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Oryza sativa
cluster # 6829 cluster # 6829       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6829#0 length = 1133 sequences # 4  
consensusID : consensus_6829#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1133
fasta sequence 
                              [CTCCACTTCCTCCTCTCATCGAAGCTAGCTGATCTGCCATGGACGCTCTCTCCTGCCTGGCGCCGCACGCCGCGCTGCTGCCGTGCGCGGCCTTCACCGACGCCGACATCACGCGCGCGCTCCACTTCTCCTCCTCCATGCCCGACACCTCCTCCTCACCCTCCTCATCCTCCTCCGCGGCCTTCCTCGCCGACTTCTGCGGTGGTGGCGCCGGAGGAGGGTTCGTGGTGTCGGCGCCGCCACCGACGATGCCGGCGATCACCTGCGAGTCCGTTCTCGTGGCCGACAGCGCGCGCCCGTCGCCGGCCGGGCCTGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGCTGGGGCTGGGCCCCGCGGGTGGGCGCGCCGGGAAGCGGCGGTCGCGGGCGTCGAAGCGCGCGCCGACCACCTACATCAGCACCGACCCGGCCAACTTCCGCCTCATGGTGCAGCACGTCACCGGCGTCCAGGCCGACCCCGCCTCCCTCGCCGACGGCGCCGCCGGCATCCTTCCCACCACCACCACCACTGCGCCGTTCGACGCCTCCTCCGGCCTCCACATGCTCGACACCTTCGCCGCCGCCAACCCGCTGCTGCAAGCCGAGCAAGCGGCGGCGCTTCAGCAGCAGCCGTGCTTCCCCACGCTGGACTCGTCGTGGAGCGCCGTCATGTACGATGGCAGCGACCTCCTCTGAGCATTCCTTCATTCCCAGCTGCTGCTGCTGCACTGCAGTGCCAACACTAGTTAATTAGGACGCCGCCGCCGACGACGACGACATAGCTAGTAGATTTCTTGCTCTCGATCGCAGTGGCCGGCCTAGCTAGCTCTACATCGATCGATCAATCCACTACCATTTCTTACTTGATTAGTTTGTCGTTGGAGCCAAGATCGTATCGATGATGCTCGCTTGATCAGGTTAAGTTGTTGAGTTACTGTAGGGTGTTACTACTAGTATTATTGTACAGCTAGCGCATTATGCATGTCATGTCGTCGTCCGTCGGTCAAACGGAGTGTG-GCTGCTATATATGCCCACATTTTATGCAGTAGTAGCTGTCTATAGCTGATCTCAGTTAATTTAATTTGTACTACGTGTATGTCAAAGCTAATTAGTCAGCAGTAAAACATCAGAAAA]

[+] EMBL AK108527             [CTCCACTTCCTCCTCTCATCGAAGCTAGCTGATCTGCCATGGACGCTCTCTCCTGCCTGGCGCCGCACGCCGCGCTGCTGCCGTGCGCGGCCTTCACCGACGCCGACATCACGCGCGCGCTCCACTTCTCCTCCTCCATGCCCGACACCTCCTCCTCACCCTCCTCATCCTCCTCCGCGGCCTTCCTCGCCGACTTCTGCGGTGGTGGCGCCGGAGGAGGGTTCGTGGTGTCGGCGCCGCCACCGACGATGCCGGCGATCACCTGCGAGTCCGTTCTCGTGGCCGACAGCGCGCGCCCGTCGCCGGCCGGGCCTGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGCTGGGGCTGGGCCCCGCGGGTGGGCGCGCCGGGAAGCGGCGGTCGCGGGCGTCGAAGCGCGCGCCGACCACCTACATCAGCACCGACCCGGCCAACTTCCGCCTCATGGTGCAGCACGTCACCGGCGTCCAGGCCGACCCCGCCTCCCTCGCCGACGGCGCCGCCGGCATCCTTCCCACCACCACCACCACTGCGCCGTTCGACGCCTCCTCCGGCCTCCACATGCTCGACACCTTCGCCGCCGCCAACCCGCTGCTGCAAGCCGAGCAAGCGGCGGCGCTTCAGCAGCAGCCGTGCTTCCCCACGCTGGACTCGTCGTGGAGCGCCGTCATGTACGATGGCAGCGACCTCCTCTGAGCATTCCTTCATTCCCAGCTGCTGCTGCTGCACTGCAGTGCCAACACTAGTTAATTAGGACGCCGCCGCCGACGACGACGACATAGCTAGTAGATTTCTTGCTCTCGATCGCAGTGGCCGGCCTAGCTAGCTCTACATCGATCGATCAATCCACTACCATTTCTTACTTGATTAGTTTGTCGTTGGAGCCAAGATCGTATCGATGATGCTCGCTTGATCAGGTTAAGTTGTTGAGTTACTGTAGGGTGTTACTACTAGTATTATTGTACAGCTAGCGCATTATGCATGTCATGTCGTCGTCCGTCGGTCAAACGGAGTGTG GCTGCTATATATGCCCACATTTTATGCAGTAGTAGCTGTCTATAGCTGATCTCAGTTAATTTAATTTGTACTACGTGTATGTCAAAGCTAATTAGTCAGCAGTAAAACATCAG    ]
