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Oryza sativa
cluster # 6862 cluster # 6862       Sequences # 4       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6862#0 length = 1888 sequences # 3  
consensus_6862#1 length = 1360 sequences # 1  

consensusID : consensus_6862#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1888
fasta sequence
                              [AATCAGGAAGATCATAGCACAGTTGCACACAGTCTTGATCAGCAATGGCATCTCACAGAGCTGCTGTTTTTGCTGTTCTTACGCTGCTACTTTCAGTAGCTGCAATTGCAATGGCTAGGCCAATCAGAAGAAGCGATTTGGGCTTGGGCCTTGGCGCTAATGGTGGGCTAGGTGTAGGACTAGGACTTGATATCGGACTAGGTGGTTCCGGCTCGGCATCTAGTTCAGGCCAGGGCTCGGGTTATGGGGCCTGGTCTGGGCCAAACGGTGGTTCTTACACTGCGTCAGGTCATGGGTTGGGCTTGGGCTCCGGATATGGGTATGGATCAGGATCCGCGTATGGAGCTGGTAATGGGGGCTCTGCTTCGGGTTGTGGCTCTGGCTCAACATCTTGCTCGGGCTCAGGATCAGGTTCCGTAGGACTAGGGACATCGATTAACGTTGGTGTGGGTGTAGGAGCCAATGGTGGCACTAACGGCGGGTCAGATTGCGACACTGGCTCTGGGTCAAACTATGGCTCTAGCACAGGCTCAAGCTCTGGCTACGGGTCGGGTGGAGTTTCCTACCGCTCACGTGGTCATGGCGGGTCTTCTAGTATTGGGTCAGGTTCGGGGGTTGGTTTAGGAGCAACTTCTGGTGCTGGTGCCGGTTCTAATGTTGGGCCAAGTGGTGGTTGCTCGACTTGTGGTTCTGGTTCTAGGTCGGGATCAGGTGCGGGTGGGGGTTCATATTCTGGATCAAATAGCGGCTCGTCATCGAGTTCTGGCTCTGGTTCAAACTCAAATTCAATTGGAGGGTCAGGATCAAGTTCGGGTGCTGGCTCTGGCTCAAGTGCAAGCTCAGGTTATGGTGGCTCTAGTTCTGGTTCTATGTCAGGATCTGGTTCAAGTTCATCATCCGGTTCCACAGGGATGTCATATGGTTCATCAGGTGCTGGCTCATTCAGTGGATCAAGCAGCGGTTCAAACTCTAATGCCGGCTCCATGTCAGGTGCAAACTCAGGAGCCGGTTCAAGCTCTAGTGCATATGGTGCATCAGGCAGTGGATCAAACTCCATGTCGGATTCAGGGTCAAGCTCAGGATCGGTTAGTGCTTCCGGAAGTGGGTCGTCCAACTCTGGTGCAGGTTCAGGTTCCAGCTCTTCTTCATGGTCCGGTTCTAATTCTGGCTCTGGCACAATGTCGGGAATTGACGCTCCGTCAAGTACA-GGAACATCGTCTACTGCTGAATCAAACTCTGGATCCGCCACCTCTGTCACCGGTGCAAACTCAGGCTCATATTCAAGCGCATGGTCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCGACTATGCCATCTGGTATAGGGGTTGCTTCTAATGCTGGCTCTAGCTCAGGTTCTTGGTCTAATGCTGGCTCAAACACTGGCACACTCTCTGGGGCTGGATCCTCTAACTGGTCAAGCTCGACGTCCGGGTCTACCTCAAGCT-CAGGTTTAGGTGGTGGGCAAGGGGTTGGAAGCAGATTCGGTTCCGGAGCCCAACCGACTTTTGGTATGGGTGGAGGAGGTGGGTTTGGAGCGGGTTACGGATTTGGAGCCGGAGCCGGAGGTTGGGGTAAGCACCATTAAGATAAGGTGTTGGGCAGATTCTTATATAAAAAAGAAGGGGGTGAGAATTTTGGATCCCCTTGCTCTCATGGTTGATTTACATGTTGTATTGAGTTCCCTGGGAATAAGCGATCATCAGTTTTCAGTACGCTCAGTTCCTCTTGTACACTAGCAGTAGCTGCTCTTTGTTTCCAACAAAATGCTTGAATCGTTGTGGTCATCGTGACGCATCAGTACGTACTTCTTCATATGTACCGGCAGATGCTATCTTGGAATGAAATCATGAAATCTTTGTGACCAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK101495             [AATCAGGAAGATCATAGCACAGTTGCACACAGTCTTGATCAGCAATGGCATCTCACAGAGCTGCTGTTTTTGCTGTTCTTACGCTGCTACTTTCAGTAGCTGCAATTGCAATGGCTAGGCCAATCAGAAGAAGCGATTTGGGCTTGGGCCTTGGCGCTAATGGTGGGCTAGGTGTAGGACTAGGACTTGATATCGGACTAGGTGGTTCCGGCTCGGCATCTAGTTCAGGCCAGGGCTCGGGTTATGGGGCCTGGTCTGGGCCAAACGGTGGTTCTTACACTGCGTCAGGTCATGGGTTGGGCTTGGGCTCCGGATATGGGTATGGATCAGGATCCGCGTATGGAGCTGGTAATGGGGGCTCTGCTTCGGGTTGTGGCTCTGGCTCAACATCTTGCTCGGGCTCAGGATCAGGTTCCGTAGGACTAGGGACATCGATTAACGTTGGTGTGGGTGTAGGAGCCAATGGTGGCACTAACGGCGGGTCAGATTGCGACACTGGCTCTGGGTCAAACTATGGCTCTAGCACAGGCTCAAGCTCTGGCTACGGGTCGGGTGGAGTTTCCTACCGCTCACGTGGTCATGGCGGGTCTTCTAGTATTGGGTCAGGTTCGGGGGTTGGTTTAGGAGCAACTTCTGGTGCTGGTGCCGGTTCTAATGTTGGGCCAAGTGGTGGTTGCTCGACTTGTGGTTCTGGTTCTAGGTCGGGATCAGGTGCGGGTGGGGGTTCATATTCTGGATCAAATAGCGGCTCGTCATCGAGTTCTGGCTCTGGTTCAAACTCAAATTCAATTGGAGGGTCAGGATCAAGTTCGGGTGCTGGCTCTGGCTCAAGTGCAAGCTCAGGTTATGGTGGCTCTAGTTCTGGTTCTATGTCAGGATCTGGTTCAAGTTCATCATCCGGTTCCACAGGGATGTCATATGGTTCATCAGGTGCTGGCTCATTCAGTGGATCAAGCAGCGGTTCAAACTCTAATGCCGGCTCCATGTCAGGTGCAAACTCAGGAGCCGGTTCAAGCTCTAGTGCATATGGTGCATCAGGCAGTGGATCAAACTCCATGTCGGATTCAGGGTCAAGCTCAGGATCGGTTAGTGCTTCCGGAAGTGGGTCGTCCAACTCTGGTGCAGGTTCAGGTTCCAGCTCTTCTTCATGGTCCGGTTCTAATTCTGGCTCTGGCACAATGTCGGGAATTGACGCTCCGTCAAGTACA GGAACATCGTCTACTGCTGAATCAAACTCTGGATCCGCCACCTCTGTCACCGGTGCAAACTCAGGCTCATATTCAAGCGCATGGTCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCGACTATGCCATCTGGTATAGGGGTTGCTTCTAATGCTGGCTCTAGCTCAGGTTCTTGGTCTAATGCTGGCTCAAACACTGGCACACTCTCTGGGGCTGGATCCTCTAACTGGTCAAGCTCGACGTCCGGGTCTACCTCAAGCT CAGGTTTAGGTGGTGGGCAAGGGGTTGGAAGCAGATTCGGTTCCGGAGCCCAACCGACTTTTGGTATGGGTGGAGGAGGTGGGTTTGGAGCGGGTTACGGATTTGGAGCCGGAGCCGGAGGTTGGGGTAAGCACCATTAAGATAAGGTGTTGGGCAGATTCTTATATAAAAAAGAAGGGGGTGAGAATTTTGGATCCCCTTGCTCTCATGGTTGATTTACATGTTGTATTGAGTTCCCTGGGAATAAGCGATCATCAGTTTTCAGTACGCTCAGTTCCTCTTGTACACTAGCAGTAGCTGCTCTTTGTTTCCAACAAAATGCTTGAATCGTTGTGGTCATCGTGACGCATCAGTACGTACTTCTTCATATGTACCGGCAGATGCTATCTTGGAATGAAATCATGAAAT                   ]
[+] EMBL OSR02761A            [              TAGCACAGTTGCACACAGTCTTGATCAGCAATGGCATCTCACAGAGCTGCTGTTTTTGCTGTTCTTACGCTGCTACTTTCAGTAGCTGCAATTGCAATGGCTAGGCCAATCAGAAGAAGCGATTTGGGCTTGGGCCTTGGCGCTAATGGTGGGCTAGGTGTAGGACTAGGACTTGATATCGGACTAGGTGGTTCCGGCTCGGCATCTAGTTCAGGCCAGGGCTCGGGTTATGGGGCCTGGTCTGGGCCAAACGGTGGTTCTTACACTGCGTCAGGTCATGGGTTGGGCTTNGGCTCCGGATATGGGTATGGATCAGGATCCGCGTATGGAGCTGGTAATGGGGGCTCTGCTTCGGGg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AU031655             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTACAGGGAACATCGTCNACTGCT AATCAAACTCTGGANCCGCCACCTCTGTCACCGGTGCAAACTCAGCCTCATATTCAAGCGCATGGTCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCGACTATNCCATCTGGTATAGGGNTTGCTTCTAATGCTGGCTCTAGCTCAGGTTCTTGGTCTAATGCTGGCTCAAACACTGGCACACTCTCTGGGGCTGNATCCTCTAACTGGTCAAGCTCGACGTCCGGGTCTACCTCAAGCTCCAGGTTTAGGTGGTGGNCAAGGGGTTGGAAGCAGATTCGGTTCCGGANCCCAACCGACTTTTGGTATGGGTGGAGGAGGTGGGTTTGGAGCGGGTTACGGATTTGGANCCGGANCCGGAGGTTGGGGTAAGCNCCATTAAGATAAGGTGTTGGGCAGATTCTTATATAAAAAAGAAGGGGGTGAGAATTTTGGANCCCCTTGCTCTCATGGTTGATTTACATGTTGTATTGAGTTCCCTGGGAATAAGCGATCATCAGTTTTCAGTACGCTCAGTTCCTCTTGTACACTAGCAGTAGCTGCTCTTTGTTTCCAACAAAATGCTTGAATCGTTGTGGTCATCGTGACGCATCAGTACGTACTTCTTCATATGTACCGGCAGATGCTATCTTGGAATGAAATCATGAAATCTTTGTGACCAAAAAAAAA]


