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Oryza sativa
cluster # 7093 cluster # 7093       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7093#0 length = 422 sequences # 4  

consensusID : consensus_7093#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 422
fasta sequence
                              [CGTTGGAGGAGGACAAGGACAGGCTGGAGGATATGGTTCAACTGGTAGTGGATCTGGTAGTGGATCTGGCTCTGGTTATAGCAATGCTAATAATAATTGGTATGGGTCAAGTGCGGGAGCGGGTGCTAGTGGTAATGGTGGAGGCAATGGCAATGGTGAAAATGGCGGGAATGGTAGTGGTGCAGGAGGTGGGTCTGGGTATGGTAATGCCTCTCCATAATTACCTTTATTCAATCAGTTCAAAGTTGGAGCCCAACTAATAGTGTTGAATCCGTGTATTTTTATCGTACTTGTTATGTCTACTTGGTAGCTACAAATAAAGGGCTCTGTTGCTTTCGAAGATGTACCCCTGTACTTGGTAGATTGTGTCACTTTACTCGGTTATTTATCATAATGAAAAATACTTGTTCTACAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU071260             [CGTTGGAGGAGGACAAGGACAGGCTGGAGGATATGGTTCAACTGGTAGTGGATCTGGTAGTGGATCTGGCTCTGGTTATAGCAATGCTAATAATAATTGGTATGGGTCAAGTGCGGGAGCGGGTGCTAGTGGTAATGGTGGAGGCAATGGCAATGGTGAAAATGGCGGGAATGGTAGTGGTGCAGGAGGTGGGTCTGGGTATGGTAATGCCTCTCCATAATTACCTTTATTCAATCAGTTCAAAGTTGGAGCCCAACTAATAGTGTTGAATCCGTGTATTTTTATCGTACTTGTTATGTCTACTTGGTAGCTACAAATAAAGGGCTCTGTTGCTTTCGAAGATGTACCCCTGTACTTGGTAGATTGTGTCACTTTACTCGGTTATTTATCATAATGAAAAATACTTGTTCTACACAAAAAAA]
[+] EMBL AU184276             [                 GACAGGCTGGAGGATATGGTTCAACTGGTAGTGGATCTGGTAGTGGATCTGGCTCTGGTTATAGCAATGCTAATAATAATTGGTATGGGTCAAGTGCGGGAGCGGGTGCTAGTGGTAATGGTGGAGGCAATGGCAATGGTGAAAATGGCGGGAATGGTAGTGGTGCAGGAGGTGGGTCTGGGTATGGTAATGCCTCTCCATAATTACCTTTATTCAATCAGTTCAAAGTTGGAGCCCAACTAATAGTGTTGAATCCGTGTATTTTTATCGTACTTGTTATGTCTACTTGGTAGCTACAAATAAAGGGCTCTGTTGCTTTCGAAGATGTACCCCTGTACTTGGTAGATTGTGTCACTTTACTCGGTTATTTATCATAATGAAAAATACTTGTTNTAAAAAAA    ]
[+] EMBL AU184275             [                 GACAGGCTGGAGGATATGGTTCAACTGGTAGTGGATCTGGTAGTGGATCTGGCTCTGGTTATAGCAATGCTAATAATAATTGGTATGGGTCAAGTGCGGGAGCGGGTGCTAGTGGTAATGGTGGAGGCAATGGCAATGGTGAAAATGGCGGGAATGGTAGTGGTGCAGGAGGTGGGTCTGGGTATGGTAATGCCTCTCCATAATTACCTTTATTCAATCAGTTCAAAGTTGGAGCCCAACTAATAGTGTTGAATCCGTGTATTTTTATCGTACTTGTTATGTCTACTTGGTAGCTACAAATAAAGGGCTCTGTTGCTTTCGAAGATGTACCCCTGTACTTGGTAGATTGTGTCACTTTACTCGGTTATTTATCATAATGAAAAATACTTGTTCTAAAAAAA    ]
[+] EMBL AU164553             [                 GACAGGCTGGAGGATATGGTTCAACTGGTAGTGGATCTGGTAGTGGATCTGGCTCTGGTTATAGCAATGCTAATAATAATTGGTATGGGTCAAGTGCGGGAGCGGGTGCTAGTGGTAATGGTGGAGGCAATGGCAATGGTGAAAATGGCGGGAATGGTAGTGGTGCAGGAGGTGGGTCTGGGTATGGTAATGCCTCTCCATAATTACCTTTATTCAATCAGTTCAAAGTTGGAGCCCAACTAATAGTGTTGAATCCGTGTATTTTTATCGTACTTGTTATGTCTACTTGGTAGCTACAAATAAAGGGCTCTGTTGCTTTCGAAGATGTACCCCTGTACTTGGTAGATTGTGTCACTTTACTCGGTTATTTATCATAATGAAAAATACTTGTTCTACA        ]


>consensus_7093#0 CGTTGGAGGAGGACAAGGACAGGCTGGAGGATATGGTTCAACTGGTAGTGGATCTGGTAG TGGATCTGGCTCTGGTTATAGCAATGCTAATAATAATTGGTATGGGTCAAGTGCGGGAGC GGGTGCTAGTGGTAATGGTGGAGGCAATGGCAATGGTGAAAATGGCGGGAATGGTAGTGG TGCAGGAGGTGGGTCTGGGTATGGTAATGCCTCTCCATAATTACCTTTATTCAATCAGTT CAAAGTTGGAGCCCAACTAATAGTGTTGAATCCGTGTATTTTTATCGTACTTGTTATGTC TACTTGGTAGCTACAAATAAAGGGCTCTGTTGCTTTCGAAGATGTACCCCTGTACTTGGT AGATTGTGTCACTTTACTCGGTTATTTATCATAATGAAAAATACTTGTTCTACAAAAAAA AA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)