These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7078#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 565 fasta sequence [CCCTTTCCTCTCTCTCTTCTCTCTCCAGCGCCACCACCACGACTCCGCCGCCGCCGCTCCCGCCACCACCACATCCCTCGCCGCCGCTGCCGCTACCAACTCCGCCTCCACCACCACCCTCGCCACCTCCGCCGCCGCCGCCTGCGCCTCCACCATCCCTCGTAGCTCTCCTTTTGCTTCTCAGTGGCCGTCTCCGCCGTGGGAGGTCGTGGCGGGCGGCAGCGGGAGGCCGTCTCCGCCGCGGCCACCTTGACGCTGAGGAGCCCTGCGATACTCGATGGGAGACGGAGTTGACATCGATTCTTGTTGCCGGTGGCCGCACCGTGGTCGGCGAGGCAGCTATGACGGGTTCTACGGCGGTCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTGCAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGATTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCATGTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGTTT] [+] EMBL AK109196 [CCCTTTCCTCTCTCTCTTCTCTCTCCAGCGCCACCACCACGACTCCGCCGCCGCCGCTCCCGCCACCACCACATCCCTCGCCGCCGCTGCCGCTACCAACTCCGCCTCCACCACCACCCTCGCCACCTCCGCCGCCGCCGCCTGCGCCTCCACCATCCCTCGTAGCTCTCCTTTTGCTTCTCAGTGGCCGTCTCCGCCGTGGGAGGTCGTGGCGGGCGGCAGCGGGAGGCCGTCTCCGCCGCGGCCACCTTGACGCTGAGGAGCCCTGCGATACTCGATGGGAGACGGAGTTGACATCGATTCTTGTTGCCGGTGGCCGCACCGTGGTCGGCGAGGCAGCTATGACGGGTTCTACGGCGGTCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTGCAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGATTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCATGTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGTTT] [+] EMBL CB643828 [ CCGCCGCCGCCGCTCCCGCCACCACCACATCCCTCGCCGCCGCTGCCGCTACCAACTCCGCCTCCACCACCACCCTCGCCACCTCCGCCGCCGCCGCCTGCGCCTCCACCATCCCTCGTAGCTCTCCTTTTGCTTCTCAGTGGCCGTCTCCGCCGTGGGAGGTCGTGGCGGGCGGCAGCGGGAGGCCGTCTCCGCCGCGGCCACCTTGACGCTGAGGAGCCCTGCGATACTCGATGGGAGACGGAGTTGACATCGATTCTTGTTGCCGGTGGCCGCACCGTGGTCGGCGAGGCAGCTATGACGGGTTCTACGGCGGTCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTGCAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGATTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCATGTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGT ] [+] EMBL CB643786 [ CCGCCGCCGCCGCTCCCGCCACCACCACATCCCTCGCCGCCGCTGCCGCTACCAACTCCGCCTCCACCACCACCCTCGCCACCTCCGCCGCCGCCGCCTGCGCCTCCACCATCCCTCGTAGCTCTCCTTTTGCTTCTCAGTGGCCGTCTCCGCCGTGGGAGGTCGTGGCGGGCGGCAGCGGGAGGCCGTCTCCGCCGCGGCCACCTTGACGCTGAGGAGCCCTGCGATACTCGATGGGAGACGGAGTTGACATCGATTCTTGTTGCCGGTGGCCGCACCGTGGTCGGCGAGGCAGCTATGACGGGTTCTACGGCGGTCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTGCAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGATTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCATGTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGT ] [-] EMBL CB643829 [ ATGACGGGTTCTACGGCGGTCGGCGACGTGGTTAAGGCGGCTTTTGCTGCTATCGGCGGTGCACAAATGGCGGCTCCTGCAGCCGTGACTAGGTGCGGATGAGCTTCATGTGTTTTTTGCATTTTGTGTCGTTTGTTGATTTGAGCATTTTAGGTCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTGCAGTTGATGGAGCATGTAGCTTGTGGTGCTAGATAGGTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||