCTGTTTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGCCAGCAAGTCATTTTCAAGTTATTTCTTCAGAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||