>consensus_6862#0 AATCAGGAAGATCATAGCACAGTTGCACACAGTCTTGATCAGCAATGGCATCTCACAGAG CTGCTGTTTTTGCTGTTCTTACGCTGCTACTTTCAGTAGCTGCAATTGCAATGGCTAGGC CAATCAGAAGAAGCGATTTGGGCTTGGGCCTTGGCGCTAATGGTGGGCTAGGTGTAGGAC TAGGACTTGATATCGGACTAGGTGGTTCCGGCTCGGCATCTAGTTCAGGCCAGGGCTCGG GTTATGGGGCCTGGTCTGGGCCAAACGGTGGTTCTTACACTGCGTCAGGTCATGGGTTGG GCTTGGGCTCCGGATATGGGTATGGATCAGGATCCGCGTATGGAGCTGGTAATGGGGGCT CTGCTTCGGGTTGTGGCTCTGGCTCAACATCTTGCTCGGGCTCAGGATCAGGTTCCGTAG GACTAGGGACATCGATTAACGTTGGTGTGGGTGTAGGAGCCAATGGTGGCACTAACGGCG GGTCAGATTGCGACACTGGCTCTGGGTCAAACTATGGCTCTAGCACAGGCTCAAGCTCTG GCTACGGGTCGGGTGGAGTTTCCTACCGCTCACGTGGTCATGGCGGGTCTTCTAGTATTG GGTCAGGTTCGGGGGTTGGTTTAGGAGCAACTTCTGGTGCTGGTGCCGGTTCTAATGTTG GGCCAAGTGGTGGTTGCTCGACTTGTGGTTCTGGTTCTAGGTCGGGATCAGGTGCGGGTG GGGGTTCATATTCTGGATCAAATAGCGGCTCGTCATCGAGTTCTGGCTCTGGTTCAAACT CAAATTCAATTGGAGGGTCAGGATCAAGTTCGGGTGCTGGCTCTGGCTCAAGTGCAAGCT CAGGTTATGGTGGCTCTAGTTCTGGTTCTATGTCAGGATCTGGTTCAAGTTCATCATCCG GTTCCACAGGGATGTCATATGGTTCATCAGGTGCTGGCTCATTCAGTGGATCAAGCAGCG GTTCAAACTCTAATGCCGGCTCCATGTCAGGTGCAAACTCAGGAGCCGGTTCAAGCTCTA GTGCATATGGTGCATCAGGCAGTGGATCAAACTCCATGTCGGATTCAGGGTCAAGCTCAG GATCGGTTAGTGCTTCCGGAAGTGGGTCGTCCAACTCTGGTGCAGGTTCAGGTTCCAGCT CTTCTTCATGGTCCGGTTCTAATTCTGGCTCTGGCACAATGTCGGGAATTGACGCTCCGT CAAGTACAGGAACATCGTCTACTGCTGAATCAAACTCTGGATCCGCCACCTCTGTCACCG GTGCAAACTCAGGCTCATATTCAAGCGCATGGTCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCGA CTATGCCATCTGGTATAGGGGTTGCTTCTAATGCTGGCTCTAGCTCAGGTTCTTGGTCTA ATGCTGGCTCAAACACTGGCACACTCTCTGGGGCTGGATCCTCTAACTGGTCAAGCTCGA CGTCCGGGTCTACCTCAAGCTCAGGTTTAGGTGGTGGGCAAGGGGTTGGAAGCAGATTCG GTTCCGGAGCCCAACCGACTTTTGGTATGGGTGGAGGAGGTGGGTTTGGAGCGGGTTACG GATTTGGAGCCGGAGCCGGAGGTTGGGGTAAGCACCATTAAGATAAGGTGTTGGGCAGAT TCTTATATAAAAAAGAAGGGGGTGAGAATTTTGGATCCCCTTGCTCTCATGGTTGATTTA CATGTTGTATTGAGTTCCCTGGGAATAAGCGATCATCAGTTTTCAGTACGCTCAGTTCCT CTTGTACACTAGCAGTAGCTGCTCTTTGTTTCCAACAAAATGCTTGAATCGTTGTGGTCA TCGTGACGCATCAGTACGTACTTCTTCATATGTACCGGCAGATGCTATCTTGGAATGAAA TCATGAAATCTTTGTGACCAAAAAAAAA



