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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7127#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 821 fasta sequence
[AGCTATAGCTAGTATATATCTGACAAATTCAGAGAAATTCAGAGAGTCACCGCGAGAGCTTAAGCTAGCTAGCTAGCCGGCCATGGCATCGCATGTGGACCCGCTGGTGGTGGGGAGGGTGATCGGCGACGTGGTGGACCTGTTCGTGCCGACGACGGCCATGTCGGTGCGGTTCGGGACCAAGGACCTCACCAACGGCTGCGAGATCAAGCCGTCCGTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCGTGCAGATCGCCGGCAGGGTC-AACGAGCTCTTCGCTCTGGTCATGACTGATCCAGATGCTCCTAGCCCCAGCGAGCCGACTATGAGAGAGTGGCTTCACTGGCTGGTGGTTAACATACCAGGTGGAAC-AGATCCTTCTCAAGGGGATGTGGTGGTGCCGTACATGGGGCCACGGCCGCCGGTGGGGATCCACCGCTACGTGATGGTGCTGTTCCAGCAGAAGGCGCGCGTGGCTGCGCCGCCGCCCGACGAGGACGCCGCGCGCGCCAGGTTCAGCACGCGCGCCTTCGCCGACCGCCACGACCTCGGCCTCCCCGTCGCCGCCCTCTACTTCAACGCCCAGAAGGAGCCCGCCATCCGCCGCCGCCGCTACTAGCCTCCCTCCCCTCGCTCGGCGTCGCCCATCCATCCATCCATGGACGGCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTATTACTGTGTGGTGATTAATTAGCTGAACTATTGTTTTGATGAAAAA]
[+] EMBL AK107056 [AGCTATAGCTAGTATATATCTGACAAATTCAGAGAAATTCAGAGAGTCACCGCGAGAGCTTAAGCTAGCTAGCTAGCCGGCCATGGCATCGCATGTGGACCCGCTGGTGGTGGGGAGGGTGATCGGCGACGTGGTGGACCTGTTCGTGCCGACGACGGCCATGTCGGTGCGGTTCGGGACCAAGGACCTCACCAACGGCTGCGAGATCAAGCCGTCCGTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCGTGCAGATCGCCGGCAGGGTC AACGAGCTCTTCGCTCTGGTCATGACTGATCCAGATGCTCCTAGCCCCAGCGAGCCGACTATGAGAGAGTGGCTTCACTGGCTGGTGGTTAACATACCAGGTGGAAC AGATCCTTCTCAAGGGGATGTGGTGGTGCCGTACATGGGGCCACGGCCGCCGGTGGGGATCCACCGCTACGTGATGGTGCTGTTCCAGCAGAAGGCGCGCGTGGCTGCGCCGCCGCCCGACGAGGACGCCGCGCGCGCCAGGTTCAGCACGCGCGCCTTCGCCGACCGCCACGACCTCGGCCTCCCCGTCGCCGCCCTCTACTTCAACGCCCAGAAGGAGCCCGCCATCCGCCGCCGCCGCTACTAGCCTCCCTCCCCTCGCTCGGCGTCGCCCATCCATCCATCCATGGACGGCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCG ]
[+] EMBL BI801968 [ cGCAGGTTCAAACGAGCTCTTCGCTCTGGTCATGACTGATCCAGATGCTCCTAGCCCCAGCGA CCGACTATGAGAGAGTGGCTTCACT GCTGGTGGTTAACATACCAGGTGGAACAAGATCCTTCTCAAGGGGATGTGGTGGT CCGTACATGGGGCCAC GCCGCCGGTGGGGATCCACCGCTACGTGATGGTGCTGTTCCAGCAGAAGGCGCGCGTGGCGGCGCCGCCGCCCGACGAGGACGCCGCGCGCGCCAGGTTCAGCACGCGCGCCTTCGCCGACCGCCACGACCTCGGCCTCCCCGTCGCCGCCCTCTACTTCAACGCCCAGAAGGAGCCCGCCAACCGCCGCCGCCGCTACTAGCCTCCCTCCCCTCGCTCGGCGTCGCCCATCCATCCATCCATGGACGGCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTC CCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTAaaaaaaaaa ]
[+] EMBL BI804369 [ GCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGCCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTATTACTGTGTGGTGATTAATTAGCTGAACTATTGTTTTGATGAAAAA]
[+] EMBL BI803120 [ GCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTATTACTGTGTGGTGATTAATTAGCTGAACTATTGTTTTGATGAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||