[+] EMBL AU183230             [           CCTCTCATCGAAGCTAGCTGATCTGCCATGGACGCTCTCTCCTGCCTGGCGCCGCACGCCGCGCTGCTGCCGTGCGCGGCCTTCACCGACGCCGACATCACGCGCGCGCTCCACTTCTCCTCCTCCATGCCCGACACCTCCTCCTCACCCTCCTCATCCTCCTCCGCGGCCTTCCTCGCCGACTTCTGCGGTGGTGGCGCCGGAGGAGGGTTCGTGGTGTCGGCGCCGCCACCGACGATGCCGGCGATCACCTGCGAGTCCGTTCTCGTGGCCGACAGCGCGCGCCCGTCGCCGGCCGGGCCTGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGCTGGGGCTGGGCCCCGCGGGTGGGCGCGCCGGGAAGCGGCGGTCGCGGGCGTCGAAGCGCGCGCCGACCACCTACATCAGCACCGACCCGGCCAACTTCCGCCTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AU174364             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ccgCTAGTTAATTAGGACGCCGCCGCCGACGACGACGACATAGCTAGTAGATTTCTTGCTCTCGATCGCAGTGGCCGGCCTAGCTAGCTCTACATCGATCGATCAATCCACTACCATTTCTTACTTGATTAGTTTGTCGTTGGAGCCAAGATCGTATCGATGATGCTCGCTTGATCAGGTTAAGTTGTTGAGTTACTGTAGGGTGTTACTACTAGTATTATTGTACAGCTAGCGCATTATGCATGTCATGTCGTCGTCCGTCGGTCAAACGGAGTGTG GCTGCTATATATGCCCACATTTTATGCAGTAGTAGCTGTCTATAGCTGATCTCAGTTAATTTAATTTGTACTACGTGTATGTCAAAGCTAATTAGTCAGCAGTAAAACATCAAAAAA]
[+] EMBL OS1321688            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTAGGACGCCGCCGCCGACGACGACGACATAGCTAGTAGATTTCTTGCTCTCGATCGCAGTGGCCGGCCTAGCTAGCTCTACATCGATCGATCAATCCACTACCATTTCTTACTTGATTAGTTTGTCGTTGGAGCCAAGATCGTATCGATGATGCTCGCTTGATCAGGTTAAGTTGTTGAGTTACTGTAGGGTGTTACTACTAGTATTATTGTACAGCTAGCGCATTATGCATGTCATGTCGTCGTCCGTCGGTCAAACGGAGTTTGNGCTGCTATATATGCCCACATTTTATGCAGTAGTAGCTGTCTATAGCTGATCTCAGTTAATTTAATTNGTACTACGTGTATGTCAAAGCTAATTAGT                     ]




>consensus_6829#0
CTCCACTTCCTCCTCTCATCGAAGCTAGCTGATCTGCCATGGACGCTCTCTCCTGCCTGG
CGCCGCACGCCGCGCTGCTGCCGTGCGCGGCCTTCACCGACGCCGACATCACGCGCGCGC
TCCACTTCTCCTCCTCCATGCCCGACACCTCCTCCTCACCCTCCTCATCCTCCTCCGCGG
CCTTCCTCGCCGACTTCTGCGGTGGTGGCGCCGGAGGAGGGTTCGTGGTGTCGGCGCCGC
CACCGACGATGCCGGCGATCACCTGCGAGTCCGTTCTCGTGGCCGACAGCGCGCGCCCGT
CGCCGGCCGGGCCTGCGCGGCGGCACCAGCAGCAGCAGCTGGGGCTGGGCCCCGCGGGTG
GGCGCGCCGGGAAGCGGCGGTCGCGGGCGTCGAAGCGCGCGCCGACCACCTACATCAGCA
CCGACCCGGCCAACTTCCGCCTCATGGTGCAGCACGTCACCGGCGTCCAGGCCGACCCCG
CCTCCCTCGCCGACGGCGCCGCCGGCATCCTTCCCACCACCACCACCACTGCGCCGTTCG
ACGCCTCCTCCGGCCTCCACATGCTCGACACCTTCGCCGCCGCCAACCCGCTGCTGCAAG
CCGAGCAAGCGGCGGCGCTTCAGCAGCAGCCGTGCTTCCCCACGCTGGACTCGTCGTGGA
GCGCCGTCATGTACGATGGCAGCGACCTCCTCTGAGCATTCCTTCATTCCCAGCTGCTGC
TGCTGCACTGCAGTGCCAACACTAGTTAATTAGGACGCCGCCGCCGACGACGACGACATA
GCTAGTAGATTTCTTGCTCTCGATCGCAGTGGCCGGCCTAGCTAGCTCTACATCGATCGA
TCAATCCACTACCATTTCTTACTTGATTAGTTTGTCGTTGGAGCCAAGATCGTATCGATG
ATGCTCGCTTGATCAGGTTAAGTTGTTGAGTTACTGTAGGGTGTTACTACTAGTATTATT
GTACAGCTAGCGCATTATGCATGTCATGTCGTCGTCCGTCGGTCAAACGGAGTGTGGCTG
CTATATATGCCCACATTTTATGCAGTAGTAGCTGTCTATAGCTGATCTCAGTTAATTTAA
TTTGTACTACGTGTATGTCAAAGCTAATTAGTCAGCAGTAAAACATCAGAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)