consensusID : consensus_6862#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 1360
fasta sequence
                              [CAGGAAGATCATAGCACAGGCTCAAGCTCTGGCTACGGGTCGGGTGGAGTTTCCTACCGCTCACGTGGTCATGGCGGGTCTTCTAGTATTGGGTCAGGTTCGGGGGTTGGTTTAGGAGCAACTTCTGGTGTTGGTGCCGGTTCTAATGTTGGGCCAAGTGGTGGTTGCTCGACTTGTGGTTCTGGTTCTAGGTCGGGATCAGGTGCGGGTGGGGGTTCATATTCTGGATCAAATAGCGGCTCGTCATCGAGTTCTGGCTCTGGTTCAAACTCAAATTCAATTGGAGGGTCAGGATCAAGTTCGGGTGCTGGCTCTGGCTCAAGTGCAAGCTCAGGTTATGGTGGCTCTAGTTCTGGTTCTATGTCAGGATCTGGTTCAAGTTCATCATCCGGTTCCACAGGGATGTCATATGGTTCATCAGGTGCTGGCTCATTCAGTGGATCAAGCAGCGGTTCAAACTCTAATGCCGGCTCCATGTCAGGTGCAAACTCAGGAGCCGGTTCAAGCTCTAGTGCATATGGTGCATCAGGCAGTGGATCAAACTCCATGTCGGATTCAGGGTCAAGCTCAGGATCGGTTAGTGCTTCCGGAAGTGGGTCGTCCAACTCTGGTGCAGGTTCAGGTTCCAGCTCTTCTTCATGGTCCGGTTCTAATTCTGGCTCTGGCACAATGTCGGGAATTGACGCTCCGTCAAGTACAGGAACATCGTCTACTGCTGAATCAAACTCTGGATCCGCCACCTCTGTCACCGGTGCAAACTCAGGCTCATATTCAAGCGCATGGTCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCGACTATGCCATCTGGTATAGGGGTTGCTTCTAATGCTGGCTCTAGCTCAGGTTCTTGGTCTAATGCTGGCTCAAACACTGGCACACTCTCTGGGGCTGGATCCTCTAACTGGTCAAGCTCGACGTCCGGGTCTACCTCAAGCTCAGGTTTAGGTGGTGGGCAAGGGGTTGGAAGCAGATTCGGTTCCGGAGCCCAACCGACTTTTGGTATGGGTGGAGGAGGTGGGTTTGGAGCGGGTTACGGATTTGGAGCCGGAGCCGGAGGTTGGGGTAAGCACCATTAAGATAAGGTGTTGGGCAGATTCTTATATAAAAAAGAAGGGGGTGAGAATTTTGGATCCCCTTGCTCTCATGGTTGATTTACATGTTGTATTGAGTTCCCTGGGAATAAGCGATCATCAGTTTTCAGTACGCTCAGTTCCTCTTGTACACTAGCAGTAGCTGCTCTTTGTTTCCAACAAAATGCTTGAATCGTTGTGGTCATCGTGACGCATCAGTACGTACTTCTTCATATGTACCGGCAGATGCTATCTTGGAATGAAATCATGAAAT]

