cluster # 7078

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Oryza sativa
cluster # 7078 cluster # 7078 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7078#0 length = 565 sequences # 4

consensusID : consensus_7078#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 565
fasta sequence

                              [CCCTTTCCTCTCTCTCTTCTCTCTCCAGCGCCACCACCACGACTCCGCCGCCGCCGCTCCCGCCACCACCACATCCCTCGCCGCCGCTGCCGCTACCAACTCCGCCTCCACCACCACCCTCGCCACCTCCGCCGCCGCCGCCTGCGCCTCCACCATCCCTCGTAGCTCTCCTTTTGCTTCTCAGTGGCCGTCTCCGCCGTGGGAGGTCGTGGCGGGCGGCAGCGGGAGGCCGTCTCCGCCGCGGCCACCTTGACGCTGAGGAGCCCTGCGATACTCGATGGGAGACGGAGTTGACATCGATTCTTGTTGCCGGTGGCCGCACCGTGGTCGGCGAGGCAGCTATGACGGGTTCTACGGCGGTCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTGCAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGATTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCATGTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGTTT]

[+] EMBL AK109196             [CCCTTTCCTCTCTCTCTTCTCTCTCCAGCGCCACCACCACGACTCCGCCGCCGCCGCTCCCGCCACCACCACATCCCTCGCCGCCGCTGCCGCTACCAACTCCGCCTCCACCACCACCCTCGCCACCTCCGCCGCCGCCGCCTGCGCCTCCACCATCCCTCGTAGCTCTCCTTTTGCTTCTCAGTGGCCGTCTCCGCCGTGGGAGGTCGTGGCGGGCGGCAGCGGGAGGCCGTCTCCGCCGCGGCCACCTTGACGCTGAGGAGCCCTGCGATACTCGATGGGAGACGGAGTTGACATCGATTCTTGTTGCCGGTGGCCGCACCGTGGTCGGCGAGGCAGCTATGACGGGTTCTACGGCGGTCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTGCAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGATTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCATGTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGTTT]
[+] EMBL CB643828             [                                            CCGCCGCCGCCGCTCCCGCCACCACCACATCCCTCGCCGCCGCTGCCGCTACCAACTCCGCCTCCACCACCACCCTCGCCACCTCCGCCGCCGCCGCCTGCGCCTCCACCATCCCTCGTAGCTCTCCTTTTGCTTCTCAGTGGCCGTCTCCGCCGTGGGAGGTCGTGGCGGGCGGCAGCGGGAGGCCGTCTCCGCCGCGGCCACCTTGACGCTGAGGAGCCCTGCGATACTCGATGGGAGACGGAGTTGACATCGATTCTTGTTGCCGGTGGCCGCACCGTGGTCGGCGAGGCAGCTATGACGGGTTCTACGGCGGTCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTGCAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGATTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCATGTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGT  ]
[+] EMBL CB643786             [                                            CCGCCGCCGCCGCTCCCGCCACCACCACATCCCTCGCCGCCGCTGCCGCTACCAACTCCGCCTCCACCACCACCCTCGCCACCTCCGCCGCCGCCGCCTGCGCCTCCACCATCCCTCGTAGCTCTCCTTTTGCTTCTCAGTGGCCGTCTCCGCCGTGGGAGGTCGTGGCGGGCGGCAGCGGGAGGCCGTCTCCGCCGCGGCCACCTTGACGCTGAGGAGCCCTGCGATACTCGATGGGAGACGGAGTTGACATCGATTCTTGTTGCCGGTGGCCGCACCGTGGTCGGCGAGGCAGCTATGACGGGTTCTACGGCGGTCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTGCAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGATTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCATGTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGT  ]
[-] EMBL CB643829             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGACGGGTTCTACGGCGGTCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTGCAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGATTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCATGTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGTT ]




>consensus_7078#0
CCCTTTCCTCTCTCTCTTCTCTCTCCAGCGCCACCACCACGACTCCGCCGCCGCCGCTCC
CGCCACCACCACATCCCTCGCCGCCGCTGCCGCTACCAACTCCGCCTCCACCACCACCCT
CGCCACCTCCGCCGCCGCCGCCTGCGCCTCCACCATCCCTCGTAGCTCTCCTTTTGCTTC
TCAGTGGCCGTCTCCGCCGTGGGAGGTCGTGGCGGGCGGCAGCGGGAGGCCGTCTCCGCC
GCGGCCACCTTGACGCTGAGGAGCCCTGCGATACTCGATGGGAGACGGAGTTGACATCGA
TTCTTGTTGCCGGTGGCCGCACCGTGGTCGGCGAGGCAGCTATGACGGGTTCTACGGCGG
TCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTG
CAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGA
TTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCAT
GTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGTTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case