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Oryza sativa
cluster # 6681 cluster # 6681       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6681#0 length = 2627 sequences # 4  

consensusID : consensus_6681#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 2627
fasta sequence
                              [CTTGGGAGCTTCCTCATGGGTATGGCCGTGTTAAACCTGATGTTGTTGCGTATAGTCGTGATATAATGGGTTCAAAGATCAGCACAGGTTGTAAAACCCTTTCAGGCACCAGTGTTGCAAGCCCGGTGGTTGCTGGTGTAGTATGCTTGCTTGTTAGTGTTATACCAGAGGAGCATCGGAAATCCATCCTTAACCCTGCAACAATGAAACAAGCCCTTGTAGAGGGTGCTTCTAGGCTTTCAGGACCAAACATGTATGAGCAGGGCGCTGGCAAGATTGACCTCTGGCAATCATACGAAATCTTGAAAAGTTACCAACCGCGTGCAAGCATCTTTCCTAATACCCTTGACTTCACTGATTGTCCCTATTTCTGGCCTTTTTGCCGCCAACCTCTGTATGCTGGAGCTATGCCAGTGGTCTTCAATGCTACAATTCTGAACGGGATGGGGGTGATTGGTTATGTTAAGGATCCTCCTGTATGGCAGCCCTCTGAGGATGTCGGCAATATTCTTAGTGTTCACTTCACCTACTCAGATGTCATATGGCCTTGGACAGGTTATCTTGCCCTGCACTTACAAGTTAAAGATGAAGGATCTCAGTTTTCAGGCATAATCAGTGGCAAGGTCACATTGTCAATTTACAGCCCAGCAGCCCATGGGGAAAGCAGTCCACGAAGTAGTTCATGTGTTCTTTACCTGAAGGTCAAGGTGGTGCCAACACCTGTTAGGTCCAGAAGAATATTGTGGGACCAATTTCATAATATCAAATACCCATCTGGTTTTGTTCCAAGAGATTCACTTAATGTGCATAATGATATCCTTGACTGGCATGGCGATCACTTGCACACGAATTTTCATATACTGTTCAACATGCTGAGAGATGCAGGATACTACATTGAGACCCTTGGATCTCCACTTACCTGCTTTGATGCTAGCAATTATGGGACACTGCTTATGGTTGACCTTGAGGATGAGTACTTCAGTGAGGAGATTCAGAAACTTAAGGATGATGTTGTACACAAAGGGCTTGGCGTTGTTGTTTTTGCAGAGTGGTATCATGTCGACACAATGGTTAAGATGACATTCTTTGATGAAAATACACGCAGTTGGTGGACTCCAATTACTGGGGGTGCAAATGTTCCTGCACTTAATGAACTTTTGGCACCATTTGGCATTGCTTTTGGGGACAAAGTACTAAGTGGTGACTTCTCAATCAATGGTGAGCAGACCCACTATGCTTCTGGGACTGATATAGTGCAATTCCCAGCAGGAGGTTTTTTGCATAGCTTCCAACTCCAGGACAACTCTAAAATTTCTCAGGATAACTCAAGAAGCGCAGATACACAAAATACCCCAGATAAAAGCAAGCTCTCTTCTATTCTTGGAATGATGGAAGCAGGCAAAGGTCGGGTTGCAGTCTATGGAGATTCAAATTGCCTTGACAGTAGTCACATGGTAACAAACTGCTATTGGCTTTTGAGAAAACTTGTGGAGTTCACTGGCAATAGAATCAAAGATCCTGTTCTTTTCTCAGAATCTGCTCAGTTAAAATTTCCAGTTTTTGAGAGCATCCATCAACTGTCACGTAGACCAGATGTGAACTTCTCAACATATTCAACTGTCGTTGGCAATGAATTGATCTGTCACCAGGATTCCCGATTTGAGGTTTGGGGAACGAAAGGTTATGGTACCCAACAAACAGGCACAACAAGAAAGTTGCCAGAGTACCAGAAAAGTGAAGCTTACAACATTTCAACACCAATAGCTTCTGACAGCACACCAGATGAAGCTGGCCTGCAAAGAAATATTTCAACACCAATAGCTTCTAAGTTTGATAAAAGAATGGACTATTTTGGTTTTCTCGGGCACGAAGAGATTGACATAGGAATGCTAGTGGCAAGCCAATGGATGGTACCTTGCTTTGCTGCTACTGCCTGCCTTATGTTGTACCTAAGTTGCAGAGTGCAACAAAAGCGCCGACGACGAAAGAAGGGGTCAACAGCTGCTAGATTGTCAAGTATGGACCGTATGGTCTAACATGACATACACACACTGTTGGGGGCCAGGATGAATATATGAATTTCGGCACTCGCATTGCAAACCTTCATGGGAATATACAGTTCGCTCCATATACAACAGAGTGGACAGGACGTGGTGAGCTTGAGTTATACCGGAATTTCCAGATCCTGTTTTCAGCTCGCAACGGGAGGCCTCTTGTCTTGAGGCACAATTTTTGCACCGTGACTGGAGGCACATGGCTC--ATTTTTTTTCTGAGCAAGGAGCTGATTCAGCTGTTCGGCAGCAGCATGGAGAGGTAT-TTCCAC-TTCAATTTCAGAT-GGTGCGTATTGACATGATGTTGTT-TGTAGTTC-GTC--AAT-TTTGCCAATGTAATAATACGTTAAT-T-TTGACGCACGATCACTGAGCTAATTCC-TTTAGGAAGGGA-CTAGAGCTAACTATTTCATTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGTCTGAAAGTGAAGGGTTTCGATCGTCTCTGTAGATCGGTTAGCTTGAGCTGCTTGTAAG-TATAGAAGAGGAAAAGGCTGTTTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGCCAGCAAGTCATTTTCAAGTTATTTCTTCAGAAAAA]

[+] EMBL AK071415             [CTTGGGAGCTTCCTCATGGGTATGGCCGTGTTAAACCTGATGTTGTTGCGTATAGTCGTGATATAATGGGTTCAAAGATCAGCACAGGTTGTAAAACCCTTTCAGGCACCAGTGTTGCAAGCCCGGTGGTTGCTGGTGTAGTATGCTTGCTTGTTAGTGTTATACCAGAGGAGCATCGGAAATCCATCCTTAACCCTGCAACAATGAAACAAGCCCTTGTAGAGGGTGCTTCTAGGCTTTCAGGACCAAACATGTATGAGCAGGGCGCTGGCAAGATTGACCTCTGGCAATCATACGAAATCTTGAAAAGTTACCAACCGCGTGCAAGCATCTTTCCTAATACCCTTGACTTCACTGATTGTCCCTATTTCTGGCCTTTTTGCCGCCAACCTCTGTATGCTGGAGCTATGCCAGTGGTCTTCAATGCTACAATTCTGAACGGGATGGGGGTGATTGGTTATGTTAAGGATCCTCCTGTATGGCAGCCCTCTGAGGATGTCGGCAATATTCTTAGTGTTCACTTCACCTACTCAGATGTCATATGGCCTTGGACAGGTTATCTTGCCCTGCACTTACAAGTTAAAGATGAAGGATCTCAGTTTTCAGGCATAATCAGTGGCAAGGTCACATTGTCAATTTACAGCCCAGCAGCCCATGGGGAAAGCAGTCCACGAAGTAGTTCATGTGTTCTTTACCTGAAGGTCAAGGTGGTGCCAACACCTGTTAGGTCCAGAAGAATATTGTGGGACCAATTTCATAATATCAAATACCCATCTGGTTTTGTTCCAAGAGATTCACTTAATGTGCATAATGATATCCTTGACTGGCATGGCGATCACTTGCACACGAATTTTCATATACTGTTCAACATGCTGAGAGATGCAGGATACTACATTGAGACCCTTGGATCTCCACTTACCTGCTTTGATGCTAGCAATTATGGGACACTGCTTATGGTTGACCTTGAGGATGAGTACTTCAGTGAGGAGATTCAGAAACTTAAGGATGATGTTGTACACAAAGGGCTTGGCGTTGTTGTTTTTGCAGAGTGGTATCATGTCGACACAATGGTTAAGATGACATTCTTTGATGAAAATACACGCAGTTGGTGGACTCCAATTACTGGGGGTGCAAATGTTCCTGCACTTAATGAACTTTTGGCACCATTTGGCATTGCTTTTGGGGACAAAGTACTAAGTGGTGACTTCTCAATCAATGGTGAGCAGACCCACTATGCTTCTGGGACTGATATAGTGCAATTCCCAGCAGGAGGTTTTTTGCATAGCTTCCAACTCCAGGACAACTCTAAAATTTCTCAGGATAACTCAAGAAGCGCAGATACACAAAATACCCCAGATAAAAGCAAGCTCTCTTCTATTCTTGGAATGATGGAAGCAGGCAAAGGTCGGGTTGCAGTCTATGGAGATTCAAATTGCCTTGACAGTAGTCACATGGTAACAAACTGCTATTGGCTTTTGAGAAAACTTGTGGAGTTCACTGGCAATAGAATCAAAGATCCTGTTCTTTTCTCAGAATCTGCTCAGTTAAAATTTCCAGTTTTTGAGAGCATCCATCAACTGTCACGTAGACCAGATGTGAACTTCTCAACATATTCAACTGTCGTTGGCAATGAATTGATCTGTCACCAGGATTCCCGATTTGAGGTTTGGGGAACGAAAGGTTATGGTACCCAACAAACAGGCACAACAAGAAAGTTGCCAGAGTACCAGAAAAGTGAAGCTTACAACATTTCAACACCAATAGCTTCTGACAGCACACCAGATGAAGCTGGCCTGCAAAGAAATATTTCAACACCAATAGCTTCTAAGTTTGATAAAAGAATGGACTATTTTGGTTTTCTCGGGCACGAAGAGATTGACATAGGAATGCTAGTGGCAAGCCAATGGATGGTACCTTGCTTTGCTGCTACTGCCTGCCTTATGTTGTACCTAAGTTGCAGAGTGCAACAAAAGCGCCGACGACGAAAGAAGGGGTCAACAGCTGCTAGATTGTCAAGTATGGACCGTATGGTCTAACATGACATACACACACTGTTGGGGGCCAGGATGAATATATGAATTTCGGCACTCGCATTGCAAACCTTCATGGGAATATACAGTTCGCTCCATATACAACAGAGTGGACAGGACGTGGTGAGCTTGAGTTATACCGGAATTTCCAGATCCTGTTTTCAGCTCGCAACGGGAGGCCTCTTGTCTTGAGGCACAATTTTTGCACCGTGACTGGAGGCACATGGCTC  ATTTTTTTTCTGAGCAAGGAGCTGATTCAGCTGTTCGGCAGCAGCATGGAGAGGTAT TTCCAC TTCAATTTCAGAT GGTGCGTATTGACATGATGTTGTT TGTAGTTC GTC  AAT TTTGCCAATGTAATAATACGTTAAT T TTGACGCACGATCACTGAGCTAATTCC TTTAGGAAGGGA CTAGAGCTAACTATTTCATTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGTCTGAAAGTGAAGGGTTTCGATCGTCTCTGTAGATCGGTTAGCTTGAGCTGCTTGTAAG TATAGAAGAGGAAAAGGCTGTTTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGCCAGCAAGTCATTTTCAAG                 ]
[+] EMBL CB676415             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTGGATCTCCACTTACCTGCTTTGATGCTAGCAATTATGGGACACTGCTTATGGTTGACCTTGAGGATGAGTACTTCAGTGAGGAGATTCAGAAACTTAAGGATGATGTTGTACACAAAGGGCTTGGCGTTGTTGTTTTTGCAGAGTGGTATCATGTCGACACAATGGTTAAGATGACATTCTTTGATGAAAATACACGCAGTTGGTGGACTCCAATTACTGGGGGTGCAAATGTTCCTGCACTTAATGAACTTTTGGCACCATTTGGCATTGCTTTTGGGGACAAAGTACTAAGTGGTGACTTCTCAATCAATGGTGAGCAGACCCACTATGCTTCTGGGACTGATATAGTGCAATTCCCAGCAGGAGGTTTTTTGCATAGCTTCCAACTCCAGGACAACTCTAAAATTTCTCAGGATAACTCAAGAAGCGCAGATACACAAAATACCCCAGATAAAAGCAAGCTCTCTTCTATTCTTGGAATGATGGAAGCAGGCAAAGGTCGGGTTGCAGTCTATGGAGATTCAAATTGCCTTGACAGTAGTCACATGGTAACAAACTGCTATTGGCTTTTGAGAAAACTTGTGGAGTTCACTGGCAATAGAATCAAAGATCCTGTTCTTTTCTCAGAATCTGCTCAGTTAAAATTTCCAGTTTTTGAGAGCATCCATCAACTGTCACGTAGACCAGATGTGAACTTCTCAACATATTCAACTGTCGTTGGCAATGAATTGATCTGTCACCAGGATTCCCGATTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CB676416             