[+] EMBL AK063970             [CAGGAAGATCATAGCACAGGCTCAAGCTCTGGCTACGGGTCGGGTGGAGTTTCCTACCGCTCACGTGGTCATGGCGGGTCTTCTAGTATTGGGTCAGGTTCGGGGGTTGGTTTAGGAGCAACTTCTGGTGTTGGTGCCGGTTCTAATGTTGGGCCAAGTGGTGGTTGCTCGACTTGTGGTTCTGGTTCTAGGTCGGGATCAGGTGCGGGTGGGGGTTCATATTCTGGATCAAATAGCGGCTCGTCATCGAGTTCTGGCTCTGGTTCAAACTCAAATTCAATTGGAGGGTCAGGATCAAGTTCGGGTGCTGGCTCTGGCTCAAGTGCAAGCTCAGGTTATGGTGGCTCTAGTTCTGGTTCTATGTCAGGATCTGGTTCAAGTTCATCATCCGGTTCCACAGGGATGTCATATGGTTCATCAGGTGCTGGCTCATTCAGTGGATCAAGCAGCGGTTCAAACTCTAATGCCGGCTCCATGTCAGGTGCAAACTCAGGAGCCGGTTCAAGCTCTAGTGCATATGGTGCATCAGGCAGTGGATCAAACTCCATGTCGGATTCAGGGTCAAGCTCAGGATCGGTTAGTGCTTCCGGAAGTGGGTCGTCCAACTCTGGTGCAGGTTCAGGTTCCAGCTCTTCTTCATGGTCCGGTTCTAATTCTGGCTCTGGCACAATGTCGGGAATTGACGCTCCGTCAAGTACAGGAACATCGTCTACTGCTGAATCAAACTCTGGATCCGCCACCTCTGTCACCGGTGCAAACTCAGGCTCATATTCAAGCGCATGGTCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCGACTATGCCATCTGGTATAGGGGTTGCTTCTAATGCTGGCTCTAGCTCAGGTTCTTGGTCTAATGCTGGCTCAAACACTGGCACACTCTCTGGGGCTGGATCCTCTAACTGGTCAAGCTCGACGTCCGGGTCTACCTCAAGCTCAGGTTTAGGTGGTGGGCAAGGGGTTGGAAGCAGATTCGGTTCCGGAGCCCAACCGACTTTTGGTATGGGTGGAGGAGGTGGGTTTGGAGCGGGTTACGGATTTGGAGCCGGAGCCGGAGGTTGGGGTAAGCACCATTAAGATAAGGTGTTGGGCAGATTCTTATATAAAAAAGAAGGGGGTGAGAATTTTGGATCCCCTTGCTCTCATGGTTGATTTACATGTTGTATTGAGTTCCCTGGGAATAAGCGATCATCAGTTTTCAGTACGCTCAGTTCCTCTTGTACACTAGCAGTAGCTGCTCTTTGTTTCCAACAAAATGCTTGAATCGTTGTGGTCATCGTGACGCATCAGTACGTACTTCTTCATATGTACCGGCAGATGCTATCTTGGAATGAAATCATGAAAT]


