These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7094#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 951 fasta sequence [CAACAGTATAGCTGAGATTGGTCATCTGACATCCTTATCTCCCTCTCCCTCCAAGTGCCTAACCCAACTCTTCCCGAGCCTTTTTCTGATCATTGGACAAATGGCCGTCTCTTCAGCCGTTCTCGTTGGGCTACTCGTCGTGAGTTGCGCCGCGGTGGCCGCAGCCACGAGGTACACCGTCGGCGACGGCGAGGGCTGGACGACCGGCGTCAACTACAACAACTGGGCCAACGGCAAGTTTTTCAGACAAGGAGACGAACTCGTGTTCAACTACCAGGCGAGGGCGCACACGGTGACGGAGGTGAGCCAGACCAACTTCGACAGCTGCAACGGCAACAGCCCGCTGAGCAACGACAACGGGGGATCGACCACCATCAGGCTCTCCTACCCGGGCATGCACTACTTCATCTGCACCATCCCCGGCCACTGCAGCAGCGGCATGAAGCTCGCCGTGAACGTCAACGGTGACCCGTCGTACTCTGCCGCCTCTTCGCCGGCGGCGGCGAGCGCTGTCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGCCCTGATCAAGCTCGCGCTGTTCTGATGGCCGCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGGAAGCCATGCAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGCAATGAAGCTGACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTT-GGTCACCGTGCAACTCGTATGTAGTAAT-CACCTTAGTTTGTTGTGGTGATTCTAAATTT-GCTTGTGCCA-CTGG-TGTATCGTCGTGTCT-GGGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAATAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGTTGTATAACTATACCGAAGTTTAATTACTTGACCTTTGTAATCACAGCTTGACCCCTCAAAA] [+] EMBL AK059930 [CAACAGTATAGCTGAGATTGGTCATCTGACATCCTTATCTCCCTCTCCCTCCAAGTGCCTAACCCAACTCTTCCCGAGCCTTTTTCTGATCATTGGACAAATGGCCGTCTCTTCAGCCGTTCTCGTTGGGCTACTCGTCGTGAGTTGCGCCGCGGTGGCCGCAGCCACGAGGTACACCGTCGGCGACGGCGAGGGCTGGACGACCGGCGTCAACTACAACAACTGGGCCAACGGCAAGTTTTTCAGACAAGGAGACGAACTCGTGTTCAACTACCAGGCGAGGGCGCACACGGTGACGGAGGTGAGCCAGACCAACTTCGACAGCTGCAACGGCAACAGCCCGCTGAGCAACGACAACGGGGGATCGACCACCATCAGGCTCTCCTACCCGGGCATGCACTACTTCATCTGCACCATCCCCGGCCACTGCAGCAGCGGCATGAAGCTCGCCGTGAACGTCAACGGTGACCCGTCGTACTCTGCCGCCTCTTCGCCGGCGGCGGCGAGCGCTGTCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGCCCTGATCAAGCTCGCGCTGTTCTGATGGCCGCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGGAAGCCATGCAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGCAATGAAGCTGACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTT GGTCACCGTGCAACTCGTATGTAGTAAT CACCTTAGTTTGTTGTGGTGATTCTAAATTT GCTTGTGCCA CTGG TGTATCGTCGTGTCT GGGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAATAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGTTGTATAACTATACCGAAGTTTAATTACTTGACCTTTGTAATCACAGCTTGACCCCTC ] [+] EMBL BI806427 [ GACC CCATCAGGCTCTCC ACCC GGCATGCACTACTTCATCT CACCAT CCCAGCCACTGCATCA CGTCATGAAGCTC CCGTGAACGTCAAC TGACCC TC TACTCGTCCNCCTCTTCNCC GC GCGGCGAGC CTGTCNCCGCAAC GCA CGGGGGCCCTGATCAAGCTCGCGCTGTTCTGAT GCCCCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGGAAGCCAT CAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGC ATGAAGCTGACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTTGGGTCACCGTGC ACTCGTATGTAGTAATGCACCTTAGTTTGTTGTGGGGATTCTAAATTTGGCTTGTGCCACCTGGTTGTATCGTCGTGTCTCGGGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAATAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGTTGTATAACTATACCGAAGTTTAATTACTTGACCTTTGTAATCACAGCTTGACCCCTCAAAA] [+] EMBL CB682676 [ CATGAAGCTCGCCGTGAACGTCAACGGTGACCCGTCGTACTCTGCCGCCTCTTCGCCGGCGGCGGCGAGCGCTGTCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGCCCTGATCAAGCTCGCGCTGTTCTGATGGCCGCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGGAAGCCATGCAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGCAATGAAGCTGACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTT GGTCACCGTGCAACTCGTATGTAGTAAT CACCTTAGTTTGTTGTGGTGATTCTAAATTT GCTTGTGCCA CTGG TGTATCGTCGTGTCT GGGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAATAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGGTGTATAACTAT ] [+] EMBL CA757919 [ TCTGCCGCCTCTTCGCCGGCGGCTGCGAGCGCTGTCGCCGCCGCGGCAGCGGGGGCCCTGATCAAGCTCGCGCTGTTCTGATGGCCGCGGTGCATGCGAGCCAGGGTAGAGACAGTGCGTGGAAGCCATGCAGGTTCTTGTCGATCGGCCGTTGCACGTTGGTGACTCGTGCAATGAAGCTGACCGTGTTTCTTCTCGTTTCTCGTGTGATTT GGTCACCGTGCAACTCGTATGTAGTAAT CACGTTAGTTTGTTGTGGTGATTCTAAATTT GCTTGTGCCA CTGG TGTATCGTCGTGTCT GGGGGCTCTGGTTATGCATGCCATGGTTTGTGTTGGTGAAATTTCTTATGGTGGGTATAAATAAAACCAAGCATGTTAAAAACATGCTGGTGGTAATGGTATAGTCGTGGTTGTATAACTATACCGGAGTTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||