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACATAGGAATGCTAGTGGCAAGCCAATGGATGGTACCTTGCTTTGCTGCTACTGCCTGCCTTATGTTGTACCTAAGTTGCAGAGTGCAACAAAAGCGCCGACGACGAAAGAAGGGGTCAACAGCTGCTAGATTGTCAAGTATGGACCGTATGGTCTAACATGACATACACACACTGTTGGGGGCCAGGATGAATATATGAATTTCGGCACTCGCATTGCAAACCTTCATGGGAATATACAGTTCGCTCCATATACAACAGAGTGGACAGGACGTGGTGAGCTTGAGTTATACCGGAATTTCCAGATCCTGTTTTCAGCTCGCAACGGGAGGCCTCTTGTCTTGAGGCACAATTTTTGCACCGTGACTGGAGGCACATGGCTCATATTTTTTTTCTGAGCAAGGAGCTGATTCAGCTGTTCGGCAGCAGCATGGAGAGGTAT TTCCAC TTCAATTTCAGAT GGTGCGTATTGACATGATGTTGTT TGTAGTTC GTCAAAAT TTTGCCAATGTAATAATACGTTAAT T TTGACGCACGATCACTGAGCTAATTCC TTTAGGAAGGGA CTAGAGCTAACTATTTCATTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGTCTGAAAGTGAAGGGTTTCGATCGTCTCTGTAGATCGGTTAGCTTGAGCTGCTTGTAAG TATAGAAGAGGAAAAGGCTGTTTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGCCAGCAAGTCATTTTCAAGT                ]
[+] EMBL BM419990             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTATNTTCCACATTCAATTTCAGATCGGTGCGTATTGACATGATGTTGTTGTGTAGTTCTGTCCAAATCTTTGCCAATGTAATAATACGTTAATCTCTTGACGCACGATCACTGAGCTAATTCCATTTAGGAAGGGATCTAGAGCTAACTATTTCATTCTTTGNTACCTTTTTACTCCGGATNTCTGAAA TGAA GGTTTCGATCGTCTCTNTAGATCGGTTAGCTTGA CTGCTTGTAAGCTATAGAAGAGGAAAAGGCTGTTTCTTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGCCAGCAAGTCATTTTCAAGTTATTTCTTCAGAAAAA]


>consensus_6681#0 CTTGGGAGCTTCCTCATGGGTATGGCCGTGTTAAACCTGATGTTGTTGCGTATAGTCGTG ATATAATGGGTTCAAAGATCAGCACAGGTTGTAAAACCCTTTCAGGCACCAGTGTTGCAA GCCCGGTGGTTGCTGGTGTAGTATGCTTGCTTGTTAGTGTTATACCAGAGGAGCATCGGA AATCCATCCTTAACCCTGCAACAATGAAACAAGCCCTTGTAGAGGGTGCTTCTAGGCTTT CAGGACCAAACATGTATGAGCAGGGCGCTGGCAAGATTGACCTCTGGCAATCATACGAAA TCTTGAAAAGTTACCAACCGCGTGCAAGCATCTTTCCTAATACCCTTGACTTCACTGATT GTCCCTATTTCTGGCCTTTTTGCCGCCAACCTCTGTATGCTGGAGCTATGCCAGTGGTCT TCAATGCTACAATTCTGAACGGGATGGGGGTGATTGGTTATGTTAAGGATCCTCCTGTAT GGCAGCCCTCTGAGGATGTCGGCAATATTCTTAGTGTTCACTTCACCTACTCAGATGTCA