>consensus_6862#1 CAGGAAGATCATAGCACAGGCTCAAGCTCTGGCTACGGGTCGGGTGGAGTTTCCTACCGC TCACGTGGTCATGGCGGGTCTTCTAGTATTGGGTCAGGTTCGGGGGTTGGTTTAGGAGCA ACTTCTGGTGTTGGTGCCGGTTCTAATGTTGGGCCAAGTGGTGGTTGCTCGACTTGTGGT TCTGGTTCTAGGTCGGGATCAGGTGCGGGTGGGGGTTCATATTCTGGATCAAATAGCGGC TCGTCATCGAGTTCTGGCTCTGGTTCAAACTCAAATTCAATTGGAGGGTCAGGATCAAGT TCGGGTGCTGGCTCTGGCTCAAGTGCAAGCTCAGGTTATGGTGGCTCTAGTTCTGGTTCT ATGTCAGGATCTGGTTCAAGTTCATCATCCGGTTCCACAGGGATGTCATATGGTTCATCA GGTGCTGGCTCATTCAGTGGATCAAGCAGCGGTTCAAACTCTAATGCCGGCTCCATGTCA GGTGCAAACTCAGGAGCCGGTTCAAGCTCTAGTGCATATGGTGCATCAGGCAGTGGATCA AACTCCATGTCGGATTCAGGGTCAAGCTCAGGATCGGTTAGTGCTTCCGGAAGTGGGTCG TCCAACTCTGGTGCAGGTTCAGGTTCCAGCTCTTCTTCATGGTCCGGTTCTAATTCTGGC TCTGGCACAATGTCGGGAATTGACGCTCCGTCAAGTACAGGAACATCGTCTACTGCTGAA TCAAACTCTGGATCCGCCACCTCTGTCACCGGTGCAAACTCAGGCTCATATTCAAGCGCA TGGTCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCGACTATGCCATCTGGTATAGGGGTTGCTTCT AATGCTGGCTCTAGCTCAGGTTCTTGGTCTAATGCTGGCTCAAACACTGGCACACTCTCT GGGGCTGGATCCTCTAACTGGTCAAGCTCGACGTCCGGGTCTACCTCAAGCTCAGGTTTA GGTGGTGGGCAAGGGGTTGGAAGCAGATTCGGTTCCGGAGCCCAACCGACTTTTGGTATG GGTGGAGGAGGTGGGTTTGGAGCGGGTTACGGATTTGGAGCCGGAGCCGGAGGTTGGGGT AAGCACCATTAAGATAAGGTGTTGGGCAGATTCTTATATAAAAAAGAAGGGGGTGAGAAT TTTGGATCCCCTTGCTCTCATGGTTGATTTACATGTTGTATTGAGTTCCCTGGGAATAAG CGATCATCAGTTTTCAGTACGCTCAGTTCCTCTTGTACACTAGCAGTAGCTGCTCTTTGT TTCCAACAAAATGCTTGAATCGTTGTGGTCATCGTGACGCATCAGTACGTACTTCTTCAT ATGTACCGGCAGATGCTATCTTGGAATGAAATCATGAAAT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_6862#0      AATCAGGAAGATCATAGCACAGTTGCACACAGTCTTGATCAGCAATGGCATCTCACAGAG 60
consensus_6862#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6862#0      CTGCTGTTTTTGCTGTTCTTACGCTGCTACTTTCAGTAGCTGCAATTGCAATGGCTAGGC 120
consensus_6862#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6862#0      CAATCAGAAGAAGCGATTTGGGCTTGGGCCTTGGCGCTAATGGTGGGCTAGGTGTAGGAC 180
consensus_6862#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6862#0      TAGGACTTGATATCGGACTAGGTGGTTCCGGCTCGGCATCTAGTTCAGGCCAGGGCTCGG 240
consensus_6862#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6862#0      GTTATGGGGCCTGGTCTGGGCCAAACGGTGGTTCTTACACTGCGTCAGGTCATGGGTTGG 300
consensus_6862#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6862#0      GCTTGGGCTCCGGATATGGGTATGGATCAGGATCCGCGTATGGAGCTGGTAATGGGGGCT 360
consensus_6862#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6862#0      CTGCTTCGGGTTGTGGCTCTGGCTCAACATCTTGCTCGGGCTCAGGATCAGGTTCCGTAG 420
consensus_6862#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6862#0      GACTAGGGACATCGATTAACGTTGGTGTGGGTGTAGGAGCCAATGGTGGCACTAACGGCG 480
consensus_6862#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_6862#0      GGTCAGATTGCGACACTGGCTCTGGGTCAAACTATGGCTCTAGCACAGGCTCAAGCTCTG 540
consensus_6862#1      -----------------------------CAGGAAGATCATAGCACAGGCTCAAGCTCTG 31
                                                    *  * *    ********************

