These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6967#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 2027 fasta sequence [TTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTGGAAATTCCCCCTAATCTCTGTCTCCCCCTCCCTCACGGCCTCACCTCTTCTCCCTCCAAATTCTCCATCCCCGGATCCCCCTCTCCTCCTCCTCCTCCGCCGCTCGTCGGAGCCGGAGGCGCGGCGGCCTTCTCCCGCGCCCTTCGTCTCCTCACACCCGCGGCGGCCGGCGAGAAGGCCCAGAGGCAAAGGCGTGAAGCGGCCTCCTCCCCCGGCGCGGCACCCTCGGACGCACGGCGGCCGGTGAGCAGGAGCAGGTTCGGAGGGGGCGACGCGGCCGGGCTCCTTCCACCGGCCAGCATCCTGGCTCGAGTCGAATTTTGAAGGAAGCATGAAGGTTGATGATGGTCCTGGCGTCAATGGCAGTAGGTGGGCCAAAATGATGAGCACAGATTCGTGGAGGTGGTGTTTAGGATTGATTTACATTGTTGCTGTTGCGAGTATATGGATTGCTGCAAGCTACATTGTTCAGTCTGTTGTGGATGAGGGTGTTTCTCCATTCTTGATTACCTACATATGCAATTCTCTATTTGTTATTTACATCCCAATAGTTGAGGCTGCACGATACTTTGAGGATTCTATCAACAACTTTTGGACAAAGTTGAAAGGCAAGGATGTTGCGGACCTGGAGCAGTCTGCTGATCTGGAGAGCATAAATCTTCTCCATGGAAGTGAACAAGAGGGCAATACAGCCTCACCAACAAGGTTGCCTGAAGACATATTGGCTTCAGAAGCAGTCTTCCCTGTCCAGGCCGAGCTGAATGTAGCAGATGGCAGCAAAGGGTTGGATGCAAAAGGGCGCTGGACACGTGCTCGTGTGGCTAGAGTCAGCATGGTAGTCTGCCCTTTCTGGTTTCTCGCTCAGCTTACATTCAACCTGTCTCTAAGATACACCACTGTTACATCAAATACGATATTGAGCAGCACGTCTAGCCTCTTCACTTTCTTGGTTGCACTAGTATTTCTTGGAGAAACATTCACGTGGTTGAAACTAATCAGTGTACTTCTCTGCATGGGAGGAACGATAATTGTTAGCCTAGCTGATTCAGGTAGTACAGCGAATACCATTGCCACAAATCCTCTACTTGGAGATGTCCTTTCTATTGTTTCAGCTGGATTGTACGCTGTGTATATCACCTTGATACGGAAAAAGCTGCCTGATGAGAAAGAAGGTCAAGGCGAAGTGAGCATGGCTCAGTTTCTTGGATTCCTTGGACTGTTTAACATGTTATTTTTCTTTCCTTTTGCATTGTTCTTGAATTTCACCAAGCTGGAGCCATTCCACAGGCTGACATGGGAGCAAGTTGGTCTTATTGTTGGAAAAGGTTTGTT-AGATAATG-TTTTGAGTGACTA-CTTGTGGGCAAAAGCAATCCTTCTCACAACAACAACA-GTAGCCACGGCTGGTCTCACGATCCAAGTTCCAATTGCTGCCA-TTGTGGATACACTAACAGGTCATGCTCCTCATCTATTGGACTACATCGGAGCTGCTGCTGTGTTGGTCGGTTTTG-CTGGCATCAACATACCTGTAGGCACTCCACAGGGTTCTCAGCAAGAGCAGGAAACTCCTATCGTCAGTATGGTTGATGATCCAGTCCATTTACCAAGTGATAGAAATGCTACTAGCATGGTTGATGATCCAGTCTATTTACCAAGTGATAGAAATGCTACTGGTGCTGTTCAATAAGGACCGGCTTGGCTTTGGAGTTTGTCACAATGTATATTTTTTTCGAGGAAAATTTTCATAATGTATATTATCAAGTAATGTATAAGGATGCGAGATCAGTACAGTTACTGTAATTGTTCCCCCTTGCCATGAAAATCATAGAGAAGGGGATAGACAGGGATTGAAATTAGATT-AACATGCTTT-CCTTGCTCATAATTTTGAGCAACTAGCCAATTGTGTTCGTTTTTGAGTTAAGCACGATTATGAAAACATTCAAGAGATTGAATAGAACATGTGTGTACTAAACATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACAT] 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AGATAATG TTTTGAGTGACTA CTTGTGGGCAAAAGCAATCCTTCTCACAACAACAACA GTAGCCACGGCTGGTCTCACGATCCAAGTTCCAATTGCTGCCA TTGTGGATACACTAACAGGTCATGCTCCTCATCTATTGGACTACATCGGAGCTGCTGCTGTGTTGGTCGGTTTTG CTGGCATCAACATACCTGTAGGCACTCCACAGGGTTCTCAGCAAGAGCAGGAAACTCCTATCGTCAGTATGGTTGATGATCCAGTCCATTTACCAAGTGATAGAAATGCTACTAGCATGGTTGATGATCCAGTCTATTTACCAAGTGATAGAAATACTACTGGTGCTGTTCAATAAGGACCGGCTTGGCTTTGGAGTTTGTCACAATGTATATTTTTTTCGAGGAAAATTTTCATAATGTATATTATCAAGTAATGTATAAGGATGCGAGATCAGTACAGTTACTGTAATTGTTCCCCCTTGCCATGAAAATCATAGAGAAGGGGATAGACAGGGATCGAAATTAGATT AACATGCTTT CCTTGCTCATAATTTTGAGCAACTAGCCAGTTGTGTTCGTTTTTGAGTTAAGCACGATTATGAAAACATTCAAGAGATTGAATAGAACATGTGTGTACTAAACATTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCACAT] [+] EMBL BI813352 [ TGTTGGAAAAGGTTGGTTAAAATAATGTTTTTGAGTGACTACCTTGTGGCCAAA C ATCCTTCTCACGACGACCACACGTAGCCAC GCTGGTCTCACGATCCAAGTTCC ATTGCTGCCACTTGTGGATACACTAACAGGTCATGCTCCTCATCTATTGGACTACATCGGAGCTGCTGCTGTGTT GTCGGTTTTG CTGGCATCAACATACCTGTAGGCACTCCACAGGGTTCTCAGCAAGA 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ATAAGGACCGGCTTGGCTTTGGAGTTTGTCAC ATGTATATTTTTTTCGAGGANNCTTTTCATAATGTATATTATCAAGTAATGTATAAGGATGCGAGATCAGTACAGTTACTGTAATTGTTCCCCCTTGCCATGAAAATCATAGAGAAGGGGATAGACAGGGATTGAAATTAGATT NACATGCTTTCCCTTGCTCATAATTTTGA C ACTAGCCAAaa ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||