TATGGCCTTGGACAGGTTATCTTGCCCTGCACTTACAAGTTAAAGATGAAGGATCTCAGT TTTCAGGCATAATCAGTGGCAAGGTCACATTGTCAATTTACAGCCCAGCAGCCCATGGGG AAAGCAGTCCACGAAGTAGTTCATGTGTTCTTTACCTGAAGGTCAAGGTGGTGCCAACAC CTGTTAGGTCCAGAAGAATATTGTGGGACCAATTTCATAATATCAAATACCCATCTGGTT TTGTTCCAAGAGATTCACTTAATGTGCATAATGATATCCTTGACTGGCATGGCGATCACT TGCACACGAATTTTCATATACTGTTCAACATGCTGAGAGATGCAGGATACTACATTGAGA CCCTTGGATCTCCACTTACCTGCTTTGATGCTAGCAATTATGGGACACTGCTTATGGTTG ACCTTGAGGATGAGTACTTCAGTGAGGAGATTCAGAAACTTAAGGATGATGTTGTACACA AAGGGCTTGGCGTTGTTGTTTTTGCAGAGTGGTATCATGTCGACACAATGGTTAAGATGA CATTCTTTGATGAAAATACACGCAGTTGGTGGACTCCAATTACTGGGGGTGCAAATGTTC CTGCACTTAATGAACTTTTGGCACCATTTGGCATTGCTTTTGGGGACAAAGTACTAAGTG GTGACTTCTCAATCAATGGTGAGCAGACCCACTATGCTTCTGGGACTGATATAGTGCAAT TCCCAGCAGGAGGTTTTTTGCATAGCTTCCAACTCCAGGACAACTCTAAAATTTCTCAGG ATAACTCAAGAAGCGCAGATACACAAAATACCCCAGATAAAAGCAAGCTCTCTTCTATTC TTGGAATGATGGAAGCAGGCAAAGGTCGGGTTGCAGTCTATGGAGATTCAAATTGCCTTG ACAGTAGTCACATGGTAACAAACTGCTATTGGCTTTTGAGAAAACTTGTGGAGTTCACTG GCAATAGAATCAAAGATCCTGTTCTTTTCTCAGAATCTGCTCAGTTAAAATTTCCAGTTT TTGAGAGCATCCATCAACTGTCACGTAGACCAGATGTGAACTTCTCAACATATTCAACTG TCGTTGGCAATGAATTGATCTGTCACCAGGATTCCCGATTTGAGGTTTGGGGAACGAAAG GTTATGGTACCCAACAAACAGGCACAACAAGAAAGTTGCCAGAGTACCAGAAAAGTGAAG CTTACAACATTTCAACACCAATAGCTTCTGACAGCACACCAGATGAAGCTGGCCTGCAAA GAAATATTTCAACACCAATAGCTTCTAAGTTTGATAAAAGAATGGACTATTTTGGTTTTC TCGGGCACGAAGAGATTGACATAGGAATGCTAGTGGCAAGCCAATGGATGGTACCTTGCT TTGCTGCTACTGCCTGCCTTATGTTGTACCTAAGTTGCAGAGTGCAACAAAAGCGCCGAC GACGAAAGAAGGGGTCAACAGCTGCTAGATTGTCAAGTATGGACCGTATGGTCTAACATG ACATACACACACTGTTGGGGGCCAGGATGAATATATGAATTTCGGCACTCGCATTGCAAA CCTTCATGGGAATATACAGTTCGCTCCATATACAACAGAGTGGACAGGACGTGGTGAGCT TGAGTTATACCGGAATTTCCAGATCCTGTTTTCAGCTCGCAACGGGAGGCCTCTTGTCTT GAGGCACAATTTTTGCACCGTGACTGGAGGCACATGGCTCATTTTTTTTCTGAGCAAGGA GCTGATTCAGCTGTTCGGCAGCAGCATGGAGAGGTATTTCCACTTCAATTTCAGATGGTG CGTATTGACATGATGTTGTTTGTAGTTCGTCAATTTTGCCAATGTAATAATACGTTAATT TTGACGCACGATCACTGAGCTAATTCCTTTAGGAAGGGACTAGAGCTAACTATTTCATTC TTTGTTACCTTTTTACTCCGGATGTCTGAAAGTGAAGGGTTTCGATCGTCTCTGTAGATC GGTTAGCTTGAGCTGCTTGTAAGTATAGAAGAGGAAAAGGCTGTTTCTTTGTTACCTTTT TACTCCGGATGCCAGCAAGTCATTTTCAAGTTATTTCTTCAGAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)