consensus_6862#0      GCTACGGGTCGGGTGGAGTTTCCTACCGCTCACGTGGTCATGGCGGGTCTTCTAGTATTG 600
consensus_6862#1      GCTACGGGTCGGGTGGAGTTTCCTACCGCTCACGTGGTCATGGCGGGTCTTCTAGTATTG 91
                      ************************************************************

consensus_6862#0      GGTCAGGTTCGGGGGTTGGTTTAGGAGCAACTTCTGGTGCTGGTGCCGGTTCTAATGTTG 660
consensus_6862#1      GGTCAGGTTCGGGGGTTGGTTTAGGAGCAACTTCTGGTGTTGGTGCCGGTTCTAATGTTG 151
                      *************************************** ********************

consensus_6862#0      GGCCAAGTGGTGGTTGCTCGACTTGTGGTTCTGGTTCTAGGTCGGGATCAGGTGCGGGTG 720
consensus_6862#1      GGCCAAGTGGTGGTTGCTCGACTTGTGGTTCTGGTTCTAGGTCGGGATCAGGTGCGGGTG 211
                      ************************************************************

consensus_6862#0      GGGGTTCATATTCTGGATCAAATAGCGGCTCGTCATCGAGTTCTGGCTCTGGTTCAAACT 780
consensus_6862#1      GGGGTTCATATTCTGGATCAAATAGCGGCTCGTCATCGAGTTCTGGCTCTGGTTCAAACT 271
                      ************************************************************

consensus_6862#0      CAAATTCAATTGGAGGGTCAGGATCAAGTTCGGGTGCTGGCTCTGGCTCAAGTGCAAGCT 840
consensus_6862#1      CAAATTCAATTGGAGGGTCAGGATCAAGTTCGGGTGCTGGCTCTGGCTCAAGTGCAAGCT 331
                      ************************************************************

consensus_6862#0      CAGGTTATGGTGGCTCTAGTTCTGGTTCTATGTCAGGATCTGGTTCAAGTTCATCATCCG 900
consensus_6862#1      CAGGTTATGGTGGCTCTAGTTCTGGTTCTATGTCAGGATCTGGTTCAAGTTCATCATCCG 391
                      ************************************************************

consensus_6862#0      GTTCCACAGGGATGTCATATGGTTCATCAGGTGCTGGCTCATTCAGTGGATCAAGCAGCG 960
consensus_6862#1      GTTCCACAGGGATGTCATATGGTTCATCAGGTGCTGGCTCATTCAGTGGATCAAGCAGCG 451
                      ************************************************************

consensus_6862#0      GTTCAAACTCTAATGCCGGCTCCATGTCAGGTGCAAACTCAGGAGCCGGTTCAAGCTCTA 1020
consensus_6862#1      GTTCAAACTCTAATGCCGGCTCCATGTCAGGTGCAAACTCAGGAGCCGGTTCAAGCTCTA 511
                      ************************************************************

consensus_6862#0      GTGCATATGGTGCATCAGGCAGTGGATCAAACTCCATGTCGGATTCAGGGTCAAGCTCAG 1080
consensus_6862#1      GTGCATATGGTGCATCAGGCAGTGGATCAAACTCCATGTCGGATTCAGGGTCAAGCTCAG 571
                      ************************************************************

consensus_6862#0      GATCGGTTAGTGCTTCCGGAAGTGGGTCGTCCAACTCTGGTGCAGGTTCAGGTTCCAGCT 1140
consensus_6862#1      GATCGGTTAGTGCTTCCGGAAGTGGGTCGTCCAACTCTGGTGCAGGTTCAGGTTCCAGCT 631
                      ************************************************************

consensus_6862#0      CTTCTTCATGGTCCGGTTCTAATTCTGGCTCTGGCACAATGTCGGGAATTGACGCTCCGT 1200
consensus_6862#1      CTTCTTCATGGTCCGGTTCTAATTCTGGCTCTGGCACAATGTCGGGAATTGACGCTCCGT 691
                      ************************************************************

consensus_6862#0      CAAGTACAGGAACATCGTCTACTGCTGAATCAAACTCTGGATCCGCCACCTCTGTCACCG 1260
consensus_6862#1      CAAGTACAGGAACATCGTCTACTGCTGAATCAAACTCTGGATCCGCCACCTCTGTCACCG 751
                      ************************************************************

consensus_6862#0      GTGCAAACTCAGGCTCATATTCAAGCGCATGGTCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCGA 1320
consensus_6862#1      GTGCAAACTCAGGCTCATATTCAAGCGCATGGTCCAACTCCAACTCCAACTCCGGCTCGA 811
                      ************************************************************

consensus_6862#0      CTATGCCATCTGGTATAGGGGTTGCTTCTAATGCTGGCTCTAGCTCAGGTTCTTGGTCTA 1380
consensus_6862#1      CTATGCCATCTGGTATAGGGGTTGCTTCTAATGCTGGCTCTAGCTCAGGTTCTTGGTCTA 871
                      ************************************************************

consensus_6862#0      ATGCTGGCTCAAACACTGGCACACTCTCTGGGGCTGGATCCTCTAACTGGTCAAGCTCGA 1440
consensus_6862#1      ATGCTGGCTCAAACACTGGCACACTCTCTGGGGCTGGATCCTCTAACTGGTCAAGCTCGA 931
                      ************************************************************

consensus_6862#0      CGTCCGGGTCTACCTCAAGCTCAGGTTTAGGTGGTGGGCAAGGGGTTGGAAGCAGATTCG 1500
consensus_6862#1      CGTCCGGGTCTACCTCAAGCTCAGGTTTAGGTGGTGGGCAAGGGGTTGGAAGCAGATTCG 991
                      ************************************************************

consensus_6862#0      GTTCCGGAGCCCAACCGACTTTTGGTATGGGTGGAGGAGGTGGGTTTGGAGCGGGTTACG 1560
consensus_6862#1      GTTCCGGAGCCCAACCGACTTTTGGTATGGGTGGAGGAGGTGGGTTTGGAGCGGGTTACG 1051
                      ************************************************************

consensus_6862#0      GATTTGGAGCCGGAGCCGGAGGTTGGGGTAAGCACCATTAAGATAAGGTGTTGGGCAGAT 1620
consensus_6862#1      GATTTGGAGCCGGAGCCGGAGGTTGGGGTAAGCACCATTAAGATAAGGTGTTGGGCAGAT 1111
                      ************************************************************

consensus_6862#0      TCTTATATAAAAAAGAAGGGGGTGAGAATTTTGGATCCCCTTGCTCTCATGGTTGATTTA 1680
consensus_6862#1      TCTTATATAAAAAAGAAGGGGGTGAGAATTTTGGATCCCCTTGCTCTCATGGTTGATTTA 1171
                      ************************************************************

consensus_6862#0      CATGTTGTATTGAGTTCCCTGGGAATAAGCGATCATCAGTTTTCAGTACGCTCAGTTCCT 1740
consensus_6862#1      CATGTTGTATTGAGTTCCCTGGGAATAAGCGATCATCAGTTTTCAGTACGCTCAGTTCCT 1231
                      ************************************************************

consensus_6862#0      CTTGTACACTAGCAGTAGCTGCTCTTTGTTTCCAACAAAATGCTTGAATCGTTGTGGTCA 1800
consensus_6862#1      CTTGTACACTAGCAGTAGCTGCTCTTTGTTTCCAACAAAATGCTTGAATCGTTGTGGTCA 1291
                      ************************************************************

consensus_6862#0      TCGTGACGCATCAGTACGTACTTCTTCATATGTACCGGCAGATGCTATCTTGGAATGAAA 1860
consensus_6862#1      TCGTGACGCATCAGTACGTACTTCTTCATATGTACCGGCAGATGCTATCTTGGAATGAAA 1351
                      ************************************************************

consensus_6862#0      TCATGAAATCTTTGTGACCAAAAAAAAA 1888
consensus_6862#1      TCATGAAAT------------------- 1360
                      *********                   




Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)